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核酸条形码技术:扩展蛋白质-蛋白质相互作用检测通量的新方法
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作者 李林鑫 秦晓红 米立志 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期281-294,共14页
蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)几乎参与了机体内所有重要的生物学过程,在细胞的基本生命过程中扮演了至关重要的角色,开发高通量的PPI检测新方法具有重要的生物学意义。目前,下一代测序技术(next-generation ... 蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)几乎参与了机体内所有重要的生物学过程,在细胞的基本生命过程中扮演了至关重要的角色,开发高通量的PPI检测新方法具有重要的生物学意义。目前,下一代测序技术(next-generation sequencing,NGS)发展快速,能在几天内测定超过10亿个模板的DNA序列。由于并行DNA测序技术所特有的敏感性、特异性、高通量和多路复用优势,其已被用作广谱分子计数器,应用于基因组测序和转录物组测序等领域。核酸条形码技术通过将寡核苷酸标签与目标蛋白质连接起来,从而标记编码蛋白质。之后,利用高通量的测序方法检测相互作用的蛋白质,实现了PPI的高通量检测。这一技术推动了PPI检测方法的飞速发展,提升了单次实验检测的通量,为构建PPI网络提供了强有力的技术支持。本文详细阐述了核酸条形码在PPI检测方法中的设计、生成和读取;通过分析核酸条形码技术在PPI研究中的应用范例,探讨了各自的优势和不足,并评估了数据的可靠性,讨论了基于核酸条形码技术的PPI检测方法未来的发展趋势。 展开更多
关键词 蛋白质-蛋白质相互作用 核酸条形码检测技术 下一代测序技术
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邻近标记技术在蛋白质-蛋白质相互作用中的研究进展
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作者 董娜 张文峰 《广东药科大学学报》 CAS 2024年第3期141-151,共11页
蛋白邻近标记(proximity labeling,PL)技术是指通过融合特定的催化酶,实现对目标蛋白相互作用蛋白的原位标记,再采用质谱或测序分析鉴定标记蛋白。该技术能够在瞬时动态条件下精确识别蛋白质相互作用,是传统分析手段的重要补充,在蛋白... 蛋白邻近标记(proximity labeling,PL)技术是指通过融合特定的催化酶,实现对目标蛋白相互作用蛋白的原位标记,再采用质谱或测序分析鉴定标记蛋白。该技术能够在瞬时动态条件下精确识别蛋白质相互作用,是传统分析手段的重要补充,在蛋白质相互作用研究中具有广阔应用前景。本文介绍了各类PL酶的工作原理、分类及优缺点;论述了该技术在研究蛋白质与蛋白质相互作用中的应用;讨论了PL技术的优势、目前存在的问题和发展趋势,以期为该技术的应用提供参考。 展开更多
关键词 蛋白邻近标记 蛋白质-蛋白质相互作用 工具酶 研究进展
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蛋白质相互作用技术在分子水平的应用
3
作者 韩镌竹 杨文腰 高铎 《品牌与标准化》 2024年第6期181-183,共3页
基于蛋白复合物在钠离子通道相关疾病中的调控作用,本文综述了蛋白质相互作用构建蛋白质关系的网络和生物学通路中涉及的体内和体外相关检测方法,如酵母双杂交系统、双分子荧光互补、免疫共沉淀技术、融合蛋白Pull-Down技术、单分子下... 基于蛋白复合物在钠离子通道相关疾病中的调控作用,本文综述了蛋白质相互作用构建蛋白质关系的网络和生物学通路中涉及的体内和体外相关检测方法,如酵母双杂交系统、双分子荧光互补、免疫共沉淀技术、融合蛋白Pull-Down技术、单分子下拉、高通量蛋白质芯片、微生物质谱、串联亲和蛋白纯化,以及以生物信息学为主的研究方法,并通过相关检测技术在大分子蛋白复合物中的应用获得新的靶点。 展开更多
关键词 蛋白质-蛋白质相互作用 酵母双杂交系统 双分子荧光互补 免疫共沉淀技术 串联亲和蛋白纯化
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阿尔茨海默病中蛋白质相互作用对β-分泌酶的调节机制 被引量:1
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作者 刘聪聪 王培昌 王亚琦 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期54-61,共8页
阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease,AD)是一种慢性神经退行性疾病,目前尚无有效的治疗方案。AD发病机制十分复杂,学说众多,目前较为公认的仍然是淀粉样蛋白级联假说。该学说认为,淀粉样斑块在脑组织的沉积是AD发病的关键病理机制。β-... 阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease,AD)是一种慢性神经退行性疾病,目前尚无有效的治疗方案。AD发病机制十分复杂,学说众多,目前较为公认的仍然是淀粉样蛋白级联假说。该学说认为,淀粉样斑块在脑组织的沉积是AD发病的关键病理机制。β-分泌酶(β-site APP cleaving enzyme 1,BACE1)是淀粉样前体蛋白(amyloid precursor protein,APP)淀粉样降解途径中的限速酶,其降解产物β-淀粉样蛋白(β-amyloid protein,Aβ)是淀粉样斑块(amyloid plaques)的主要成分。AD患者大脑BACE1浓度和活性增加,是引起AD的重要因素。因此,探究BACE1生成及活性调节的影响因素不仅对于理解AD的发病机制至关重要,而且对于开发AD的新治疗靶点也有重要意义。蛋白质之间的相互作用在蛋白质参与的各种生物学过程中发挥着重要的作用,因而被广泛研究。BACE1的相互作用蛋白质可以通过直接结合、间接结合和参与各种细胞信号转导通路等方式直接或间接地在BACE1的转录、翻译、修饰与胞内运输等各个环节对BACE1进行调节,从而影响AD的发生与疾病的进程。本文将从BACE1的生物学功能,以及相互作用蛋白质对BACE1的转录、翻译、细胞内转运及其活性与降解的调节作用进行综述,探讨BACE1生理功能与活性的影响因素,以及BACE1互作蛋白质调控BACE1的作用机制,旨在为理解AD的发病机制以及药物研发提供新的思考。 展开更多
关键词 阿尔茨海默病 Β-分泌酶 相互作用蛋白质 调节机制
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基于特征的深度学习预测化合物-蛋白质相互作用的研究进展
5
作者 荣丹琪 王倩 +2 位作者 唐丽 司婉雨 赵鸿萍 《中国药科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期305-313,共9页
药物研发过程中,化合物-蛋白质相互作用(compound-protein interaction,CPI)预测是发现苗头化合物、药物重定位等研究的关键技术手段。近年来,深度学习被广泛应用于CPI研究,加速了药物发现中CPI预测的发展。本文重点讨论基于特征的CPI... 药物研发过程中,化合物-蛋白质相互作用(compound-protein interaction,CPI)预测是发现苗头化合物、药物重定位等研究的关键技术手段。近年来,深度学习被广泛应用于CPI研究,加速了药物发现中CPI预测的发展。本文重点讨论基于特征的CPI预测模型,首先,介绍了CPI预测中常见的数据库、化合物和蛋白质的典型特征表示方法。根据建模中的关键问题,从多模态和注意力机制两个方面,对基于特征的CPI预测模型展开论述。在此基础上,选取其中12个模型,在3个经典数据集上评估了模型在分类任务和回归任务中的性能。本文总结当前该领域面临的挑战,对未来的发展方向进行展望,为CPI预测方法进一步研究提供思路。 展开更多
关键词 深度学习 化合物-蛋白质相互作用 药物重定位 苗头化合物筛选
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糖-蛋白质相互作用 被引量:11
6
作者 黄毅 黄金花 +1 位作者 谢青季 姚守拙 《化学进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2008年第6期942-950,共9页
糖生物学被认为是生物化学领域"最后的前沿"。糖-蛋白质相互作用是信号传导、细胞黏附、病菌感染、受精、增殖、分化和免疫应答等很多细胞识别过程的基础,在生命科学中意义重大。本文综述了糖-凝集素特异性结合、细胞/细菌相... 糖生物学被认为是生物化学领域"最后的前沿"。糖-蛋白质相互作用是信号传导、细胞黏附、病菌感染、受精、增殖、分化和免疫应答等很多细胞识别过程的基础,在生命科学中意义重大。本文综述了糖-凝集素特异性结合、细胞/细菌相关的糖-蛋白质相互作用、基因表达的相关调节和基于凝集素媒介的药物导向治疗,以及糖-蛋白质相互作用研究的电化学、压电传感、光谱学、纳米技术、微阵列技术和生物传感器等方法和器件与相关的生物医学应用进展。 展开更多
关键词 -蛋白质相互作用 生物医学应用 糖化学
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偶氮羧Ⅰ-铽(Ⅲ)配合物与蛋白质相互作用的吸光光谱行为的研究及应用 被引量:4
7
作者 魏琴 李燕 +2 位作者 于海琴 李乐义 杜斌 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2005年第8期1175-1178,共4页
研究了偶氮羧Ⅰ-铽(Ⅲ) 与蛋白质的相互作用及其应用.在pH 1.20的HCl-KCl缓冲溶液中,蛋白质的加入使得偶氮羧Ⅰ-铽 (Ⅲ) 在510 nm 处的吸收峰峰值明显降低,且吸光度的变化与加入的蛋白质的浓度呈线性关系,于510 nm处测得摩尔吸光系数为... 研究了偶氮羧Ⅰ-铽(Ⅲ) 与蛋白质的相互作用及其应用.在pH 1.20的HCl-KCl缓冲溶液中,蛋白质的加入使得偶氮羧Ⅰ-铽 (Ⅲ) 在510 nm 处的吸收峰峰值明显降低,且吸光度的变化与加入的蛋白质的浓度呈线性关系,于510 nm处测得摩尔吸光系数为ε=7.75×105L/(mol·cm)-1,牛血清白蛋白在0~55 mg/L范围内符合朗伯-比尔定律.将此方法用于尿样和奶粉中蛋白质的测定,结果令人满意. 展开更多
关键词 偶氮羧Ⅰ-铽配合物 蛋白质 相互作用 吸光光谱 光谱探针
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表面等离子体共振技术在蛋白质-蛋白质相互作用研究中的应用 被引量:11
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作者 杨彦 戴宗 邹小勇 《分析测试学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第11期1344-1350,共7页
表面等离子共振(SPR)近年来迅速发展为用于分析生物分子相互作用的一项技术。该技术无需标记、特异性强、灵敏度高、样品用量小,可实现在线连续实时检测。目前SPR已被广泛应用于免疫学、蛋白质组学、药物筛选、细胞信号转导、受体/配体... 表面等离子共振(SPR)近年来迅速发展为用于分析生物分子相互作用的一项技术。该技术无需标记、特异性强、灵敏度高、样品用量小,可实现在线连续实时检测。目前SPR已被广泛应用于免疫学、蛋白质组学、药物筛选、细胞信号转导、受体/配体垂钓等领域。该文阐述了基于表面等离子体共振技术生物传感器的基本原理和技术流程,综述了SPR在蛋白质-蛋白质相互作用动力学研究、蛋白质结构及功能研究、蛋白质突变和碎片分析、信号转导中的应用以及SPR在蛋白质-蛋白质相互作用研究中的多项关键技术。指出SPR通过与光谱、电化学等多技术联用后,可以获得更加详实的信息。 展开更多
关键词 表面等离子体共振 蛋白质-蛋白质相互作用 综述
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蛋白质-蛋白质相互作用界面统计分析 被引量:3
9
作者 高莹 来鲁华 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第7期676-679,共4页
以作者开发的从蛋白质结合部位推导出其界面所具有的疏水性质和氢键性质的计算程序PP_SITE为基础,利用蛋白质结构数据库(PDB),对蛋白质-蛋白质相互作用界面进行了统计分析.从PDB中挑出非冗余的链间相互作用对,计算出这个数据集中所有链... 以作者开发的从蛋白质结合部位推导出其界面所具有的疏水性质和氢键性质的计算程序PP_SITE为基础,利用蛋白质结构数据库(PDB),对蛋白质-蛋白质相互作用界面进行了统计分析.从PDB中挑出非冗余的链间相互作用对,计算出这个数据集中所有链间界面的疏水和氢键相互作用特征.对得到的界面特征进行统计分析,寻找能够明显聚类的界面特征.结果表明,界面大小、氢键和疏水相互作用在界面所占比例以及疏水相互作用的集中程度可以作为分类的依据. 展开更多
关键词 蛋白质-蛋白质相互作用 PP_SITE程序 界面分类
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2,7-二氯荧光素与蛋白质相互作用的分光光度法研究 被引量:1
10
作者 罗英 何冀川 万怀龙 《光谱实验室》 CAS CSCD 2006年第5期1099-1102,共4页
首次采用分光光度法研究了模拟生理条件(pH7.4Tris-HCl缓冲溶液,离子强度I=0.1)下2,7-二氯荧光素与牛血清白蛋白(BSA)相互作用的情况。研究结果表明两者相互作用形成稳定的复合物,最大吸收波长为509nm,与2,7-二氯荧光素的最大吸收波长50... 首次采用分光光度法研究了模拟生理条件(pH7.4Tris-HCl缓冲溶液,离子强度I=0.1)下2,7-二氯荧光素与牛血清白蛋白(BSA)相互作用的情况。研究结果表明两者相互作用形成稳定的复合物,最大吸收波长为509nm,与2,7-二氯荧光素的最大吸收波长502nm比较,红移了7nm;两者之间主要通过静电引力结合,但并不排除疏水作用力和氢键;两者之间的结合数为32。 展开更多
关键词 2 7-二氯荧光素 蛋白质 分光光度法 相互作用
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基于元数据的异构蛋白质-蛋白质相互作用数据库整合 被引量:1
11
作者 张智 张正国 《中国生物医学工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期201-206,共6页
研究蛋白质-蛋白质相互作用是理解生命活动的基础。在蛋白质-蛋白质相互作用的研究过程中,产生了大量来源于实验和预测的数据。这些数据存储于彼此异构的数据库中。对上述异构数据库进行数据整合是实现共享和最大限度利用已有蛋白质-蛋... 研究蛋白质-蛋白质相互作用是理解生命活动的基础。在蛋白质-蛋白质相互作用的研究过程中,产生了大量来源于实验和预测的数据。这些数据存储于彼此异构的数据库中。对上述异构数据库进行数据整合是实现共享和最大限度利用已有蛋白质-蛋白质相互作用数据必须解决的关键问题。据此问题提出了基于元数据理论和查询转换方法的异构数据库整合方案,并构建了一个基于网络的蛋白质-蛋白质相互作用相关异构数据库的整合平台,成功实现了对9个蛋白质-蛋白质相互作用数据库的整合。 展开更多
关键词 蛋白质-蛋白质相互作用 异构数据库 数据整合 元数据
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甲胎蛋白和维生素K缺乏或拮抗剂-Ⅱ诱导的蛋白质对肝细胞癌的诊断价值
12
作者 余溪 夏益兰 沈林杰 《癌症进展》 2023年第18期2038-2040,2044,共4页
目的探讨甲胎蛋白(AFP)和维生素K缺乏或拮抗剂-Ⅱ诱导的蛋白质(PIVKA-Ⅱ)对肝细胞癌(HCC)的诊断价值。方法选取71例HCC患者作为观察组,另选取35例肝炎患者作为对照组。比较两组患者的一般资料及AFP、PIVKA-Ⅱ水平,并分析AFP、PIVKA-Ⅱ... 目的探讨甲胎蛋白(AFP)和维生素K缺乏或拮抗剂-Ⅱ诱导的蛋白质(PIVKA-Ⅱ)对肝细胞癌(HCC)的诊断价值。方法选取71例HCC患者作为观察组,另选取35例肝炎患者作为对照组。比较两组患者的一般资料及AFP、PIVKA-Ⅱ水平,并分析AFP、PIVKA-Ⅱ单独和联合检测对HCC的诊断价值。结果两组患者乙型肝炎e抗原(HBeAg)阳性情况比较,差异有统计学意义(P﹤0.01)。观察组患者AFP和PIVKA-Ⅱ水平均明显高于对照组,差异均有统计学意义(P﹤0.01)。AFP和PIVKA-Ⅱ联合检测诊断HCC的曲线下面积(AUC)最大,AFP单独检测诊断HCC的AUC最小。结论AFP和PIVKA-Ⅱ联合检测诊断HCC的应用价值高于AFP或PIVKA-Ⅱ单独检测。 展开更多
关键词 肝细胞癌 甲胎蛋白 维生素K缺乏或拮抗剂-Ⅱ诱导的蛋白质 诊断价值
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两种含1,3,4-噻二唑α-氨基膦酸酯与蛋白质弱相互作用的ESI-MS研究
13
作者 张宇虹 韩国胜 +2 位作者 武现丽 高伟霞 廖新成 《郑州大学学报(理学版)》 CAS 北大核心 2014年第4期73-77,共5页
用ESI-MS研究了两种含1,3,4-噻二唑α-氨基膦酸酯与蛋白质,包括溶菌酶、胰岛素和细胞色素c之间的非共价相互作用.结果表明,这两种含1,3,4-噻二唑α-氨基膦酸酯能与多种蛋白质形成非共价复合物,并且使溶液中蛋白质分子构象趋于收缩.对于... 用ESI-MS研究了两种含1,3,4-噻二唑α-氨基膦酸酯与蛋白质,包括溶菌酶、胰岛素和细胞色素c之间的非共价相互作用.结果表明,这两种含1,3,4-噻二唑α-氨基膦酸酯能与多种蛋白质形成非共价复合物,并且使溶液中蛋白质分子构象趋于收缩.对于同一种蛋白质,底物分子结构的细微差别会形成稳定性和计量比均有差别的复合物.对于同一种底物与不同蛋白质作用时,形成的复合物比例和稳定性有较大的差别. 展开更多
关键词 ESI-MS 1 3 4-噻二唑 Α-氨基膦酸酯 蛋白质 非共价相互作用
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分析蛋白质-蛋白质相互作用界面的新方法
14
作者 高莹 王任小 来鲁华 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第8期676-679,共4页
疏水性和氢键是蛋白质-蛋白质相互作用中的主要因素.提出一种新的计算方法,从蛋白受体的结合部位推导出蛋白配体相应部位应该具有的疏水性质和氢键性质.应用这种方法可以很容易地找出影响相互作用的关键残基,并且将界面的这两种特征用... 疏水性和氢键是蛋白质-蛋白质相互作用中的主要因素.提出一种新的计算方法,从蛋白受体的结合部位推导出蛋白配体相应部位应该具有的疏水性质和氢键性质.应用这种方法可以很容易地找出影响相互作用的关键残基,并且将界面的这两种特征用图形软件显示出来.在应用到实际蛋白-蛋白相互作用中时,发现它的用途并不限于此.它可以作为研究蛋白相互作用的一个基本工具. 展开更多
关键词 蛋白质-蛋白质相互作用 界面分析 相关突变 疏水性 氢键
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酵母中与α_1-肾上腺素受体C末端相互作用的蛋白质
15
作者 张坦 徐琦 +2 位作者 陈凤荣 韩启德 张幼怡 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第11期1538-1539,共2页
关键词 酵母 Α1-肾上腺素受体 C末端 相互作用 蛋白质 IgA肾病 慢性肾小球肾炎
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血液透析患者蛋白质-能量消耗风险预测模型的构建及验证
16
作者 丁明妹 曹丽霞 +2 位作者 葛星 刘燕 孔凌 《临床肾脏病杂志》 2024年第11期899-905,共7页
目的调查分析血液透析患者蛋白质-能量消耗(protein-energy wasting,PEW)的发生率和危险因素,并构建可视化的风险预测模型和预测性能验证。方法收集2020年2月至2023年2月在中国人民解放军东部战区总医院血液净化中心维持性血液透析患者... 目的调查分析血液透析患者蛋白质-能量消耗(protein-energy wasting,PEW)的发生率和危险因素,并构建可视化的风险预测模型和预测性能验证。方法收集2020年2月至2023年2月在中国人民解放军东部战区总医院血液净化中心维持性血液透析患者313例为研究对象,透析时间至少6个月,根据国际肾脏营养与代谢学会关于PEW的诊断标准分为PEW组125例和无PEW组188例。单因素比较两组患者的临床资料和血生化指标,并采用Logistic回归模型筛选PEW的危险因素,R软件建立列线图模型,采用Bootstrap法进行内部验证,绘制受试者工作特征曲线计算曲线下面积(area under curve,AUC)和C-指数评估模型的准确度,校准曲线评估一致性,Hosmer-Lemeshow检验判断拟合优度。结果单因素分析发现,PEW组女性和糖尿病增多,N末端B型利钠肽原(N terminal pro B type natriuretic peptide,NT-proBNP)和尿素清除指数增加,而受教育时间、体重指数、上臂肌围、膳食蛋白摄入量、白蛋白、血肌酐和尿素氮、总胆固醇(total cholesterol,TC)、维生素D和血红蛋白降低(P<0.05)。单因素和多因素回归分析显示,女性(OR=1.571,95%CI:1.060~2.330,P=0.023)和NT-proBNP(OR=1.493,95%CI:1.045~2.133,P=0.032)是PEW的危险因素,而TC(OR=0.820,95%CI:0.704~0.956,P=0.003)和维生素D(OR=0.882,95%CI:0.623~0.987,P<0.001)是保护因素。受试者工作特征曲线显示,列线图预测PEW的AUC为0.867(95%CI:0.812~0.952,P<0.001),C-指数为0.875。并且列线图有较好的一致性和拟合优度。结论维持性血液透析患者往往有较高的PEW发生风险,根据性别、NT-proBNP、TC和维生素D构建一款列线图模型,对指导临床评估PEW发生风险有较好的应用潜能。 展开更多
关键词 血液透析 蛋白质-能量消耗 列线图 N末端-脑利钠肽前体 总胆固醇 维生素D
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基于混合深度学习的蛋白质-多肽结合位点识别研究
17
作者 朱琪 郑美丽 张步忠 《安庆师范大学学报(自然科学版)》 2024年第3期101-106,共6页
蛋白质和多肽间的相互作用机制非常重要,且使用计算方法预测蛋白质-多肽相互作用位点能快速定位并有效降低研发成本。然而,现有模型预测两者结合位点的准确率不高,并且难以处理数据不平衡问题。基于此,本文提出了一个基于混合深度学习... 蛋白质和多肽间的相互作用机制非常重要,且使用计算方法预测蛋白质-多肽相互作用位点能快速定位并有效降低研发成本。然而,现有模型预测两者结合位点的准确率不高,并且难以处理数据不平衡问题。基于此,本文提出了一个基于混合深度学习策略的预测方法——ResPep。在数据集处理层面上,用K-means聚类算法对数据集中多数类样本下采样以平衡数据样本;在算法处理层面上,用残差网络、一维卷积神经网络和多头注意力网络来建立轻量级的混合深度学习模型,同时模型学习融入代价敏感性。结果表明,与多个现有方法相比,ResPep在公共测试数据集TS125上拥有更好的泛化性能。 展开更多
关键词 蛋白质-多肽 相互作用位点识别 深度学习 不平衡数据 蛋白质序列
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蛋白质-蛋白质相互作用及其抑制剂研究进展 被引量:2
18
作者 赵亚雪 唐赟 《生命科学》 CSCD 2007年第5期506-511,共6页
蛋白质-蛋白质相互作用在细胞活动和生命过程中扮演着非常重要的角色。基因调节、免疫应答、信号转导、细胞组装等等都离不开蛋白质-蛋白质的相互作用。近几年,靶向蛋白质-蛋白质相互作用及其抑制剂研究也逐渐成为研究的热点;但是蛋白... 蛋白质-蛋白质相互作用在细胞活动和生命过程中扮演着非常重要的角色。基因调节、免疫应答、信号转导、细胞组装等等都离不开蛋白质-蛋白质的相互作用。近几年,靶向蛋白质-蛋白质相互作用及其抑制剂研究也逐渐成为研究的热点;但是蛋白质复合物相互作用界面的一些特点和性质,如相互作用界面较大、结合界面较为平坦等,使蛋白质-蛋白质相互作用及其抑制剂研究充满了挑战。本文主要总结了蛋白质-蛋白质相互作用界面的一些性质和特点,分析了界面特性与其抑制剂设计的关系,并讨论了蛋白质-蛋白质相互作用的理论预测方法及其抑制剂的类型和特点,最后又通过实例说明了如何进行蛋白质-蛋白质相互作用抑制剂的设计。 展开更多
关键词 蛋白质-蛋白质相互作用 界面 抑制剂 设计
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一种改进的荧光共振能量转移方法分析同质二聚体内蛋白质-蛋白质相互作用(英文) 被引量:1
19
作者 韩福军 罗永峰 徐军 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第7期619-629,共11页
荧光共振能量转移(fluorescence resonance energy transfer ,FRET)技术日益广泛的应用于检测活细胞中分子内和分子间的相互作用.由于FRET仅发生于相互作用的供体和受体,即供体-受体复合物之间,所以检测的FRET信号必须经标准化处理以去... 荧光共振能量转移(fluorescence resonance energy transfer ,FRET)技术日益广泛的应用于检测活细胞中分子内和分子间的相互作用.由于FRET仅发生于相互作用的供体和受体,即供体-受体复合物之间,所以检测的FRET信号必须经标准化处理以去除供体受体比例和浓度的影响然后才能够进行FRET的比较研究.由于供体和受体的比例相同,分子内FRET的检测较为简单;而分子间FRET的检测存在更多的不确定因素,导致现有的方法很难精确定量.根据1类特殊的分子间相互作用,同质二聚体的独特特征,推导出供体-受体复合物的含量,进而开发了1种同质二聚体分子间FRET的精确定量的方法,以1种同质二聚体,雌激素受体α(estrogen receptor alpha ,ERα)为供体和受体对,通过和其它的方法比较,证实了该方法用于FRET检测可获得更可靠的结果. 展开更多
关键词 雌激素受体 荧光共振能量转移 标准化 同质二聚体 蛋白质-蛋白质相互作用
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蛋白质-蛋白质相互作用的实验检测方法 被引量:4
20
作者 孔文娜 周宓 +1 位作者 林海霞 王任小 《上海大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期106-116,共11页
生物体内的蛋白质分子常常通过与其他蛋白质分子发生相互作用来发挥其生物功能.因此,研究蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)对于阐明蛋白质分子的生物功能以及分子作用机理具有重要的意义.主要介绍基于生物物理... 生物体内的蛋白质分子常常通过与其他蛋白质分子发生相互作用来发挥其生物功能.因此,研究蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)对于阐明蛋白质分子的生物功能以及分子作用机理具有重要的意义.主要介绍基于生物物理和生物化学原理的检测蛋白质-蛋白质相互作用的实验研究方法,并对发展趋势做出展望. 展开更多
关键词 蛋白质-蛋白质相互作用 生物物理方法 生物化学方法
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