拟南芥SUPERMAN基因表观突变的研究进展

本文综述了拟南芥SUPERMAN基因表观突变体clarkkent(clk)的表型、基因型、DNA甲基化及表观突变机制等方面的研究进展。主要研究结果有:clk是SUPERMAN(SUP)的等位基因,能遗传但不稳定,其对称位点(CpG和CPXPG)和非对称位点的胞嘧啶高度甲基化,伴随着SUP转录水平的下降;CpG和CPXPG胞嘧啶甲基转移酶分别是METHYLTRANSFERASE1(MET1)和受KRYPTONITE基因调控的CHROMOMETHYLASE3(CMT3)。

胚系表观突变与人类肿瘤

表观突变是指表观遗传调控出现错误,导致正常情况下表达的基因沉默或者正常情况下沉默的基因转录表达。表观突变通常被认为是局部体细胞事件,一般只存在于病变组织。但是,最近几年关于遗传性非息肉性结直肠癌的研究发现,在部分患者中,所有检测的正常组织均存在MLH1单等位基因启动子区域CpG岛甲基化,并证实这种异常甲基化是肿瘤形成的病因。随后,关于其他抑癌基因MSH2与BRCA1等的胚系异常甲基化也陆续有报道。这提示,表观突变也可以起源于胚系(生殖细胞形成期或胚胎发育早期),从而造成全身细胞广泛的基因转录沉默。这种胚系表观突变类似于经典的基因胚系序列突变,可能成为人类疾病发生的病因。本文着重对近年来抑癌基因胚系表观突变研究进展作一综述,探讨胚系表观突变可能的产生机制和代间遗传的可能性,并展望其给人类疾病病因研究所带来的深远影响。

老年急性髓系白血病分子学特征及临床意义

目的:研究老年急性髓系白血病(AML)患者分子学特征及临床意义。方法:借助双脱氧链终止测序方法研究52例老年AML患者的分子学特征,结合临床资料分析51个血液病相关基因的突变情况及临床意义,并对39例接受DCAG方案化疗的患者进行疗效分析。结果:老年AML患者有较高的突变频率[98.1%(51/52)],不同的突变基因之间存在一些共存或互斥现象。突变个数随着年龄增长而增加,表观遗传学突变DNMT3A、TET2(P<0.01)及FLT3-ITD(P<0.05)发生率亦随着年龄增长而增高。c-KIT突变在低危核型组AML最常见(P<0.01),而NPM1和DNMT3A等突变则常见于中危组(P<0.05),尤其在核型正常的AML中多见。接受DCAG方案化疗的老年AML患者有较高的完全缓解率[71.8%(28/39)]。结论:老年AML患者具有特定的分子学特征,甲基化相关基因突变发生率较高,这对临床诊疗有一定的指导意义。

Russel Silver综合征19例病例系列报告

目的总结分析经甲基化特异性多重链接探针扩增技术(MS-MLPA)确诊的Russel Silver综合征(RSS)患儿的临床特征、基因型(表观突变)以及表型和基因型的相关性,旨在提升对该病的认识。方法收集2015年1月1日至2019年6月30日复旦大学附属儿科医院(我院)分子医学中心经MS-MLPA确诊的RSS连续病例的临床资料。MS-MLPA行11p15区域甲基化和拷贝数变异(CNV)情况检测,应用Gene Marker软件对实验数据进行均一化处理及结果判读。结果19例RSS患儿,女8例,男11例,确诊年龄中位数3.3岁(3月龄至10岁)。小于胎龄儿18例,就诊时18例患儿身高均低于同龄儿童身高P3,体重均低于同龄儿童体重P10。特殊面容发生率较高的表型有前额突出9例,三角脸7例,肢体不对称和手指短或内侧弯曲6例,小下颌5例。其他表现包括眼距宽、低耳位、高腭弓、牙齿突出、胸廓畸形、脊柱侧凸和房间隔缺损等。19例RSS患儿有3例检测到携带11p15区域拷贝数重复,余16例均显示H19-DMR低甲基化且无CNV。结论有宫内和出生后生长发育迟缓、肢体不对称和特殊面容的儿童,应注意RSS的可能,首选MS-MLPA检测,以利于及早干预和遗传咨询。

急性髓系白血病患者表观遗传学修饰基因突变的分析

目的探讨急性髓系白血病(AML)患者表观遗传学修饰基因突变(EMMs)的携带率及其临床特征。方法选取2011年5月至2021年2月于连云港市第一人民医院初诊的172例AML患者为研究对象。应用二代测序技术检测42种髓系基因的变异情况,回顾性分析EMMs患者的临床及分子学特征,以及去甲基药物(HMAs)对其生存的影响。结果在172例初诊的AML患者中,71例(41.28%)携带EMMs[EMMs(+)],变异基因分别为TET2(14.53%,25/172)、DNMT3A(11.63%,20/172)、ASXL1(9.30%,16/172)、IDH2(9.30%,16/172)、IDH1(8.14%,14/172)、EZH2(0.58%,1/172)。EMMs(+)患者的外周血血红蛋白低于EMMs(-)患者(72 g/L vs.88 g/L,Z=-1.985,P<0.05)。老年AML患者的EMMs(+)携带率显著高于青年患者[71.11%(32/45)vs.30.70%(39/127),χ^(2)=22.38,P<0.001]。EMMs与NPM1基因变异呈正相关(r=0.413,P<0.001),与CEPBA基因双变异呈负相关(r=-0.219,P<0.05)。EMMs(+)的预后中危AML患者中,与常规化疗方案相比,含HMAs的化疗方案可以延长患者中位无进展生存时间(PFS)及中位总生存时间(OS)(PFS:11.5个月vs.25.5个月,P<0.05;OS:12.5个月vs.27个月,P<0.05)。在老年患者中,与常规方案相比,含HMAs化疗方案也可延长中位PFS及中位OS(PFS:4个月vs.18.5个月,P<0.05;7个月vs.23.5个月,P<0.05)。结论AML患者的EMMs携带率较高,含HMAs的化疗方案可以延长预后中危及老年AML患者的生存,对AML的个体化治疗有一定的指导意义。

急性髓系白血病表观遗传学的靶向治疗：第56届美国血液学会年会报道

急性髓系白血病（AML）是一组基因改变导致的造血干细胞克隆性增殖失调的异质性疾病。尽管根据细胞遗传学、分子遗传学和临床表现等特征进行分层治疗可以提高年轻AML患者的治疗效果，但是老年AML患者的总体生存率仍然较差。最近几年，新一代测序技术已经证实在大部分AML患者中编码参与转录表观调节蛋白的基因频发突变，这促使人们对AML患者的表观基因组有了新的认识，并使针对表观突变基因的靶向治疗成为可能。文章介绍第56届美国血液学会（ASH）年会关于AML常见的表观遗传学基因突变及其重要作用、表观突变基因潜在的治疗靶点和去甲基化药物的临床运用等。

急性髓系白血病中表观遗传学的研究进展

急性髓系白血病(AML)是某种基因改变导致的基因功能不可逆性改变,造成白血病细胞异常增殖、分化障碍、凋亡异常等,从而引起白血病的发生、发展.表观遗传学是指所研究的基因在序列不发生改变的情况下,却发生了可遗传基因表达的改变.目前有大量研究数据表明,AML发病与表观遗传学的调控密切相关.表观遗传修饰在细胞代谢、免疫微环境和免疫应答中的调控作用越来越受到重视,文章将系统阐述表观遗传学在AML细胞代谢、免疫微环境和免疫应答中的调控作用,以及针对性干预治疗措施的研究进展.