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血清蛋白组与消化道恶性肿瘤研究进展 被引量:3
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作者 王延峰 米志宽 +2 位作者 张华华 陈亚妮 张静 《陕西医学杂志》 CAS 2017年第11期1619-1620,共2页
近几年来国内外消化道恶性肿瘤的发病率和病死率不断上升,特别是结肠癌、肝癌、胃癌患者严重危害着人类健康。随着蛋白组学的快速发展,应用蛋白组学技术对恶性肿瘤的早期特异性诊断标志物的发现、蛋白质的诊断模型的建立、靶向治疗、发... 近几年来国内外消化道恶性肿瘤的发病率和病死率不断上升,特别是结肠癌、肝癌、胃癌患者严重危害着人类健康。随着蛋白组学的快速发展,应用蛋白组学技术对恶性肿瘤的早期特异性诊断标志物的发现、蛋白质的诊断模型的建立、靶向治疗、发病机制等方面的研究已成为近期的热点之一。本文将对蛋白质组学在恶性消化道肿瘤中的研究进展进行简要综述。 展开更多
关键词 消化系统肿瘤 @血清蛋白组
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基于血清蛋白组学初步探讨脑心通胶囊防治心脑血管疾病的作用机制 被引量:22
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作者 耿潇 陈璐 +6 位作者 赵步长 李春晓 邱丽珍 尤星宇 王益民 张璐莎 王虹 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第15期2864-2871,共8页
步长脑心通胶囊具有益气活血,化瘀通络的作用,临床广泛用于冠心病、心绞痛、脑卒中等心脑血管疾病的治疗,其预防的药效物质基础及可能作用机制尚不明确。该实验取C57BL/6小鼠20只,雌雄各半,按体重随机分为对照组(生理盐水)和脑心通组。... 步长脑心通胶囊具有益气活血,化瘀通络的作用,临床广泛用于冠心病、心绞痛、脑卒中等心脑血管疾病的治疗,其预防的药效物质基础及可能作用机制尚不明确。该实验取C57BL/6小鼠20只,雌雄各半,按体重随机分为对照组(生理盐水)和脑心通组。适应性喂养7 d后开始给药,连续灌胃3 d,末次给药后1 h,心尖取血,每组取6只制备血清蛋白样品,进行双向凝胶电泳,图像分析,质谱检测,筛选并鉴定差异表达蛋白,对差异蛋白进行生物信息学分析。脑心通胶囊给药组与对照组差异表达蛋白24个,其中与对照组相比,上调12个,下调12个。差异蛋白所参与的通路涉及细胞凋亡信号通路,血管内皮生长因子信号传导通路等,其中vasohibin-1是血管生成的负反馈调节因子,Western blot结果证实脑心通胶囊可使vasohibin-1蛋白表达降低,与双向电泳结果一致。脑心通胶囊给药组血清蛋白表达有差异,差异蛋白的主要作用靶位为内皮细胞、炎症细胞及血小板等,这些蛋白的改变提示脑心通胶囊在一定程度上可以改善冠心病及缺血性脑血管疾病,为脑心通胶囊未病先防的分子机制研究提供了潜在的生物标志物。 展开更多
关键词 脑心通胶囊 血清蛋白组 双向凝胶电泳
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基于血清蛋白组学探讨黄芩清热除痹胶囊改善急性痛风性关节炎急性炎症的作用研究 被引量:15
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作者 孙广瀚 刘健 +4 位作者 万磊 刘维 龙琰 鲍丙溪 张颖 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期3061-3067,共7页
目的基于血清蛋白组学初步探讨黄芩清热除痹胶囊(Huangqin Qingre Chubi Capsule,HQC)改善急性痛风性关节炎(acute gouty arthritis,AGA)急性炎症的作用研究。方法运用Raybiotech细胞因子抗体芯片筛选治疗前10名AGA患者和10名健康志愿... 目的基于血清蛋白组学初步探讨黄芩清热除痹胶囊(Huangqin Qingre Chubi Capsule,HQC)改善急性痛风性关节炎(acute gouty arthritis,AGA)急性炎症的作用研究。方法运用Raybiotech细胞因子抗体芯片筛选治疗前10名AGA患者和10名健康志愿者的血清标本AGA特异性蛋白质。选取3例AGA患者及健康志愿者,采用Western blotting法检测HQC干预前后特异性蛋白质的表达量;选取60例AGA患者及健康志愿者,运用ELISA法检测HQC干预后炎症因子白细胞介素-1β(interleukin-1β,IL-1β)、IL-6、肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)、转化生长因子-β(transforming growth factor-β,TGF-β)、超敏C-反应蛋白(hypersensitiveC-reactiveprotein,hs-CRP)水平。结果基于蛋白质组学确定了4种AGA特异性蛋白质,包括人肿瘤坏死因子受体超家族成员II(tumor necrosis factor receptor II,TNF-RII)、人巨噬细胞炎性蛋白1β(macrophage inflammatory protein 1β,MIP-1β)、人白细胞介素-8(IL-8)、人粒细胞巨噬细胞集落刺激因子(granulocyte macrophage colony stimulating factor,GM-CSF)。Western blotting检测结果显示对照组与AGA患者治疗前比较,TNF-RII、MIP-1β、IL-8、GM-CSF蛋白水平差异显著,AGA患者治疗前TNF-RII、MIP-1β、IL-8蛋白呈现高表达,GM-CSF蛋白呈现低表达。与治疗前比较,经HQC治疗后AGA患者血清TNF-RII、MIP-1β、IL-8水平显著降低,GM-CSF水平显著升高。ELISA检测结果显示,HQC治疗前后AGA患者血清TNF-RII、MIP-1β、IL-8、GM-CSF水平差异明显,与治疗前比较,治疗后AGA患者血清TNF-RII、MIP-1β、IL-8水平显著降低(P<0.01),GM-CSF水平显著升高(P<0.01)。结论HQC可能是通过调控GM-CSF、IL-8、MIP-1β和TNF-RII等特异性蛋白质的表达,从而改善AGA患者炎症状态,提高机体抗炎能力。 展开更多
关键词 血清蛋白组 急性痛风性关节炎 黄芩清热除痹胶囊 肿瘤坏死因子受体超家族成员Ⅱ 巨噬细胞炎性蛋白 白细胞介素-8 粒细胞巨噬细胞集落刺激因子
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Ⅲ~Ⅳ期糖尿病肾病不同中医证型的血清蛋白组学研究 被引量:5
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作者 刘垠浩 陈丽贞 《湖南中医杂志》 2020年第1期7-10,共4页
目的:探索Ⅲ~Ⅳ期糖尿病肾病(DN)患者血清差异蛋白,同时筛选不同中医证型的血清差异蛋白。方法:收集Ⅲ~Ⅳ期DN患者70例(气阴两虚证19例,脾肾气虚证18例,血瘀证16例,湿热证17例),同时选择健康受试者35例(健康对照组),应用表面加强激光解... 目的:探索Ⅲ~Ⅳ期糖尿病肾病(DN)患者血清差异蛋白,同时筛选不同中医证型的血清差异蛋白。方法:收集Ⅲ~Ⅳ期DN患者70例(气阴两虚证19例,脾肾气虚证18例,血瘀证16例,湿热证17例),同时选择健康受试者35例(健康对照组),应用表面加强激光解吸电离-飞行时间-质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测各组血清蛋白指纹图谱,并对差异蛋白峰进行对比分析。结果:1) DN组与健康对照组之间共有9个蛋白峰存在显著差异,质荷比(M/Z)分别为2042.57、3291.28、4986.15、5312.69、5564.09、9861.47、10786.53、13392.89、17395.27;2)气阴两虚证与脾肾气虚证之间共有4个蛋白峰存在显著差异,M/Z分别为2994.77、4986.15、7937.25、2758.91;3)气阴两虚证与血瘀证之间共有4个蛋白峰存在显著差异,M/Z分别为4986.15、16982.62、6819.69、9947.36;4)气阴两虚证与湿热证之间共有3个蛋白峰存在显著差异,M/Z分别为4986.15、11741.33、7001.54;5)脾肾气虚证与血瘀证之间共有3个蛋白峰存在显著差异,M/Z分别为3448.22、8063.43、9787.21;6)脾肾气虚证与湿热证之间共有5个蛋白峰存在显著差异,M/Z分别为2144.34、3992.01、8871.35、10568.32、14643.47;7)血瘀证与湿热证之间共有6个蛋白峰存在显著差异,M/Z分别为4233.15、5771.32、5987.18、8496.76、6651.25、13551.94。结论:Ⅲ~Ⅳ期DN组与健康对照组血清蛋白表达存在差异,该差异或可作为相关临床诊断的标志物,对探索DN的发病机制具有重要的参考价值;在不同中医证型之间能够找到差异血清蛋白,可能反映"证"的实质内涵,对今后建立诊断决策模型具有积极意义。 展开更多
关键词 糖尿病肾病 中医证型 血清蛋白组 表面加强激光解吸电离-飞行时间-质谱技术
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转录组测序结合蛋白组学技术筛选肝癌转移基因 被引量:5
5
作者 秦荔荣 周怡 +3 位作者 邓小芳 李洪涛 臧宁 何敏 《世界华人消化杂志》 CAS 2015年第13期2050-2057,共8页
目的:通过高通量转录组测序和相对定量血清蛋白组学技术筛选肝癌转移相关的关键基因.方法:利用Ion Proton.测序仪比较人肝癌细胞株(Smmc-7721)和正常人肝细胞株(L-02)的差异表达基因,对差异表达基因进行聚类分析、GO功能注释和富集分析... 目的:通过高通量转录组测序和相对定量血清蛋白组学技术筛选肝癌转移相关的关键基因.方法:利用Ion Proton.测序仪比较人肝癌细胞株(Smmc-7721)和正常人肝细胞株(L-02)的差异表达基因,对差异表达基因进行聚类分析、GO功能注释和富集分析,获得肝癌细胞转移相关基因;收集10例肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者血清及匹配10例正常人血清,通过相对和绝对定量的同位素标记(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)联合基质辅助激光解吸电离串联飞行时间质谱(ma t r ixassisted laser desorption/ionization tandemtime of flight mass spectrometry,MALDITOF/MS)检测肝癌与正常对照组血清差异表达蛋白;将两组学结果进行交集分析,确定肝癌转移关键基因,并在76例HCC和癌旁组织中进行免疫组织化学验证.结果:对肝癌细胞及正常肝细胞进行转录组测序分析,共得到肝癌细胞差异表达基因618个,生物信息学分析差异表达基因主要聚集在转移相关、转录因子相关、氧化还原过程等14个分子功能,其中转移相关功能基因所占比例最大,达15.05%(93/618);血清蛋白组学分析共得到69个肝癌血清差异表达蛋白,其中在肝癌组上调33个,下调36个;将转录组测序筛选的与转移功能相关基因与蛋白质组学进行交集分析,发现有3个共同交集的差异因子,其中差异最明显的是肝癌中表达上调的热休克蛋白90 AA1(heat shock protein 90 AA1,HSP90AA1);免疫组织化学验证结果显示,HSP90α表达强阳性在门脉转移和无门脉转移HCC组织中的比例分别为66.7%(16/24)和25%(13/52)(P<0.005),HSP90α在有门脉转移的肝癌组织表达明显增高.结论:利用转录组结合血清蛋白组策略,发现HSP90AA1可能是在肝癌转移重要基因. 展开更多
关键词 肝细胞癌 血清蛋白组 转录组测序 HSP90AA1 转移
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应用液体芯片-飞行时间质谱技术筛选血清中肺癌标志蛋白 被引量:2
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作者 杨拴盈 田应选 +5 位作者 南岩东 卜丽娜 霍树芬 林秀丽 杜洁 尚文丽 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期17-22,共6页
目的应用液体芯片-飞行时间质谱系统分析肺癌与对照组血清差异表达蛋白,筛选肺癌标志蛋白。方法将105例肺癌患者和90例对照者[44名正常人,46例良性肺疾病(BLDs)]的血清随机分成训练组(肺癌和对照各60例)和验证组[肺癌45例(早期13例,晚... 目的应用液体芯片-飞行时间质谱系统分析肺癌与对照组血清差异表达蛋白,筛选肺癌标志蛋白。方法将105例肺癌患者和90例对照者[44名正常人,46例良性肺疾病(BLDs)]的血清随机分成训练组(肺癌和对照各60例)和验证组[肺癌45例(早期13例,晚期32例),对照30例(正常及BLDs各15例)]。应用ClinProt及相关分析工具软件ClinProTools结合遗传算法(GA)等生物统计学和生物信息学方法分析上述195份血清。进行归一化平滑处理总离子流图(TIC),消除化学及电物理噪声;分析组间差异蛋白并计算差异大小,后按差异大小由大到小排列;应用GA对各差异蛋白的敏感性及特异性进行初步评价,建立判别模型并验证。结果比较肺癌及对照血清蛋白表达谱时共发现98个差异蛋白峰。质荷比(m/z)分别为1 865.81 u和4 054 u的蛋白在两组间差异最大,且这两种蛋白在肺癌组各样品谱图中的丰度大于正常对照组;以蛋白1 865.81 u为X轴,4 054 u为Y轴建立坐标系(坐标值代表相应蛋白丰度),观察样品分布,可见两组样品混杂差区域较小,说明这两种蛋白的区分肺癌和对照(正常人和BLDs)的能力良好。应用GA,以训练组数据建立判别模型时,系统筛选出一个由m/z分别为3 192.082、862.554、643.495、336.64、3 954.88、9 288.98 u及4 209.64 u的7个特征峰组成的诊断模型。以验证组数据进行交叉验证时,该模型对肺癌及对照的识别率分别为82.22%(37/45)和80.00%(24/30),对早期肺癌的识别率为76.92%(10/13)。鉴定所得到的m/z分别为1 778、1 8654、209 u蛋白峰,得出前两个蛋白峰均为C3f,而4 209 u则为真核细胞肽链释放因子。结论肺癌患者与正常人及BLDs患者血清蛋白质表达谱之间存在差异;使用ClinProTools结合GA等生物信息学方法有望筛选出肺癌诊断标志蛋白。 展开更多
关键词 液体芯片质谱技术 肺癌 诊断 血清蛋白组 ClinProt系统
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慢性阻塞性肺疾病患者的血清差异表达蛋白分析 被引量:1
7
作者 杨娟 杨栓盈 +3 位作者 倪磊 宋土生 于林 黄辰 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期61-64,共4页
目的应用液体芯片-飞行时间质谱技术从慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者的血清中找出差异表达蛋白,筛选出其蛋白多肽(m/z)的疾病标志物。方法应用液体蛋白芯片(MB-WCX)结合飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)技术对16例病理确诊的COPD患者和32例正... 目的应用液体芯片-飞行时间质谱技术从慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者的血清中找出差异表达蛋白,筛选出其蛋白多肽(m/z)的疾病标志物。方法应用液体蛋白芯片(MB-WCX)结合飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)技术对16例病理确诊的COPD患者和32例正常对照人群进行血清蛋白组分析。采用ClinProTools软件进行蛋白多肽的组间差异对比,共获得115个蛋白多肽峰图,其中24个蛋白多肽峰图具有极显著差异(P<0.001),其中10个蛋白多肽在COPD患者中表达下调,其余14个蛋白多肽在COPD患者中表达上调。两组数据中最大差异的两个蛋白多肽峰分别是m/z:1 012.92和m/z:4 152.85。结论利用液体芯片-飞行时间质谱技术可以从COPD患者的血清中获得稳定丰富的蛋白多肽图谱,并且能够筛选出潜在的疾病标志物。 展开更多
关键词 液体芯片-飞行时间质谱 COPD患者 血清蛋白组 疾病标志物
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去除血清中高、中丰度蛋白方法的优化 被引量:2
8
作者 胡蝶飞 李国坚 +2 位作者 吴继周 臧宁 宁秋悦 《广西医科大学学报》 CAS 2011年第2期250-252,共3页
目的:通过比较和优化血清样品制备方法,建立简便、灵敏的去除血清中高、中丰度蛋白的方法。方法:运用盐析法、有机溶剂法和亲和层析柱法去除血清中高、中丰度蛋白,经蛋白浓度测定和SDS-PAGE电泳分析,比较3种方法对高、中丰度蛋白去除效... 目的:通过比较和优化血清样品制备方法,建立简便、灵敏的去除血清中高、中丰度蛋白的方法。方法:运用盐析法、有机溶剂法和亲和层析柱法去除血清中高、中丰度蛋白,经蛋白浓度测定和SDS-PAGE电泳分析,比较3种方法对高、中丰度蛋白去除效果及小分子蛋白的保留和分布情况。结果:乙腈沉淀法能去除血清样品中90%左右的高、中丰度蛋白,同时可残留更多15 ku以下的小分子蛋白;盐析沉淀法和亲和层析柱法均能去除血清样品中大部分高、中丰度蛋白,但所得的15 ku以下的小分子蛋白少于乙腈沉淀法所得到的相应蛋白。结论:用1.2倍体积乙腈沉淀法处理血清样品可去除绝大部分高、中丰度蛋白,同时收获更多的15 ku以下的小分子量蛋白。 展开更多
关键词 血清蛋白组 高、中丰度蛋白 乙腈沉淀法 SDS-PAGE
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结直肠癌肝转移血清蛋白指纹图谱诊断模型的建立及临床应用 被引量:1
9
作者 孙敏 黄东 +1 位作者 李恒 熊斌 《湖北医药学院学报》 CAS 2012年第3期191-196,共6页
目的:检测结直肠癌肝转移、结直肠癌和健康人血清中蛋白质质谱,筛选特异的生物标记物,构建结直肠癌肝转移血清蛋白指纹图谱的早期诊断模型。方法:利用表面增强激光解析/电离-飞行时间-质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测76例血清标本的蛋白质质... 目的:检测结直肠癌肝转移、结直肠癌和健康人血清中蛋白质质谱,筛选特异的生物标记物,构建结直肠癌肝转移血清蛋白指纹图谱的早期诊断模型。方法:利用表面增强激光解析/电离-飞行时间-质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测76例血清标本的蛋白质质谱,其中结直肠癌肝转移8例,结直肠癌无肝转移58例,健康人10例。运用支持向量机(SVM)和判别分析法处理数据、建立和评估诊断模型。结果:⑴留一法交叉验证区分结直肠癌肝转移与健康人的诊断模型,训练集和测试集的敏感性和特异性均达到100%;⑵留一法交叉验证区分结直肠癌肝转移与结直肠癌无肝转移组的诊断模型,训练集敏感性和特异性均达到100%,测试集的敏感性87.5%,特异性98.28%;⑶留一法交叉验证区分结直肠癌肝转移组和对照组的诊断模型,训练集的敏感性、特异性分别为100%、98.53%,测试集的敏感性、特异性分别为75.0%、97.06%。结论:SELDI技术结合生物信息学分析工具,是筛选和鉴定结直肠癌肝转移候选标志物的非常有效方法,建立的诊断模型为结直肠癌肝转移的早期临床诊断尤其是定性诊断提供了新手段。 展开更多
关键词 结直肠癌 肝转移 表面增强激光解析/电离-飞行时间-质谱 支持向量机 诊断模型 生物标志物 血清蛋白组
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小细胞肺癌患者血清差异表达蛋白分析
10
作者 朱江 邓智平 +3 位作者 宋张骏 张锋 韩丕华 王治伦 《现代肿瘤医学》 CAS 2013年第3期530-533,共4页
目的:检测小细胞肺癌(small cell lung cancer,SCLC)患者的血清蛋白多肽指纹图谱,分析SCLC患者与正常对照人群的蛋白表达差异,筛查其可作为潜在标记物的差异表达蛋白多肽。方法:应用液体蛋白芯片结合飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)技术对1... 目的:检测小细胞肺癌(small cell lung cancer,SCLC)患者的血清蛋白多肽指纹图谱,分析SCLC患者与正常对照人群的蛋白表达差异,筛查其可作为潜在标记物的差异表达蛋白多肽。方法:应用液体蛋白芯片结合飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)技术对14例病理确诊的SCLC患者和32例正常对照人群进行血清蛋白组分析。采用Clin Pro Tools软件进行蛋白多肽的组间差异对比。结果:共获得57个蛋白多肽峰,其中18个蛋白多肽峰具有极显著差异(P<0.001),其中9个蛋白多肽在SCLC患者中表达下调,其余9个蛋白多肽在SCLC患者中表达上调。两组数据中最大差异的两个蛋白多肽峰分别是m/z:1451.43和m/z:4643.31。结论:利用液体芯片-飞行时间质谱技术可以从SCLC患者的血清中获得稳定丰富的蛋白多肽谱,且能够筛选出多个组间显著差异表达的蛋白多肽,可作为SCLC临床辅助诊断的潜在疾病标志物。 展开更多
关键词 液体芯片-飞行时间质谱 SCLC患者 血清蛋白组 疾病标志物
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Ⅲ~Ⅳ期糖尿病肾病气阴两虚证患者的血清蛋白质组学研究 被引量:3
11
作者 刘垠浩 陈丽贞 +2 位作者 苏小惠 蓝元隆 戴秀娟 《现代中西医结合杂志》 CAS 2019年第7期701-704,共4页
目的应用表面加强激光解吸电离-飞行时间-质谱(SELDI-TOF-MS)技术,从蛋白质组学角度筛选Ⅲ~Ⅳ期糖尿病肾病(DN)患者气阴两虚证的差异蛋白。方法采集37例Ⅲ~Ⅳ期气阴两虚证DN患者(DN气阴两虚证组)、33例Ⅲ~Ⅳ期非气阴两虚证DN患者(DN... 目的应用表面加强激光解吸电离-飞行时间-质谱(SELDI-TOF-MS)技术,从蛋白质组学角度筛选Ⅲ~Ⅳ期糖尿病肾病(DN)患者气阴两虚证的差异蛋白。方法采集37例Ⅲ~Ⅳ期气阴两虚证DN患者(DN气阴两虚证组)、33例Ⅲ~Ⅳ期非气阴两虚证DN患者(DN非气阴两虚证组)和35例健康受试者(健康对照组)的血清样本,采用SELDI-TOF-MS技术检测各组血清蛋白表达谱,后运用Biomarker WizardTM和Biomarker PatternsTM软件进行数据分析,筛选出特异蛋白,建立诊断决策树模型。结果 DN气阴两虚证组与健康对照组共有8个蛋白峰比较差异有统计学意义(P均<0. 05); DN气阴两虚证组与DN非气阴两虚证组共有11个蛋白峰比较差异有统计学意义(P均<0. 05);质荷比为4 986. 15Da所代表的蛋白可能在Ⅲ~Ⅳ期DN气阴两虚证患者中呈特异表达;以质荷比为1 084. 57 Da等11个蛋白组成的证候决策树模型,敏感性为97. 3%,特异性为95. 6%。结论Ⅲ~Ⅳ期DN气阴两虚证的发生发展,可能是以质荷比为4 986. 15 Da蛋白的差异表达为物质基础的。 展开更多
关键词 糖尿病肾病 SELDI-TOF-MS技术 血清蛋白组 气阴两虚证
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乳腺癌患者血清差异表达蛋白分析
12
作者 朱江 邓智平 +1 位作者 韩丕华 宋张骏 《现代肿瘤医学》 CAS 2014年第9期2082-2085,共4页
目的:检测乳腺癌(breast cancer,BC)患者的血清蛋白多肽图谱,分析乳腺癌患者与正常对照人群的蛋白表达差异,筛查其可作为潜在标记物的差异表达蛋白多肽。方法:采用液体芯片磁柱分离系统结合基质辅助激光解析电离化/飞行时间质谱(matrix ... 目的:检测乳腺癌(breast cancer,BC)患者的血清蛋白多肽图谱,分析乳腺癌患者与正常对照人群的蛋白表达差异,筛查其可作为潜在标记物的差异表达蛋白多肽。方法:采用液体芯片磁柱分离系统结合基质辅助激光解析电离化/飞行时间质谱(matrix assisted laser desorption ionization/time of flight MS,MALDI-TOF MS)技术对50例病理确诊的早期乳腺癌患者和50例正常对照人群进行血清蛋白组分析。采用Clin Pro Tools软件进行蛋白多肽的组间差异对比。结果:在分子量范围1000-10000Da共检测到78个蛋白多肽峰图,其中11个蛋白多肽峰图具有极显著差异(P<0.001),它们中有5个蛋白多肽在乳腺癌患者中表达下调,其余6个蛋白多肽在乳腺癌患者中表达上调。其中,质核比(m/z)为:4957.03以及4600.01,在乳腺癌患者组与正常对照人群血清中为最大差异表达的蛋白多肽。结论:利用液体芯片-飞行时间质谱技术以及Clin Prot系统可捕获到丰富且稳定的乳腺癌患者血清蛋白多肽图谱并能筛选出多个组间显著差异表达的蛋白多肽,可作为乳腺癌临床辅助诊断的潜在疾病标志物。 展开更多
关键词 液体芯片-飞行时间质谱 乳腺癌 血清蛋白组 疾病标志物
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术前血清ITGβ6水平对CEA正常的可切除胃癌患者预后的预测价值 被引量:1
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作者 何旭 王德奋 +1 位作者 王科壹 卢家吉 《临床肿瘤学杂志》 CAS 2022年第10期896-902,共7页
目的 探讨术前血清整合素β6(ITGβ6)水平对癌胚抗原(CEA)正常的可切除胃癌患者预后的预测价值。方法 收集2015年1月至2017年5月间在我院普外科接受手术的295例胃癌患者的病历资料,术前CEA≤5 ng/ml。另外收集同时期150例健康志愿者作... 目的 探讨术前血清整合素β6(ITGβ6)水平对癌胚抗原(CEA)正常的可切除胃癌患者预后的预测价值。方法 收集2015年1月至2017年5月间在我院普外科接受手术的295例胃癌患者的病历资料,术前CEA≤5 ng/ml。另外收集同时期150例健康志愿者作为对照组。术前和术后30 d(辅助化疗前)收集患者血清标本。随机选取胃癌患者和对照组各6份血清样本(胃癌患者术前血清样本),采用液相色谱-质谱法(LC-MS/MS)进行血清蛋白组学分析。采用酶联免疫吸附测定法检测所有血清样本ITGβ6水平。Kaplan-Meier法绘制总生存期(OS)和无病生存期(DFS)曲线。采用Cox风险比例回归模型分析影响患者DFS和OS的因素。结果 经LC-MS/MS血清蛋白组学分析,存在71个差异性表达蛋白,其中ITGβ6上调最明显。与对照组比较,胃癌组患者血清ITGβ6基线水平升高[4.16(1.70,9.48) ng/ml vs. 0.32(0.09,1.03) ng/ml,P<0.001]。与术前比较,术后胃癌患者血清ITGβ6水平降低[1.14(0.20,2.42) ng/ml vs. 4.16(1.70,9.48) ng/ml,P<0.001]。p N分期、肿瘤直径、分化程度、血清CA199水平、血清CA242水平与血清ITGβ6基线水平有关(P<0.05)。血清ITGβ6高水平组(>4.16 ng/ml)患者OS和PFS较低水平组(≤4.16 ng/ml)更差(P<0.05)。多因素Cox风险比例模型结果显示,血清ITGβ6基线水平>4.16 ng/ml与较短的PFS和OS有关(P<0.05)。结论 术前血清ITGβ6水平对CEA水平正常的胃癌患者预后有良好的预测价值。 展开更多
关键词 胃癌 血清蛋白组学分析 整合素β6 癌胚抗原 预后
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大鼠挤压伤解压后各时间点蛋白质组学差异 被引量:1
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作者 吴超 张赛 +2 位作者 张椿钰 王恺 程明 《解放军医药杂志》 CAS 2020年第1期16-22,共7页
目的通过对挤压伤大鼠血清进行检测,筛选出相关差异表达蛋白,了解疾病的发展及转归,为挤压伤的临床治疗提供依据。方法将大鼠随机分为对照组(C组)、0 h组(Z组)、12 h组(T组)、72 h组(S组),每组10只,使用自研挤压平台对大鼠进行挤压造模... 目的通过对挤压伤大鼠血清进行检测,筛选出相关差异表达蛋白,了解疾病的发展及转归,为挤压伤的临床治疗提供依据。方法将大鼠随机分为对照组(C组)、0 h组(Z组)、12 h组(T组)、72 h组(S组),每组10只,使用自研挤压平台对大鼠进行挤压造模,运用iTRAQ技术对大鼠血清进行蛋白质组学检测,并运用蛋白组学分析方法对结果进行分析。结果本实验共鉴定出568个蛋白,汇总筛选出变化趋势相同的蛋白共得到110个共同差异蛋白。剔除变化小于1.5倍(包括1.5倍)的蛋白,得到上调蛋白18个,下调蛋白11个。STRING网络互作分析得到Pkm、Pgam2、Aldoa、Pygm、Serpina3n、Hp、A2m、Fgg、Fn1、Lcn2、Adssl1、Pvalb、Serpina6、Afm处于关键节点。差异蛋白KEGG通路富集结果糖酵解/糖异生、胰高血糖素信号通路、碳代谢、癌症中的中枢碳代谢均为与糖代谢有关的通路。结论糖酵解对挤压伤的进展有重要意义,相关糖代谢酶类Aldoa、Pgam2、Pkm及14-3-3蛋白ε、维生素E结合蛋白可能对判断疾病进程有一定参考价值,CK作为既往血液指标与疾病进程相关。血清白蛋白可能在治疗挤压伤中有一定作用。 展开更多
关键词 挤压伤 血清蛋白组 糖酵解 碳代谢 维生素E结合蛋白 大鼠 Wistar
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蛋白质组学的研究进展 被引量:9
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作者 刘嘉 李冬 +1 位作者 王徐 代大年 《现代医药卫生》 2019年第9期1380-1384,共5页
1994年,澳大利亚科学家首次提出了蛋白质组的概念。蛋白质组是指所有基因表达的所有蛋白质及其存在方式,是由单个基因组、细胞、组织或个体表达的完整蛋白质组分[1]。蛋白质组学主要阐明生物体中所有蛋白质的表达和功能模式,分析细胞内... 1994年,澳大利亚科学家首次提出了蛋白质组的概念。蛋白质组是指所有基因表达的所有蛋白质及其存在方式,是由单个基因组、细胞、组织或个体表达的完整蛋白质组分[1]。蛋白质组学主要阐明生物体中所有蛋白质的表达和功能模式,分析细胞内动态变化的蛋白质成分、表达水平与修饰状态,了解其相互之间的作用与联系。蛋白质组学逐渐成为生命科学中最热门的研究课题,其大致可分为:(1)结构蛋白质组学[2]。也称组成蛋白质组学,是对基因组中编码的所有蛋白质及其各种结构的全景研究。蛋白质的一级结构通常可通过基因组序列的整个开放阅读框(ORF)预测,结晶蛋白质的空间结构则可使用X射线衍射等技术进行研究,蛋白的鉴定、测序可通过质谱法实现,并可进一步研究其磷酸化和糖基化修饰。(2)功能蛋白质组学[3]。功能蛋白质组学在某特定时间、某特定环境条件下对蛋白质进行研究,是蛋白质组研究中的重要环节,也是沟通生物大分子水平到细胞水平的桥梁研究。其主要采用基于蛋白质双向电泳串联质谱的技术路线,并结合融合蛋白等体内表达的特定方法。(3)活性蛋白之间的相互作用[4]。包括蛋白质和核酸之间的相互作用,蛋白质之间相互作用的能力和特征,以及全细胞蛋白质网络的构建,是用以理解细胞内各种事件的传导和调节的关键。主要使用多种技术检测蛋白质相互作用,如免疫共沉淀、交联反应、蛋白质芯片亲和印迹、亲和层析、酵母双杂交、荧光能量共振转移、表面等离子体共振等技术,提供有关全细胞或生物体中蛋白质相互作用的总体定量信息[5]。 展开更多
关键词 双向凝胶电泳 质谱 血清蛋白组 抗体芯片 综述
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应用比较蛋白组学技术筛选乳腺癌血清标志物 被引量:3
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作者 向明钧 方先松 +1 位作者 马明星 谭德勇 《云南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期479-483,共5页
为了寻找乳腺癌血清标志蛋白标志物,本研究用试剂盒去除血清样品中的高丰度蛋白,通过固相pH梯度双向凝胶电泳分离乳腺癌病人血清和非乳腺癌血清,银染显色,分析比较电泳图谱寻找差异蛋白.用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱测定差异蛋... 为了寻找乳腺癌血清标志蛋白标志物,本研究用试剂盒去除血清样品中的高丰度蛋白,通过固相pH梯度双向凝胶电泳分离乳腺癌病人血清和非乳腺癌血清,银染显色,分析比较电泳图谱寻找差异蛋白.用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱测定差异蛋白的肽指纹图谱,MASCOT软件分析确定为何种蛋白,然后用蛋白印迹验证与乳腺癌发生关系密切的差异蛋白.本研究获得了分辨率高、重复性好的双向电泳银染图谱,得到3个差异明显的蛋白,经肽指纹分析并结合数据库查询,初步鉴定为人血凝级联反应中的关键酶、人体细胞凋亡蛋白抑制剂样蛋白ILP-2、人体HP蛋白.蛋白印迹研究表明ILP-2在乳腺癌血清中的含量明显高于非乳腺癌血清样本,该蛋白有可能是乳腺癌标志物. 展开更多
关键词 乳腺癌 血清比较蛋白组 双向凝胶电泳 质谱分析 蛋白印迹
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一维凝胶电泳图谱数字化定量比较法的建立及验证 被引量:1
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作者 胡蝶飞 李国坚 +2 位作者 吴继周 臧宁 宁秋悦 《内科》 2011年第1期1-4,共4页
目的探讨凝胶定量软件Quantity One用于血清差异蛋白质组学研究的可行性。方法运用凝胶成像系统中的定量软件Quantity One对各电泳图上的各条带进行定量分析,将图形结果转换为数据结果;用上述技术分别对健康体检者和肝癌病人各32份除高... 目的探讨凝胶定量软件Quantity One用于血清差异蛋白质组学研究的可行性。方法运用凝胶成像系统中的定量软件Quantity One对各电泳图上的各条带进行定量分析,将图形结果转换为数据结果;用上述技术分别对健康体检者和肝癌病人各32份除高丰度蛋白的血清电泳图进行分析,验证该研究方法的可行性。结果两组间有10个条带差异具有统计学意义(P<0.05)。通过文献检索,其中9条找到相对应分子量的HCC标志物。结论凝胶定量软件QuantityOne可量化处理电泳条带的分子量和灰度;一维凝胶电泳技术可用于血清差异蛋白初期比较研究。 展开更多
关键词 血清蛋白组 SDS-PAGE Quantity One软件 原发性肝细胞癌
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二噁英慢性低剂量暴露对雌性SD大鼠血清蛋白的影响
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作者 陈曦 汤乃军 +4 位作者 马世伟 马晓明 赵力军 刘静 张春梅 《中国工业医学杂志》 CAS 北大核心 2009年第3期163-167,F0003,共6页
目的对慢性低剂量暴露于2,3,7,8-四氯二苯并二噁英(TCDD)的雌性SD大鼠血清蛋白改变进行研究,对TCDD毒性效应作进一步阐述。方法雌性SD大鼠随机分为3个染毒组和1个对照组[(n=8只/组,0 ng/(kg.d)、20 ng/(kg.d)、50 ng/(kg.d)、125 ng/(kg... 目的对慢性低剂量暴露于2,3,7,8-四氯二苯并二噁英(TCDD)的雌性SD大鼠血清蛋白改变进行研究,对TCDD毒性效应作进一步阐述。方法雌性SD大鼠随机分为3个染毒组和1个对照组[(n=8只/组,0 ng/(kg.d)、20 ng/(kg.d)、50 ng/(kg.d)、125 ng/(kg.d)],灌胃染毒29周,采用双向凝胶电泳和基质辅助激光解吸飞行时间串联质谱技术对大鼠血清进行蛋白组学研究,寻找差异蛋白点,并对其肝脏进行组织病理学检测。结果上调的蛋白包括补体C4,载脂蛋白A-Ⅳ前体和低分子量的激肽原前体;触珠蛋白和补体C3仅在染毒组大鼠凝胶中被识别,而对照组未见;而α-抑制因子Ⅲ前体只在对照组的胶上被识别。肝脏组织病理学检测显示染毒组大鼠肝脏出现肝细胞的脂肪变性、空泡形成、肝细胞坏死等改变,并且随染毒剂量的增加严重程度增加。结论慢性低剂量染毒使得血清蛋白谱发生改变,所改变的蛋白质与TCDD的免疫毒性、肝毒性、氧化应激等效应有关。血清差异蛋白可为TCDD毒作用分子标志物的筛选提供依据。 展开更多
关键词 2 3 7 8-四氯二苯并二噁英 血清蛋白组 基质辅助激光解吸飞行时间串联质谱 双向电泳
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药物处理心肌缺血大鼠有效性的研究
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作者 郭庆 谭德勇 《昆明师范高等专科学校学报》 2005年第4期56-60,共5页
现代生物学表明,所有生物性状的变化是基因表达变化的结果.双向电泳是目前蛋白质常规分析技术中分辨率较高的方法.采用双向电泳技术分析了正常大鼠、心肌缺血模型大鼠、药物处理后的大鼠的血清蛋白组的差异,从而探讨利用双向电泳技术分... 现代生物学表明,所有生物性状的变化是基因表达变化的结果.双向电泳是目前蛋白质常规分析技术中分辨率较高的方法.采用双向电泳技术分析了正常大鼠、心肌缺血模型大鼠、药物处理后的大鼠的血清蛋白组的差异,从而探讨利用双向电泳技术分析药物处理的有效性. 展开更多
关键词 药物有效性 双向电泳 分析模式 大鼠 血清蛋白组
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循环生物标志物在脑胶质瘤诊治中的应用进展
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作者 宋钰辉 王忠 《中国临床神经外科杂志》 2023年第8期530-532,共3页
胶质瘤是中枢神经系统最为常见的原发性肿瘤,占40%~50%。脑胶质瘤具有复发率高、病死率高、治愈率低的特点。胶质瘤的诊断、分型和治疗一直是临床研究的热点。近年来,研究发现一些与胶质瘤发生、发展有关的循环生物标志物,是以血液和血... 胶质瘤是中枢神经系统最为常见的原发性肿瘤,占40%~50%。脑胶质瘤具有复发率高、病死率高、治愈率低的特点。胶质瘤的诊断、分型和治疗一直是临床研究的热点。近年来,研究发现一些与胶质瘤发生、发展有关的循环生物标志物,是以血液和血清为主要来源,并对胶质瘤的诊断及预后可以做出更加准确的判断。本文对循环生物标志物在脑胶质瘤诊治中的应用进展作一综述。 展开更多
关键词 胶质瘤 循环生物标志物 血清蛋白组 循环肿瘤细胞
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