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蝙蝠蛾鳞翅虫草Samsoniella hepiali模式菌株线粒体基因组系统发育分析
被引量:
1
1
作者
孙涛
李天昊
+6 位作者
黄偶
祝孔福
陈思琪
王雅南
王垚
王元兵
虞泓
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第10期1572-1584,共13页
蝙蝠蛾鳞翅虫草Samsoniellahepiali是重要的药用虫生真菌,根据现代分类系统,隶属于虫草科Cordycipitaceae鳞翅虫草属Samsoniella。本研究对蝙蝠蛾鳞翅虫草模式菌株(ICMM82-2)线粒体基因组进行测序、组装和注释,发现其线粒体基因组成闭...
蝙蝠蛾鳞翅虫草Samsoniellahepiali是重要的药用虫生真菌,根据现代分类系统,隶属于虫草科Cordycipitaceae鳞翅虫草属Samsoniella。本研究对蝙蝠蛾鳞翅虫草模式菌株(ICMM82-2)线粒体基因组进行测序、组装和注释,发现其线粒体基因组成闭合环状,大小为24246bp。基因区域占比为85.10%,共编码42个基因,包括15个蛋白质编码基因(PCGs)、2个rRNA基因和25个tRNA基因。15个PCGs均以ATG为起始密码子,以TAA为终止密码子,偏好密码子为UUA。各氨基酸使用频率具有较大差异,其中亮氨酸(Leu)出现频率最高。25个tRNA基因可转运全部20种氨基酸,其中19个tRNA基因二级结构为三叶草结构。本研究基于线粒体基因组中14个PCGs基因串联数据集,构建肉座菌目6科50个物种的系统发育树,进一步证实蝙蝠蛾鳞翅虫草模式菌株系统发育位置隶属于肉座菌目Hypocreales虫草科Cordycipitaceae鳞翅虫草属Samsoniella。通过虫草科线粒体基因组共线性分析,发现其中12个物种有5个同源区,3个物种存在6个同源区,同源区域A和B长度变异较大。与其他虫草科物种相比,蝙蝠蛾鳞翅虫草线粒体基因组较小,同源区域相对较短。蝙蝠蛾鳞翅虫草模式菌株线粒体基因组信息有助于鉴别其物种特异性,确定其系统发育关系,将为虫草系统发育研究提供新思路,为继续研究鳞翅虫草属物种药用价值提供系统发育依据。
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关键词
蝙蝠蛾鳞翅虫草
虫草
科
线粒体基因组
系统发育
原文传递
题名
蝙蝠蛾鳞翅虫草Samsoniella hepiali模式菌株线粒体基因组系统发育分析
被引量:
1
1
作者
孙涛
李天昊
黄偶
祝孔福
陈思琪
王雅南
王垚
王元兵
虞泓
机构
云南大学生态与环境学院云百草实验室
云南大学生命科学学院
中国中医科学院中药资源中心道地药材国家重点实验室培育基地
出处
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第10期1572-1584,共13页
基金
国家自然科学基金(31870017)
云南省科技厅项目[2018FY001(-006)]。
文摘
蝙蝠蛾鳞翅虫草Samsoniellahepiali是重要的药用虫生真菌,根据现代分类系统,隶属于虫草科Cordycipitaceae鳞翅虫草属Samsoniella。本研究对蝙蝠蛾鳞翅虫草模式菌株(ICMM82-2)线粒体基因组进行测序、组装和注释,发现其线粒体基因组成闭合环状,大小为24246bp。基因区域占比为85.10%,共编码42个基因,包括15个蛋白质编码基因(PCGs)、2个rRNA基因和25个tRNA基因。15个PCGs均以ATG为起始密码子,以TAA为终止密码子,偏好密码子为UUA。各氨基酸使用频率具有较大差异,其中亮氨酸(Leu)出现频率最高。25个tRNA基因可转运全部20种氨基酸,其中19个tRNA基因二级结构为三叶草结构。本研究基于线粒体基因组中14个PCGs基因串联数据集,构建肉座菌目6科50个物种的系统发育树,进一步证实蝙蝠蛾鳞翅虫草模式菌株系统发育位置隶属于肉座菌目Hypocreales虫草科Cordycipitaceae鳞翅虫草属Samsoniella。通过虫草科线粒体基因组共线性分析,发现其中12个物种有5个同源区,3个物种存在6个同源区,同源区域A和B长度变异较大。与其他虫草科物种相比,蝙蝠蛾鳞翅虫草线粒体基因组较小,同源区域相对较短。蝙蝠蛾鳞翅虫草模式菌株线粒体基因组信息有助于鉴别其物种特异性,确定其系统发育关系,将为虫草系统发育研究提供新思路,为继续研究鳞翅虫草属物种药用价值提供系统发育依据。
关键词
蝙蝠蛾鳞翅虫草
虫草
科
线粒体基因组
系统发育
Keywords
Samsoniella hepiali
Cordycipitaceae
mitochondrial genome
phylogenetic analysis
分类号
S567.3 [农业科学—中草药栽培]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
蝙蝠蛾鳞翅虫草Samsoniella hepiali模式菌株线粒体基因组系统发育分析
孙涛
李天昊
黄偶
祝孔福
陈思琪
王雅南
王垚
王元兵
虞泓
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
1
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