期刊文献+
共找到569篇文章
< 1 2 29 >
每页显示 20 50 100
长链非编码RNA母系表达基因8通过微小RNA-495-3p调控急性髓性白血病细胞高迁移率族蛋白A1表达及对细胞增殖、凋亡的作用机制研究
1
作者 张璐 郭含梦 王庆义 《陕西医学杂志》 CAS 2024年第7期895-899,共5页
目的:探讨长链非编码RNA(lncRNA)母系表达基因8(MEG8)通过微小RNA-495-3p(miR-495-3p)调控急性髓性白血病细胞(AML)高迁移率族蛋白A1(HMGA1)表达及对细胞增殖、凋亡的机制。方法:选取50例经确诊为AML患者的骨髓活检标本与52例健康骨髓... 目的:探讨长链非编码RNA(lncRNA)母系表达基因8(MEG8)通过微小RNA-495-3p(miR-495-3p)调控急性髓性白血病细胞(AML)高迁移率族蛋白A1(HMGA1)表达及对细胞增殖、凋亡的机制。方法:选取50例经确诊为AML患者的骨髓活检标本与52例健康骨髓捐赠者骨髓标本,常规培养人AML细胞株HL-60,采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法骨髓单个核细胞中lncRNA MEG8 mRNA表达。将HL-60细胞分为六组,即HL-60组(HL-60细胞)、si-NC组(转染si-NC)、si-lncRNA MEG8组(转染si-lncRNA MEG8)、mimic-NC组(转染mimic-NC)、miR-495-3p mimic组(转染miR-495-3p mimic)、si-lncRNA MEG8+miR-495-3p mimic组(转染si-lncRNA MEG8+miR-495-3p mimic),CCK-8法检测培养24、48、72 h各组细胞增殖能力,流式细胞术检测细胞凋亡,Western blot法检测细胞中HMGA1表达,双荧光素酶报告基因实验验证lncRNA MEG8、miR-495-3p、HMGA1之间的关系。结果:与对照组相比,观察组lncRNA MEG8 mRNA表达升高(P<0.05)。与miR NC+MEG8 WT组比较,miR-495-3p mimic+MEG8 WT组荧光素酶活性下降(P<0.05),与miR NC+HMGA1 WT组比较,miR-495-3p mimic+HMGA1 WT组荧光素酶活性下降(P<0.05)。与HL-60组、si-NC组、mimic-NC组比较,si-lncRNA MEG8组、miR-495-3p mimic组和si-lncRNA MEG8+miR-495-3p mimic组24、48 h细胞增殖能力均显著下降,si-lncRNA MEG8+miR-495-3p mimic组细胞增殖率最低(P<0.05)。与HL-60组、si-NC组和mimic-NC组比较,si-lncRNA MEG8+miR-495-3p mimic组HL-60细胞凋亡率高于si-lncRNA MEG8组和miR-495-3p mimic组(均P<0.05)。与HL-60组、si-NC组和mimic-NC组比较,si-lncRNA MEG8+miR-495-3p mimic组HMGA1蛋白表达低于si-lncRNA MEG8组和miR-495-3p mimic组(均P<0.05)。结论:沉默lncRNA MEG8可能通过上调miR-495-3p来下调HMGB1,来抑制HL-60细胞的恶性生物学行为,可为探索AML潜在治疗靶点提供了新思路。 展开更多
关键词 长链非编码RNA 母系表达基因8 微小RNA-495-3p 急性髓性白血病细胞 高迁移率族蛋白1
下载PDF
基于整合分析基因表达数据筛选急性胰腺炎中差异表达基因
2
作者 曾春艳 李俊 陈幼祥 《南昌大学学报(医学版)》 2024年第5期81-87,共7页
目的了解急性胰腺炎(acute pancreatitis,AP)的生物学和分子发病机制,为预防和治疗AP提供依据。方法从基因表达总库数据库获取基因表达数据集GSE109227、GSE3644和GSE65146,其中包括AP小鼠和对照小鼠胰腺样本的基因表达谱。使用GEO2R鉴... 目的了解急性胰腺炎(acute pancreatitis,AP)的生物学和分子发病机制,为预防和治疗AP提供依据。方法从基因表达总库数据库获取基因表达数据集GSE109227、GSE3644和GSE65146,其中包括AP小鼠和对照小鼠胰腺样本的基因表达谱。使用GEO2R鉴定所有差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并使用基因本体(gene ontology,GO)和京都基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析进行注释。结果在GSE109227、GSE3644和GSE65146数据集中发现38个共同的DEGs,将其构建成1个蛋白质-蛋白质相互作用(protein-proteininteraction,PPI)网络,确定了枢纽蛋白,并提取了功能模块。通过PPI网络分析确定参与粘连接头通路的3个基因(Cdh1、Iqgap1和Actn4),可能为AP的诊断和治疗提供潜在的生物标志物。结论Cdh1、Iqgap1和Actn4基因对AP的发生和发展有影响,这可能为AP的诊断和治疗提供新的靶点。 展开更多
关键词 急性胰腺炎 差异表达基因 GO和KEGG分析 蛋白质-蛋白质相互作用 生物标志物
下载PDF
铁蓄积大鼠食管黏膜组织差异表达基因的筛选及生物学功能分析
3
作者 刘国红 任雨轩 +2 位作者 邵谦毅 梁硕 王丽萍 《山东医药》 CAS 2024年第12期37-41,共5页
目的筛选铁蓄积大鼠食管黏膜组织差异表达基因,并分析差异表达基因的生物学功能。方法12只6周龄雄性SD大鼠随机分为铁蓄积组和对照组,每组6只,铁蓄积组隔天腹腔注射蔗糖铁溶液制备铁蓄积模型,对照组注射等量生理盐水,14周后取血和食管... 目的筛选铁蓄积大鼠食管黏膜组织差异表达基因,并分析差异表达基因的生物学功能。方法12只6周龄雄性SD大鼠随机分为铁蓄积组和对照组,每组6只,铁蓄积组隔天腹腔注射蔗糖铁溶液制备铁蓄积模型,对照组注射等量生理盐水,14周后取血和食管、肝等组织,应用血清学、组织学方法鉴定铁蓄积造模是否成功;剥离两组食管黏膜组织,采用转录组测序技术筛选差异表达基因,并对差异表达基因进行基因本体(GO)功能富集分析及真核生物蛋白相邻类的聚簇(KOG)分类富集分析。结果筛选出9个差异表达基因,5个上调基因包括昼夜相关转录抑制因子(Ciart)、液泡蛋白质分选因子25(Vps25)、甲状腺激素应答蛋白(Thrsp)、UDP-N-乙酰氨基葡萄糖焦磷酸化酶1(Uap1)、血清解整合素—金属蛋白酶33(Adam33),4个下调基因包括过氧化物酶基因(Pxdn)、硫酸乙酰肝素蛋白多糖基因2(Hspg2)、中心体相关蛋白2(Cep2)、G蛋白信号转导调节因子4(Rgs4)。GO功能富集分析显示,上调基因的生物过程(BP)集中在节律过程、代谢过程、行为、生物过程调节、特定位置运动、生物过程的负调控、生物调节、定位、细胞过程、多细胞生物过程;细胞组成(CC)主要集中在膜封闭腔、细胞器部分、细胞器、膜、细胞外区域部分、膜部分、细胞部分、细胞;分子功能(MF)主要集中在结合、结构分子活性、催化活性。下调基因的BP主要集中在解毒、刺激反应、细胞组成或生物形成、信号、生物过程的负调控、生物过程的正调节、发育过程、细胞过程、生物过程调节、生物调节、代谢过程;CC主要集中在细胞外基质、细胞外基质组成、细胞外区域部分、细胞外区域、细胞器、膜、细胞部分、细胞;MF主要集中在酶调节活性、抗氧化活性、分子功能调节剂、受体调节活性、结构分子活性、结合、催化活性。KOG分类富集分析显示,表达上调的基因中有3个获得功能注释,Uap1被注释到细胞壁/膜/包膜生物形成,Adam33被注释到翻译后修饰,蛋白质折叠和伴侣蛋白,Vps25被注释到功能预测。表达下调的基因中有2个获得功能注释,Rgs4被注释到信号转导机制,Hspg2被注释到翻译后修饰,蛋白质折叠和伴侣蛋白。结论铁蓄积大鼠食管黏膜组织中共筛选出9个差异表达基因,包括5个表达上调基因和4个表达下调基因。GO功能富集分析显示差异表达基因主要参与的BP包括节律过程、代谢过程、细胞过程、生物过程调节等,主要参与的CC包括细胞器、膜、细胞外区域部分等,主要参与的MF包括结合、催化活性、结构分子活性。有5个差异基因获得KOG功能注释,包括翻译后修饰、蛋白质折叠和伴侣蛋白、信号转导等,主要参与细胞周期、细胞代谢、细胞增殖及氧化应激等通路。 展开更多
关键词 铁蓄积 差异表达基因 基因本体功能富集 真核生物蛋白相邻类的聚簇分类富集
下载PDF
动物品种间免疫球蛋白基因表达谱及其多样性形成机制研究进展
4
作者 邱彦博 易晓华 +2 位作者 唐晓琴 韦燕佩 孙秀柱 《动物医学进展》 北大核心 2024年第8期89-93,共5页
免疫球蛋白(immunoglobulins,Igs)是存在于人和动物血清、组织液及其他外分泌液中的一类具有抗体性质的球蛋白,是构成免疫防御的重要组成部分。研究普遍认为免疫球蛋白基因在物种进化中相对保守,但近几年的研究发现,Ig基因多样化的特征... 免疫球蛋白(immunoglobulins,Igs)是存在于人和动物血清、组织液及其他外分泌液中的一类具有抗体性质的球蛋白,是构成免疫防御的重要组成部分。研究普遍认为免疫球蛋白基因在物种进化中相对保守,但近几年的研究发现,Ig基因多样化的特征在同一物种不同品种以及生物体不同发育水平中存在差异。IgV基因的种系变异可能具有功能效应,故不同动物品种Ig基因的内在多态性以及多样化表达机制在一定程度上也影响着机体的抗病能力。论文综述了目前已知的同一物种不同品种的免疫球蛋白重链和轻链可变区基因及其多样化表达机制的差异,以期为相关动物的抗病育种和免疫学研究提供参考依据。 展开更多
关键词 免疫球蛋白 不同品种 差异基因 多样性表达
下载PDF
子痫前期差异表达基因的筛选和生物信息学分析
5
作者 宋红红 《吉林医学》 CAS 2024年第7期1618-1622,共5页
目的:筛选子痫前期胎盘组织差异表达基因并行生物信息学分析,探索子痫前期的发生机制。方法:在基因表达综合数据库中筛选出GSE10588、GSE25906和GSE74341三个数据集,GEO2R法筛选出子痫前期组和正常妊娠组胎盘组织的差异表达基因,使用DA... 目的:筛选子痫前期胎盘组织差异表达基因并行生物信息学分析,探索子痫前期的发生机制。方法:在基因表达综合数据库中筛选出GSE10588、GSE25906和GSE74341三个数据集,GEO2R法筛选出子痫前期组和正常妊娠组胎盘组织的差异表达基因,使用DAVID数据库对其进行基因本体(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,通过STRING网站及Cytoscape软件构建蛋白质的相互作用(PPI)网络并进行可视化,筛选关键基因。结果:共筛选出255个差异表达基因,其中120个基因表达上调,135个基因表达下调。进一步筛选出前10个关键基因:RHOA,CXCR4,RPL7A,RPL6,CXCL12,MRPS12,PLEC,MAPK1,DDX5,ITGB1。GO分析显示,在生物学过程组中,基因主要富集于细胞黏附、细胞分化、趋化因子、细胞迁徙等;在细胞组分组中,基因主要富集于黏着斑、外泌体、细胞黏附等;在分子功能组中,基因主要富集于细胞黏附。KEGG通路富集分析提示基因主要富集于白细胞迁徙、趋化因子信号通路、血小板激活、黏着斑等。结论:本研究通过生物信息学方法发现细胞黏附、细胞骨架、外泌体、趋化因子等因素参与子痫前期的发生,为子痫前期发生机制的进一步研究和药物靶点、标志物的筛选提供了基础。 展开更多
关键词 子痫前期 妊娠期高血压 生物信息学分析 差异表达基因 蛋白质互作网络
下载PDF
P-糖蛋白编码基因mdr1在肝细胞癌中差异表达的定量检测
6
作者 邱秀华 林川 +5 位作者 满晓波 张宝华 唐亮 程庆宝 吴孟超 王红阳 《中国医药导刊》 2006年第2期115-115,126,共2页
  化疗药对于肝细胞癌(HCC)的疗效较差,有研究表明其与多种多药耐药(multidrug resistance,MDR)基因有关[1],而多药耐药基因1(mdr1)的编码蛋白P-糖蛋白(P-glycoprotein,P-gp)在其中占有重要地位[2],本研究利用逆转录实时荧光...   化疗药对于肝细胞癌(HCC)的疗效较差,有研究表明其与多种多药耐药(multidrug resistance,MDR)基因有关[1],而多药耐药基因1(mdr1)的编码蛋白P-糖蛋白(P-glycoprotein,P-gp)在其中占有重要地位[2],本研究利用逆转录实时荧光聚合酶链反应(Real-time PCR)技术定量检测了mdr1基因在肝细胞癌中的表达. 展开更多
关键词 蛋白编码基因 MDR1基因 P-糖蛋白 肝细胞癌 定量检测 差异表达 实时荧光聚合酶链反应 多药耐药基因 编码蛋白 PCR)
下载PDF
COPD相关差异表达基因筛选、生物学功能分析及其编码蛋白互作网络分析 被引量:3
7
作者 刘兆宇 胡腊 +4 位作者 曾子成 林海 李明 易高 姚文霞 《山东医药》 CAS 2019年第30期13-16,共4页
目的分析慢性阻塞性肺病(COPD)患者肺组织中差异表达基因及其编码蛋白的互作关系,筛选出COPD相关的关键基因。方法从NCBI公共数据平台GEO数据库下载COPD表达谱数据集GSE57148,采用R软件及其扩展包对表达谱数据进行处理和分析,获得差异... 目的分析慢性阻塞性肺病(COPD)患者肺组织中差异表达基因及其编码蛋白的互作关系,筛选出COPD相关的关键基因。方法从NCBI公共数据平台GEO数据库下载COPD表达谱数据集GSE57148,采用R软件及其扩展包对表达谱数据进行处理和分析,获得差异表达基因,并通过STRING、Cytoscape等对差异表达基因进行生物学功能分析及编码蛋白互作分析。结果一共获得117个基因为差异表达基因,其中发生上调的基因有63 个,发生下调的基因有54个;信号通路分析发现这些基因主要富集于细胞外基质形成、胶原纤维化形成和氧化激活通路等。蛋白网络互作分析发现VWF、FGG、IGF1、F5、RPS15、RPS12、SEC61B、THBS1、F13A1为差异表达基因中的Hub基因。结论COPD肺组织中共有117个基因差异性表达,上调表达基因63个,下调基因54个;这些差异性表达基因主要参与细胞外基质改变、纤维化和氧化还原活性等信号通路;VWF、FGG、IGF1、F5、RPS15、RPS12、 SEC61B、THBS1和F13A1为Hub基因,可能在COPD的疾病进程中发挥了关键作用。 展开更多
关键词 慢性阻塞性肺病 生物信息学 差异表达基因 蛋白互作网络
下载PDF
转录组测序分析外源水杨酸诱导茶树热激蛋白基因的响应
8
作者 刘悦 曲浩 +3 位作者 田易萍 陈春林 冉隆珣 陈林波 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第4期607-614,共8页
水杨酸是诱导植物抗性机制中重要的信号分子,外源喷施水杨酸能够调控多种防御相关蛋白质,提升农作物的抗病能力。开展外源水杨酸诱导茶树抗性机制的研究能够挖掘抗病基因,为茶树抗病育种提供分子基础。本研究采集外源喷施水杨酸0 h、6 h... 水杨酸是诱导植物抗性机制中重要的信号分子,外源喷施水杨酸能够调控多种防御相关蛋白质,提升农作物的抗病能力。开展外源水杨酸诱导茶树抗性机制的研究能够挖掘抗病基因,为茶树抗病育种提供分子基础。本研究采集外源喷施水杨酸0 h、6 h、12 h、24 h、48 h的茶树叶片进行转录组测序与分析,结果表明,外源喷施水杨酸6 h、12 h、24 h、48 h时茶树叶片内差异表达基因数量分别为9 360个、3 399个、596个、115个,外源水杨酸处理后各时间点均发生差异表达的基因共604个。KEGG功能富集结果显示,处理后6 h时富集于植物激素信号转导、植物-病原菌互作、核糖体、剪接体和碳代谢通路上的差异表达基因数量分别为95个、73个、121个、94个、154个。差异表达基因中有12个热激因子基因、40个热激蛋白基因和12个WRKY家族转录因子基因上调表达。处理48 h后,无上调表达的热激因子基因,但仍有28个热激蛋白基因上调表达。病程相关蛋白基因在检测阶段均上调表达。外源水杨酸的诱导作用在处理6 h时最为明显,并且引起了大量热激蛋白的响应。本研究结果为开展外源水杨酸诱导茶树抗病机制和茶树抗病分子育种研究提供了参考。 展开更多
关键词 外源水杨酸 茶树 转录组 差异表达基因 热激蛋白
下载PDF
黄萎病菌侵染下陆地棉Dirigent-like蛋白基因表达差异分析 被引量:14
9
作者 郭宝生 师恭曜 +5 位作者 王凯辉 刘素恩 赵存鹏 王兆晓 耿军义 华金平 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第22期4349-4359,共11页
目的发掘陆地棉Dirigent-like蛋白基因家族,明确不同黄萎病抗性品种间该基因家族成员的多态性及表达差异。方法利用Illumina Hiseq 2000测序平台,通过RNA-Seq测序技术,获得黄萎病菌侵染陆地棉抗病品种和感病品种的Dirigent-like蛋白基... 目的发掘陆地棉Dirigent-like蛋白基因家族,明确不同黄萎病抗性品种间该基因家族成员的多态性及表达差异。方法利用Illumina Hiseq 2000测序平台,通过RNA-Seq测序技术,获得黄萎病菌侵染陆地棉抗病品种和感病品种的Dirigent-like蛋白基因家族成员Unigene序列;采用生物信息学软件对其进行核苷酸序列及编码蛋白的多重比对和系统进化分析;针对该家族成员设计特异的quantitative real-time PCR引物,在Applied Biosystems 7500 Real Time PCR System上使用SYBR green PCR试剂盒标记反应产物,棉花Gh ACTIN为内标,采用2-ΔΔCt法分析抗病品种冀79、感病品种TM-1中该基因家族成员在0 h及受侵染1、8、24、48、72和96 h后的表达差异。结果获得12个陆地棉Dirigent-like蛋白基因家族成员;该家族成员分属3个进化群,基因间存在4个保守结构域。其同源基因在D5基因组染色体上,主要集中于第2、3、6、7、9、10、13染色体。陆地棉受黄萎病侵染后,Dirigent-like蛋白基因抗病、感病品种间差异表达,抗病品种冀79受黄萎病菌侵染1 h时上调2倍以上的有Gh DIR4、Gh DIR6、Gh DIR7、Gh DIR9、Gh DIR10和Gh DIR11,其中,Gh DIR9上调6.5倍;侵染8 h时Gh DIR1、Gh DIR4、Gh DIR7和Gh DIR11上调,有2个上调2倍以上;侵染24 h时仅Gh DIR4上调2倍以上;侵染48 h时Gh DIR1、Gh DIR4、Gh DIR7和Gh DIR11上调达到2倍以上;侵染72 h时仅Gh DIR9上调2倍以上,达到6.4倍;侵染96 h时仅Gh DIR4上调2倍以上。感病品种TM-1受侵染1 h时仅Gh DIR7上调2倍以上;受侵染8 h时Gh DIR7上调325倍,Gh DIR10上调2倍以上;侵染24和48 h时Gh DIR4、Gh DIR5、Gh DIR6、Gh DIR7、Gh DIR9、Gh DIR10急剧上调,Gh DIR7、Gh DIR9、Gh DIR10上调10倍以上;受侵染72 h时Gh DIR4和Gh DIR7还保持较高的表达量;侵染96 h时Gh DIR5、Gh DIR6、Gh DIR7、Gh DIR9、Gh DIR10和Gh DIR11保持较高的表达量。由此看出,受黄萎病侵染时抗病种质冀79 Dirigent-like蛋白基因家族成员上调表达要早于感病品种,但是,该基因家族成员在感病品种受侵染8 h后上调倍数远远高于抗病品种,而且到96 h时其表达量还较高;抗病品种上调的Dirigent-like蛋白家族成员Gh DIR4、Gh DIR7、Gh DIR9和Gh DIR11值得关注;Gh DIR6、Gh DIR7、Gh DIR9和Gh DIR10在感病品种TM-1中上调显著。此外,抗病、感病品种间Gh DIR1、Gh DIR3、Gh DIR5、Gh DIR8、Gh DIR10和Gh DIR12存在核苷酸多态性。结论 Dirigent-like蛋白与黄萎病菌侵入后棉花植株的抗性反应相关。 展开更多
关键词 棉花 Dirigent-like蛋白基因 黄萎病菌 表达差异
下载PDF
茶树花蕾14-3-3蛋白基因的分子克隆及差异表达分析 被引量:12
10
作者 余梅 江昌俊 +4 位作者 房婉萍 叶爱华 王朝霞 李叶云 朱林 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第10期2983-2991,共9页
【目的】从分子水平研究茶树花蕾发育阶段的相关基因表达,了解茶树花蕾的发育机理,利用分子生物学技术抑制茶树的生殖生长、促进营养生长。【方法】利用cDNA-AFLP技术对茶树花蕾发育早期和晚期的差异表达进行分析。采用RACE技术克隆到... 【目的】从分子水平研究茶树花蕾发育阶段的相关基因表达,了解茶树花蕾的发育机理,利用分子生物学技术抑制茶树的生殖生长、促进营养生长。【方法】利用cDNA-AFLP技术对茶树花蕾发育早期和晚期的差异表达进行分析。采用RACE技术克隆到花蕾发育晚期阶段特异表达的、在花蕾发育中可能起重要作用的14-3-3基因,通过RT-PCR和Western-blot方法研究该基因转录水平和蛋白质表达水平的特点。【结果】在测定的大约1110个茶树花蕾cDNA片段中,122个(10.9%)是差异性表达的,其中87个在发育晚期特异表达,包括茶树14-3-3蛋白基因(GenBank登录号:DQ444463),其全长为1072bp,包含1个由783个核苷酸组成的ORF,编码260个氨基酸,5′非翻译区和3′非翻译区分别有67和222个核苷酸,该基因与其它植物的14-3-3蛋白基因在核苷酸序列和推导的氨基酸序列方面均有着比较高的相似性。RT-PCR和Western-blot分析表明该基因在茶树的晚期发育花蕾中特异表达。【结论】14-3-3蛋白仅存在于茶树发育晚期的花蕾中。cDNA-AFLP技术能用于茶树花蕾不同发育时期的基因分离研究。 展开更多
关键词 茶树 差异表达基因 14-3-3蛋白 CDNA-AFLP WESTERN-BLOT
下载PDF
筛选差异表达基因和蛋白质的方法进展 被引量:19
11
作者 王吉村 药立波 赵忠良 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第1期33-36,共4页
分离和鉴定差异表达基因和蛋白质不仅有助于发现基因和蛋白质的功能 ,更有助于揭示某些疾病的发生机理 .目前筛选差异表达基因的方法主要有差异显示PCR方法 (differentialdisplayRT PCR ,DDRT PCR)、消减杂交法 (subtractivehybridizati... 分离和鉴定差异表达基因和蛋白质不仅有助于发现基因和蛋白质的功能 ,更有助于揭示某些疾病的发生机理 .目前筛选差异表达基因的方法主要有差异显示PCR方法 (differentialdisplayRT PCR ,DDRT PCR)、消减杂交法 (subtractivehybridization ,SH )、基因芯片技术 (DNAchiptechnique)和基因表达的系统分析 (serialanalysisofgeneexpression ,SAGE)等 ,其中消减杂交法中又先后建立了代表性差异分析技术 (representationaldifferenceanalysis ,RDA)、抑制消减杂交法 (suppressionsubtractivehybridization ,SSH)和获得全长基因的消减杂交法 (full length gene obtainablesubtractivehybridization) .筛选差异表达蛋白质的方法主要有双向电泳技术(two dimentionalgelelectrophoresis)和噬菌体全套抗体库技术 (phagedisplayantibodyrepertoirelibrarytechnique) .这些方法各有特点 ,各有利弊 ,研究者可根据自己的需要选择适合于自己的方法 . 展开更多
关键词 筛选 差异表达基因 差异表达蛋白
下载PDF
日本血吸虫信号蛋白编码基因表达质粒的构建 被引量:6
12
作者 李德发 沈继龙 +3 位作者 祖莹 王维 郭泽坤 余龙 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期123-124,共2页
关键词 日本血吸虫 信号蛋白 编码基因 质粒 构建 基因表达
下载PDF
关于Runx2基因突变、基因表达调节和编码的两个主要蛋白异构体typeI和typeII功能差异的研究
13
作者 李雅林 戴志洁 +3 位作者 郑世平 潘玮 周宏灏 肖洲生 《中国临床药理学与治疗学》 CAS CSCD 2007年第10期1184-1185,共2页
AIM: This study is aimed to investigate Runx2’s regulation by phytoestrogens resveratrol and genistein, screen for Runx2 mutation in Chinese cleidocranial dysplasia(CCD) patients, also determine the functional differ... AIM: This study is aimed to investigate Runx2’s regulation by phytoestrogens resveratrol and genistein, screen for Runx2 mutation in Chinese cleidocranial dysplasia(CCD) patients, also determine the functional difference between Runx2’s two major isoforms-type I and type II. METHODS: The simian virus 40 large T antigens (SV40LT) gene was used to establish immortalized hBMSCs and the cell line were then identified by specific surface markers confirmation and pro-longed life span and renewable proliferative capacity illustration. Then we tested resveratrol and genistein’s regulation on the cell line by monitoring several osteoblastic markers and invested the possible involved pathway by western blotting. Subsequently, we determined the functional difference of Runx2’s two major isoforms-type I and type II-in osteoblastic differentiation by RNAi. Also for the first time we screened for the Runx2 mutations in Chinese CCD patients by DNA analysis. RESULTS: We successfully established a permanent hBMSCs by stable transfection of SV40LT. Based on this cell line platform, we illustrated that phytoestrogens resveratrol and genistein regulated Runx2’s expression in osteoblastic differentiation and might partly via MAPK pathway. We also found that type I and type II play a different role in osteoblastic differentiation process, during which type I major increased in the early phase and important for the cell proliferation while type II predominantly functioned in the late stage and necessary for the cell maturation. What’s more, we sequencing coding domains and promoter domains of Runx2 from 9 patients in 3 different CCD familial cases and found two nucleotide changes. CONCLUSION: In this paper, we set up an immortalized hBMSC line by stable transfection of SV40LT which brings convenience for the later studies, reveals that resveratrol and genistein are capable of promote osteoblastic differentiation and are probably via MAPK pathway, also finds that type I major functions in the early stage of osteoblastic differentiation while type II predominantly functions in the late stage, which for the first time distinguishes their effects and gave new hints for bone-related diseases therapies. Moreover, the investigation on RUNX2 mutations in CCD patients adds new records to the repertoire of RUNX2 mutations in China. 展开更多
关键词 RUNX2 基因突变 基因表达 调节 编码 蛋白异构体 功能差异
下载PDF
胃癌中医证型p53与nm23基因蛋白表达性别差异分析 被引量:7
14
作者 施俊 许玲 +1 位作者 何金 孙大志 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2005年第8期940-944,共5页
目的:分析男女两性胃癌中医不同证型p53与nm23基因蛋白表达的差异及其与TNM分期、淋巴结转移、远处转移的关系,为探索胃癌中医证本质提供依据.方法:胃癌患者术前按中医辨证分型标准归类成6型;术后标本用免疫组化Envision法检测胃癌组织... 目的:分析男女两性胃癌中医不同证型p53与nm23基因蛋白表达的差异及其与TNM分期、淋巴结转移、远处转移的关系,为探索胃癌中医证本质提供依据.方法:胃癌患者术前按中医辨证分型标准归类成6型;术后标本用免疫组化Envision法检测胃癌组织p53与nm23蛋白表达,并对不同证型按性别进行比较分析,包括TNM分期、淋巴结转移和远处转移等.结果:胃癌患者各证型表达与TNM分期无关,淋巴结与远处转移无差异,痰湿凝结和胃热伤阴2型淋巴结转移男女两性存在差异(P<0.05),痰湿凝结型女性淋巴结转移多于男性,胃热伤阴型则反之,胃热伤阴型远处转移女性多于男性(P<0.05).各证型间及男女两性p53与nm23表达无显著差异(P>0.05),各证型女性患者p53表达存在差异(P=0.03),痰湿凝结型p53表达男性高于女性(P=0.01),胃热伤阴型p53与nm23表达女性高于男性(P<0.05).结论:胃癌特定中医证型男女两性p53(痰湿凝结和胃热伤阴型)与nm23(胃热伤阴型)蛋白表达存在差异,与淋巴结转移、远处转移存在关联. 展开更多
关键词 胃癌 中医证型 P53 NM23 基因蛋白 表达 性别差异
下载PDF
基质金属蛋白酶14基因在人喉鳞状细胞癌中表达差异的分析 被引量:7
15
作者 刘业海 唐平章 +6 位作者 刘芝华 徐震纲 祁永发 李爱东 丁芳 张立勇 骆爱萍 《中华耳鼻咽喉科杂志》 CSCD 北大核心 2004年第8期501-506,共6页
目的 探讨基质金属蛋白酶14(matrix mettallo-proteinase 14,MMP14)即膜性基质金属蛋白酶(membrane type-1 matrix metalloproteinase,MT1-MMP)基因在喉癌中表达与喉癌临床病理生物学行为的关系。方法 从分子和蛋白质水平,研究MMP14在... 目的 探讨基质金属蛋白酶14(matrix mettallo-proteinase 14,MMP14)即膜性基质金属蛋白酶(membrane type-1 matrix metalloproteinase,MT1-MMP)基因在喉癌中表达与喉癌临床病理生物学行为的关系。方法 从分子和蛋白质水平,研究MMP14在喉癌组织和其相邻的正常黏膜组织的表达差异,分析MMP14基因及其蛋白表达与喉癌临床病理生物学行为的关系。结果 33例配对喉癌标本中MMP14基因在26例喉癌组织中的表达明显高于其相应的正常黏膜组织,2例喉癌低表达,5例表达差异不明显。MMP14基因在不同分期的声门型喉癌中的表达差异无显著性(P>0.05),但在不同分化程度、有无淋巴结转移的声门型喉癌中,表达差异有显著性(P<0.05);在不同分期、不同分化程度及有无淋巴结转移的声门上型喉癌中,表达差异有显著性(P<0.05)。MMP14蛋白绝大多数位于癌巢细胞质内及癌巢间质内的成纤维细胞质内,在部分病例中有的正常黏膜细胞内不表达,有的表达;MMP14蛋白在绝大多数喉癌组织中的表达明显高于其相邻的正常黏膜组织。MMP14蛋白表达与MMP14基因表达基本是一致的。MMP14蛋白表达差异有显著性组患者的术后生存率与表达差异无显著性组的术后生存率无统计学差异(P>0.05)。结论 MMP14蛋白在喉癌的侵袭中可能只起一定的作用。 展开更多
关键词 基质金属蛋白酶14基因 喉鳞状细胞癌 基因表达差异 预后
下载PDF
p16基因mRNA及其编码蛋白在宫颈癌中的表达 被引量:4
16
作者 魏晓丽 许静洪 +1 位作者 张波 侯琳 《陕西医学杂志》 CAS 北大核心 2004年第6期543-544,546,共3页
目的 :探讨宫颈癌中 p1 6m RNA及其编码蛋白的表达水平与肿瘤发生、发展和预后的相关性。方法 :用原位杂交法和免疫组化染色法分别对宫颈癌、CIN、正常宫颈组织中的 p1 6m RNA及其蛋白进行检测。结果 :p1 6m RNA和蛋白在正常宫颈、CIN... 目的 :探讨宫颈癌中 p1 6m RNA及其编码蛋白的表达水平与肿瘤发生、发展和预后的相关性。方法 :用原位杂交法和免疫组化染色法分别对宫颈癌、CIN、正常宫颈组织中的 p1 6m RNA及其蛋白进行检测。结果 :p1 6m RNA和蛋白在正常宫颈、CIN、宫颈癌组织中均有表达 ,且表达阳性率逐渐降低 ,分别为 90 %和 1 0 0 % ,60 %和 60 % ;42 .5 %和 47.5 %。p1 6m RNA及其蛋白表达与宫颈癌病理分级、临床分期、淋巴结转移有关。结论 :p1 6m RNA及其蛋白的表达与宫颈癌发生、发展有关 ,p1 6基因不仅为细胞周期的固有调控者 。 展开更多
关键词 P16基因 MRNA 编码蛋白 宫颈癌 表达
下载PDF
幽门螺杆菌18000u外膜蛋白编码基因的克隆及表达 被引量:4
17
作者 姜政 黄爱龙 +3 位作者 汪志群 陶小红 王丕龙 蒲丹 《世界华人消化杂志》 CAS 2002年第3期266-270,共5页
目的:构建含幽门螺杆菌(Hp)18000u外膜蛋白编码基因的重组载体并在E.coli BL21中表达。为Hp的疫苗开发、快速诊断试剂盒的研究奠定基础。 方法:用PCR从Hp染色体中,扩增18000u外膜蛋白编码基因片段。将目的基因与pET32a(+)同时经Bam H I,... 目的:构建含幽门螺杆菌(Hp)18000u外膜蛋白编码基因的重组载体并在E.coli BL21中表达。为Hp的疫苗开发、快速诊断试剂盒的研究奠定基础。 方法:用PCR从Hp染色体中,扩增18000u外膜蛋白编码基因片段。将目的基因与pET32a(+)同时经Bam H I,Hind Ⅲ双酶切、纯化、连接,转化含有目的基因的重组载体。以含目的基因片段的重组载体转化大肠杆菌BL21(DE30)并表达。表达产物经纯化后,用ELISA法检测其抗原性。 结果:经酶切、测序分析表明,插入的基因片段为Hp 18000 u的外膜蛋白编码基因,与Tomb等报道相比较,有2%编码基因发生变异,1.7%氨基酸残基改变。经SDS-PAGE分析发现,融合基因表达的蛋白为38000 u,其中pET32a(+)表达的蛋白约为20000 u,可溶性表达产物占全菌总蛋白的21.3%。重组蛋白经Ni-NTA琼脂糖树脂纯化后,其纯度达95%以上。ELISA法检测显示,该重组蛋白可被Hp阳性患者的血清所识别,具有良好的抗原性。 结论:成功地克隆并表达Hp 18000 u的外膜蛋白编码基因,为Hp蛋白质疫苗的研制和快速诊断试剂盒的研究奠定了基础。 展开更多
关键词 幽门螺杆菌 18000u外膜蛋白编码基因 克隆 表达
下载PDF
SARS病毒S蛋白编码基因在大肠杆菌中的克隆与表达 被引量:2
18
作者 贾雪梅 钱超 +4 位作者 卢春 姚堃 曾怡 黄丽 姜平 《江苏医药》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期415-417,F002,共4页
目的 克隆传染性非典型肺炎 (SARS)病毒纤突蛋白S氨基端编码序列 ,并将其置于大肠杆菌作融合表达 ,为快速检测SARS病人IgM提供抗原。方法 从GenBank获得SARS病毒BJ0 1株纤突蛋白S基因序列 ,人工合成其氨基端 5 0 1bp双链DNA序列 ,在 ... 目的 克隆传染性非典型肺炎 (SARS)病毒纤突蛋白S氨基端编码序列 ,并将其置于大肠杆菌作融合表达 ,为快速检测SARS病人IgM提供抗原。方法 从GenBank获得SARS病毒BJ0 1株纤突蛋白S基因序列 ,人工合成其氨基端 5 0 1bp双链DNA序列 ,在 5’和 3’端分别引入BamHⅠ、XhoⅠ酶切位点。常规法将其克隆到 pBluescriptⅡSK(+)质粒中进行核酸序列测定 ,进一步将其克隆进原核表达载体pGEX 6 p 1中 ,构建含S蛋白基因的重组原核表达质粒。重组原核表达质粒经酶切鉴定后转化大肠杆菌 (E .coli)BL2 1感受态细胞 ,以异丙基硫代 β D 半乳糖苷 (IPTG)诱导表达融合蛋白。结果 核酸序列测定与分析的结果表明 ,克隆的 5 0 1bp基因序列与基因数据库中所登记的BJ0 1毒株序列呈现 10 0 %同源性。IPTG诱导后的菌体 ,经SDS 聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE) ,显示有一个大小为 4 2ku的融合表达蛋白产生。结论 S蛋白氨基端 5 0 1bp编码基因在E .coli中获得正确表达 ,为进一步研究提供了实验室资料。 展开更多
关键词 SARS病毒 S蛋白编码基因 大肠杆菌 克隆 传染性非典型肺炎 基因表达 纤突蛋白S 原核表达
下载PDF
转Bt基因抗虫棉外源Bt蛋白的差异表达 被引量:2
19
作者 常丽娟 宋君 +4 位作者 刘文娟 张富丽 王东 尹全 雷绍荣 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第6期1275-1278,共4页
【目的】研究转Bt基因抗虫棉外源Bt蛋白表达的时空规律,明确Bt蛋白表达量和转Bt基因抗虫棉抗性的内在联系,更加有效降低靶标害虫危害。【方法】采用ELISA(Enzyme-linked immunosorbent assay)蛋白定量检测方法,以转Bt基因抗虫棉鄂抗虫棉... 【目的】研究转Bt基因抗虫棉外源Bt蛋白表达的时空规律,明确Bt蛋白表达量和转Bt基因抗虫棉抗性的内在联系,更加有效降低靶标害虫危害。【方法】采用ELISA(Enzyme-linked immunosorbent assay)蛋白定量检测方法,以转Bt基因抗虫棉鄂抗虫棉1号(GK19)为研究材料,对转Bt基因抗虫棉不同组织器官、不同生长时期主茎功能叶和不同生长时期主茎不同叶位叶片的Bt蛋白含量进行检测。【结果】转Bt基因抗虫棉不同组织器官Bt蛋白含量存在差异,苗期叶片最高,花、蕾、铃次之,根、茎较低;不同生长时期主茎功能叶Bt蛋白含量呈现出随生长发育时间推进而降低的趋势;不同生长时期主茎不同叶位叶片Bt蛋白含量差异较大,苗期和盛蕾期第1~7叶呈现出逐渐下降的趋势,而盛花期和盛铃期第1~7叶呈现出先缓慢升高后逐渐稳定的趋势。【结论】Bt蛋白在转Bt基因抗虫棉各生长时期,各组织器官都有表达,且表达量呈时空动态变化。 展开更多
关键词 转BT基因抗虫棉 ELISA Bt蛋白含量 差异表达
下载PDF
应用表达谱基因芯片筛选植物激活蛋白处理水稻相关差异基因 被引量:5
20
作者 黄丽俊 邱德文 +3 位作者 刘峥 左斌 杨秀芬 王建华 《科学技术与工程》 2005年第24期1885-1889,共5页
应用基因表达谱检测植物激活蛋白处理水稻相关差异基因的表达,建立相关基因表达谱。用Cy5和Cy3分别标记激活蛋白处理和对照cDNA,将两种荧光探针混合,与载有10368位点的水稻表达谱cDNA基因芯片进行杂交,并用芯片扫描系统进行扫描,通过Cy5... 应用基因表达谱检测植物激活蛋白处理水稻相关差异基因的表达,建立相关基因表达谱。用Cy5和Cy3分别标记激活蛋白处理和对照cDNA,将两种荧光探针混合,与载有10368位点的水稻表达谱cDNA基因芯片进行杂交,并用芯片扫描系统进行扫描,通过Cy5与Cy3信号强度比值的计算研究基因的表达差异。共获得97个差异表达基因,其中上调基因4个,下调基因93个。应用基因表达谱芯片成功筛选了植物激活蛋白处理水稻差异表达的基因,为深入揭示该激活蛋白的作用机制研究提供依据。 展开更多
关键词 基因表达 差异表达 植物激活蛋白 基因芯片
下载PDF
上一页 1 2 29 下一页 到第
使用帮助 返回顶部