利用HPLC构建黑桑指纹图谱并分析黑桑的主要活性成分,结合网络药理学和分子对接技术研究黑桑治疗阿尔兹海默病(Alzheimer’s disease,AD)的作用分子机制。HPLC法建立12批黑桑的指纹图谱并对共有峰进行指认识别,进一步采用相似度评价、...利用HPLC构建黑桑指纹图谱并分析黑桑的主要活性成分,结合网络药理学和分子对接技术研究黑桑治疗阿尔兹海默病(Alzheimer’s disease,AD)的作用分子机制。HPLC法建立12批黑桑的指纹图谱并对共有峰进行指认识别,进一步采用相似度评价、聚类分析、主成分分析、正交偏最小二乘法判别分析(orthogonal partial least squares discriminant analysis,OPLS-DA)和理想解相似性排序法(technique for order preference by similarity to ideal solution,TOPSIS)对12批黑桑样品进行评价;通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)和Swiss Target Prediction平台获得黑桑的活性成分与靶点信息。使用Gene Cards数据库和AD专属数据库(Chemogenomics Database For Alzheimer’s Disease)获得AD的疾病靶点信息,得到黑桑治疗AD的潜在作用靶点。通过String(Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins,String)和Cytoscape3.7.2构建PPI网络图并进行拓扑分析。利用R软件对核心靶点进行GO和KEGG富集分析。通过Auto Dock软件进行模拟分子对接。黑桑HPLC指纹图谱的相似度均>0.96,并指认出3个色谱峰,通过聚类分析将12批样品聚为3类,主成分分析结果与聚类分析结果一致。网络药理学筛选后最终得到12个核心靶点,并对核心靶点进行富集分析得到1480个GO条目和104个KEGG通路。黑桑可能通过核心靶点调节PI3K-Akt信号通路、中性粒细胞外陷等信号通路,进而调控炎症等反应,多靶点-多通路-多途径达到治疗和预防AD的效果。展开更多
文摘利用HPLC构建黑桑指纹图谱并分析黑桑的主要活性成分,结合网络药理学和分子对接技术研究黑桑治疗阿尔兹海默病(Alzheimer’s disease,AD)的作用分子机制。HPLC法建立12批黑桑的指纹图谱并对共有峰进行指认识别,进一步采用相似度评价、聚类分析、主成分分析、正交偏最小二乘法判别分析(orthogonal partial least squares discriminant analysis,OPLS-DA)和理想解相似性排序法(technique for order preference by similarity to ideal solution,TOPSIS)对12批黑桑样品进行评价;通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)和Swiss Target Prediction平台获得黑桑的活性成分与靶点信息。使用Gene Cards数据库和AD专属数据库(Chemogenomics Database For Alzheimer’s Disease)获得AD的疾病靶点信息,得到黑桑治疗AD的潜在作用靶点。通过String(Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins,String)和Cytoscape3.7.2构建PPI网络图并进行拓扑分析。利用R软件对核心靶点进行GO和KEGG富集分析。通过Auto Dock软件进行模拟分子对接。黑桑HPLC指纹图谱的相似度均>0.96,并指认出3个色谱峰,通过聚类分析将12批样品聚为3类,主成分分析结果与聚类分析结果一致。网络药理学筛选后最终得到12个核心靶点,并对核心靶点进行富集分析得到1480个GO条目和104个KEGG通路。黑桑可能通过核心靶点调节PI3K-Akt信号通路、中性粒细胞外陷等信号通路,进而调控炎症等反应,多靶点-多通路-多途径达到治疗和预防AD的效果。
文摘本研究通过建立黄芪不同炮制品HPLC指纹图谱及多成分含量测定方法,并结合化学计量法对其进行比较分析,为黄芪炮制品的综合利用提供理论支持。采用HPLC建立黄芪炮制品指纹图谱并进行6种成分的含量测定,并通过聚类分析(hierarchical clustering analysis,HCA)、主成分分析(principal component analysis,PCA)和正交偏最小二乘-判别分析(orthogonal partial least squares discriminant analysis,OPLS-DA)评价不同黄芪炮制品的差异,找寻差异性成分。结果显示,不同炮制品(各10批)共得到20个共有峰,其中指认了6个共有峰,且6个成分在各自的质量浓度范围内线性关系良好(r>0.999),平均加样回收率为100.5%~102.1%,相对标准偏差(relative standard deviation,RSD)为0.77%~2.1%;指纹图谱相似度结果显示,蜜麸黄芪、蜜炙黄芪、盐黄芪、酒黄芪各自10批的相似度均在0.900以上,但不同类型炮制品的相似度降低;聚类分析可将四种炮制品聚为3类,主成分分析与聚类分析结果一致,可相互佐证,正交偏最小二乘-判别分析能有效的将4种炮制品区分,以变量重要性投影(variable importance of projection,VIP)大于1为依据,筛选了9种主要差异成分,确认了毛蕊异黄酮苷、芒柄花苷、5-羟甲基糠醛是引起黄芪不同炮制品间成分差异的主要标志性成分。该研究所建立的黄芪炮制品HPLC指纹图谱结合化学计量法的方法准确可靠,可为黄芪炮制品的质量控制和品质评价提供参考依据。