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白藜芦醇靶点蛋白质的研究 被引量:3
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作者 冯磊 花慧 +1 位作者 邱丽颖 金坚 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第8期128-133,共6页
为探讨白藜芦醇在肿瘤细胞中的结合靶点蛋白质。采用亲和甄别磁珠法生物淘洗白藜芦醇的靶点蛋白质。在构建并优化了白藜芦醇结构模型的基础上,通过分子动力学优化分析白藜芦醇与其靶点蛋白质的结构模型,并且使用分子对接分析验证两者的... 为探讨白藜芦醇在肿瘤细胞中的结合靶点蛋白质。采用亲和甄别磁珠法生物淘洗白藜芦醇的靶点蛋白质。在构建并优化了白藜芦醇结构模型的基础上,通过分子动力学优化分析白藜芦醇与其靶点蛋白质的结构模型,并且使用分子对接分析验证两者的结合作用。结果表明,亲和甄X别磁珠法直接筛选到的能与白藜芦醇的特异性结合的蛋白质是Myosin蛋白质和Actin蛋白质,并且成功构建得到了合理的白藜芦醇分子与Actin蛋白质的复合物的三维结构。通过分析白藜芦醇分子与Ac-tin蛋白活性氨基酸残基结合模式发现,残基Val30,Phe31,Pro32,Thr203,Ala204,Glu205,Pro243,Asp244,等对两者的结合都有重要贡献。白藜芦醇是通过作用于肿瘤细胞的骨架结构蛋白来干扰细胞的有丝分裂过程,从而导致肿瘤细胞的体外增殖受到抑制。 展开更多
关键词 白藜芦醇 蛋白质 MCF-7细胞
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一种新型免疫层析技术在临床乳腺癌Her-2蛋白定量检测中的应用 被引量:1
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作者 张洁莹 岳洋 +1 位作者 邓桥生 糜军 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期467-473,共7页
建立一种靶点蛋白质快速定量检测方法。在原有侧向流动免疫层析技术的基础上,通过优化层析材料和纳米微球的均一性、改进检测区的检测方法,经逐点扫描技术,建立标准浓度曲线,以达到对临床靶点蛋白质的定量检测。以乳腺癌组织中的Her2表... 建立一种靶点蛋白质快速定量检测方法。在原有侧向流动免疫层析技术的基础上,通过优化层析材料和纳米微球的均一性、改进检测区的检测方法,经逐点扫描技术,建立标准浓度曲线,以达到对临床靶点蛋白质的定量检测。以乳腺癌组织中的Her2表达为例,通过对已知浓度样品的检测,验证本技术方法的准确度大于96%。另外,以蛋白质免疫印迹作为组织中特定蛋白质检测金标准,分析临床肿瘤组织中Her2蛋白的含量,其准确率也达到95.5%,而免疫组织化学方法检测准确率仅为69.58%。新型免疫层析法检测结果与靶向治疗患者的愈后密切相关(P<0.01)。改进后的新型免疫层析方法能够准确地对临床靶点蛋白质进行定量检测,而且结合侧向流动技术的简单、快速和易用性,这种新型检测方法可以广泛应用于临床组织标本、血液标本和体液标本中靶点蛋白质的临场定量检测,在一定程度上可以替代免疫组化技术。 展开更多
关键词 免疫层析 蛋白质定量检测 微阵列检测
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持久性有机污染物4,4'-DDE和CB-153的反向虚拟筛选 被引量:4
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作者 许先进 苏计国 +5 位作者 刘斌 李春华 谭建军 张小轶 陈慰祖 王存新 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2013年第10期2276-2285,共10页
持久性有机污染物(POPs)会导致人类和动植物各种疾病的发生,已经成为一种新的全球性环境问题.研究发现,POPs分子能够特异性地结合到生物体内一些蛋白质受体上,发挥其致病机制.本文运用基于分子对接的反向虚拟筛选方法,从蛋白质结构数据... 持久性有机污染物(POPs)会导致人类和动植物各种疾病的发生,已经成为一种新的全球性环境问题.研究发现,POPs分子能够特异性地结合到生物体内一些蛋白质受体上,发挥其致病机制.本文运用基于分子对接的反向虚拟筛选方法,从蛋白质结构数据库中筛选出配体分子可能的受体蛋白质,研究了持久性有机污染物4,4-DDE和CB-153潜在的受体蛋白质.结合实验信息,讨论分析了排在前5%的蛋白质受体.值得注意的是,已知的一些蛋白质受体都排在了虚拟筛选结果的前列.该研究不仅有助于进一步了解这些有毒污染物分子的致病机制,还将为设计针对该类污染物分子的生物传感器提供有用的信息. 展开更多
关键词 持久性有机污染物 反向虚拟筛选 蛋白质靶点 生物传感器
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基于网络药理学探讨防己黄芪汤治疗慢性心力衰竭的潜在机制 被引量:4
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作者 范吉林 朱婷婷 张世亮 《山东中医药大学学报》 2021年第3期340-346,共7页
目的:利用网络药理学探讨防己黄芪汤治疗慢性心力衰竭(CHF)的潜在机制。方法:利用中药系统药理学技术平台(TCMSP)检索防己黄芪汤的药物活性成分及其相关靶点,并通过全球蛋白质资源(Uniprot)数据库进行基因的标准化处理。通过在线人类孟... 目的:利用网络药理学探讨防己黄芪汤治疗慢性心力衰竭(CHF)的潜在机制。方法:利用中药系统药理学技术平台(TCMSP)检索防己黄芪汤的药物活性成分及其相关靶点,并通过全球蛋白质资源(Uniprot)数据库进行基因的标准化处理。通过在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库、基因卡片(GeneCards)数据库检索得到CHF的相关靶点,将药物活性成分靶点与疾病的相关靶点相映射,取得的交集靶点即为防己黄芪汤治疗CHF的潜在靶点。利用Cytoscape软件构建防己黄芪汤治疗CHF的“药物-成分-疾病”靶点网络图,并运用生物分子功能注释系统(STRING)数据库以及Cytoscape软件构建防己黄芪汤治疗CHF的核心蛋白质互作(PPI)靶点网络图。利用DAVID数据库对获得的交集靶点进行基因本体论(GO)生物过程和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:筛选出的防己黄芪汤治疗CHF的活性成分有124个,相关靶点135个,与CHF相交合的靶点涉及α-1β肾上腺素受体(ADRA1B)和一氧化氮合酶3(NOS3)等。防己黄芪汤治疗CHF的GO生物过程涉及G蛋白偶联乙酰胆碱受体活性、药物结合、平滑肌收缩的正调控、对药物的反应等;防己黄芪汤治疗CHF可能与钙信号传导途径、神经活性配体-受体相互作用、环磷酸鸟苷酸/环磷酸鸟苷酸依赖的蛋白激酶(cGMP/PKG)信号通路、环磷酸腺苷(cAMP)信号通路、心肌细胞中的肾上腺素信号传导等通路相关。结论:防己黄芪汤治疗CHF涉及多个靶点、生物过程与通路,提示防己黄芪汤治疗CHF的机制较为复杂。 展开更多
关键词 防己黄芪汤 慢性心力衰竭 网络药理学 药物活性成分 蛋白质互作 《金匮要略》
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The proteomic study and the target discovery of W026B, a new compound with brain protective effect 被引量:3
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作者 Siyu Zhao Xiaoyan Liu +2 位作者 Yuanjun Zhu Ye Liu Yinye Wang 《Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences》 CAS CSCD 2019年第6期381-392,共12页
W026B is a new compound that has a protective effect on cerebral ischemia reperfusion(I-R)injury in mice,while its specific mechanism is still unknown.In this study,proteomics was used to observe the effect of W026B o... W026B is a new compound that has a protective effect on cerebral ischemia reperfusion(I-R)injury in mice,while its specific mechanism is still unknown.In this study,proteomics was used to observe the effect of W026B on protein expression in brain I-R tissue,and to reveal its potential target.A total of 42 significantly altered proteins were identified in both brain I-R model and W026B treatment from 4852 proteins detected by proteomics,and most of these proteins were related to immunity and inflammation,metabolism,neuroprotection as well as cell proliferation and cell structure.Western blotting analysis showed that three out of five selected proteins showed consistent alteration with the proteomics.Regulator of G protein signaling 17(RGS17)was selected for further study,and its knockdown by siRNA RGS17 aggravated brain injury and abolished the protective effect of W026B.W026B could bind with RGS17(KD:6.04×10–6 mol/L).The knockdown of RGS17 aggravated Neuro-2 a cell damage induced by group I metabotropic glutamate receptors(mGluRs)agonist,and abolished the protective effect of W026B.In conclusion,W026B protected brain against I-R injury by affecting diverse proteins.RGS17 might be one of its targets and a potential therapeutic target of brain I-R injury.The upstream receptor of G protein,which was regulated by RGS17 and affected by W026B,might be group I m GluRs.This study provided useful evidence for the further R&D and the potential clinical application of W026B. 展开更多
关键词 Brain ischemia Reperfusion injury PROTEOMICS Target discovery W026B
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