番茄筋腐病抗感材料果实中CAD基因的表达与分析

以筋腐病易感高代自交系C285和抗病高代自交系P31的果实为材料,研究了番茄果实不同发育时期木质素含量的差异、果实中CAD基因的预测及2个CAD基因的相对表达。结果表明,C285果实中木质素含量在转色期时达到峰值,红熟期略有降低,而P31果实中的木质素含量在绿熟期、转色期及红熟期变化较小,绿熟期含量最低、红熟期最高;利用拟南芥CAD基因作为参考基因,在番茄中共查询到5个CAD旁系同源基因,且在核酸水平与拟南芥中同源基因间的一致性为66.7%;5个CAD基因在2份材料中存在13个突变位点,其中Solyc01g107590(CAD590)和Solyc03g078440(CAD440)突变位点较多;CAD590和CAD440在P31的绿熟期和转色期相对表达量较为稳定,在红熟期则大幅升高,而2个基因在C285中则均呈下降趋势,其中CAD440降幅更大;绿熟期CAD590和CAD440在C285中相对表达量与P31相比分别高出2倍和5倍,转色期P31中CAD590和CAD440则分别高于C285同期的表达量,其增幅分别为44.4%、130%、170%;而红熟期2个基因的相对表达量在P31材料中差异较小。因此推断CAD基因的表达与木质素含量之间存在一定关系。

甘蓝型油菜BnABCG8基因的克隆及表达分析

甘蓝型油菜是重要的油料作物之一,随着对油脂需求的日益增加,高含油量油菜育种有着很重要的现实意义。本研究克隆了甘蓝型油菜BnABCG8基因,全长1 722 bp,编码573个氨基酸。通过生物信息学分析,发现BnABCG8蛋白是一类典型的半分子ABC转运蛋白,具有"NBD-TMD"排列的结构域特点。系统进化分析表明,BnABCG8与拟南芥ABCG(WBC)亚家族亲缘关系较近。半定量PCR以及荧光定量PCR发现,BnABCG8基因在甘蓝型油菜根、茎、叶、花以及长角果等不同部位均有表达,在长角果中表达量最高,意味着BnABCG8极有可能参与脂质的运输调控植物的生长发育。

Oncomine数据库在肿瘤研究中的应用

Oncomine是目前世界上最大的癌基因芯片数据库和综合数据挖掘平台之一,该数据库整合了GEO、TCGA和已发表文献来源的RNA和DNA-seq数据。数据库目前含有715个基因表达数据集(datasheet)、86 733个人体肿瘤组织和正常组织样本的信息,且有新的数据不断更新。Oncomine数据库囊括的肿瘤类型有19种,包括:膀胱癌、脑/中枢神经系统肿瘤、乳腺癌、宫颈癌、结直肠癌、食管癌、胃癌、头/颈肿瘤、肾癌、白血病、肝癌、肺癌、淋巴瘤、黑色素瘤、骨髓瘤、卵巢癌、胰腺癌、前列腺癌、肉瘤。本文就如何利用Oncomine数据库,进行肿瘤组织中癌基因表达差异性分析以及基因共表达分析、癌基因在肿瘤组织中的表达及拷贝数分析、多组研究数据集的荟萃分析(metaanalysis)、以及癌基因表达与患者生存率关系等进行分析。通过该数据库可以对肿瘤癌基因进行研究前的筛查,有利于发现新的肿瘤生物标记物或治疗靶点,为临床科学研究奠定一定的理论基础。

地理信息系统名词审定委员会成立会议纪要

地理信息系统是一门跨学科的科学技术,近年来在研究、使用的深度和广度上都有突飞猛进的发展,但名词审定工作却未能跟上学科发展,给学术交流和学科发展造成了一定程度的障碍。尤其在与港、台的交流中这个问题就更显突出。

烟草β-微管蛋白基因NtTubB的克隆及逆境响应分析

为明确烟草NtTubB在烟草中的生物学功能,在烟草K326中同源克隆到1个TubB蛋白基因NtTubB,并对其基因结构、生物信息学预测、进化关系以及逆境下的表达模式进行分析。结果表明,NtTubB基因cDNA全长为2 783 bp,其中开放阅读框2 475 bp,由3个外显子和2个内含子组成,编码443个氨基酸残基组成的亲水蛋白。NtTubB蛋白序列无信号肽和跨膜结构域,存在多个磷酸化位点,主要定位于细胞质中,序列高度保守,尤其是N端序列,含有2个保守结构域(GTPase domain和C-terminal domain),均属于Tubulin/FtsZ family家族。高级结构以α-螺旋和无规卷曲为主。进化分析表明,普通烟草NtTubB的氨基酸序列与林烟草NsTubB高度同源。逆境响应分析表明,NtTubB基因受脱落酸(ABA)、水杨酸(SA)、赤霉素(GA)、茉莉酸甲酯(MeJA)、过氧化氢(H2O2)、高盐、低温和高温诱导,暗示烟草NtTubB基因参与了多种激素和非生物胁迫的应答反应。

20世纪美国黑人女性小说中的人文主义探析——以对现实生活的描写为例

20世纪是妇女运动风起云涌的一个时期,在黑人解放运动和女权运动的大背景下,黑人女性作家们纷纷用自己的手中之笔,写出了一部又一部佳作。她们打破了之前黑人女性们多年的失语现象,创作出了一个个鲜活的黑人女性形象。更为重要的是,这些作品和人物形象包含着黑人女性作家们对于人文主义的追求,展示出了黑人女性们的坚韧、互助和博爱。本文从黑人女性作家作品中对于现实生活描写的角度,分析了她们作品中所蕴含和表达出的人文主义特征。