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伴与不伴糖尿病肾病的糖尿病视网膜病变患者血浆蛋白质组学研究
被引量:
5
1
作者
李志琛
刘颖
+5 位作者
何徐军
梅伟群
陈建斌
张华北
欧阳建
钱佳丽
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2019年第13期2094-2098,共5页
目的研究伴与不伴糖尿病肾病(DN)的糖尿病视网膜病变(DR)患者血浆蛋白质组学,寻找差异表达蛋白,为筛选相关血浆标志物提供依据。方法入组16例T2DM患者,8例DR伴DN患者纳入DNDR组,8例单纯DR患者纳入DR组,利用蛋白质组非标记(label-free)...
目的研究伴与不伴糖尿病肾病(DN)的糖尿病视网膜病变(DR)患者血浆蛋白质组学,寻找差异表达蛋白,为筛选相关血浆标志物提供依据。方法入组16例T2DM患者,8例DR伴DN患者纳入DNDR组,8例单纯DR患者纳入DR组,利用蛋白质组非标记(label-free)定量技术对16例血浆标本进行检测,并行液相串联质谱分析(LC-MS/MS),计算蛋白质表达丰度,筛选差异蛋白并行生物信息学分析,包括基因本体(GO)和代谢与信号转导通路(Pathway)注释和富集分析、差异蛋白相互作用网络分析。ELISA法检测两组患者血浆IGFBP7、CPS1 水平,验证label-free 结果。结果以均数和中位数差异倍数均≥ 2.5 倍(上/下调)为标准,筛选出差异蛋白17个,上调11个,下调6个。GO富集分析显示结合蛋白在分子功能蛋白中占绝对优势。Pathway 富集分析示CPS1在丙氨酸,天冬氨酸和谷氨酸代谢中起作用。蛋白相互作用网络分析显示HSPG2、CPS1、IGFBP7、TLN1、KRT5之间有相互作用。ELISA法结果显示IGFBP7在DR组较DNDR组表达升高,CPS1在DR组较DNDR组表达降低。结论采用label-free定量技术发现DR组与DNDR组存在多种差异表达蛋白,这些差异蛋白提供了不同的候选相关血浆标志物和早期防治的靶点。
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关键词
糖尿病视网膜病变
糖尿病肾病
蛋白质非标定量技术
血浆
蛋白质
组学
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职称材料
题名
伴与不伴糖尿病肾病的糖尿病视网膜病变患者血浆蛋白质组学研究
被引量:
5
1
作者
李志琛
刘颖
何徐军
梅伟群
陈建斌
张华北
欧阳建
钱佳丽
机构
解放军第
浙江省人民医院浙江省胃肠病学重点实验室
出处
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2019年第13期2094-2098,共5页
基金
南京军区医药卫生重点项目(编号:11Z038)
浙江省医药卫生科技计划项目(编号:2013KYA177)
杭州市科技发展计划医药卫生及重点专科专病科研攻关专项(编号:20130633B30)
文摘
目的研究伴与不伴糖尿病肾病(DN)的糖尿病视网膜病变(DR)患者血浆蛋白质组学,寻找差异表达蛋白,为筛选相关血浆标志物提供依据。方法入组16例T2DM患者,8例DR伴DN患者纳入DNDR组,8例单纯DR患者纳入DR组,利用蛋白质组非标记(label-free)定量技术对16例血浆标本进行检测,并行液相串联质谱分析(LC-MS/MS),计算蛋白质表达丰度,筛选差异蛋白并行生物信息学分析,包括基因本体(GO)和代谢与信号转导通路(Pathway)注释和富集分析、差异蛋白相互作用网络分析。ELISA法检测两组患者血浆IGFBP7、CPS1 水平,验证label-free 结果。结果以均数和中位数差异倍数均≥ 2.5 倍(上/下调)为标准,筛选出差异蛋白17个,上调11个,下调6个。GO富集分析显示结合蛋白在分子功能蛋白中占绝对优势。Pathway 富集分析示CPS1在丙氨酸,天冬氨酸和谷氨酸代谢中起作用。蛋白相互作用网络分析显示HSPG2、CPS1、IGFBP7、TLN1、KRT5之间有相互作用。ELISA法结果显示IGFBP7在DR组较DNDR组表达升高,CPS1在DR组较DNDR组表达降低。结论采用label-free定量技术发现DR组与DNDR组存在多种差异表达蛋白,这些差异蛋白提供了不同的候选相关血浆标志物和早期防治的靶点。
关键词
糖尿病视网膜病变
糖尿病肾病
蛋白质非标定量技术
血浆
蛋白质
组学
Keywords
diabetic retinopathy
diabetic nephropathy
label-free quantification technology
plasma proteomics
分类号
R587.2 [医药卫生—内分泌]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
伴与不伴糖尿病肾病的糖尿病视网膜病变患者血浆蛋白质组学研究
李志琛
刘颖
何徐军
梅伟群
陈建斌
张华北
欧阳建
钱佳丽
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2019
5
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