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螯虾次目功能基因密码子偏好性研究
被引量:
5
1
作者
李喜莲
杨元杰
+2 位作者
李倩
刘金殿
顾志敏
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2014年第4期862-867,共6页
以螯虾次目功能基因组中的208个蛋白质编码基因序列为数据来源,应用CodonW 1.4软件对螯虾次目功能基因中密码子组成、同义密码子使用频率、密码子3个位置的G+C含量、有效密码子数等进行分析。结果显示,螯虾次目密码子第三位的G+C含量明...
以螯虾次目功能基因组中的208个蛋白质编码基因序列为数据来源,应用CodonW 1.4软件对螯虾次目功能基因中密码子组成、同义密码子使用频率、密码子3个位置的G+C含量、有效密码子数等进行分析。结果显示,螯虾次目密码子第三位的G+C含量明显高于第一/二位,表现出对以G或C碱基结尾的密码子的偏好性使用,并确定了9个螯虾次目最优密码子。上述研究结果为今后螯虾次目新基因的发现、功能基因表达调控研究、蛋白质结构和功能预测、以及与其他虾类的比较基因组学研究、螯虾分子标记育种等提供了理论基础。
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关键词
螯虾次目
密码子偏好性
最优密码子
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职称材料
题名
螯虾次目功能基因密码子偏好性研究
被引量:
5
1
作者
李喜莲
杨元杰
李倩
刘金殿
顾志敏
机构
浙江省淡水水产研究所
出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2014年第4期862-867,共6页
基金
公益性行业(农业)科研专项经费项目(201003070)
湖州市自然科学基金项目(2012YZ09)
文摘
以螯虾次目功能基因组中的208个蛋白质编码基因序列为数据来源,应用CodonW 1.4软件对螯虾次目功能基因中密码子组成、同义密码子使用频率、密码子3个位置的G+C含量、有效密码子数等进行分析。结果显示,螯虾次目密码子第三位的G+C含量明显高于第一/二位,表现出对以G或C碱基结尾的密码子的偏好性使用,并确定了9个螯虾次目最优密码子。上述研究结果为今后螯虾次目新基因的发现、功能基因表达调控研究、蛋白质结构和功能预测、以及与其他虾类的比较基因组学研究、螯虾分子标记育种等提供了理论基础。
关键词
螯虾次目
密码子偏好性
最优密码子
Keywords
Astacidea
codon bias
optimal codon
分类号
Q38 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
螯虾次目功能基因密码子偏好性研究
李喜莲
杨元杰
李倩
刘金殿
顾志敏
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2014
5
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参考文献
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