SERINC1表达在肺癌中的预后作用及与肿瘤免疫浸润的关系

目的本研究旨在探讨血清素转运蛋白1(SERINC1)在肺癌预后中的作用。方法从GEO数据库下载了肺癌的单细胞测序scRNA数据,提取上皮细胞显著表达基因。同时Xena数据库下载TCGA数据,并进行了差异分析。将以上两者差异显著表达基因取交集,得到了上皮细胞差异基因。使用LASSO、随机森林、GBM、XGBoost等多种机器学习算法取交集,得到了FAM107A、SERINC1、MDK、GGCT、AVL9和FEZ16个交集基因。由于SERINC1在肺癌中还未被研究,对SERINC1进行了一系列的临床相关性分析,包括诊断ROC分析、表达分析、富集分析、生存分析、蛋白表达、蛋白互作分析以及免疫浸润分析。结果通过单细胞测序和机器学习筛选出了目标基因SERINC1。ROC分析SERINC1的AUC值高达0.972,显示出很高的诊断效能。K-M曲线显示,SERINC1表达高的患者的预后明显好于表达量低的患者,其HR值为0.71(95%CI:0.63~0.81)和0.48(95%CI:0.39~0.61),这表明基因表达量越高的患者预后更好。免疫浸润分析揭示,SERINC1与多种免疫细胞相关,且与多种T细胞的标志基因集相关。结论SERINC1是肺癌的一个有前景的预后标志物,且与免疫浸润相关。