甘蓝型油菜BnAR基因家族全基因组鉴定与响应低温胁迫的表达分析

为了解甘蓝型油菜(Brassica napus L.)中BnAR基因的基本信息、进化关系及其在低温胁迫下的表达模式,对甘蓝型油菜BnAR基因家族成员进行全基因组鉴定,并探究低温胁迫下家族成员的表达情况。结果表明:甘蓝型油菜参考基因组中共鉴定出14个BnAR基因家族成员,分布在8条染色体上,将其命名为BnAR-1~BnAR-14,可分为ADC和DapDC两个亚家族;启动子顺式作用元件分析发现,BnAR基因家族成员的启动子区含有多种与激素和胁迫响应相关的元件;甘蓝型油菜组内共线性分析发现11对基因具有共线性关系,Ka/Ks分析发现所有同源基因的比值均小于0.5,说明BnAR基因家族在进化过程中受到严格的纯化选择;转录组数据分析表明,14个BnAR基因均响应低温胁迫,其中BnAR-4、BnAR-5、BnAR-11和BnAR-13受低温胁迫程度最为强烈,荧光定量PCR验证结果与转录组数据高度一致,因此可将这4个基因作为候选基因进行后续的功能验证。