蚂蚁基因组DNA提取方法比较

对蚁科3种蚂蚁分别用SDS-蛋白酶K消化法和2种改进的盐提取法进行基因组总DNA的提取。结果表明,SDS-蛋白酶K消化法和饱和氯化钠提取法均能从标本获得基因组DNA;而乙酸钾提取法获得的DNA太少且纯度低,琼脂糖凝胶电泳DNA条带弥散现象严重。通过比较综合分析,蚂蚁DNA提取的最优方法是SDS-蛋白酶K消化法。

血清丙肝病毒RNA二种提取方法的比较

２４例抗－ＨＣＶ阳性的血清标本，同时以硫氰胍半字符热酚变性方法和蛋白酶ＫＩ肖化法裂解提取丙肝病毒ＲＮＡ（ＨＣＶＲＮＡ），并应用反转录半字符多聚酶链反应（ＲＴ－ＰＣＲ）和套式多聚酶链反应（Ｎｅｓｔ－ＰＣＲ）检测ＨＣＶＲＮＡ。结果表明，硫氰胍半字符热酚法明显优于蛋白酶Ｋ消化法。前者处理标本的阳性检出率为５８．３％，后者处理标本的阳性检出率为３３．３％（Ｐ＜０．０５）；前者操作步骤简便，在试剂的保存等方面优于后者。

拟步甲昆虫基因组DNA提取的比较研究

对拟步甲科 8种昆虫的新鲜标本及无水乙醇浸泡标本 ,分别用SDS 蛋白酶K消化法和乙酸钾抽提法进行基因组总DNA的提取 .经 5次重复实验 ,结果表明 ,用两种方法均能从新鲜标本中获得较完整的DNA ,且DNA得率较高 ;而对于无水乙醇保存的标本 ,提取出的DNA用琼脂糖凝胶电泳检测不出DNA条带 ,说明标本在保存过程中DNA可能发生了变化 ,致使提取出的DNA量太少或未分离出DNA .通过对比实验 ,分析原因 ,阐明了两种方法的优缺点 ,并提出了该类昆虫用于DNA提取的标本的保存方法 .

一种从蠕虫组织切片中提取DNA作PCR鉴定虫种的简便方法

目的建立一种实用于临床病理鉴别诊断组织切片内蠕虫虫种的分子病理学方法。方法制作已知的和从临床收集的多种蠕虫和宿主组织病理切片标本,用改良蛋白K消化法对各种蠕虫切片的白片、HE染色片和免疫组化片组织提取DNA;设计合成检测并殖吸虫、曼氏裂头蚴和猪囊虫各自特异性基因片段的引物,分别对各DNA提取物作PCR扩增,经凝胶电泳观察目的基因片段;比较分析三种蠕虫各自最小组织量检测的敏感性和特异性。结果对三种蠕虫所选用的引物均可扩增出清晰的特异性目的条带。用改良蛋白K消化法提取蠕虫DNA可PCR扩增出目的片段的敏感性均优于商品化试剂盒提取法,可提出DNA的最小组织面及厚度为:肺吸虫的为1.50 mm2,10μm;曼氏裂头蚴的为4.87 mm2,5μm;猪囊虫的为5.80 mm2,5μm。经10个临床标本检测均获得理想结果。结论本研究成功地探索出一种对病理切片中微量组织提取DNA作PCR鉴定虫种的简便方法,为病理诊断提供了进一步鉴别此3种蠕虫的分子病理学手段。

一种快速、经济提取外周凝血基因组DNA方法的建立

目的:建立一种经济、快速且高质量提取人体外周凝血DNA的方法。方法:摸索最佳的匀浆条件,对外周凝血块进行匀浆,采用KI法对匀浆液进行基因组DNA的提取,通过凝胶电泳、单重PCR和多重PCR检测凝血基因组DNA的提取产量和质量,并分别与常规的凝血基因组DNA提取方法,即蛋白酶K消化法,以及提取抗凝血基因组DNA的KI法进行比较分析。结果:最佳的匀浆条件为:39000 rmp,15秒。在此条件下提取的基因组DNA完整性好,纯度和产量与蛋白酶K消化法提取凝血DNA和KI法提取抗凝血DNA的结果相比,没有统计学差异。单重PCR和多重PCR也获得了理想的扩增结果。结论:与常规的外周凝血提取方法相比(蛋白酶K消化法),本方法节省了时间和成本,能快速、经济、有效地提取外周凝血基因组DNA,可用于后续的科研和临床诊断需要,解决了部分科研机构血液基因组DNA的样本来源问题。