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一株2011年出现的季节性甲型H1N1流行性感冒病毒血凝素基因特性的研究
1
作者
沈佳仁
赵百慧
+7 位作者
高烨
俞雪莲
王嘉瑜
袁政安
吴凡
谢晓红
陶力新
张曦
《微生物与感染》
2012年第3期157-163,共7页
本文通过比较2011年分离培养的1株季节性甲型H1N1流行性感冒(简称流感)病毒(A/Shanghai/1167/2011(H1N1))与历年季节性甲型H1N1流感病毒的血凝素(HA)基因,追溯该病毒的基因变异与来源,探讨该毒株的出现对流感防控工作的意义。采用反转录...
本文通过比较2011年分离培养的1株季节性甲型H1N1流行性感冒(简称流感)病毒(A/Shanghai/1167/2011(H1N1))与历年季节性甲型H1N1流感病毒的血凝素(HA)基因,追溯该病毒的基因变异与来源,探讨该毒株的出现对流感防控工作的意义。采用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法扩增病毒的HA和神经氨酸酶(NA)片段,并进行测序;应用分子生物学软件对获得的序列进行分析,绘制基因进化树;同时,通过血凝抑制试验检测2011年下半年健康人群中该流感病毒的抗体水平。结果显示,A/Shanghai/1167/2011(H1N1)的HA基因序列与世界卫生组织(WHO)2007~2008年季节性甲型H1N1流感病毒疫苗株A/Brisbane/59/2007(H1N1)最接近,同源性达99.2%,与新型甲型H1N1流感病毒A/California/07/2009疫苗株同源性仅为72.4%。其HA基因裂解位点为PSIQSR↓GLF,尚未出现高致病性的分子特征。HA片段共编码557个氨基酸,有9个潜在的糖基化位点,序列与2009年前WHO疫苗株A/NewCaledonia/20/1999(H1N1)、A/SolomonIslands/3/2006(H1N1)和/Brisbane/59/2007(H1N1)相比,分别有15、12和4处不同,这些差异分布在Sa、Sb、Ca1、Ca2、Cb5个抗原决定簇的氨基酸差异分别有5、5和2处。该毒株在健康人群血清的抗体阳性率为34.33%,几何平均效价(GMT)为10.38。A/Shanghai/1167/2011(H1N1)是2011年出现在上海地区的一个季节性甲型H1N1流感病毒毒株,其抗原变异与既往季节性甲型H1N1流感病毒相比不大,但在以A(H1N1)pdm09为主要流行株的年份检测到散在发生的既往季节性甲型H1N1流感病毒毒株应当引起重视,其在人群中的抗体水平较低,易引起流行,需要提高对类流感人群中此种毒株的持续监测。
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关键词
流行性感冒病毒
季节性甲型H1N1流行性感冒病毒
血凝素序列
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职称材料
浙江省与日本A_3型流行性感冒病毒株的血凝特性及HA1序列比较
被引量:
13
2
作者
卢亦愚
严菊英
+1 位作者
周敏
姜晓路
《中华流行病学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第1期15-18,共4页
目的 比较近年来在浙江省与日本流行的A3(H3N2 )型流行性感冒 (流感 )毒株的血凝特征与血凝素重链 (HA1)区域的序列差异。方法 对浙江省不同性状的流感代表株进行了抗原性分析 ,并与日本同期的毒株作了血凝特性及HA1区域的氨基酸序列...
目的 比较近年来在浙江省与日本流行的A3(H3N2 )型流行性感冒 (流感 )毒株的血凝特征与血凝素重链 (HA1)区域的序列差异。方法 对浙江省不同性状的流感代表株进行了抗原性分析 ,并与日本同期的毒株作了血凝特性及HA1区域的氨基酸序列比较分析。结果 近年在浙江流行的A3型流行株 ,其抗原性已发生较大变异 ,其中绝大部分是对鸡红细胞缺乏凝集特性的O相毒株 ,它与A 武汉 3 5 9 95株二者在HA1区域的氨基酸同源性仅为 94.82 % ,存在较大差异 ,这些O相毒株可以通过在MDCK细胞上的传代而转变为D相毒株 ,日本的同期毒株 ,其情况也相似。结论 A3型流感病毒在HA1区域发生的变异 。
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关键词
浙江
日本
A3型流行性感冒病毒株
血凝特性
HA1
序列
比较
流行性感冒
血凝素
重链
序列
原文传递
题名
一株2011年出现的季节性甲型H1N1流行性感冒病毒血凝素基因特性的研究
1
作者
沈佳仁
赵百慧
高烨
俞雪莲
王嘉瑜
袁政安
吴凡
谢晓红
陶力新
张曦
机构
上海市疾病预防控制中心
上海市奉贤区疾病预防控制中心
出处
《微生物与感染》
2012年第3期157-163,共7页
基金
"十一五"国家科技重大专项(2008ZX10004-002)
上海市公共卫生人才培养计划(GWDTR201201)
文摘
本文通过比较2011年分离培养的1株季节性甲型H1N1流行性感冒(简称流感)病毒(A/Shanghai/1167/2011(H1N1))与历年季节性甲型H1N1流感病毒的血凝素(HA)基因,追溯该病毒的基因变异与来源,探讨该毒株的出现对流感防控工作的意义。采用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法扩增病毒的HA和神经氨酸酶(NA)片段,并进行测序;应用分子生物学软件对获得的序列进行分析,绘制基因进化树;同时,通过血凝抑制试验检测2011年下半年健康人群中该流感病毒的抗体水平。结果显示,A/Shanghai/1167/2011(H1N1)的HA基因序列与世界卫生组织(WHO)2007~2008年季节性甲型H1N1流感病毒疫苗株A/Brisbane/59/2007(H1N1)最接近,同源性达99.2%,与新型甲型H1N1流感病毒A/California/07/2009疫苗株同源性仅为72.4%。其HA基因裂解位点为PSIQSR↓GLF,尚未出现高致病性的分子特征。HA片段共编码557个氨基酸,有9个潜在的糖基化位点,序列与2009年前WHO疫苗株A/NewCaledonia/20/1999(H1N1)、A/SolomonIslands/3/2006(H1N1)和/Brisbane/59/2007(H1N1)相比,分别有15、12和4处不同,这些差异分布在Sa、Sb、Ca1、Ca2、Cb5个抗原决定簇的氨基酸差异分别有5、5和2处。该毒株在健康人群血清的抗体阳性率为34.33%,几何平均效价(GMT)为10.38。A/Shanghai/1167/2011(H1N1)是2011年出现在上海地区的一个季节性甲型H1N1流感病毒毒株,其抗原变异与既往季节性甲型H1N1流感病毒相比不大,但在以A(H1N1)pdm09为主要流行株的年份检测到散在发生的既往季节性甲型H1N1流感病毒毒株应当引起重视,其在人群中的抗体水平较低,易引起流行,需要提高对类流感人群中此种毒株的持续监测。
关键词
流行性感冒病毒
季节性甲型H1N1流行性感冒病毒
血凝素序列
Keywords
Influenza virus
Seasonal influenza A (H1 N1) virus
Hemagglutinin sequence
分类号
R373.13 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
浙江省与日本A_3型流行性感冒病毒株的血凝特性及HA1序列比较
被引量:
13
2
作者
卢亦愚
严菊英
周敏
姜晓路
机构
浙江省疾病预防控制中心病毒学研究所
出处
《中华流行病学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第1期15-18,共4页
文摘
目的 比较近年来在浙江省与日本流行的A3(H3N2 )型流行性感冒 (流感 )毒株的血凝特征与血凝素重链 (HA1)区域的序列差异。方法 对浙江省不同性状的流感代表株进行了抗原性分析 ,并与日本同期的毒株作了血凝特性及HA1区域的氨基酸序列比较分析。结果 近年在浙江流行的A3型流行株 ,其抗原性已发生较大变异 ,其中绝大部分是对鸡红细胞缺乏凝集特性的O相毒株 ,它与A 武汉 3 5 9 95株二者在HA1区域的氨基酸同源性仅为 94.82 % ,存在较大差异 ,这些O相毒株可以通过在MDCK细胞上的传代而转变为D相毒株 ,日本的同期毒株 ,其情况也相似。结论 A3型流感病毒在HA1区域发生的变异 。
关键词
浙江
日本
A3型流行性感冒病毒株
血凝特性
HA1
序列
比较
流行性感冒
血凝素
重链
序列
Keywords
Influenza
Hemagglutinin 1 (HA1) sequence
Hemagglutination characteristics
分类号
R373.1 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一株2011年出现的季节性甲型H1N1流行性感冒病毒血凝素基因特性的研究
沈佳仁
赵百慧
高烨
俞雪莲
王嘉瑜
袁政安
吴凡
谢晓红
陶力新
张曦
《微生物与感染》
2012
0
下载PDF
职称材料
2
浙江省与日本A_3型流行性感冒病毒株的血凝特性及HA1序列比较
卢亦愚
严菊英
周敏
姜晓路
《中华流行病学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2003
13
原文传递
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