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最大泡压法测定吐温-80的表面参数及亲水基分子截面积 被引量:2
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作者 余丹妮 谷正昊 韩永虎 《大学化学》 CAS 2020年第3期67-75,共9页
运用溶液表面吸附原理,以升级后的最大泡压装置测定了25℃下非离子表面活性剂吐温-80的表面吸附等温线,通过近似处理得到吐温-80的临界胶束浓度(CMC),进一步求得吐温-80的亲水基截面积,分析了图解法处理数据的不足和实验开展的优势。该... 运用溶液表面吸附原理,以升级后的最大泡压装置测定了25℃下非离子表面活性剂吐温-80的表面吸附等温线,通过近似处理得到吐温-80的临界胶束浓度(CMC),进一步求得吐温-80的亲水基截面积,分析了图解法处理数据的不足和实验开展的优势。该实验对学生学习和解析复杂的表面吸附等温线具有重要的指导意义。 展开更多
关键词 吐温-80 临界胶束浓度 分子面积
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表面膜压与单个分子所占面积的关系 被引量:3
2
作者 汤传义 姚卫霞 《安庆师范学院学报(自然科学版)》 2003年第4期17-19,共3页
单分子表面膜膜压π与单个分子膜所占面积A的关系极为复杂。借助于动态膜压仪,研究表面膜压π随单个分子膜面积A的变化关系。由膜压与面积的关系,来确定单分子膜物态及其它性质。
关键词 表面 分子面积 平面物态 分子表面 物态
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从分子极性表面积预测β-受体阻断剂的血浆蛋白结合率
3
作者 詹淑玉 傅旭春 《海峡药学》 2007年第8期50-52,共3页
目的从分子极性表面积和分子量预测药物的血浆蛋白结合率。方法根据半经验自洽场分子轨道AM1法得到的优化构型用Monte Carlo法计算得到分子量和分子极性表面积。用逐步多元回归分析法建立从药物的分子量、分子极性表面积预测14种β-受... 目的从分子极性表面积和分子量预测药物的血浆蛋白结合率。方法根据半经验自洽场分子轨道AM1法得到的优化构型用Monte Carlo法计算得到分子量和分子极性表面积。用逐步多元回归分析法建立从药物的分子量、分子极性表面积预测14种β-受体阻断剂的血浆蛋白结合率的数学模型。回归方程采用statistics60软件做逐步多元回归分析得到。结果β-受体阻断剂的血浆蛋白结合率与分子量(MW)、氢键给体表面积(SH)和氢键受体表面积(So,N)具有良好的相关性,回归方程为:fb=1.89-6.50×10-2So.N+6.24×10-4SH2+1.41×10-4MW*So.N(n=13,R=0.8891)。结论β-受体阻断剂的血浆蛋白结合率与分子量和分子极性表面积密切相关。从分子极性表面积预测药物血浆蛋白结合率具有方便快捷的优点,可用于相关的药动学参数的研究。 展开更多
关键词 血浆蛋白结合率 分子极性表面 分子 Β-受体阻断剂
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13X分子筛吸附性能及其比表面积的研究 被引量:1
4
作者 陈树军 黄毅雄 +3 位作者 付越 安家荣 陶致成 李雪健 《真空科学与技术学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第10期1175-1179,共5页
对于真空绝热压力容器来说,如何获得并且能够长期维持满足要求的夹层真空度,主要在于吸附剂的吸附性能和微观结构。为此,采用巨正则系综的蒙特卡罗方法,结合13X分子筛在298 K下吸附CO2的实验数据,优化了模拟力场参数。通过模拟308 K下的... 对于真空绝热压力容器来说,如何获得并且能够长期维持满足要求的夹层真空度,主要在于吸附剂的吸附性能和微观结构。为此,采用巨正则系综的蒙特卡罗方法,结合13X分子筛在298 K下吸附CO2的实验数据,优化了模拟力场参数。通过模拟308 K下的CO2吸附和298 K下的N2吸附并与实验数据进行对比,验证了优化的力场参数的准确性和可靠性,表明该力场参数在不同温度和吸附质的条件下能够较准确的模拟13X分子筛的吸附行为。最后使用优化调整后的力场参数模拟13X分子筛在77K温度下的N2吸附等温线,同时采用ASAP2020物理吸附仪对13X分子筛样品进行微观结构测试。对比模拟与实验的吸附等温线,发现压力在0~70 k Pa内两者比较接近,并计算了其比表面积,模拟所得分子筛比表面积为455.52m2/g,与实验值的相对误差为4.3%,表明利用模拟的方法可以获得吸附剂的比表面积。研究结果将会极大地促进真空绝热压力容器的快速发展。 展开更多
关键词 真空绝热力容器 13X分子 吸附等温线 表面
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L-α-二油酸磷酯酰胆碱和芦丁硬脂酸酯混合单分子膜的相容性 被引量:1
5
作者 段煜 杜宗良 +2 位作者 唐卫文 李瑞霞 吴大诚 《化学研究与应用》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期183-187,共5页
Rutin was acylated with stearic acid in esterification reaction catalyzed by immobilized Candida antarctica lipase B(Novozym 435).The results suggested that the regioselectivity of the lipase-catalyzed esterification ... Rutin was acylated with stearic acid in esterification reaction catalyzed by immobilized Candida antarctica lipase B(Novozym 435).The results suggested that the regioselectivity of the lipase-catalyzed esterification of rutin was specific at the C4’’’ position of the rhamnose moiety.The monolayer of dioleoylphosphatidylcholine(DOPC) was used as the model membrane to study their molecular interaction with RS.The miscibility of DOPC/RS mixed monolayers has been investigated by Langmuir film balance to yield quantitative information on the nature of the molecular interaction,which could provide valuable insights to reveal the antioxidative activity mechanism of flavonoids.Pure RS and pure DOPC were capable of forming monolayers with liquid-phase at the air/water interface.The two components of DOPC/RS monolayer were miscible throunghout the mixture composition range.The effects of the temperature of the subphase on the miscibility and molecular interaction of DOPC/RS monolayers were investigated.The miscibility was more excellent at higher temperature.The condensing effect of RS,which represented the attractive forces between DOPC and RS,could be ascribed to the match of molecular shapes of RS and DOPC on the monolayers packing. 展开更多
关键词 混合单分子 芦丁硬脂酸酯 L-α-二油酸磷脂酰胆碱 表面压-分子面积等温线 相容性 分子间相互作用
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快速热解褐煤焦的比表面积及孔隙结构 被引量:63
6
作者 刘辉 吴少华 +4 位作者 孙锐 徐睿 邱朋华 李可夫 秦裕琨 《中国电机工程学报》 EI CSCD 北大核心 2005年第12期86-90,共5页
利用热力工况与实际煤粉锅炉相似的管式沉降炉,获得快速热解条件下不同粒度、不同热解时间的煤焦试样,采用美国Micromeritics公司ASAP2020自动吸附仪测定低温氮吸附等温线,不同粒度及不同热解时间的煤焦其吸附等温线都是带回线的Ⅱ型吸... 利用热力工况与实际煤粉锅炉相似的管式沉降炉,获得快速热解条件下不同粒度、不同热解时间的煤焦试样,采用美国Micromeritics公司ASAP2020自动吸附仪测定低温氮吸附等温线,不同粒度及不同热解时间的煤焦其吸附等温线都是带回线的Ⅱ型吸附等温线,说明其具有较连续的完整的孔系统,孔径范围小至分子级孔,大至无上限孔(相对而言).各煤焦试样的比表面积及孔径分布具有相似的特点,分布曲线起始部分上翘,在孔直径3~4nm内出现峰值.试验条件下,随着热解时间的增加,煤焦的比表面积和孔容积减小.在各个相同的热解时间条件下,平均粒度29.61μm煤样的煤焦比表面积和孔容积均大于平均粒度72.79μm煤样的煤焦,表明煤粉粒度的减小对其热解后煤焦的孔隙结构有重要影响. 展开更多
关键词 表面 孔隙结构 煤焦 快速热解 吸附等温线 平均粒度 管式沉降炉 自动吸附仪 煤粉锅炉 热力工况 热解条件 孔径分布 分布曲线 试验条件 煤粉粒度 孔容积 时间 分子 相似 试样 减小 煤样 上翘
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秸秆-污泥复合基活性炭的制备及其对1,2,4-酸氧体的吸附特性 被引量:24
7
作者 周品 谷麟 +3 位作者 饶姗姗 黄永春 袁海平 朱南文 《环境化学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期106-111,共6页
以污水处理厂剩余污泥与芦苇秸秆为原料,采用化学活化和高温热解的方法制备了秸秆-污泥复合基活性炭,研究了其各项性质及对1,2-重氮氧基萘-4-磺酸(1,2,4-酸氧体)的吸附性能.结果显示,当污泥与秸秆的质量比为4∶1时,经0.5 mol.L-1的KOH... 以污水处理厂剩余污泥与芦苇秸秆为原料,采用化学活化和高温热解的方法制备了秸秆-污泥复合基活性炭,研究了其各项性质及对1,2-重氮氧基萘-4-磺酸(1,2,4-酸氧体)的吸附性能.结果显示,当污泥与秸秆的质量比为4∶1时,经0.5 mol.L-1的KOH活化并且600℃高温炭化后,复合基活性炭的比表面积和含碳量分别为558.1 m.2g-1和58.9%,比污泥基活性炭提高了9.2%和4.6%,掺杂秸秆能有效提高污泥制备活性炭的比表面积和含碳量;扫描电镜观察显示,复合基活性炭表面呈多孔状.热分析研究发现复合基活性炭前躯体的高温热解过程主要伴随低温区域的脱水以及高温区域的造孔,其800℃热解时的烧失率为43%;N2吸附脱附曲线表明添加秸秆有利于增加活性炭微孔及中孔数量;在25℃下对酸氧体的吸附等温线结果显示,经秸秆掺杂的复合基活性炭其吸附性能明显提高,最大吸附量为56.4 mg.g-1,而同等条件下污泥基活性炭的最大吸附量仅为20.4 mg.g-1,表明复合基活性炭对该染料具有较好的吸附性能.从而本研究也为更好地实现污泥的资源化利用提供了一条有效途径. 展开更多
关键词 秸秆 复合基活性炭 表面 1 2 4-酸氧体 吸附等温线
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水包稠油乳状液稳定性研究 Ⅱ.稠油官能团组分表面膜性质探索 被引量:12
8
作者 范维玉 宋远明 +2 位作者 郭玉玺 刘兴玉 赵福麟 《石油学报(石油加工)》 EI CAS CSCD 北大核心 2001年第4期12-17,共6页
测定了辽河油田杜 -84稠油化学官能团组分酸性分、碱性分、两性分、中性分以及沥青质、胶质的表面膜膜压 -面积 ( π-A)等温曲线和膜面积损失曲线 ,考察了水相 p H值、扩展溶剂芳香度等因素对 π-A曲线的影响。结果表明 ,稠油各组分都... 测定了辽河油田杜 -84稠油化学官能团组分酸性分、碱性分、两性分、中性分以及沥青质、胶质的表面膜膜压 -面积 ( π-A)等温曲线和膜面积损失曲线 ,考察了水相 p H值、扩展溶剂芳香度等因素对 π-A曲线的影响。结果表明 ,稠油各组分都能在空气 /水表面形成二维不溶性表面膜 ,其中酸性分和沥青质的膜压较高 ;扩展溶剂芳香度增大 ,酸性分和两性分的膜压明显增大 ;p H值对酸性分、碱性分、两性分和沥青质 π-A曲线的影响最大 ,一般来说 ,增强碱性条件 ,有利于各组分膜压的提高 ;膜面积损失曲线表明 ,酸性分形成的单分子膜最稳定 ,沥青质、两性分形成的单分子膜较稳定。综合分析结果表明 ,酸性分或沥青质是稠油中成膜的主要界面活性组分 ,它们对水包稠油乳状液稳定性的贡献较大 ;油相高芳香度。 展开更多
关键词 稠油乳状液 稠油组分 表面膜性质 -面积等温曲线
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溶液表面吸附实验拓展 被引量:2
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作者 李田 杨玲 +2 位作者 徐金荣 吴忠云 朱涛 《实验技术与管理》 CAS 北大核心 2016年第4期43-45,共3页
对经典的物理化学实验"溶液表面吸附的测定"进行了拓展,将体系由单一的正丁醇溶液扩展成正丁醇、异丁醇和叔丁醇一系列同分异构体。分别测定了3种醇溶液在不同浓度下的表面张力,拟合实验数据进而计算得到了单分子的占有面积,... 对经典的物理化学实验"溶液表面吸附的测定"进行了拓展,将体系由单一的正丁醇溶液扩展成正丁醇、异丁醇和叔丁醇一系列同分异构体。分别测定了3种醇溶液在不同浓度下的表面张力,拟合实验数据进而计算得到了单分子的占有面积,并与chem3D软件的理论模拟进行了比较。结果表明,实验求得吸附量和单分子占有面积的同时,可以有效地区分分子纳米尺度的结构差异。实验有助于增强学生对微观的具象认识,并对表面吸附实验有更加深刻全面的理解。 展开更多
关键词 表面吸附 最大泡 表面张力 同分异构体 分子占有面积
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多孔苯乙烯-二乙烯基苯共聚物的制备与孔结构 被引量:3
10
作者 胡友根 周志平 盛维琛 《高分子材料科学与工程》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第11期71-74,共4页
以甲苯和正庚烷为混合致孔剂,悬浮法制备多孔苯乙烯-二乙烯基苯共聚物(St-DVB)。在77K低温下,采用氮气吸附法测定了多孔St-DVB共聚物的氮气吸附-脱附等温线。通过改变交联度和致孔剂组分(甲苯与正庚烷配比),研究了它们对共聚物微观孔结... 以甲苯和正庚烷为混合致孔剂,悬浮法制备多孔苯乙烯-二乙烯基苯共聚物(St-DVB)。在77K低温下,采用氮气吸附法测定了多孔St-DVB共聚物的氮气吸附-脱附等温线。通过改变交联度和致孔剂组分(甲苯与正庚烷配比),研究了它们对共聚物微观孔结构的影响。结果表明,共聚物的孔体积和平均孔径随甲苯与正庚烷配比的增大而减小,比表面积和微孔体积在甲苯与正庚烷配比为1∶1时最大。交联度对共聚物孔结构的影响显著,比表面积和孔体积随交联度的增大而明显增加,平均孔径随交联度的增大而减小。 展开更多
关键词 多孔苯乙烯-二乙烯基苯共聚物 氮气吸附-脱附等温线 表面 孔体积 平均孔径
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SiO_2气凝胶表面特性对其吸附性能的影响 被引量:8
11
作者 张志华 倪星元 +2 位作者 沈军 吴广明 周斌 《材料导报》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第7期115-117,共3页
以多聚硅 E-40为硅源,采用溶胶-凝胶方法,通过常压干燥、表面修饰、450℃热处理等工艺制备了具有不同表面特性的 SiO_2气凝胶。用扫描电镜 SEM,^(13)C,^(29)Si NMR 谱以及孔径分布仪对其结构进行了表征,并对其吸附特性进行了研究。结果... 以多聚硅 E-40为硅源,采用溶胶-凝胶方法,通过常压干燥、表面修饰、450℃热处理等工艺制备了具有不同表面特性的 SiO_2气凝胶。用扫描电镜 SEM,^(13)C,^(29)Si NMR 谱以及孔径分布仪对其结构进行了表征,并对其吸附特性进行了研究。结果表明:在不同制备条件下,SiO_2气凝胶的表面亲、疏水特性差异非常大,比表面积、孔体积、孔径以及对有机物吸附量的变化也很大。SiO_2气凝胶具有纳米多孔结构,较好的疏水、亲水特性可调性,很强的吸附能力,具有广阔的应用前景。 展开更多
关键词 SIO2气凝胶 表面特性 吸附性能 溶胶-凝胶方法 纳米多孔结构 ^29Si 干燥 表面修饰 扫描电镜 ^13C 孔径分布 NMR谱 吸附特性 制备条件 疏水特性 表面 吸附能力 热处理 450 SEM 孔体积 吸附量 有机物 可调性
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HIV-1蛋白酶的质子化状态 被引量:1
12
作者 洪正平 王秀娥 《原子与分子物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期577-580,共4页
将分子动力学模拟和分子力学-泊松/波耳兹曼方法相结合,研究在HIV蛋白酶和抑制剂ABT-538的复合物中的不同质子化位置.结果表明:不同的质子化状态对蛋白酶的温度因子、蛋白酶和抑制剂的结合自由能及氢键都有很大影响.用分子力学-泊松/波... 将分子动力学模拟和分子力学-泊松/波耳兹曼方法相结合,研究在HIV蛋白酶和抑制剂ABT-538的复合物中的不同质子化位置.结果表明:不同的质子化状态对蛋白酶的温度因子、蛋白酶和抑制剂的结合自由能及氢键都有很大影响.用分子力学-泊松/波耳兹曼方法计算显示:在B链中,25号天冬氨酸OD1氧原子被质子化的结合自由能最强,计算得到的温度因子和实验值比较吻合.另外,由氢键分析看出:在此质子化状态中,药物和蛋白酶、药物和W301水分子、W301水分子和蛋白酶形成的氢键在整个动力学模拟过程中最稳定. 展开更多
关键词 质子化 分子动力学 分子力学-泊松/波耳兹曼表面积方法 HIV蛋白酶 氢键
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基于粉煤灰分子筛的TiO2结构和光催化性能的研究 被引量:1
13
作者 肖鹏 张云怀 《材料导报》 EI CAS CSCD 2004年第F04期78-79,共2页
以粉煤灰分子筛为载体,采用溶胶-凝胶法制备TiO2负载膜光催化剂,通过XRD、SEM、BET比表面积等技术,对粉煤灰分子筛负载TiO2光催化剂的形貌和晶型结构进行了表征;以苯酚为降解对象,考察了不同催化剂对苯酚的去除率。
关键词 粉煤灰 光催化性能 TIO2光催化剂 溶胶-凝胶法 分子筛负载 表面 晶型结构 XRD SEM BET 去除率 苯酚
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肾素与抑制性地肤子皂苷相互作用的分子机制(英文)
14
作者 光翠娥 张海玲 +1 位作者 汪俊卿 Robert PHILLIPS 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第9期8-13,共6页
地肤子中的木鳖子皂苷Ic和2’-O-β-D-吡喃葡萄糖木鳖子皂苷Ic有较强抑制肾素体外活性的功能。分子对接证实两皂苷与肾素结合较好,分别形成9个和4个氢键,氨基酸Ser230与Tyr231是氢键作用的关键残基,而Ala229、Met303、His301、Asp38、Ar... 地肤子中的木鳖子皂苷Ic和2’-O-β-D-吡喃葡萄糖木鳖子皂苷Ic有较强抑制肾素体外活性的功能。分子对接证实两皂苷与肾素结合较好,分别形成9个和4个氢键,氨基酸Ser230与Tyr231是氢键作用的关键残基,而Ala229、Met303、His301、Asp38、Arg82、Tyr83与Ile137则对疏水结合起重要作用。分子动力学模拟约1 000 ps后,两复合物平衡,均方根偏差分别为0.224 nm和0.219 nm,两皂苷降低了肾素链开始约160个氨基酸的均方根波动。分子力学泊松-波尔兹曼表面积法获得的结合自由能分别为-44.36 kcal/mol与-62.46 kcal/mol,其中主要驱动力是静电和范德华作用,而极性溶剂化能则强烈阻碍结合。3种方法综合揭示了两种地肤子皂苷抑制肾素的分子机制。 展开更多
关键词 肾素 皂苷 分子对接 分子动力学模拟 分子力学泊松-波尔兹曼表面
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砖坯半干压成型的理论与实践
15
作者 赵镇魁 龙伦芳 《砖瓦》 2010年第7期60-62,共3页
采用含水率低于10%的潮湿粉料,在较高的压力(7MPa-15MPa,有时达20MPa)下,压制成一定形状的砖坯的方法,叫半干压法。因为松散的原料颗粒中没有足够的水分,所以成型时必须施加较大的压力,使原料颗粒紧密挤合,并发生变形.从而扩大其接... 采用含水率低于10%的潮湿粉料,在较高的压力(7MPa-15MPa,有时达20MPa)下,压制成一定形状的砖坯的方法,叫半干压法。因为松散的原料颗粒中没有足够的水分,所以成型时必须施加较大的压力,使原料颗粒紧密挤合,并发生变形.从而扩大其接触面积,借表面分子的作用,迫使其机械粘结。 展开更多
关键词 半干成型 砖坯 半干 接触面积 表面分子 颗粒 原料
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相互作用熵方法在计算生物分子体系结合自由能中的发展和应用
16
作者 段莉莉 黄开放 钟素素 《山东师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2020年第3期274-285,共12页
分子力学泊松-玻尔兹曼溶剂可及表面积(MM/PBSA)是一种非常主流的计算生物大分子体系结合自由能的方法,但是其中熵变的计算一直以来都是理论计算上的难点.2016年发展的相互作用熵方法因其理论严谨、计算成本低等优势得到了广泛的应用.... 分子力学泊松-玻尔兹曼溶剂可及表面积(MM/PBSA)是一种非常主流的计算生物大分子体系结合自由能的方法,但是其中熵变的计算一直以来都是理论计算上的难点.2016年发展的相互作用熵方法因其理论严谨、计算成本低等优势得到了广泛的应用.该方法已在周期蛋白依赖性激酶2、胰蛋白酶、HIV蛋白酶、间变性淋巴瘤激酶与配体以及P53与MDMX/MDM2等一些关键的体系上得到了应用,这为研究者理解生物大分子中相互作用的机理提供了可信且新颖的途径.本文介绍了相互作用熵方法的发展,并为其在生物大分子中的应用提供了可行的指引和建议. 展开更多
关键词 相互作用熵 分子力学泊松-玻尔兹曼溶剂可及表面 结合自由能 分子动力学模拟
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卵磷脂LB膜的π-A曲线及其结构的原子力显微镜研究 被引量:4
17
作者 陈益 孙润广 《液晶与显示》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期357-362,共6页
以蔗糖溶液为亚相,用KSV Minitrough研究卵磷脂LB膜的π-A曲线,以及各种参数(浓度、温度、pH值)对其π-A曲线的影响。并用原子力显微镜观察不同状态下(气相、液相、固相)卵磷脂LB膜的结构特征。实验结果表明,改变各种参数,卵磷... 以蔗糖溶液为亚相,用KSV Minitrough研究卵磷脂LB膜的π-A曲线,以及各种参数(浓度、温度、pH值)对其π-A曲线的影响。并用原子力显微镜观察不同状态下(气相、液相、固相)卵磷脂LB膜的结构特征。实验结果表明,改变各种参数,卵磷脂LB膜的π-A曲线会发生一定程度的变化,且在不同的膜压下样品的粗糙程度也会发生不同程度的变化。在常温中性条件下,加入一定量(40~95μL)的卵磷脂可以得到最佳的成膜曲线。在亚相中,卵磷脂存在不同程度的堆积,固相时样品的粗糙程度最大,液相次之,气相最小。 展开更多
关键词 卵磷脂 蔗糖 Langmuir_Blodgett膜 原子力显微镜 表面-分子面积曲线
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人血清白蛋白与氯氰菊酯相互作用的分子模拟研究 被引量:2
18
作者 邓培渊 王辉 +2 位作者 袁洪哲 王广军 李长看 《农药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期11-17,共7页
运用分子对接、分子动力学、结合自由能计算和丙氨酸扫描等分子模拟方法,研究了人血清白蛋白(human serum albumin,HSA)与氯氰菊酯的结合模式。结果表明:氯氰菊酯与HSA结合形成了稳定的复合物,与其氨基酸残基Arg209形成1个氢键,结合... 运用分子对接、分子动力学、结合自由能计算和丙氨酸扫描等分子模拟方法,研究了人血清白蛋白(human serum albumin,HSA)与氯氰菊酯的结合模式。结果表明:氯氰菊酯与HSA结合形成了稳定的复合物,与其氨基酸残基Arg209形成1个氢键,结合自由能为–83.43 kJ/mol,其中范德华力是结合的主要驱动力,极性溶剂化能是主要抑制力。丙氨酸突变扫描结果显示,氨基酸残基Lys199的ΔΔG_(bind)值为16.78 kJ/mol,是HSA和氯氰菊酯结合的关键氨基酸。该研究结果为阐明氯氰菊酯在人体内的代谢机制提供了理论参考。 展开更多
关键词 人血清白蛋白 氯氰菊酯 分子动力学 分子力学泊松-波尔兹曼表面积法(MM-PBSA) 丙氨酸突变扫描
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基于分子动力学模拟提高嗜热磷酸三酯酶样内酯酶非特异性底物活力的理论研究
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作者 朱镜璇 于正飞 +4 位作者 刘野 詹冬玲 韩佳睿 田晓翩 韩葳葳 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2019年第1期138-146,共9页
采用分子动力学模拟和拉伸分子动力学模拟方法,结合分子力学-广义玻恩表面积(MM-GB/SA)方法进行自由能计算和结构交互指纹分析,研究了模拟过程中非特异性底物(对氧磷/内酯)分别与嗜热磷酸三酯酶样内酯酶(SsoPox)野生型和突变体(W263F/W2... 采用分子动力学模拟和拉伸分子动力学模拟方法,结合分子力学-广义玻恩表面积(MM-GB/SA)方法进行自由能计算和结构交互指纹分析,研究了模拟过程中非特异性底物(对氧磷/内酯)分别与嗜热磷酸三酯酶样内酯酶(SsoPox)野生型和突变体(W263F/W263T)结合的构象变化,分析了Loop8中重要残基Trp263的突变提高SsoPox非特异性底物活力的原因,发现其能够影响门控残基Phe229的构象变化,导致活性口袋入口变宽(Phe229与Tyr99之间的距离变大),使对氧磷和内酯更容易结合到蛋白质的活性位点上; Asp256和Arg223形成盐桥的几率高于野生型(WT) SsoPox,在Arg223(位于Loop7)的协助下质子更加高效地从活性中心的Asp256(位于Loop8)传递到溶剂中去,因而能够提高SsoPox水解底物的效率.通过比较2个野生型复合物的结构稳定性和结合自由能差异,发现在模拟过程中SsoPox与内酯的复合物体系更加稳定并且具有更低的结合自由能,有利于SsoPox识别底物并使其埋在活性部位的疏水环境中,促进氢氧化物亲核进攻底物的亲电中心.因此,底物与酶稳定的相互作用可能是SsoPox具有天然内酯酶活性的原因之一. 展开更多
关键词 嗜热类磷酸三酯酶样内酯酶 分子动力学模拟 拉伸分子动力学模拟 分子力学-广义玻恩表面 结构交互指纹分析
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关于稀溶液中溶剂的蒸气压下降问题讨论
20
作者 王保玉 《新乡学院学报(社会科学版)》 1994年第2期48-49,44,共3页
在物理化学中讲到稀溶液依数性时指出稀溶液的蒸气压下降,但没有解释为什么下降.而在无机化学中是这样解释的:“由于在溶剂中加入难挥发的溶质,溶液表面或多或少地被溶质分子占据着.减少了单位面积上溶剂的分子数,因此在同一温度下,溶... 在物理化学中讲到稀溶液依数性时指出稀溶液的蒸气压下降,但没有解释为什么下降.而在无机化学中是这样解释的:“由于在溶剂中加入难挥发的溶质,溶液表面或多或少地被溶质分子占据着.减少了单位面积上溶剂的分子数,因此在同一温度下,溶液表面上单位时间里逸出液面的溶剂分子数相应地比纯溶剂减少,溶液的蒸气压下降.”这里把蒸气压下降的原因归结为由于溶液表面被一部分溶质分子占据着使液相分子从液体表面进入气相的有效面积(气化面积)减小了,因而单位时间里逸出的溶剂分子数即气化速度减小.也有人这样解释:“当溶剂中溶入难挥发溶质后.溶剂分子要逸出液面,除了受同种分子的吸引外,还要受到作用力更大的溶质分子的吸引,致使其逸出液面的阻力增大,因而蒸气压下降.”下面我们就对这个问题加以讨论.首先,对于上面最后一种解释是不对的。 展开更多
关键词 蒸气下降 稀溶液 溶液的依数性 溶质分子 分子 液体表面 单位面积 化学势 相平衡 分子运动
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