精子相关抗原9B细胞及T细胞表位富集区预测

目的:预测人精子相关抗原9(SPAG-9)的表位富集区。方法:以SPAG-9的全长序列为基础,利用生物信息学软件,采用Hopp&Woods的亲水性方案、Zimmerman极性参数和Jameson-Wolf抗原指数方案和Emini表面可及性方案,并结合SPAG-9的二级结构与其柔性区域及跨膜区域对SPAG-9的优势B表位进行综合分析,进一步运用抗原指数分析预测SPAG-9的B细胞表位。同时,分别应用SYFPEITHI、NetCTL以及IEDB预测HLA-A2、HLA-A24限制的CTL表位。最后,综合B细胞表位和CTL表位,预测SPAG-9的表位富集区。结果:经综合分析,SPAG-9的B细胞优势表位可能存在于N端的197-201,236-243,249-253,291-299,306-312,324-327,332-337,348-352,488-494,539-542,546-550,565-573,699-702,802-807,869-873,875-880,882-887,1 173-1 178,1 195-1 200区段。其HLA-A2限制的CTL表位肽为19-27,49-57,50-58,56-64,343-351,381-389,413-421,447-455,521-529,551-559,665-673,733-741,837-845,926-934,950-958,964-972,998-1 006,1 016-1 024,1 094-1 102,1 140-1 148,1 150-1 158区段,HLA-A24限制的CTL表位肽为31-39,137-145,517-525,943-951。综合B表位与CTL表位,SPAG-9的332-352与551-573区段,即SAENEEKSEVQAIIESTPELD、SIWQFFSRLFSSSSNTTKKPEPP肽段是SPAG-9的表位富集区。结论:利用生物信息学预测发现SPAG-9抗原的332-352与551-573为SPAG-9的表位富集区。

T细胞功能学与结构免疫学结合方法鉴定HLA—A2限制性的细胞毒性T淋巴细胞表位富集区

T细胞表位在抗病毒的T细胞免疫中发挥核心作用，目前已在多种病原微生物的蛋白序列上发现存在T细胞表位的聚集现象。本文建立了一套功能学与结构学结合的策略鉴定病原体上细胞毒性T细胞（Cytotoxic T Lymphocyte，CTL）表位富集区的方法，并以严重急性呼吸道综合征（SARS）相关冠状病毒（SARS．CoV）的M蛋白为例，成功地鉴定了一个HLA—A2限制性的表位富集区。首先通过生物信息学的方法预测并合成M蛋白跨膜区的HLA—A2潜在结合多肽，通过体外复性实验和T2细胞结合实验验证多肽与HLA．A2的结合力；然后在HLA—A2．1／Kb转基因小鼠中检测这些多肽的免疫原性；最后通过x射线衍射技术，成功解析了其中一条多肽与HLA—A＊0201的复合物结构，其结构显示该多肽具有典型的HLA—A＊0201表位的结构特点，但却呈现出与以往鉴定多肽不同的构象和锚定残基。本文对于理解机体对SARS—CoV等病原体产生的T细胞免疫反应，以及为更广泛的人群设计T细胞疫苗具有重要意义。

T细胞功能学与结构免疫学结合方法鉴定HLA-A2限制性的细胞毒性T淋巴细胞表位富集区

T细胞表位在抗病毒的T细胞免疫中发挥核心作用,目前已在多种病原微生物的蛋白序列上发现存在T细胞表位的聚集现象。本文建立了一套功能学与结构学结合的策略鉴定病原体上细胞毒性T细胞(Cytotoxic T Lymphocyte,CTL)表位富集区的方法,并以严重急性呼吸道综合征(SARS)相关冠状病毒(SARS-CoV)的M蛋白为例,成功地鉴定了一个HLA-A2限制性的表位富集区。首先通过生物信息学的方法预测并合成M蛋白跨膜区的HLA-A2潜在结合多肽,通过体外复性实验和T2细胞结合实验验证多肽与HLA-A2的结合力;然后在HLA-A2.1/Kb转基因小鼠中检测这些多肽的免疫原性;最后通过X射线衍射技术,成功解析了其中一条多肽与HLA-A*0201的复合物结构,其结构显示该多肽具有典型的HLA-A*0201表位的结构特点,但却呈现出与以往鉴定多肽不同的构象和锚定残基。本文对于理解机体对SARS-CoV等病原体产生的T细胞免疫反应,以及为更广泛的人群设计T细胞疫苗具有重要意义。