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E2A-PBX1融合基因阳性的儿童急性淋巴细胞白血病携带变异型融合转录本
被引量:
2
1
作者
李志刚
赵玮
+1 位作者
吴敏媛
胡亚美
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
2006年第3期516-520,共5页
为了研究儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)中E2A-PBX1融合基因的表达,采用位于E2A基因不同位置的上游引物与下游PBX1引物,检测了410例儿童ALL,包括362例B细胞ALL和48例T细胞ALL。结果发现:17例患儿携带E2A-PBX1融合基因,检出率4.1%,且全部为...
为了研究儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)中E2A-PBX1融合基因的表达,采用位于E2A基因不同位置的上游引物与下游PBX1引物,检测了410例儿童ALL,包括362例B细胞ALL和48例T细胞ALL。结果发现:17例患儿携带E2A-PBX1融合基因,检出率4.1%,且全部为B细胞ALL,而且所有阳性病例均表达一种变异型融合转录本,后者是由E2A基因的第13外显子(159bp)被差异剪切形成的。经BLASTn比对分析,这种转录本保持了原来的开放阅读框,但导致53个氨基酸残基的丢失。这53个氨基酸残基位于活化区2,会导致融合蛋白中部分环-螺旋结构以及全部七聚体亮氨酸重复序列的丢失。结论:携带E2A-PBX1融合基因的儿童ALL表达典型和变异型2种融合转录本,后者是由E2A基因第13外显子被差异剪切而形成的,它将导致融合蛋白中53个氨基酸残基及其所构成的部分环-螺旋结构以及全部七聚体亮氨酸重复序列的丢失。
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关键词
急性淋巴细胞白血病
E2A-PBX1
融合
基因
变异
型
融合
转录本
活化区2
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职称材料
群体基因组结构变异检测工作流
被引量:
1
2
作者
曹舒淇
刘诗琦
姜涛
《生物信息学》
2021年第4期232-239,共8页
结构变异作为人类基因组上的一种大规模的变异类型,对分子与细胞进程、调节功能、基因表达调控、个体表型具有重要的影响,检测群体中基因组结构变异有助于绘制群体基因组变异图谱,刻画群体遗传进化特征,为疾病诊治、精准医疗的发展提供...
结构变异作为人类基因组上的一种大规模的变异类型,对分子与细胞进程、调节功能、基因表达调控、个体表型具有重要的影响,检测群体中基因组结构变异有助于绘制群体基因组变异图谱,刻画群体遗传进化特征,为疾病诊治、精准医疗的发展提供支撑。本研究提出一种面向高通量测序的群体基因组结构变异检测工作流,该工作流通过使用多种高性能基因组结构变异检测算法实现全面、精准的结构变异挖掘,使用多层融合与过滤获得高精度群体结构变异候选集合,利用基因型重新校正、变异修剪、类型校对,最终完整绘制群体基因组结构变异图谱。基于该工作流对由267个样本组成的人群进行群体结构变异检测,检测出了96202个结构变异,其变异种类和频率分布与其他国际基因组计划相符,这些结果证明了本工作流具有良好的群体结构变异检测能力。同时,工作流通过并行的方式在内存可控的基础上显著降低了分析时间,为大规模人群基因组结构变异的高效检测提供了重要支撑。
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关键词
群体基因组
结构
变异
变异
检测
变异
融合
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职称材料
甲状腺结节良恶性的分子分型研究
被引量:
2
3
作者
李浩榕
韩如来
+1 位作者
郁丹燕
叶蕾
《内科理论与实践》
2023年第4期266-269,共4页
目的:建立用于甲状腺结节分子分型的二代靶向测序方案。方法:基于生物素化探针靶向捕获和高通量测序技术,对112个甲状腺结节相关基因进行靶向测序,建立用于甲状腺结节分子分型与分化水平的二代靶向测序方案,甲状腺结节Panel(ThyNod Pan...
目的:建立用于甲状腺结节分子分型的二代靶向测序方案。方法:基于生物素化探针靶向捕获和高通量测序技术,对112个甲状腺结节相关基因进行靶向测序,建立用于甲状腺结节分子分型与分化水平的二代靶向测序方案,甲状腺结节Panel(ThyNod Panel,甲结Panel)。基因包括甲状腺良性结节相关基因、甲状腺恶性肿瘤相关基因、甲状腺发育和功能基因、细胞来源标志基因等,检测目的基因碱基替换、插入缺失、拷贝数变异和融合等突变类型以及基因表达水平。使用甲结Panel对良恶性甲状腺结节进行分子分型。结果:成功构建并应用甲结Panel,完成856例良恶性甲状腺结节检测。其中676例甲状腺结节检出意义明确的突变,占比79.0%。627例甲状腺结节病理诊断明确,良性结节占比17.6%。甲状腺恶性肿瘤病理类型包括经典性乳头状癌、滤泡亚型乳头状癌、髓样癌等。最常见的突变检出基因为BRAF(n=426),其次是RET(n=68),RET/PTC融合(n=68),DICER1(n=35),还有端粒酶逆转录酶(telomerase reverse transcriptase,TERT)(n=35)、HRAS(n=24)、NRAS(n=23)、神经营养酪氨酸受体激酶(neurotrophin receptor kinase,NTRK3)融合基因(n=19)、真核翻译起始因子1A,X染色体(eukaryotic translation initiation factor 1A,X-chromosomal,EIF1AX)基因(n=11)等。对检出突变统计结节恶性率,BRAF V600E、RET融合变异等结节恶性比例高于90.0%,而RAS-类变异恶性率仅为18.9%。结论:甲结Panel可有效进行甲状腺结节的分子分型。
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关键词
甲状腺结节
甲状腺结节Panel
靶向测序
融合变异
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职称材料
论语素的大小与层级、融合与变异
被引量:
13
4
作者
苏宝荣
《中国语文》
CSSCI
北大核心
2007年第3期266-271,共6页
语素不仅是语法形式的底层,也是语义结构的底层,语素在语义学、特别是汉语词汇学研究中占有极其重要的位置。而目前人们对语素自身的性质、特征的认识及对其功能与变化的分析,还相当笼统。语素分析是区分汉语中复音单纯词(主要是联绵词...
语素不仅是语法形式的底层,也是语义结构的底层,语素在语义学、特别是汉语词汇学研究中占有极其重要的位置。而目前人们对语素自身的性质、特征的认识及对其功能与变化的分析,还相当笼统。语素分析是区分汉语中复音单纯词(主要是联绵词)与合成词(主要是复合词)、以及认识合成词词义的关键。为了正确地进行语素分析,必须注意到以下两个方面:一是语素本身也存在一个大小、层级问题;二是语素在组合成复合词的过程中还存在一个融合与变异的问题。
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关键词
语素
大小与层级
融合
与
变异
原文传递
论满汉音乐的融合与发展
5
作者
赵德生
《作家》
北大核心
2013年第12X期216-217,共2页
随着满族人民迁入关内与汉族人民共同生活,在与汉族人民生活、语言、文化环境的交融过程中,便形成了与汉族文化相互借鉴、吸收的格局。满汉两族之间音乐的相互交融相互借鉴由来已久,从早期的宫廷音乐以及宗教祭祀等礼仪音乐都互取所长,...
随着满族人民迁入关内与汉族人民共同生活,在与汉族人民生活、语言、文化环境的交融过程中,便形成了与汉族文化相互借鉴、吸收的格局。满汉两族之间音乐的相互交融相互借鉴由来已久,从早期的宫廷音乐以及宗教祭祀等礼仪音乐都互取所长,这种交融不但促进了两个民族间音乐的繁荣与兴盛,而且对两个民族间的音乐文化也起到了推广与促进作用,这种民族间的音乐融合,体现了满族音乐海纳百川的学习姿态,因而在一定程度上增强了满族音乐文化的兴盛与发展,这是历史发展的必然结果,也是音乐文化随历史进步的必然选择。
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关键词
民间音乐
宗教祭祀与宫廷音乐
音调
融合
与曲调
变异
萨满教音乐
原文传递
满汉民族音乐艺术的多元交融
被引量:
1
6
作者
崔伟
《民族艺术》
CSSCI
北大核心
2010年第4期128-131,共4页
满族和汉族在民间音乐、宗教祭祀音乐和宫廷音乐等传统唱腔音乐诸方面的互为吸收和融合,表明了民族生态文化(含音乐文化)的相互融合,是一个历史发展的必然趋势,是一种正常现象。各民族的音乐文化,就是在这种环境下不断地丰富自己,完善自...
满族和汉族在民间音乐、宗教祭祀音乐和宫廷音乐等传统唱腔音乐诸方面的互为吸收和融合,表明了民族生态文化(含音乐文化)的相互融合,是一个历史发展的必然趋势,是一种正常现象。各民族的音乐文化,就是在这种环境下不断地丰富自己,完善自己,从而得到发展和繁荣。
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关键词
民间音乐
宗教祭祀与宫廷音乐
音调
融合
与曲调
变异
萨满教音乐
原文传递
题名
E2A-PBX1融合基因阳性的儿童急性淋巴细胞白血病携带变异型融合转录本
被引量:
2
1
作者
李志刚
赵玮
吴敏媛
胡亚美
机构
首都医科大学附属北京儿童医院血液病中心
出处
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
2006年第3期516-520,共5页
文摘
为了研究儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)中E2A-PBX1融合基因的表达,采用位于E2A基因不同位置的上游引物与下游PBX1引物,检测了410例儿童ALL,包括362例B细胞ALL和48例T细胞ALL。结果发现:17例患儿携带E2A-PBX1融合基因,检出率4.1%,且全部为B细胞ALL,而且所有阳性病例均表达一种变异型融合转录本,后者是由E2A基因的第13外显子(159bp)被差异剪切形成的。经BLASTn比对分析,这种转录本保持了原来的开放阅读框,但导致53个氨基酸残基的丢失。这53个氨基酸残基位于活化区2,会导致融合蛋白中部分环-螺旋结构以及全部七聚体亮氨酸重复序列的丢失。结论:携带E2A-PBX1融合基因的儿童ALL表达典型和变异型2种融合转录本,后者是由E2A基因第13外显子被差异剪切而形成的,它将导致融合蛋白中53个氨基酸残基及其所构成的部分环-螺旋结构以及全部七聚体亮氨酸重复序列的丢失。
关键词
急性淋巴细胞白血病
E2A-PBX1
融合
基因
变异
型
融合
转录本
活化区2
Keywords
ALL
E2A-PBXI fusion gene
variant type of fusion transcript
2nd activation domain
分类号
R733.71 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
群体基因组结构变异检测工作流
被引量:
1
2
作者
曹舒淇
刘诗琦
姜涛
机构
哈尔滨工业大学计算学部
出处
《生物信息学》
2021年第4期232-239,共8页
基金
国家重点研发项目(No.2017YFC0907503)
国家自然科学基金项目(No.32000467).
文摘
结构变异作为人类基因组上的一种大规模的变异类型,对分子与细胞进程、调节功能、基因表达调控、个体表型具有重要的影响,检测群体中基因组结构变异有助于绘制群体基因组变异图谱,刻画群体遗传进化特征,为疾病诊治、精准医疗的发展提供支撑。本研究提出一种面向高通量测序的群体基因组结构变异检测工作流,该工作流通过使用多种高性能基因组结构变异检测算法实现全面、精准的结构变异挖掘,使用多层融合与过滤获得高精度群体结构变异候选集合,利用基因型重新校正、变异修剪、类型校对,最终完整绘制群体基因组结构变异图谱。基于该工作流对由267个样本组成的人群进行群体结构变异检测,检测出了96202个结构变异,其变异种类和频率分布与其他国际基因组计划相符,这些结果证明了本工作流具有良好的群体结构变异检测能力。同时,工作流通过并行的方式在内存可控的基础上显著降低了分析时间,为大规模人群基因组结构变异的高效检测提供了重要支撑。
关键词
群体基因组
结构
变异
变异
检测
变异
融合
Keywords
Population genomes
Structural variation
Variation detection
Variant integration
分类号
TP399 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
甲状腺结节良恶性的分子分型研究
被引量:
2
3
作者
李浩榕
韩如来
郁丹燕
叶蕾
机构
上海交通大学医学院附属瑞金医院内分泌代谢科、上海市内分泌代谢病研究所、国家代谢性疾病临床医学研究中心(上海)、国家卫健委内分泌代谢病重点实验室、上海市内分泌肿瘤重点实验室
出处
《内科理论与实践》
2023年第4期266-269,共4页
基金
国家自然科学基金项目(项目编号:92059106、82141115)。
文摘
目的:建立用于甲状腺结节分子分型的二代靶向测序方案。方法:基于生物素化探针靶向捕获和高通量测序技术,对112个甲状腺结节相关基因进行靶向测序,建立用于甲状腺结节分子分型与分化水平的二代靶向测序方案,甲状腺结节Panel(ThyNod Panel,甲结Panel)。基因包括甲状腺良性结节相关基因、甲状腺恶性肿瘤相关基因、甲状腺发育和功能基因、细胞来源标志基因等,检测目的基因碱基替换、插入缺失、拷贝数变异和融合等突变类型以及基因表达水平。使用甲结Panel对良恶性甲状腺结节进行分子分型。结果:成功构建并应用甲结Panel,完成856例良恶性甲状腺结节检测。其中676例甲状腺结节检出意义明确的突变,占比79.0%。627例甲状腺结节病理诊断明确,良性结节占比17.6%。甲状腺恶性肿瘤病理类型包括经典性乳头状癌、滤泡亚型乳头状癌、髓样癌等。最常见的突变检出基因为BRAF(n=426),其次是RET(n=68),RET/PTC融合(n=68),DICER1(n=35),还有端粒酶逆转录酶(telomerase reverse transcriptase,TERT)(n=35)、HRAS(n=24)、NRAS(n=23)、神经营养酪氨酸受体激酶(neurotrophin receptor kinase,NTRK3)融合基因(n=19)、真核翻译起始因子1A,X染色体(eukaryotic translation initiation factor 1A,X-chromosomal,EIF1AX)基因(n=11)等。对检出突变统计结节恶性率,BRAF V600E、RET融合变异等结节恶性比例高于90.0%,而RAS-类变异恶性率仅为18.9%。结论:甲结Panel可有效进行甲状腺结节的分子分型。
关键词
甲状腺结节
甲状腺结节Panel
靶向测序
融合变异
Keywords
Thyroid nodules
ThyNod Panel
Target sequencing
Fusion
分类号
R581 [医药卫生—内分泌]
下载PDF
职称材料
题名
论语素的大小与层级、融合与变异
被引量:
13
4
作者
苏宝荣
机构
河北师范大学
出处
《中国语文》
CSSCI
北大核心
2007年第3期266-271,共6页
文摘
语素不仅是语法形式的底层,也是语义结构的底层,语素在语义学、特别是汉语词汇学研究中占有极其重要的位置。而目前人们对语素自身的性质、特征的认识及对其功能与变化的分析,还相当笼统。语素分析是区分汉语中复音单纯词(主要是联绵词)与合成词(主要是复合词)、以及认识合成词词义的关键。为了正确地进行语素分析,必须注意到以下两个方面:一是语素本身也存在一个大小、层级问题;二是语素在组合成复合词的过程中还存在一个融合与变异的问题。
关键词
语素
大小与层级
融合
与
变异
Keywords
morpheme
size and hierarchy
blending and variation
分类号
H14 [语言文字—汉语]
原文传递
题名
论满汉音乐的融合与发展
5
作者
赵德生
机构
牡丹江师范学院音乐与舞蹈学院
出处
《作家》
北大核心
2013年第12X期216-217,共2页
文摘
随着满族人民迁入关内与汉族人民共同生活,在与汉族人民生活、语言、文化环境的交融过程中,便形成了与汉族文化相互借鉴、吸收的格局。满汉两族之间音乐的相互交融相互借鉴由来已久,从早期的宫廷音乐以及宗教祭祀等礼仪音乐都互取所长,这种交融不但促进了两个民族间音乐的繁荣与兴盛,而且对两个民族间的音乐文化也起到了推广与促进作用,这种民族间的音乐融合,体现了满族音乐海纳百川的学习姿态,因而在一定程度上增强了满族音乐文化的兴盛与发展,这是历史发展的必然结果,也是音乐文化随历史进步的必然选择。
关键词
民间音乐
宗教祭祀与宫廷音乐
音调
融合
与曲调
变异
萨满教音乐
分类号
J607 [艺术—音乐]
原文传递
题名
满汉民族音乐艺术的多元交融
被引量:
1
6
作者
崔伟
机构
湖州师范学院艺术学院副
出处
《民族艺术》
CSSCI
北大核心
2010年第4期128-131,共4页
文摘
满族和汉族在民间音乐、宗教祭祀音乐和宫廷音乐等传统唱腔音乐诸方面的互为吸收和融合,表明了民族生态文化(含音乐文化)的相互融合,是一个历史发展的必然趋势,是一种正常现象。各民族的音乐文化,就是在这种环境下不断地丰富自己,完善自己,从而得到发展和繁荣。
关键词
民间音乐
宗教祭祀与宫廷音乐
音调
融合
与曲调
变异
萨满教音乐
分类号
J607 [艺术—音乐]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
E2A-PBX1融合基因阳性的儿童急性淋巴细胞白血病携带变异型融合转录本
李志刚
赵玮
吴敏媛
胡亚美
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
2006
2
下载PDF
职称材料
2
群体基因组结构变异检测工作流
曹舒淇
刘诗琦
姜涛
《生物信息学》
2021
1
下载PDF
职称材料
3
甲状腺结节良恶性的分子分型研究
李浩榕
韩如来
郁丹燕
叶蕾
《内科理论与实践》
2023
2
下载PDF
职称材料
4
论语素的大小与层级、融合与变异
苏宝荣
《中国语文》
CSSCI
北大核心
2007
13
原文传递
5
论满汉音乐的融合与发展
赵德生
《作家》
北大核心
2013
0
原文传递
6
满汉民族音乐艺术的多元交融
崔伟
《民族艺术》
CSSCI
北大核心
2010
1
原文传递
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