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补体蛋白C3c与抑制剂Compstatin的结合自由能计算
1
作者
杨威
张峰
+1 位作者
马志
郑俊峰
《大连海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期154-159,共6页
采用分子动力学模拟取样,运用MM-PBSA方法计算了人类C3c-Compstatin复合物的结合自由能。通过能量分解方法探究了人类补体蛋白C3c上抑制剂结合域MG4~MG5(巨球蛋白区域)上的主要残基与配体Compstatin纤维蛋白之间的相互作用和识别。结...
采用分子动力学模拟取样,运用MM-PBSA方法计算了人类C3c-Compstatin复合物的结合自由能。通过能量分解方法探究了人类补体蛋白C3c上抑制剂结合域MG4~MG5(巨球蛋白区域)上的主要残基与配体Compstatin纤维蛋白之间的相互作用和识别。结果表明:C3c与补体抑制剂Compstatin的理论结合自由能(-8.06 kcal/mol)与试验值(-6.72 kcal/mol)吻合较好,分子内能总和(-177.24 kcal/mol)对补体抵制剂的结合贡献最大,其次为真空静电作用能(-108.74 kcal/mol)和范德华作用能(-68.51kcal/mol)。作为对结晶试验的补充,进行了C3c蛋白和小分子抑制剂之间结合的动态过程以及在两者结合的影响下蛋白形态变化的分子动力学模拟,结果发现C3c上的残基ARG459、ASP491、MET457和Compsta-tin上的残基TRP7、TRP4、HIS10为结合自由能作出了主要贡献。该结果对进一步研究C3补体抑制剂的机制提供了结构方面的信息。
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关键词
分子动力学
MM-PBSA
GBSA方法
结合自由能
补体蛋白c3
c
结合肽
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职称材料
茶皂素抑制慢性系统性炎症诱导的小鼠脑内补体C3表达上调
被引量:
1
2
作者
张熠超
孙凯丽
+1 位作者
谷莉
宋丹
《解剖科学进展》
CAS
2022年第2期173-176,共4页
目的 研究茶皂素对慢性系统性炎症诱导的小鼠脑内小胶质细胞激活和补体C3表达的影响。方法将小鼠随机分为对照组、脂多糖(LPS)组、茶皂素(TS)组和LPS+TS组。应用免疫荧光染色法观察小鼠脑内Iba-1阳性细胞数量;ELISA和荧光定量PCR法检测...
目的 研究茶皂素对慢性系统性炎症诱导的小鼠脑内小胶质细胞激活和补体C3表达的影响。方法将小鼠随机分为对照组、脂多糖(LPS)组、茶皂素(TS)组和LPS+TS组。应用免疫荧光染色法观察小鼠脑内Iba-1阳性细胞数量;ELISA和荧光定量PCR法检测补体C3蛋白水平及mRNA表达的变化。结果 LPS给药后可引起外周血、脑皮层C3水平迅速增高, LPS停药后14d小鼠前额皮质Iba-1阳性细胞数量及补体C3蛋白和mRNA表达增加,发生时间较外周C3水平变化延后。而茶皂素预处理对LPS诱导的小鼠前额皮质Iba-1阳性细胞数量及补体C3蛋白和mRNA表达增加有明显的抑制作用。结论 茶皂素抑制LPS诱导的神经炎症作用与抑制脑内补体C3mRNA表达相关。
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关键词
茶皂素
脂多糖
补体蛋白c3
小胶质细胞
慢性系统性炎症
小鼠
原文传递
题名
补体蛋白C3c与抑制剂Compstatin的结合自由能计算
1
作者
杨威
张峰
马志
郑俊峰
机构
大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室
出处
《大连海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期154-159,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(3047132)
文摘
采用分子动力学模拟取样,运用MM-PBSA方法计算了人类C3c-Compstatin复合物的结合自由能。通过能量分解方法探究了人类补体蛋白C3c上抑制剂结合域MG4~MG5(巨球蛋白区域)上的主要残基与配体Compstatin纤维蛋白之间的相互作用和识别。结果表明:C3c与补体抑制剂Compstatin的理论结合自由能(-8.06 kcal/mol)与试验值(-6.72 kcal/mol)吻合较好,分子内能总和(-177.24 kcal/mol)对补体抵制剂的结合贡献最大,其次为真空静电作用能(-108.74 kcal/mol)和范德华作用能(-68.51kcal/mol)。作为对结晶试验的补充,进行了C3c蛋白和小分子抑制剂之间结合的动态过程以及在两者结合的影响下蛋白形态变化的分子动力学模拟,结果发现C3c上的残基ARG459、ASP491、MET457和Compsta-tin上的残基TRP7、TRP4、HIS10为结合自由能作出了主要贡献。该结果对进一步研究C3补体抑制剂的机制提供了结构方面的信息。
关键词
分子动力学
MM-PBSA
GBSA方法
结合自由能
补体蛋白c3
c
结合肽
Keywords
mole
c
ular dynami
c
s
MM-PBSA/GBSA method
binding free energy
c
ompliment
c
3
c
c
ompstatin
分类号
R331 [医药卫生—人体生理学]
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职称材料
题名
茶皂素抑制慢性系统性炎症诱导的小鼠脑内补体C3表达上调
被引量:
1
2
作者
张熠超
孙凯丽
谷莉
宋丹
机构
中国医科大学药学院中心实验室
中国医科大学药学院中药与生药学教研室
出处
《解剖科学进展》
CAS
2022年第2期173-176,共4页
基金
辽宁省自然科学基金(20180550571)。
文摘
目的 研究茶皂素对慢性系统性炎症诱导的小鼠脑内小胶质细胞激活和补体C3表达的影响。方法将小鼠随机分为对照组、脂多糖(LPS)组、茶皂素(TS)组和LPS+TS组。应用免疫荧光染色法观察小鼠脑内Iba-1阳性细胞数量;ELISA和荧光定量PCR法检测补体C3蛋白水平及mRNA表达的变化。结果 LPS给药后可引起外周血、脑皮层C3水平迅速增高, LPS停药后14d小鼠前额皮质Iba-1阳性细胞数量及补体C3蛋白和mRNA表达增加,发生时间较外周C3水平变化延后。而茶皂素预处理对LPS诱导的小鼠前额皮质Iba-1阳性细胞数量及补体C3蛋白和mRNA表达增加有明显的抑制作用。结论 茶皂素抑制LPS诱导的神经炎症作用与抑制脑内补体C3mRNA表达相关。
关键词
茶皂素
脂多糖
补体蛋白c3
小胶质细胞
慢性系统性炎症
小鼠
Keywords
teasaponin
lipopolysa
c
c
haride
c
omplement
c
omponent
3
mi
c
roglia
c
hroni
c
systemi
c
inflammation
mouse
分类号
R741.02 [医药卫生—神经病学与精神病学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
补体蛋白C3c与抑制剂Compstatin的结合自由能计算
杨威
张峰
马志
郑俊峰
《大连海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
0
下载PDF
职称材料
2
茶皂素抑制慢性系统性炎症诱导的小鼠脑内补体C3表达上调
张熠超
孙凯丽
谷莉
宋丹
《解剖科学进展》
CAS
2022
1
原文传递
已选择
0
条
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参考文献
引证文献
统计分析
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