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采用网络药理学和分子对接技术探讨“补肾解毒散结方”治疗结直肠癌的潜在分子机制
1
作者
蔡云梅
李荣梅
+3 位作者
何思宇
张荣平
于浩飞
张兰春
《中医肿瘤学杂志》
2022年第4期21-29,共9页
目的 采用网络药理学与分子对接技术,探讨“补肾解毒散结方”治疗结直肠癌(Colorectal cancer,CRC)的潜在分 子作用机制。方法 采用网络药理学与分子对接技术,利用 TCMSP、PubChem、Swiss Target Prediction数据库检索“补肾解 毒散结...
目的 采用网络药理学与分子对接技术,探讨“补肾解毒散结方”治疗结直肠癌(Colorectal cancer,CRC)的潜在分 子作用机制。方法 采用网络药理学与分子对接技术,利用 TCMSP、PubChem、Swiss Target Prediction数据库检索“补肾解 毒散结方”主要组方生地黄、女贞子、肉苁蓉和山慈菇的活性成分及潜在靶点,通过 Genecards、OMIM数据库检索结直肠 癌的治疗靶点。利用 Venny2.1.0软件构建药物与疾病交集靶点,STRING数据库建立靶点蛋白相互作用关系,Cytoscape3.6.1 软件构建“药物-活性成分-靶点”网络。基于 Bioconductor数据库运用 R语言分析软件对核心靶点进行 GO功能分析和 KEGG 通路富集分析。通过 AutoDockTools-1.5.6等软件预测核心靶点与核心成分的分子对接。结果 “补肾解毒散结方”共有 20种 活性成分和 37个“药物-疾病”交集靶点。GO功能分析得到 957条生物学过程、20个细胞组分、76个分子功能,KEGG富 集分析得到涉 HIF-1、PI3K-Akt、病毒感染、p53、细胞凋亡等 102条信号通路,同时,分子对接结果初步验证了核心靶点 AR、BCL2、CASP3、CASP9、PPARG、PRSS1等与山奈酚、木犀草素、槲皮素等活性成分间具有较好的结合活性。结论 “补肾解毒散结方”可能通过活性成分山奈酚、木犀草素、槲皮素与 AR、BCL2、CASP3、CASP9、PPARG、PRSS1等靶蛋白 结合发挥防治结直肠癌的作用,为结直肠癌的治疗研究和临床应用提供了理论依据。
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关键词
补肾解毒结散方
结
直肠癌
网络药理学
分子对接
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采用网络药理学和分子对接技术探讨“补肾解毒散结方”治疗结直肠癌的潜在分子机制
1
作者
蔡云梅
李荣梅
何思宇
张荣平
于浩飞
张兰春
机构
昆明医科大学实验动物学部
昆明医科大学基础医学院
云南中医药大学
昆明医科大学药学院暨云南省天然药物药理重点实验室
出处
《中医肿瘤学杂志》
2022年第4期21-29,共9页
基金
云南省王新华专家工作站(编号:202005AF150043)。
文摘
目的 采用网络药理学与分子对接技术,探讨“补肾解毒散结方”治疗结直肠癌(Colorectal cancer,CRC)的潜在分 子作用机制。方法 采用网络药理学与分子对接技术,利用 TCMSP、PubChem、Swiss Target Prediction数据库检索“补肾解 毒散结方”主要组方生地黄、女贞子、肉苁蓉和山慈菇的活性成分及潜在靶点,通过 Genecards、OMIM数据库检索结直肠 癌的治疗靶点。利用 Venny2.1.0软件构建药物与疾病交集靶点,STRING数据库建立靶点蛋白相互作用关系,Cytoscape3.6.1 软件构建“药物-活性成分-靶点”网络。基于 Bioconductor数据库运用 R语言分析软件对核心靶点进行 GO功能分析和 KEGG 通路富集分析。通过 AutoDockTools-1.5.6等软件预测核心靶点与核心成分的分子对接。结果 “补肾解毒散结方”共有 20种 活性成分和 37个“药物-疾病”交集靶点。GO功能分析得到 957条生物学过程、20个细胞组分、76个分子功能,KEGG富 集分析得到涉 HIF-1、PI3K-Akt、病毒感染、p53、细胞凋亡等 102条信号通路,同时,分子对接结果初步验证了核心靶点 AR、BCL2、CASP3、CASP9、PPARG、PRSS1等与山奈酚、木犀草素、槲皮素等活性成分间具有较好的结合活性。结论 “补肾解毒散结方”可能通过活性成分山奈酚、木犀草素、槲皮素与 AR、BCL2、CASP3、CASP9、PPARG、PRSS1等靶蛋白 结合发挥防治结直肠癌的作用,为结直肠癌的治疗研究和临床应用提供了理论依据。
关键词
补肾解毒结散方
结
直肠癌
网络药理学
分子对接
Keywords
Bushen Jiedu Sanjie Recipe
colorectal cancer
network pharmacology
molecular docking
分类号
R735.3 [医药卫生—肿瘤]
R730.52 [医药卫生—肿瘤]
R273 [医药卫生—中西医结合]
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作者
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1
采用网络药理学和分子对接技术探讨“补肾解毒散结方”治疗结直肠癌的潜在分子机制
蔡云梅
李荣梅
何思宇
张荣平
于浩飞
张兰春
《中医肿瘤学杂志》
2022
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