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基于PubMLST数据库分析蜡样芽胞杆菌群的遗传学
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作者 万经 赵炜 +2 位作者 崔颖 毛展 周帼萍 《中国酿造》 CAS 北大核心 2019年第5期164-168,共5页
以蜡样芽胞杆菌(Bacillus cereus)PubMLST数据库为数据来源,通过Phyloviz、Mega和IQ-tree软件研究蜡样芽胞杆菌群的遗传学。结果表明,筛选后得到1 329株完整的蜡样芽胞杆菌群的菌株信息,其中蜡样芽胞杆菌(B. cereus)及变种864株、苏云... 以蜡样芽胞杆菌(Bacillus cereus)PubMLST数据库为数据来源,通过Phyloviz、Mega和IQ-tree软件研究蜡样芽胞杆菌群的遗传学。结果表明,筛选后得到1 329株完整的蜡样芽胞杆菌群的菌株信息,其中蜡样芽胞杆菌(B. cereus)及变种864株、苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis)及变种345株、炭疽芽胞杆菌(Bacillus anthracis)61株、韦氏芽胞杆菌(Bacillus weihenstephanensis)、蕈状芽胞杆菌(Bacillus mycoides)、假蕈状芽胞杆菌(Bacillus pseudomycoides)分别为33、21和5株。群内占比很高的蜡样芽胞杆菌和苏云金芽胞杆菌具有丰富而复杂的遗传多样性,相互交织地散布于群内几乎所有的进化分支上,两者无法区分;炭疽芽胞杆菌在进化树上位于相对独立而保守的一个分支;韦氏芽胞杆菌与蕈状芽胞杆菌虽然在菌落形态上差异很大,但两者在系统进化树上位于同一个分支,同源性极高。 展开更多
关键词 蜡样芽胞杆菌群 PubMLST数据库 多位点序列分型 体遗传学分析
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蜡样芽胞杆菌群分类学研究进展 被引量:1
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作者 张慧娟 李伟 魏建春 《疾病监测》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期355-362,共8页
蜡样芽胞杆菌群由蜡样芽胞杆菌及其近缘菌组成,该群内菌种由于在表型特征和基因特征上高度相似,使该群菌分类和鉴定复杂且难以统一。随着分子生物学和基因组学的发展,该群分类学研究发展迅速,目前已形成了表型、基因组以及将表型和基因... 蜡样芽胞杆菌群由蜡样芽胞杆菌及其近缘菌组成,该群内菌种由于在表型特征和基因特征上高度相似,使该群菌分类和鉴定复杂且难以统一。随着分子生物学和基因组学的发展,该群分类学研究发展迅速,目前已形成了表型、基因组以及将表型和基因组特征相结合的基因种/亚种/生物变种方法等几种分类框架。本研究就近年来蜡样芽胞杆菌群分类学研究进展进行综述。 展开更多
关键词 蜡样芽胞杆菌群 分类学 研究进展
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rpoB作为蜡样芽胞杆菌群快速检测的标志基因的实验研究 被引量:4
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作者 朱诗应 何胜菲 +3 位作者 王文博 赵平 任浩 戚中田 《热带医学杂志》 CAS 2012年第10期1171-1174,共4页
目的探讨常规PCR和实时荧光定量PCR(Q-PCR)方法检测蜡样芽胞杆菌群rpoB基因的特异性和敏感性。方法提取蜡样芽胞杆菌群和其他各种对照细菌的基因组DNA,合成蜡样芽胞杆菌群rpoB基因扩增引物,采用常规PCR和SYBRgreen实时定量PCR两种方法扩... 目的探讨常规PCR和实时荧光定量PCR(Q-PCR)方法检测蜡样芽胞杆菌群rpoB基因的特异性和敏感性。方法提取蜡样芽胞杆菌群和其他各种对照细菌的基因组DNA,合成蜡样芽胞杆菌群rpoB基因扩增引物,采用常规PCR和SYBRgreen实时定量PCR两种方法扩增rpoB基因片段,并将PCR产物克隆到pMD18-T载体后进行DNA测序。结果常规PCR和Q-PCR均能扩增出蜡样芽胞杆菌群rpoB基因的174bpDNA片段,而各种对照菌株均未见扩增。序列比对发现蜡样芽胞杆菌群细菌在该片段中存在5处核苷酸的不同,差异率为2.88%。以炭疽芽胞杆菌基因组DNA系列稀释作为扩增模板显示常规PCR最小检出量为3.42pg,Q-PCR的敏感性达到171fg,3次重复实验显示Q-PCR检测rpoB基因的灵敏度为(3.32×101±7.45×100)拷贝。结论以rpoB基因为检测靶基因的Q-PCR方法具有高度的特异性和良好的敏感性,能实现对蜡样芽胞杆菌群快速而准确的检测。 展开更多
关键词 蜡样芽胞杆菌群 RPOB基因 实时定量PCR
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Analysis and Evaluation of Microbial Contamination of Raw Beef in Supermarkets in Phnom Penh
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作者 Sarin Neang Vouchsim Kong Rithy Chrun Borarin Buntong Kuyhor Te Vichet Chep 《Journal of Food Science and Engineering》 2013年第2期94-98,共5页
The study focused on analysis and evaluation of microbial contamination of raw beef was designed to (1) determine the presence of foodborne pathogens in raw beef; (2) compare the prevalence of microbial contaminat... The study focused on analysis and evaluation of microbial contamination of raw beef was designed to (1) determine the presence of foodborne pathogens in raw beef; (2) compare the prevalence of microbial contamination among the three supermarkets, and (3) evaluate the sanitary quality of raw beef products. Also, six kind of microorganisms including Total Plate Count, Total Coliform and Fecal Coliform, which represented sanitary quality and E. coli, S. Aureus and B. cereus, which determined the presence of foodborne pathogens, were analyzed. The procedures used to analyse experimental samples taken from three supermarket (in every one week for three weeks) in Phnom Penh were based on Merck's study in 2005. The results had shown that there were no significant differences in Total Plate Counts, Total Coliform and Fecal Coliform in all samples, and they were found in unacceptable numbers in the raw beef products. However, the prevalence of foodborne pathogens including E. coli, S. aureus and B. cereus were found in acceptable numbers. Furthermore, the samples taken from the second supermarket had the highest level of microbial contamination among the three supermarkets, while the samples taken from the first supermarket had the lowest level of microbial contamination. This experimental finding demonstrated the need for sanitary improvement in the beef retails markets and strict sanitary guideline and implementation of these practices could guarantee consumers' health by consuming raw beefs with the lowest risk of foodborne pathogens. 展开更多
关键词 Raw beef microbial contamination foodborne pathogen sanitary quality foodbome pathogenic quality.
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