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蛋白质结构型的定义和识别
被引量:
5
1
作者
李晓琴
罗辽复
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2002年第1期124-127,共4页
提出紧结构域的概念 ,由二级结构序列中一段或几段连续的α螺旋和 β折叠构成的空间紧密堆集的最大折叠体称为紧结构域 .利用 3种紧结构域 (α域 ,β域和α/β域 )定义球蛋白的 5种结构型 :α型蛋白 ,β型蛋白 ,α/β型蛋白 ,多域蛋白和...
提出紧结构域的概念 ,由二级结构序列中一段或几段连续的α螺旋和 β折叠构成的空间紧密堆集的最大折叠体称为紧结构域 .利用 3种紧结构域 (α域 ,β域和α/β域 )定义球蛋白的 5种结构型 :α型蛋白 ,β型蛋白 ,α/β型蛋白 ,多域蛋白和 ζ型蛋白 .将 12 6 1个代表性的蛋白质 (10 2 2家族 )进行分类 ,并和SCOP库的分类做了比较 .进行了删去序列冗余的分析 .在此基础上提出结构型的预测方案 ,成功率在 82 %~ 85 %.
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关键词
蛋白质结构型
二级
结构
序列
紧
结构
域
序列冗余
预测
识别
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职称材料
蛋白质结构型的识别方法
被引量:
1
2
作者
李晓琴
罗辽复
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2002年第6期938-941,共4页
给出了α型、β型、α/ β型、多域型蛋白质二级结构主序列六联体的分布规律 .提出了根据蛋白质二级结构主序列对蛋白质结构型进行识别 (分类 )的方法 .以蛋白质二级结构主序列三联体为参数 ,利用Mahalanobis距离方法对上述 4种结构型...
给出了α型、β型、α/ β型、多域型蛋白质二级结构主序列六联体的分布规律 .提出了根据蛋白质二级结构主序列对蛋白质结构型进行识别 (分类 )的方法 .以蛋白质二级结构主序列三联体为参数 ,利用Mahalanobis距离方法对上述 4种结构型的蛋白质进行识别 ,分类的总体准确率为 81% ;以二级结构主序列中六联体的频数构成蛋白质结构的多样性源 ,利用多样性增量极小化对上述 4种结构型进行识别 ,分类的总体准确率为 83% .
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关键词
蛋白质结构型
识别方法
二级
结构
序列
多样性指标
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职称材料
题名
蛋白质结构型的定义和识别
被引量:
5
1
作者
李晓琴
罗辽复
机构
内蒙古大学理工学院
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2002年第1期124-127,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目 (39960 0 23)~~
文摘
提出紧结构域的概念 ,由二级结构序列中一段或几段连续的α螺旋和 β折叠构成的空间紧密堆集的最大折叠体称为紧结构域 .利用 3种紧结构域 (α域 ,β域和α/β域 )定义球蛋白的 5种结构型 :α型蛋白 ,β型蛋白 ,α/β型蛋白 ,多域蛋白和 ζ型蛋白 .将 12 6 1个代表性的蛋白质 (10 2 2家族 )进行分类 ,并和SCOP库的分类做了比较 .进行了删去序列冗余的分析 .在此基础上提出结构型的预测方案 ,成功率在 82 %~ 85 %.
关键词
蛋白质结构型
二级
结构
序列
紧
结构
域
序列冗余
预测
识别
Keywords
protein structural class
secondary structure sequence
compact structural domain
sequence redundancy
prediction
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
下载PDF
职称材料
题名
蛋白质结构型的识别方法
被引量:
1
2
作者
李晓琴
罗辽复
机构
内蒙古大学物理系
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2002年第6期938-941,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目 (3 9960 0 2 390 10 3 0 3 0 )~~
文摘
给出了α型、β型、α/ β型、多域型蛋白质二级结构主序列六联体的分布规律 .提出了根据蛋白质二级结构主序列对蛋白质结构型进行识别 (分类 )的方法 .以蛋白质二级结构主序列三联体为参数 ,利用Mahalanobis距离方法对上述 4种结构型的蛋白质进行识别 ,分类的总体准确率为 81% ;以二级结构主序列中六联体的频数构成蛋白质结构的多样性源 ,利用多样性增量极小化对上述 4种结构型进行识别 ,分类的总体准确率为 83% .
关键词
蛋白质结构型
识别方法
二级
结构
序列
多样性指标
Keywords
protein structural class, secondary structure sequence, diversity measure
分类号
Q518.1 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
蛋白质结构型的定义和识别
李晓琴
罗辽复
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2002
5
下载PDF
职称材料
2
蛋白质结构型的识别方法
李晓琴
罗辽复
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2002
1
下载PDF
职称材料
已选择
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参考文献
引证文献
统计分析
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