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人鼻咽癌单克隆细胞株在传代移植的裸鼠体内转移与HLA表达定量的关系
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作者 张钦明 黄剑 +3 位作者 唐慰萍 莫梅英 李飞虹 蔡琼珍 《中国组织化学与细胞化学杂志》 CAS CSCD 2001年第4期434-436,共3页
为了研究人鼻咽癌单克隆细胞裸鼠体内传代转移特性及 HL A的表达变化 ,我们以人鼻咽癌单克隆细胞株 (CNE-2 Z- H5 )为对象 ,将各单克隆细胞株移植于裸鼠 ,待肿瘤发生转移后 ,取其淋巴结和肺转移灶癌细胞再次移植裸鼠 ,如此移植 2 - 4代 ... 为了研究人鼻咽癌单克隆细胞裸鼠体内传代转移特性及 HL A的表达变化 ,我们以人鼻咽癌单克隆细胞株 (CNE-2 Z- H5 )为对象 ,将各单克隆细胞株移植于裸鼠 ,待肿瘤发生转移后 ,取其淋巴结和肺转移灶癌细胞再次移植裸鼠 ,如此移植 2 - 4代 ,观察每代裸鼠的转移特性及鼻咽癌细胞 HL A表达的免疫组织化学定量变化。结果显示随着鼻咽癌单克隆细胞的传代移植 ,每代裸鼠肿瘤的转移率增高 (P<0 .0 1) ,转移途径更为单一。淋巴道转移的克隆细胞其 HL A 类抗原的表达随体内传代次数的增加而呈明显降低的趋势 ,与原代比较有显著性差异 (P<0 .0 1) ,但第 4代又急刷升高 (P<0 .0 1) ;HL A 类抗原的表达则呈波浪样改变 ;各代间表达平均强度变化不规则。肺转移灶癌细胞的 HL A 、 HL A 类抗原表达明显降低 ,两者与原代癌细胞比较都有显著性差异 (P<0 .0 1)。表明鼻咽癌细胞演进中转移能力和细胞本身特性、体内的环境选择关系密切 ,且可能和癌细胞 HL 展开更多
关键词 鼻咽癌单克隆细胞株 传代移植 裸鼠 HLA 表达定量 肿瘤转移
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牦牛皮肤中调控毛色基因表达定量和黑色素细胞组织学分析 被引量:4
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作者 高泽成 梁春年 +3 位作者 吴晓云 李明娜 张志飞 阎萍 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2017年第2期117-123,共7页
旨在通过分子水平和组织学水平阐明牦牛不同被毛颜色的机理。采用实时荧光定量PCR技术检测皮肤组织中决定色素形成通路中的主效基因:鼠灰色基因(Agouti signaling protein gene(ASIP),Agouti)、小眼畸形相关转录因子(Microphthalmia-ass... 旨在通过分子水平和组织学水平阐明牦牛不同被毛颜色的机理。采用实时荧光定量PCR技术检测皮肤组织中决定色素形成通路中的主效基因:鼠灰色基因(Agouti signaling protein gene(ASIP),Agouti)、小眼畸形相关转录因子(Microphthalmia-associated transcription factor,MITF)、黑色素皮质素受体1基因(Melanocortin 1 receptor,MC1R)和酪氨酸酶基因(Tyrosinasegene,TYR)表达量。结果表明:MC1R表达量在黑色毛色高于白色毛色;MITF表达量在黑色毛色与白色毛色中差异明显;ASIP表达量在白色毛色和黑色毛色中差异不显著;TYR表达量在天祝纯白被毛中表达量是大通纯黑被毛的2.87倍,这与有色被毛高表达的结果相反,TYR的表达量对牦牛黑色素的合成影响有待深入研究。采用石蜡切片制作方法,用HE和甲苯胺蓝染色。通过显微镜观察发现牦牛毛囊是由毛鞘、毛乳头和毛球外面周围的结缔组织形成的。在天祝白牦牛的表皮和毛囊周围发现分布着大量的黑色素细胞,同时发现有少量的黑色素颗粒存在。大通牦牛的毛囊和表皮黑色素细胞中均发现有黑色素的存在。黑色被毛毛囊中与毛发相连毛乳头附近的黑色素含量比毛囊周围其他部位含量高。大通牦牛的毛囊群比天祝牦牛毛囊群密集,毛囊的直径比天祝长,毛发较粗。大通牦牛毛囊周围黑色素细胞比天祝白牦牛密集,细胞核大,而且更为明显。 展开更多
关键词 牦牛 毛色基因 定量表达 石蜡切片 黑色素
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单细胞蛋白表达定量分析技术在造血干细胞异质性检测中的应用
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作者 李淑惠 容婵 +3 位作者 梁翠莎 李小波 唐亚犁 张选红 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期527-531,共5页
目的利用单细胞蛋白表达定量分析技术建立研究造血干细胞(HSC)异质性的方法.方法将不表达绿色荧光蛋白(GFP)的小鼠HSC(HSC-GFP-)与表达绿色荧光蛋白的小鼠HSC(HSC-GFP+)按1∶1比例混合,采用单细胞蛋白表达定量分析技术:通过标准孔径芯... 目的利用单细胞蛋白表达定量分析技术建立研究造血干细胞(HSC)异质性的方法.方法将不表达绿色荧光蛋白(GFP)的小鼠HSC(HSC-GFP-)与表达绿色荧光蛋白的小鼠HSC(HSC-GFP+)按1∶1比例混合,采用单细胞蛋白表达定量分析技术:通过标准孔径芯片捕获HSC单细胞,在单细胞蛋白质分离模块(Milo系统)进行细胞裂解、蛋白电泳及紫外照射激活芯片内交联物质;芯片中的蛋白与相应抗体发生免疫反应,再与荧光标记的二抗结合;最后通过双荧光通道扫描模块采集荧光信号成像、运用Scout软件分析每个细胞中表达β微管蛋白(β-tubulin)和GFP的蛋白条带吸光度值,得到表达蛋白的细胞数及细胞中蛋白水平表达分布以分析细胞异质性.通过表达GFP及β-tubulin的细胞数计算转染GFP的细胞得率,与流式细胞术检测结果相比对验证.结果单细胞蛋白表达定量分析技术检测表达GFP的小鼠HSC比例为44.20%,流式细胞术检测结果为42.528%;细胞中GFP表达水平分布在(0.42~7.35)×10^(5)之间,表明存在细胞异质性.结论单细胞蛋白表达定量分析技术可用于HSC异质性的检测. 展开更多
关键词 造血干细胞(HSC) 单细胞蛋白表达定量分析技术 细胞异质性
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芝麻热胁迫响应基因SiHsfB-2b的克隆及表达特性分析
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作者 田媛 苏小雨 +7 位作者 王东勇 李丰 张鹏钰 付锦州 戎亚思 王龙 高桐梅 吴寅 《山东农业科学》 北大核心 2024年第7期8-15,共8页
为探究B类热激转录因子(HSFs)在芝麻耐热性中的分子功能,基于前期转录组分析鉴定到的编码B类HSF家族蛋白HsfB2b的基因序列,以郑太芝3号耐热白芝麻品种为材料,采用同源克隆方法克隆了芝麻SiHsfB-2b基因,对其进行生物信息学分析,同时分析... 为探究B类热激转录因子(HSFs)在芝麻耐热性中的分子功能,基于前期转录组分析鉴定到的编码B类HSF家族蛋白HsfB2b的基因序列,以郑太芝3号耐热白芝麻品种为材料,采用同源克隆方法克隆了芝麻SiHsfB-2b基因,对其进行生物信息学分析,同时分析其在芝麻不同器官和热胁迫下的表达特性,并对其进行亚细胞定位。结果表明:SiHsfB-2b基因CDS序列全长为936 bp,编码311个氨基酸;系统进化树分析表明SiHsfB-2b与松蒿、独脚金和锈鳞木樨榄的同源蛋白关系较近,含保守DNA结合结构域;亚细胞定位于细胞核内;SiHsfB-2b基因启动子区域含有13类顺式作用元件,其中与胁迫响应和激素响应相关的各有3类。RT-qPCR分析结果显示,热胁迫可诱导SiHsfB-2b在芝麻根、茎和叶中上调表达,叶中相对表达量最高;在持续高温胁迫下,SiHsfB-2b在芝麻茎和叶中的表达量呈上升趋势,且在胁迫后期的叶中表现出显著上调,而根中的表达量呈现出先上升后下降趋势。综上推测,SiHsfB-2b基因可能通过介导胁迫和激素信号等通路积极响应热胁迫,这可为后期深入研究芝麻耐热性的分子机制奠定理论基础。 展开更多
关键词 芝麻 耐热性 SiHsfB-2b基因 基因克隆 定量表达分析 亚细胞定位
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乳腺浸润性癌中CD147和PHH3的表达与临床病理特征的关系
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作者 刘莹 徐小艳 +3 位作者 徐宪伟 牛冰 李海平 姜黄 《中国体视学与图像分析》 2024年第1期74-82,共9页
目的观察浸润性乳腺癌中CD147蛋白的定量表达和PHH3阳性细胞数目,分析二者与多个临床病理特征的关系及相关性。方法选取80例乳腺原发浸润性癌手术切除标本为研究对象,29例正常乳腺组织作为对照组,采用免疫组织化学SP法检测CD147和PHH3... 目的观察浸润性乳腺癌中CD147蛋白的定量表达和PHH3阳性细胞数目,分析二者与多个临床病理特征的关系及相关性。方法选取80例乳腺原发浸润性癌手术切除标本为研究对象,29例正常乳腺组织作为对照组,采用免疫组织化学SP法检测CD147和PHH3的表达,用IPP6.0图像分析软件对CD147蛋白表达进行定量测试,计数PHH3阳性个数和有丝分裂指数,分析浸润性乳腺癌中CD147和PHH3的表达与临床病理特征的关系,用Spearman法分析二者之间的相关性。结果CD147主要定位于乳腺癌细胞胞膜或膜浆,PHH3主要定位于浸润性乳腺癌有丝分裂的细胞核内,二者在浸润性乳腺癌组织中的定量表达和阳性数目均显著高于正常乳腺组织(P=0.000)。80例浸润性乳腺癌中,CD147蛋白定量表达在肿瘤直径较大、WHO分级较高、淋巴结有转移、TNMⅢ-Ⅳ期、雌激素受体(estrogen receptor,ER)阴性、Her-2基因无扩增阳性强度较高(P均<0.05);PHH3阳性数目和有丝分裂指数在肿瘤直径较大、WHO分级较高、淋巴结有转移状况及TNM分期Ⅲ-Ⅳ期(P_(均)<0.05)。CD147蛋白表达越高,PHH3阳性数目相应越多,有丝分裂指数越高,Spearman分析显示CD147分别与PHH3阳性数目和有丝分裂指数呈显著正相关(r=0.950,r=0.706,P=0.000)。结论浸润性乳腺癌中CD147和PHH3高表达,与肿瘤的发生发展有关,二者呈正相关,检测乳腺癌中CD147蛋白定量表达、PHH3阳性数目和有丝分裂指数有助于侵袭和转移的判断,为乳腺癌临床病理诊断提供了参考价值。 展开更多
关键词 乳腺浸润性癌 CD147 PHH3 定量表达 临床病理特征 相关性
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割手密抗旱相关基因SsREMO-1a的表达与功能分析
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作者 洪亚楠 刘洋 +2 位作者 姚艳丽 胡小文 徐磊 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第6期1196-1202,共7页
【目的】获得割手密SsREMO-1a基因全序列,开展组织特异表达、qPCR分析、亚细胞定位研究,研究转SsREMO-1a基因拟南芥的表型变化以及CAT基因的表达模式。【方法】以海南甘蔗野生种(割手密Sp-24)为材料,通过PCR、纯化、克隆和测序验证后获... 【目的】获得割手密SsREMO-1a基因全序列,开展组织特异表达、qPCR分析、亚细胞定位研究,研究转SsREMO-1a基因拟南芥的表型变化以及CAT基因的表达模式。【方法】以海南甘蔗野生种(割手密Sp-24)为材料,通过PCR、纯化、克隆和测序验证后获得完整的割手密SsREMO-1a基因序列。对苗期正常生长的割手密进行干旱胁迫处理,于胁迫处理后0、1、2、3、4和5 d收集幼嫩叶片、根和茎等组织进行组织特异表达分析和qPCR分析。采用烟草亚细胞定位技术、基因遗传转化技术等对SsREMO-1a的表达情况进行组织定位和功能分析。构建pBI221-SsREMO-1a-GFP融合表达载体,通过农杆菌转化烟草进行细胞定位分析。构建过量表达载体pCAMBIA 1304-SsREMO-1a,利用农杆菌转化法将SsREMO-1a导入拟南芥,观测干旱胁迫后0、1、2、3、4和5 d植株表型以及CAT-1基因表达量。【结果】SsREMO-1a基因全长均为738 bp,开放读码框(ORF)564 bp,编码187个氨基酸;组织特异性表达表明,SsREMO-1a在根、茎、叶中均有表达;qPCR分析结果表明,该基因受干旱胁迫的诱导并呈显著上调表达;亚细胞定位结果表明,SsREMO-1a蛋白定位于细胞膜上;共获得11个转基因拟南芥株系,抗旱性鉴定表明转基因植株能够提高植株的抗旱能力;转基因植株CAT-1基因表达量显著升高。【结论】SsREMO-1a能够提高植株的抗旱能力,对CAT-1基因具有一定的调控作用。 展开更多
关键词 割手密 REMO基因 干旱胁迫 定量表达 功能分析
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乳腺浸润性癌中EZH2定量表达和M2型巨噬细胞相关性及与临床病理特征的关系 被引量:1
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作者 方会娟 徐小艳 +1 位作者 徐宪伟 姜黄 《中国体视学与图像分析》 2023年第3期248-255,共8页
目的 观察浸润性乳腺癌中EZH2蛋白的定量表达和CD163阳性巨噬细胞数目,分析上述蛋白与多个临床病理因素的关系以及二者之间的相关性。方法 采用免疫组织化学SP法检测67例原发性浸润性乳腺癌和相应的癌旁组织中EZH2和CD163的表达,用IPP... 目的 观察浸润性乳腺癌中EZH2蛋白的定量表达和CD163阳性巨噬细胞数目,分析上述蛋白与多个临床病理因素的关系以及二者之间的相关性。方法 采用免疫组织化学SP法检测67例原发性浸润性乳腺癌和相应的癌旁组织中EZH2和CD163的表达,用IPP图像分析软件对EZH2蛋白表达进行定量测试,计数高倍视野CD163的个数,分析EZH2和CD163与浸润性乳腺癌临床病理特征的关系,用Spearman法分析二者之间的相关性。结果 EZH2主要定位于乳腺癌细胞核内,在浸润性乳腺癌中的表达显著高于癌旁组织(P=0.000),CD163主要表达于浸润性乳腺癌癌巢周围组织间隙中,定位于组织细胞质内,巢状或散在分布,其在浸润性乳腺癌组织中阳性数目显著高于癌旁组织(P=0.000)。EZH2蛋白定量表达和CD163的阳性数目与浸润性乳腺癌的肿瘤直径、WHO分级、TNM分期、淋巴结转移状况、雌激素受体(estrogen receptor, ER)、孕激素受体(progesterone receptor, PR)表达均相关(P均<0.05)。Spearman相关性分析显示浸润性乳腺癌组织中EZH2的定量表达与CD163数目呈显著正相关(r=0.990,P=0.000)。结论 EZH2和CD163在浸润性乳腺癌中高表达,与浸润性乳腺癌的侵袭和转移有关,二者呈正相关,EZH2表达与肿瘤微环境中CD163阳性的巨噬细胞可能存在协同作用促进浸润性乳腺癌的发生发展,对浸润性乳腺癌中EZH2和CD163表达规律及相关性研究,能够为乳腺癌靶向治疗提供一定理论依据。 展开更多
关键词 乳腺浸润性癌 EZH2 CD163 定量表达 临床病理特征
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拟南芥CHS基因表达的实时荧光定量PCR检测 被引量:2
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作者 王艳 蒋磊 李韶山 《植物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期594-598,共5页
在简要介绍实时荧光定量PCR反应和定量原理的基础上,采用TaqMan荧光定量PCR技术,研究了UV-B辐射对拟南芥(Arabidopsisthaliana)CHS(查耳酮合成酶基因)表达的诱导,获得了与传统Northern杂交一致的结果。实时荧光定量PCR用于基因表达的定... 在简要介绍实时荧光定量PCR反应和定量原理的基础上,采用TaqMan荧光定量PCR技术,研究了UV-B辐射对拟南芥(Arabidopsisthaliana)CHS(查耳酮合成酶基因)表达的诱导,获得了与传统Northern杂交一致的结果。实时荧光定量PCR用于基因表达的定量检测,具有特异性强、自动化程度高、高效快捷,避免使用放射性同位素,能同时对多个样品中的起始模板进行准确定量等特点,因此该方法已逐渐被广泛用于基因表达的定量分析。 展开更多
关键词 拟南芥 查耳酮合成酶基因 基因表达定量分析 实时荧光定量PCR 荧光定量PCR检测 基因表达 NORTHERN杂交 CHS 放射性同位素 PCR反应
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实时荧光定量RT-PCR检测ICP4、IFN-γ和IL-18基因在ILTV感染鸡三叉神经节中的表达 被引量:2
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作者 木古丽 王云峰 +3 位作者 石星明 童光志 何来 王玫 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第10期1150-1153,1166,共5页
将20只4月龄SPF鸡人工感染传染性喉气管炎病毒(ILTV)WG株,于感染后39d翅静脉和肌肉注射地塞米松(DEX),感染后5、9、10、11、12、39d及DEX处理后1、2、3、5、6、7、8d采喉拭子,检测病毒DNA,并于感染前和感染后6、10、20、31d及DEX处理后2... 将20只4月龄SPF鸡人工感染传染性喉气管炎病毒(ILTV)WG株,于感染后39d翅静脉和肌肉注射地塞米松(DEX),感染后5、9、10、11、12、39d及DEX处理后1、2、3、5、6、7、8d采喉拭子,检测病毒DNA,并于感染前和感染后6、10、20、31d及DEX处理后2、4、7、10、30d每组各取1只鸡颈静脉放血致死后无菌采集三叉神经节,提总RNA后利用real-timeRT-PCR的方法定量检测ICP4、IFN-γ和IL-18特异性mRNA。结果表明,在人工感染后处于潜伏状态的病毒能再被激活,并且ICP4基因在病毒还未被激活时就能低水平表达,这种低水平的立即早期(IE)基因的表达能提供持续的抗原刺激来维持神经节中的炎性细胞分泌IFN-γ和IL-18,以至于维持病毒处于潜伏状态而不致激活后感染其他的健康宿主;DEX处理后2d,IFN-γ的表达达到峰值,对病毒的再激活起抑制作用,尽管DEX处理前后IL-18的表达量没有明显变化,推测当潜伏的病毒一旦被激活时,IFN-γ可协同IL-18起到抑制IL-TV的作用。 展开更多
关键词 传染性喉气管炎病毒 地塞米松(DEX) 基因表达定量分析 实时荧光定量RT—PCR
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作物产量“三合结构”定量表达及高产分析 被引量:71
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作者 张宾 赵明 +2 位作者 董志强 陈传永 孙锐 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第10期1674-1681,共8页
针对目前作物产量水平长期徘徊难以突破,产量分析理论缺乏量化指标体系,可操作性指导作用小等问题,依据"三合结构"模式二级结构层各因素间的关系,建立了"三合结构"定量表达式,并通过田间试验与模型模拟相结合的方法... 针对目前作物产量水平长期徘徊难以突破,产量分析理论缺乏量化指标体系,可操作性指导作用小等问题,依据"三合结构"模式二级结构层各因素间的关系,建立了"三合结构"定量表达式,并通过田间试验与模型模拟相结合的方法,对春玉米、夏玉米、水稻和冬小麦高产实例进行定量化分析,明确了限制产量进一步提高的关键因素,提出了高产突破的可能方向。结果表明,提高叶片平均净同化率(MNAR),改善群体的物质生产能力,是水稻产量进一步提升的关键;适当提高平均叶面积指数(MLAI)或经济系数(HI)可能会进一步增加冬小麦产量;春玉米籽粒产量主要伴随着MLAI和单位面积穗数(EN)的增加而提高,其实质是平均作物生长率(MCGR)的提高增加了单位面积上总粒数(TGN)。进一步研究确定了"三合结构"定量表达式参数间的函数关系式,通过公式代换可推导出某一参数与目标参数的函数关系。作物产量"三合结构"定量表达式的建立为作物群体定量化研究提供了新的思路和方法,有助于全面掌握群体参数变化与产量形成的定量关系,为指导作物生产进行有效的技术调控提供依据。 展开更多
关键词 作物 产量分析 定量表达
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春兰AGL6基因的克隆及实时定量表达分析 被引量:21
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作者 孙崇波 向林 +3 位作者 施季森 胡凤荣 郭方其 秦德辉 《分子植物育种》 CAS CSCD 2010年第5期939-944,共6页
本研究采用RT-PCR结合RACE技术从春兰(Cymbidium goeringii)中分离到一个AGL6基因。序列分析表明,该基因含有一个729bp长的开放阅读框(ORF),共编码242个氨基酸。系统进化树分析显示,该基因属于MADS-box基因家族AP1/AGL9组的AGL6同源基因... 本研究采用RT-PCR结合RACE技术从春兰(Cymbidium goeringii)中分离到一个AGL6基因。序列分析表明,该基因含有一个729bp长的开放阅读框(ORF),共编码242个氨基酸。系统进化树分析显示,该基因属于MADS-box基因家族AP1/AGL9组的AGL6同源基因,其编码的蛋白与其它植物AGL6类蛋白具有较高的同源性,命名为CgAGL6(基因登录号为HM208533)。实时荧光定量表达分析表明,CgAGL6基因春兰不同组织中均有表达,其中在唇瓣、花芽和子房中的表达量较高,在花瓣和萼片中的表达量次之,在根、叶和蕊柱中的表达量最低,显示了CgAGL6基因可能在春兰成花转变和花器官的形成过程中起着重要作用。 展开更多
关键词 春兰 AGL6基因 实时荧光定量表达 花发育
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春兰GLO基因的克隆和实时定量表达分析 被引量:13
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作者 向林 李伯钧 +3 位作者 秦德辉 郭方其 吴超 孙崇波 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2011年第3期517-522,共6页
采用RT-PCR结合RACE技术从春兰(Cymbidium goeringii)中分离到一个GLO基因。该基因含有一个630 bp的开放阅读框(ORF),共编码210个氨基酸。系统进化树分析显示,该基因属于B类MADS-box基因的PI/GLO家族,其编码的蛋白与其他植物PI/GLO类蛋... 采用RT-PCR结合RACE技术从春兰(Cymbidium goeringii)中分离到一个GLO基因。该基因含有一个630 bp的开放阅读框(ORF),共编码210个氨基酸。系统进化树分析显示,该基因属于B类MADS-box基因的PI/GLO家族,其编码的蛋白与其他植物PI/GLO类蛋白具有很高的同源性,命名为CgGLO(登录号HM106984)。实时荧光定量表达分析表明,CgGLO主要在第二轮花器官唇瓣和花瓣中表达,在萼片、子房和叶片中表达较少,在蕊柱和根中表达量最少,这种表达模式支持了van Tunen对ABC模型的修正,也显示了CgGLO基因可能在春兰花器官以及子房的形成过程中起着重要作用。 展开更多
关键词 春兰 ABC模型 GLO基因 实时荧光定量表达
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基于三维景观指数的城市景观美学特征定量表达——以深圳市为例 被引量:15
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作者 吴健生 袁甜 王彤 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第13期4519-4528,共10页
城市景观由自然元素与人工元素构成,以建筑为主体,辅以外部空间环境。对城市景观美学价值的研究有利于探讨如何提升城市形象及居民生活环境,为城市规划设计纳入了感性与理性结合的合理途径。景观美学特征以不同方式影响整体景观质量,合... 城市景观由自然元素与人工元素构成,以建筑为主体,辅以外部空间环境。对城市景观美学价值的研究有利于探讨如何提升城市形象及居民生活环境,为城市规划设计纳入了感性与理性结合的合理途径。景观美学特征以不同方式影响整体景观质量,合理运用景观指数对城市景观美学特征进行量化表达,是评估景观质量的重要前提。在整理借鉴景观美学相关研究的基础上,结合景观生态学理论基础,以城市空间内部审美者的角度将城市景观五大美学特征,包括自然性、开阔性、多样性、奇特性和协调性,转化为可定量表达的二维及三维景观指数。量化指标易使用数据进行快速评估,对于城市规划设计有着积极意义。 展开更多
关键词 城市景观美学 三维景观指数 定量表达
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菊花节律钟输出基因CmGI(GIGANTEA)的cDNA全长克隆、序列信息及定量表达分析 被引量:6
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作者 孙霞 王秀峰 +2 位作者 郑成淑 邢世岩 束怀瑞 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第13期2690-2703,共14页
【目的】克隆菊花节律钟输出基因GIGANTEA的cDNA全长序列,进行序列信息学分析,研究其mRNA的相对定量表达。【方法】利用多聚酶链式反应(PCR)结合5′RACE、3′RACE技术,克隆节律钟输出基因GIGANTEA的cDNA全长序列,应用生物信息学软件对... 【目的】克隆菊花节律钟输出基因GIGANTEA的cDNA全长序列,进行序列信息学分析,研究其mRNA的相对定量表达。【方法】利用多聚酶链式反应(PCR)结合5′RACE、3′RACE技术,克隆节律钟输出基因GIGANTEA的cDNA全长序列,应用生物信息学软件对获得的基因核苷酸序列及编码的蛋白质序列进行分析;通过在线建模软件对蛋白质的三维结构进行建模预测;利用实时荧光定量PCR技术,用2-△△Ct法进行GIGANTEA的mRNA相对定量表达分析。【结果】从菊花品种‘Jinba’中克隆得到节律钟输出基因GIGANTEA的cDNA全长序列,核苷酸序列长度3 461 bp,开放阅读框3 453 bp,编码1 150个氨基酸。氨基酸序列分析显示,该基因编码的蛋白与植物节律钟输出基因GIGANTEA同源,命名为CmGI基因,序列提交到GenBank,登录号为JQ043439。序列比对显示与葡萄、蓖麻等的GI的相似度依次为76%、75%。构建类似蛋白系统进化树显示,菊花CmGI与拟南芥(Arabidopsis thaliana GIGANTEA,ABP96482.1)分子进化距离最近,其次是白菜(Brassica rapa GIGANTEA,AEB33730.1);预测CmGI蛋白有6个跨膜螺旋多次跨膜;为转录因子,定位在细胞核中,为非分泌性蛋白质;不具备信号肽;对CmGI三级结构建模预测表明,蛋白核心结构符合转录因子与DNA结合常见的功能域HTH、HLH;采用荧光相对定量分析,菊花CmGI的表达呈昼夜节律表达模式;不同花芽分化阶段叶片中CmGI基因mRNA水平差异大,两个高峰值分别出现在花芽分化启动期和小花原基分化中期;营养生长的组培苗、长日照条件下的叶、芽、花蕾期均是痕量表达;盛花期表达量依次为叶片>舌状花>筒状花。【结论】从菊花中克隆得到节律钟输出基因CmGI,对该基因的进一步深入研究有助于探索光周期途径菊花成花的分子调控机制,可作为切花菊花期调控分子育种的目标基因。 展开更多
关键词 菊花 花芽分化 节律钟输出基因CmGI 定量表达
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梨茎尖中PpKO基因表达量的实时荧光定量PCR分析 被引量:10
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作者 田义轲 李节法 +2 位作者 王彩虹 殷豪 白牡丹 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2012年第3期62-66,共5页
以黄金梨不同发育时间的新梢茎尖为试材,应用实时荧光定量PCR技术,对18S rRNA、Actin、GAPDH和S19这4个常用内参基因在梨茎尖组织中的表达稳定性进行了评估。GeNorm软件分析显示,它们表达稳定度的平均值(M)依次是0.365,0.392,0.457和0.5... 以黄金梨不同发育时间的新梢茎尖为试材,应用实时荧光定量PCR技术,对18S rRNA、Actin、GAPDH和S19这4个常用内参基因在梨茎尖组织中的表达稳定性进行了评估。GeNorm软件分析显示,它们表达稳定度的平均值(M)依次是0.365,0.392,0.457和0.517,即表达稳定性从高到低的排序是:Actin>18S rRNA>GADPH>S19。选择Actin作为校正内参基因,对处于不同发育时期的新梢茎尖组织中贝壳杉烯氧化酶基因PpKO的表达量进行研究,发现该基因在新梢生长过程中出现2次表达高峰,基本与春梢、秋梢的快速生长期吻合,且秋梢中的表达量远高于春梢。 展开更多
关键词 内参基因 梨贝壳杉烯氧化酶基因(PpKO) 定量表达
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糖尿病慢性皮肤溃疡瘦素及其受体OB-RL的定量表达 被引量:2
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作者 曹瑛 薛耀明 +2 位作者 高方 李晨钟 曾慧妍 《广东医学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第23期3055-3057,共3页
目的观察瘦素(Leptin)及其受体OB-RL在糖尿病慢性皮肤溃疡边缘皮肤组织中的定量表达,探讨Leptin及其受体在糖尿病慢性皮肤溃疡发生及难愈合机制中的意义。方法以糖尿病慢性皮肤溃疡边缘皮肤组织为观察组,以正常皮肤组织为对照组,采用HE... 目的观察瘦素(Leptin)及其受体OB-RL在糖尿病慢性皮肤溃疡边缘皮肤组织中的定量表达,探讨Leptin及其受体在糖尿病慢性皮肤溃疡发生及难愈合机制中的意义。方法以糖尿病慢性皮肤溃疡边缘皮肤组织为观察组,以正常皮肤组织为对照组,采用HE常规染色观察两组皮肤基本组织学变化,通过反转录PCR法检测两组Leptin及OB-RL mRNA的表达。结果观察组具有典型的组织学改变,与对照组清晰的表皮复层结构,丰富且规则、致密的胶原排列形成了鲜明的组织学反差。对照组及观察组表皮厚度分别为(0.99±0.23)mm、(1.63±0.33)mm,两组真皮层厚度分别为(2.71±0.38)mm、(1.38±0.41)mm,差异均有统计学意义(P<0.01)。Leptin mRNA的表达在对照组及观察组表达分别为(0.46±0.05)%和(0.23±0.02)%,OB-RL mRNA在两组中的表达分别为(0.44±0.09)%和(0.28±0.03)%,差异均有统计学意义(P<0.01)。结论糖尿病慢性皮肤溃疡Leptin及其受体OB-RL表达下调可能是其愈合延迟的重要原因之一。 展开更多
关键词 瘦素 瘦素受体 糖尿病 慢性皮肤溃疡 定量表达
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互花米草NHX1基因的cDNA全长克隆、序列信息及定量表达分析 被引量:3
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作者 徐璐 尹海波 +5 位作者 张侠 曹雪霖 卢楠楠 闫丽华 陈世华 郭善利 《江苏农业科学》 北大核心 2016年第8期34-38,共5页
以盐生植物互花米草(Spartina alterniflora)为试验材料,利用RACE技术克隆到编码Na+/H+逆向转运蛋白的NHX1基因的cDNA全长序列。利用生物信息学软件及网站对获得的基因核苷酸序列及编码的蛋白质序列进行分析,结果发现该核苷酸序列长度为... 以盐生植物互花米草(Spartina alterniflora)为试验材料,利用RACE技术克隆到编码Na+/H+逆向转运蛋白的NHX1基因的cDNA全长序列。利用生物信息学软件及网站对获得的基因核苷酸序列及编码的蛋白质序列进行分析,结果发现该核苷酸序列长度为2 277 bp,开放阅读框为1 623 bp,编码540个氨基酸残基,且该基因所编码的蛋白质与植物的Na+/H+逆向转运蛋白NHX1同源,所以命名为SaNHX1基因。同时氨基酸序列比对显示,其与芦苇(Phragmites australis NHX,BAD95562.1)、玉米(Zea mays NHX,XP_008653443.1)、水稻(Oryza sativa NHX,BAA83337.1)等的NHX亲缘关系相近,同源相似性依次为94%、92%、91%。利用Qiagene Rotor Gene Q荧光实时定量PCR仪对不同时间盐处理及ABA处理的互花米草材料进行荧光定量PCR检测。结果发现,在盐处理及ABA处理的不同处理时期,该基因的相对表达量都发生了明显的变化,这表明该基因受到了盐胁迫及ABA胁迫的诱导,由此可以看出Sa NHX1基因与植物的耐盐性有着密切的关系。 展开更多
关键词 耐盐性 互花米草 NHX1基因 相对定量表达
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金花茶CnbHLH79转录因子的克隆、亚细胞定位及表达分析 被引量:3
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作者 李博 刘合霞 +2 位作者 陈宇玲 周兴文 朱宇林 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期241-250,共10页
为探究CnbHLH79转录因子在金花茶花色形成中的作用机理,克隆了金花茶CnbHLH79转录因子的编码序列,对其进行生物信息学和亚细胞定位分析,利用荧光定量PCR技术分析了CnbHLH79转录因子在金花茶不同组织,以及不同发育阶段的花瓣中的表达模式... 为探究CnbHLH79转录因子在金花茶花色形成中的作用机理,克隆了金花茶CnbHLH79转录因子的编码序列,对其进行生物信息学和亚细胞定位分析,利用荧光定量PCR技术分析了CnbHLH79转录因子在金花茶不同组织,以及不同发育阶段的花瓣中的表达模式,并分析CnbHLH79转录因子的表达量与色相b^(*)、类黄酮物质含量的相关关系。研究结果表明,CnbHLH79转录因子的开放阅读框长度为855 bp,共编码284个氨基酸,具有bHLH_AtBPE_like保守结构域。系统进化分析发现,金花茶CnbHLH79蛋白与茶树bHLH79蛋白的亲缘关系最近。亚细胞定位分析显示,CnbHLH79转录因子主要在细胞核中发挥功能。对CnbHLH79转录因子进行实时荧光定量PCR分析发现,该转录因子在金花茶的根、花等组织中表达量较高;还发现在花朵开放过程中,CnbHLH79转录因子的表达量总体呈先高后低,逐步下降的趋势;此外,CnbHLH79的表达量与色相b^(*)值、槲皮素-7-O-葡糖苷的相关性系数分别为-0.92、-0.7,它们之间的负相关性较高。本研究将为阐明CnbHLH79转录因子在金花茶中调控类黄酮的合成机制,以及调控花瓣显黄色的作用机理奠定基础。 展开更多
关键词 金花茶 CnbHLH79转录因子 花色形成 类黄酮合成调控 亚细胞定位 表达定量 相关分析
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青海三岔河灰紫色软玉颜色定量表达与紫色成因研究 被引量:10
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作者 罗泽敏 沈锡田 杨明星 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2017年第3期822-828,共7页
颜色是衡量宝玉石品质、价格的重要因素,对宝玉石颜色的量化研究一直是宝石科学关注的热点。在透射光条件下观察宝玉石颜色特征是珠宝行业中十分重要的手段。本研究致力于依赖光谱和光谱分析技术,建立一套依照透射法实现软玉颜色定量表... 颜色是衡量宝玉石品质、价格的重要因素,对宝玉石颜色的量化研究一直是宝石科学关注的热点。在透射光条件下观察宝玉石颜色特征是珠宝行业中十分重要的手段。本研究致力于依赖光谱和光谱分析技术,建立一套依照透射法实现软玉颜色定量表达、颜色复原和确定致色机制的方法。以来自中国青海格尔木地区、具有渐变颜色特点的灰紫色软玉为例,采用紫外-可见吸收光谱(UV-Vis)定量测量、结合国际照明委员会1976 CIE L*a*b*色度学模型转化及计算机软件处理(Adobe Photoshop),实现对特定厚度(1.0 mm)灰紫色软玉样品颜色的定量表达和颜色复原。样品浅色和深色区域复原的颜色与样品透射光下肉眼观察颜色较为接近,存在的色差可能与玉石样品的半透明多晶质结构有关。而对于紫色的致色机理,通过激光剥蚀电感耦合等离子质谱仪(LA-ICP-MS),我们发现微量元素Mn含量随颜色加深呈现递增规律。在较深颜色区域,光致发光光谱(PL)中检测到的以585 nm为中心的发射峰、UV-Vis光谱中以530 nm为中心的吸收峰,以及电子顺磁共振光谱(EPR)的六重超精细分裂峰都在指示Mn^(2+)是导致灰紫色软玉中紫色调的主要原因。本工作对于研究透射光条件下宝玉石样品颜色定量观测和表达提供了确切的实验方法依据,并为采用光谱学确定致色元素以及致色机理提供了有价值的实验信息。 展开更多
关键词 软玉 紫外可见吸收光谱 透射法 CIE L*a*b* 颜色定量表达和复原 Mn^(2+)
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PTEN在口腔鳞状细胞癌中的定量分析及平阳霉素化疗对其表达的影响 被引量:2
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作者 陈中 张雨温 张素欣 《现代口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期9-10,共2页
目的 探讨抑癌基因PTEN在口腔鳞状细胞癌组织中的定量表达,平阳霉素化疗对该基因表达的作用。方法收集1999~2002年口腔鳞状细胞癌石蜡包埋组织88例,分化疗组44例,未化疗组44例。化疗组为术前3天用平阳霉素48毫克。选择28例正常口腔... 目的 探讨抑癌基因PTEN在口腔鳞状细胞癌组织中的定量表达,平阳霉素化疗对该基因表达的作用。方法收集1999~2002年口腔鳞状细胞癌石蜡包埋组织88例,分化疗组44例,未化疗组44例。化疗组为术前3天用平阳霉素48毫克。选择28例正常口腔粘膜组织作为对照组。应用流式细胞术定量分析技术研究PTEN在口腔鳞状细胞癌中的定量表达。结果PTEN在正常粘膜组FI值为1.0±0.03,平阳霉素化疗组FI值为0.8±0.06,未化疗组FI值为0.68±0.03。各组之间FI值均有显著性差异。结论PTEN在口腔鳞状细胞癌组织中呈低表达,平阳霉素化疗使其含量上升。 展开更多
关键词 PTEN 鳞状细胞癌 押癌基因 流式细胞术 蛋白定量表达
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