表观基因组学在猪遗传育种中的研究进展

生猪产业是我国畜牧业的支柱产业,我国的生猪养殖和猪肉消费量均占全球50%以上,但种猪性能与国外差距较大。因此,培育拥有自主知识产权、性状优良的种猪是保障我国生猪养殖业可持续健康发展的关键,而揭示重要经济性状的遗传机制是猪遗传改良的基础。表观基因组学是在核苷酸序列不发生改变的情况下,研究基因组上的化学修饰和空间结构变化影响基因表达调控和功能的一门学科,近年来在猪遗传育种领域逐步得到广泛应用。表观基因组学在解释分子功能机制、挖掘功能靶点、探究进化过程方面有着突出优势,为研究猪复杂性状和环境适应的生物分子调控机制提供新思路。本文分析和总结了表观基因组学在猪遗传育种领域的研究现状和发展趋势,为阐明猪重要经济性状形成机制提供参考。

基于表观基因组学的DNA元件鉴定方法研究进展

在人类基因组测序已经完成的"后基因组"时代,对基因组序列的功能注释,尤其是各种DNA调控元件的鉴定,已成为进一步理解人类基因组复杂机制的瓶颈问题.最近,针对染色质状态图谱的大规模研究工作,揭示了各类DNA元件特征性的染色质修饰标记.这些研究结果推动了一系列基于有监督和无监督学习的DNA元件预测方法的产生,其中一些方法已经成功应用于多个基因组的DNA元件预测,并且已成为未知基因组的常规注释工具.这些预测方法因其算法特点和预测策略不同而适用于不同类型的DNA元件预测任务.大多数情况下,使用者需要联合使用多个预测方法来达到预测敏感性和特异性的平衡.尽管各类算法在DNA元件预测中都有一些成功的应用,但每一类算法都有其特有的弊端,需要使用者认真避免.本文回顾了前期和当下DNA元件预测方法的主要类型,全面分析了各类方法的优缺点,指出了下一步可以改进的方向.本综述中的分析和观点有助于读者深入理解DNA元件预测算法的主要原则,进而在相关研究中更好地应用这些方法.

肿瘤表观基因组学药物治疗研究进展

表观基因组学(Epigenomics)是在基因组水平上对表观遗传学改变的探讨,与肿瘤相关的表观基因改变主要是DNA甲基化和组蛋白修饰,综述了与肿瘤相关表观基因药物治疗的研究进展。

表观基因组学研究方法进展与评价

表观遗传学是指基于非基因序列改变所致基因表达水平的变化,如DNA甲基化和组蛋白修饰等;表观基因组学则是在基因组水平上对表观遗传学改变的研究。DNA甲基化已经成为表观遗传学和表观基因组学的重要研究内容,人类表观基因组计划的最终目标是绘制出人类基因组中甲基化可变位点图谱。随着研究的不断深入,各种研究方法被开发出来以满足不同类型研究的需要。文章主要介绍目前已有的表观基因组学研究方法,并对其进行简要分析和总结。

视网膜母细胞瘤的治疗、基因组学和表观基因组学研究进展

视网膜母细胞瘤(retinoblastoma,RB)是一种好发于婴幼儿的最常见的眼内恶性肿瘤,严重危害患儿的视力、眼球甚至生命。我国的RB患儿多为高风险晚期,多数患儿不得已采用眼球摘除术,严重影响日后生存质量。RB是第一个发现的与基因改变有关的疾病,视网膜母细胞瘤基因1(RB1)及其等位基因的失活是RB发病的首要原因。近年来研究表明,RB的发生发展与基因组及表观基因组均有很大的关系。现对RB治疗概况及其基因组学、表观基因组学研究进展做一综述。

比较表观基因组学方法来研究基因组调节功能

人类基因组测序产生了大量的基因信息，但是理解每个基因的功能的目标仍未实现。比较表观基因组学（comparative epigenomics）能进行DNA和组蛋白修饰的种间比较，对起调节作用的基因组序列进行标注，该方法能确定基因的作用。

遗传学走进基因组学和表观基因组学时代

2014年7月,"第34届国际动物遗传学大会"在我国召开,1300多名中外代表出席会议。本专题从动物基因组学与表观基因组学新技术应用、鸡基因组学与表观基因组学研究、鸭基因组学研究及特禽基因组学研究等五个方面对大会部分专家报告内容进行了呈现。

表观基因组学加速实用化进程陆续发现癌症分子靶标

继表观基因组癌症治疗药物之后，表观基因组癌症诊断药也开始得到实际应用。表观基因组学的研究陆续发现了癌症分子靶标，将人们的注意力吸引到表观基因组药物研制上。表观基因组学、抗体探针、高灵敏度的甲基化组（methylolne）技术开发正在加速。

肿瘤表观基因组学研究进展

多年来遗传学改变一直是肿瘤研究的焦点,近来人们越来越认识到异常表观遗传修饰在肿瘤形成中所起的重要作用。表观遗传修饰包括DNA甲基化、组蛋白修饰等,其变异会导致基因转录异常。表观基因组学是在基因组水平上对表观遗传学改变的研究。文章主要介绍目前已知的肿瘤表观基因组学相关内容,阐述表观遗传修饰与肿瘤的紧密关系及异常表观遗传修饰作为生物标记在肿瘤诊断、预后及治疗方面的最新研究进展。

食用植物成分和中药用于癌症化学预防:Nrf2,表观基因组学,癌症干细胞(英文)

癌症是世界范围内的首要致死原因之一。现代诊断和治疗技术的革新改善了癌症患者的治疗和护理,但晚期癌症的治疗仍然是一个巨大的挑战。因此,亟需新的创造性的策略来防治癌症。几个世纪以来,草药曾被用于防治癌症等疾病。科研资助机构,例如美国的国家癌症研究所(NCI),在近期加强了对利用天然植物成分和非毒性药物如非甾体抗炎药(NSAIDs)预防或减缓癌症发生研究的支持。本文综述了利用来源于蔬果、绿茶和中药的生物活性成分来预防癌症方面的研究,尤其是重点讨论了在Nrf2、表观基因组学和癌症干细胞等方面的影响。

中草药表观基因组学研究现状与展望

表观遗传学的实质是非DNA突变引起可继承表型变化的遗传现象.表观基因组学是在基因组水平研究表观遗传变异的科学.中草药表观基因组学是以药用植物和药用真菌为研究对象,利用分子生物学、生物信息学及"组学"相关技术,在全基因组水平上,对表观遗传修饰调控中草药次生代谢、生长发育、胁迫响应的分子机制以及中草药活性成分对生物体表观调控的药理机制进行研究的一门学科,将为解析环境因子在中药材道地性品质形成中的作用机制及中药药理新机制提供理论基础.比较表观遗传学是中草药表观基因组学研究的主要方法.本文综述了中草药表观基因组学的研究现状,探讨并展望了中草药表观基因组学研究相关成果在阐明中药材道地性的生物学实质以及中药药理新机制等方面的理论意义和应用前景.

环境基因组学和环境表观基因组学

陈学敏教授和杨克敌教授主编的《现代环境卫生学》（第二版）第六章作了简明的阐述：随着人类基因组计划（HGP）的深入开展，环境科学与人类基因组计划交叉融合，以探讨人群中环境污染所致健康损害的差异性，即遗传因素的基因多态性，并深入研究环境．基因、基因一基因交互作用，其目标是研究遗传变异如何影响机体对环境因素的反应。环境表观基因组学是从基因水平探讨环境因素表观遗传效应及其对表达的影响。

操控基因开关治疗疾病 治疗癌症和肥胖的新王牌“表观基因组学”

20世纪70年代，出现了改变生命遗传信息（基因组）的“转基因”技术。90年代，仅对基因组的某个特定部位进行操作的“基因组编辑”技术登场。这种技术用时短、操作简便，而且能够高效地改变基因。时至今日，科学家们已经在尝试运用基因组编辑技术，在不改变基因本身的情况下，通过操纵基因的开关来调控基因的表达，这一技术被称为“表观基因组编辑”，目前正处在研究开发的阶段。如果能将表观基因组编辑运用于医疗的话，就有可能成为治疗癌症等疾病的新王牌。本文将介绍万众期待的表观基因组编辑技术。

人类表观基因组计划

DNA甲基化所致基因表观遗传学转录失活已经成为肿瘤表观基因组学研究的重点内容。基因组水平上研究DNA甲基化模式对于肿瘤疾病的诊断、治疗和预后判断具有重要的实用价值。为此 ,人类表观基因组协会(HEC)于 2 0 0 3年宣布正式启动为期五年的人类表观基因组计划 (HEP)。HEP的实施标志着人类表观基因组学研究又跨上了一个新台阶。

周围神经损伤后再生的表观遗传学调控机制研究进展

周围神经损伤反应及影响再生的表观遗传学机制尚未被阐明。本文着眼于表观遗传学调控机制,从DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA等方面对周围神经损伤后再生的表观遗传学调控机制进行综述,为优化周围神经损伤后再生的临床治疗提供基础知识。

第十九届全国植物基因组学大会成功召开

第十九届全国植物基因组学大会于2018年8月19-22日在四川成都成功召开。大会由中国遗传学会植物遗传与基因组学专业委员会主办,四川农业大学和中国科学院遗传与发育生物学研究所承办。大会主席为张启发院士、执行主席为杨维才研究员、秘书长为李平教授。来自国内外162所高校和科研院所以及19个企业的1100余名代表参会。在为期三天的会议中,与会代表就基因组测序与新技术、功能基因组、蛋白质组代谢组与生物信息、基因组多样性、表观遗传学和表观基因组学、转基因技术和分子育种等6个专题进行了广泛深入的交流和讨论。大会安排了口头报告45个,其中国外特邀报告6个、国内特邀报告3个、重要报告30个、学生报告6个。大会共收到摘要194篇,展示墙报79份。

基因组测序技术及其应用研究进展

基因组测序技术从第1代Sanger测序经第2代高通量测序已发展到第3代单分子测序,第2代高通量测序技术是当前基因组测序中最主要的分析技术。对高通量测序技术在全基因组de novo测序、全基因组重测序、简化基因组测序、宏基因组测序分析和表观基因组学研究等领域的应用原理、步骤及现状进行综述,以为基因组测序技术的应用提参考。