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基于表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术的慢性肾衰竭中医湿证尿液中相关蛋白研究 被引量:8
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作者 郝一鸣 洪名超 +2 位作者 王文静 金亚明 王忆勤 《中国中西医结合杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第11期1496-1499,共4页
目的采用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(surface-enhanced laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术研究慢性肾衰竭(chronic renal failure,CRF)中医湿证患者的尿液蛋白标志物。方法采集... 目的采用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(surface-enhanced laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术研究慢性肾衰竭(chronic renal failure,CRF)中医湿证患者的尿液蛋白标志物。方法采集CRF湿证患者90例和非湿证患者60例的尿液,采用H4蛋白芯片技术进行尿液蛋白质组学研究,用蛋白芯片阅读器PBSⅡ对芯片进行扫描、分析。结果 (1)湿证组与非湿证组尿液样本的蛋白质图谱在质荷比1000-20000范围内检测到25个差异蛋白峰(P<0.01)。(2)经生物信息学分析建立CRF中医湿证尿液蛋白预测模型,得到M/Z8654.96、M/Z2081.65、M/Z18667.3和M/Z2242.14共4个差异蛋白峰组成的生物标记物可以将湿证组和非湿证组样本较好地分类,其正确率84.7%,灵敏度为92.2%,特异性为73.3%。(3)湿证组与非湿证组尿液中差异蛋白峰经SwissProt数据库鉴定,可能为7种蛋白质。结论初步筛选出CRF中医湿证的尿液蛋白标志物,建立了CRF中医湿证尿液蛋白预测模型,通过数据库对尿液蛋白标志物进行了鉴定,为CRF中医湿证的临床辨证提供了一定的实验依据。 展开更多
关键词 慢性肾衰竭 中医湿证 尿液 表面增强激光解析离子化飞行时间质谱
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表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术筛选的肺腺癌血清标志蛋白与传统肿瘤标志物的比较 被引量:5
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作者 何伟伟 陈海泉 +2 位作者 罗晓阳 陆汉魁 高云朝 《上海医学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第7期483-486,共4页
目的比较表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)筛选的肺腺癌血清标志蛋白与传统肿瘤标志物癌胚抗原(CEA)、神经元特异性烯醇化酶(NSE)、糖类抗原(CA125)和细胞角蛋白19片断(CYFRA21-1)对肺腺癌诊断价值的差异。方法肺... 目的比较表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)筛选的肺腺癌血清标志蛋白与传统肿瘤标志物癌胚抗原(CEA)、神经元特异性烯醇化酶(NSE)、糖类抗原(CA125)和细胞角蛋白19片断(CYFRA21-1)对肺腺癌诊断价值的差异。方法肺腺癌组和健康对照组各71例,按性别、年龄配对,采用SELDI-TOF-MS检测血清蛋白质质谱,筛选出血清肺腺癌标志蛋白。采用化学发光法检测血清CYFRA21-1、CEA、CA125和NSE水平。并比较联合检测对肺腺癌的诊断价值。结果①SELDI-TOF-MS检测结果:肺腺癌组有5个蛋白质峰明显呈高表达,该5个峰的相对分子质量分别为4047.79±1.60、4203.99±1.91、4959.81±2.13、5329.30±2.55和7760.12±4.11。②肺腺癌组血清CEA、CA125、NSE和CYFRA21-1水平分别为(54.38±12.79)μg/L、(130.45±54.36)mg/L、(16.85±4.65)μg/L和(23.45±5.75)μg/L,均显著高于健康对照组[(5.26±1.74)μg/L、(21.01±8.1 6)mg/L、(8.53±3.08)μg/L和(2.48±1.23)μg/L,P值均<0.05]。③5个蛋白质峰联合检测中,以3项指标阳性对肺腺癌的诊断效率最高(灵敏性、特异性分别为92.96%、90.14%);CEA、CAl25、NSE和CYFRA21-1联合检测中,2项指标阳性对肺腺癌的诊断效率较高(灵敏性、特异性分别为63.38%、56.34%)。结论SELDI-TOF-MS技术是一种快速、简便易行且高通量的分析方法,可直接筛选出相对特异的肿瘤标志蛋白,与传统肿瘤标志物相比,更利于肺腺癌早期诊断和筛查。 展开更多
关键词 肿瘤标志物 肺腺癌 表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术 蛋白质组学
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表面增强激光解析/离子化飞行时间质谱技术在神经管缺陷胎儿母亲血清、尿液和羊水蛋白质标志物筛查中的研究 被引量:3
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作者 刘振江 袁正伟 赵群 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期738-746,共9页
目的探讨利用表面增强激光解析/离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术结合分类与回归树分析(classification and regression tree analysis,CART)在筛选神经管缺陷胎儿母亲血清和尿液蛋白质标志物的应用。方法孕母血清样本31例,尿液样... 目的探讨利用表面增强激光解析/离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术结合分类与回归树分析(classification and regression tree analysis,CART)在筛选神经管缺陷胎儿母亲血清和尿液蛋白质标志物的应用。方法孕母血清样本31例,尿液样本35例和羊水样本20例用于检测。采用PBSIIC型蛋白质芯片阅读机读取数据。SELDI数据结果采用分类与回归树分析(CART)建立血清和尿液诊断模型,用于区分神经管缺陷组与正常对照组。结果与正常组比较,神经管畸形组血清中有8种蛋白质高表达,4种蛋白质低表达;尿液中有4种蛋白质高表达,1种蛋白质低表达;羊水中有6种蛋白质高表达,1种蛋白质低表达。4种蛋白质峰用于建立决策分类树诊断模型,血清诊断灵敏度88.20%,特异度100%;尿液诊断灵敏度80.00%,特异度93.33%。结论血清和尿液蛋白质谱的高灵敏度和特异度提示表面增强激光解析/离子化飞行时间质谱结合分类与回归树分析能够筛选神经管缺陷胎儿和正常对照。 展开更多
关键词 神经管缺陷 表面增强激光解析/离子化飞行时间质谱 分类与回归树分析 蛋白质标志物
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表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术研究神经管缺陷胎儿母亲尿液中蛋白质谱改变规律 被引量:1
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作者 刘振江 袁正伟 赵群 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期220-224,共5页
目的探讨表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术在筛选神经管缺陷胎儿母亲尿液中蛋白质标志物的应用。方法经超声确诊为神经管缺陷胎儿的孕妇20例和正常孕妇15例。神经管缺陷包括脊柱裂10例,无脑儿5例,脑积水5例。所有... 目的探讨表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术在筛选神经管缺陷胎儿母亲尿液中蛋白质标志物的应用。方法经超声确诊为神经管缺陷胎儿的孕妇20例和正常孕妇15例。神经管缺陷包括脊柱裂10例,无脑儿5例,脑积水5例。所有孕妇均取清晨空腹尿5ml,离心后取上清,选用CM10芯片检测。采用PBSⅡC型蛋白质芯片阅读机读取数据。设定优化相对分子质量范围1000~30000Da。数据分析使用Ciphergen protein chip 3.1.1软件。结果共检测到39个尿液差异蛋白质峰,有统计学意义的差异蛋白质峰5个。病例组中有4种蛋白质高表达,相对分子质量分别为8320,8209,9099,10567;1种蛋白质低表达,相对分子质量3458。建立决策分类树,得到带有3个终结点的决策分类树,获得2个标志性蛋白质,分子量为9096,8244。进行留一法交叉验证后,神经管缺陷诊断模型的灵敏度为80.0%,特异度为93.3%。结论应用SELDI-TOF-MS技术可以在孕妇尿液中筛查出神经管缺陷的特异性蛋白质标志物,进一步可用于神经管缺陷产前早期无创诊断。 展开更多
关键词 神经管缺陷 表面增强激光解析离子化飞行时间质谱 产前诊断 蛋白质标志物
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表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术筛查早期肺腺癌的临床价值 被引量:1
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作者 郭立人 杨之怡 +1 位作者 黄明翔 许德新 《福建医药杂志》 CAS 2018年第4期10-13,共4页
目的探讨表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)筛查结节状磨玻璃影的早期肺腺癌的临床应用价值。方法所有患者进行CT检查显示:病灶直径≤2cm,结节状磨玻璃影,且实性成分大于30%。对CT检查上述异常的患者,术前采用SELDI... 目的探讨表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)筛查结节状磨玻璃影的早期肺腺癌的临床应用价值。方法所有患者进行CT检查显示:病灶直径≤2cm,结节状磨玻璃影,且实性成分大于30%。对CT检查上述异常的患者,术前采用SELDI-TOF-MS进行血清蛋白指纹图谱检测,显示某一肺癌相关的蛋白峰增高,即考虑为早期肺腺癌。分别将SELDI-TOF-MS、CT检查检查结果与术后病理诊断结果进行对比,计算诊断的正确率、灵敏度和特异度。结果 CT检测的诊断正确率为72.29%(60/83),灵敏度为72.97%(54/74),特异度为66.7%(6/9);SELDITOF-MS检测的诊断正确率为97.50%(78/80),灵敏度为97.3%(72/74),特异度为100%(6/6)。两者比较差异均具有统计学意义(P<0.01)。结论血清蛋白指纹图谱技术筛查结节状磨玻璃影的早期肺腺癌具有较高的灵敏度和特异度,可提高早期肺癌的正确率。 展开更多
关键词 表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术 结节状磨玻璃影 肺腺癌
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表面增强激光解析/离子化飞行时间质谱技术在神经管缺陷胎儿母亲血清标志物筛查中的应用
6
作者 刘振江 袁正伟 +1 位作者 赵群 宋丹丹 《中国妇幼保健》 CAS 北大核心 2010年第5期650-654,共5页
目的:探讨表面增强激光解析/离子化飞行时间质谱(SELDI—TOF—MS)技术在筛选神经管缺陷胎儿母亲血清蛋白质标志物中的应用。方法:经超声确诊为胎儿神经管缺陷的孕妇17例和正常孕妇14例,神经管缺陷包括脊柱裂7例、无脑儿4例、脑膨... 目的:探讨表面增强激光解析/离子化飞行时间质谱(SELDI—TOF—MS)技术在筛选神经管缺陷胎儿母亲血清蛋白质标志物中的应用。方法:经超声确诊为胎儿神经管缺陷的孕妇17例和正常孕妇14例,神经管缺陷包括脊柱裂7例、无脑儿4例、脑膨出6例。所有孕妇均于清晨空腹取外周静脉血5ml,离心后取血清,然后用CM10芯片按照蛋白质芯片标准操作流程进行检测。采用PBSIIC型蛋白质芯片阅读机读取数据,设定优化相对分子质量范围1000~30000Da。统计分析使用Ciphergen protein chip3.1.1软件。结果:所有神经管畸形胎儿母亲血清标本共检测到55个差异蛋白峰,其中12个与正常组比较存在统计学意义,包括8种蛋白质/多肽高表达,质荷比(m/z)分别为4105、4297、4188、6650、8583、3282、2750、3327;4种蛋白质/多肽低表达,m/z分别为5497,28078,9155,9434。建立决策分类树,得到了带有3个终结点的决策分类树,获得了2个标志性蛋白质,m/z分别为4105、7788。神经管缺陷诊断模型的灵敏度为88.2%,特异度为100%。结论:应用SELDI技术可以筛查出神经管缺陷的特异性蛋白质标志物,是神经管缺陷产前诊断的重要方法之一。 展开更多
关键词 神经管缺陷 表面增强激光解析/离子化飞行时间质谱 产前诊断 蛋白质标志物
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SELDI-TOF-MS技术检测肺腺癌血清生物标志物 被引量:9
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作者 廖萍 王文静 +5 位作者 朱佩云 刘茶珍 陆晔 刘国星 罗晓阳 项翠琴 《中国肿瘤》 CAS 2006年第4期258-261,共4页
[目的]用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术寻找肺腺癌病人血清蛋白标志物,探讨吸烟与肺腺癌血清中蛋白质组谱变化的关系。[方法]收集肺腺癌病人和正常对照人群血清各50例,按照年龄、性别、吸烟史进行一一配对,采用... [目的]用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术寻找肺腺癌病人血清蛋白标志物,探讨吸烟与肺腺癌血清中蛋白质组谱变化的关系。[方法]收集肺腺癌病人和正常对照人群血清各50例,按照年龄、性别、吸烟史进行一一配对,采用WCX2芯片技术对血清蛋白进行捕获,用蛋白芯片阅读器PBSⅡ对芯片进行扫描、分析。[结果]肺腺癌病人血清蛋白图谱与正常对照组相比,存在10个差异表达蛋白(P<10-5),其中包括6个高表达蛋白,分子量分别是4050Da、4205Da、5329Da、5899Da、7761Da、9285Da,4个低表达蛋白,分子量分别是2564Da、2932Da、3082Da、3442Da。肺腺癌病人有吸烟史的与不吸烟的进行比较,血清蛋白表达差异无显著性(P>0.01)。[结论]SELDI-TOF-MS技术能筛选出灵敏度和特异性较好的差异蛋白,为肺腺癌的早期发现提供了一种新的、无创实验方法。 展开更多
关键词 表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术 肺腺癌 蛋白质组学
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SELDI-TOF-MS联合蛋白质组学实验数据库对结直肠癌血清标志物的鉴定 被引量:4
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作者 蔡建 高春芳 +3 位作者 范乃军 盛新华 赵光 王秀丽 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2009年第27期2854-2858,共5页
目的:探讨表面增强激光解析离子化飞行时间质谱仪(SELDI-TOF-MS)联合蛋白质组学实验数据库方法研究结直肠癌患者血清标志物的可行性.方法:应用SELDI-TOF-MS对169例结直肠癌患者与83例正常人血清进行了蛋白质谱检测,通过Biomarker Wizar... 目的:探讨表面增强激光解析离子化飞行时间质谱仪(SELDI-TOF-MS)联合蛋白质组学实验数据库方法研究结直肠癌患者血清标志物的可行性.方法:应用SELDI-TOF-MS对169例结直肠癌患者与83例正常人血清进行了蛋白质谱检测,通过Biomarker WizardTM与Biomarker PatternsTM软件分析发现差异蛋白,建立结直肠癌诊断模型;用蛋白质组学实验数据库检索鉴定出有意义的差异蛋白,并用ELISA法对结直肠癌患者及正常人血清样本中差异蛋白表达进行验证.结果:发现34种差异蛋白,以质荷比(m/z)为2873,3163,6121,7778的4种差异蛋白组成的分类树诊断模型,在学习模式下其诊断结直肠癌的灵敏度为91.57%,特异度为90.53%;在测试模式下分别为82.25%,80.72%.其中m/z为7778的蛋白峰强度在结直肠癌患者血清中明显高于正常人(P<0.01),数据库检索结果提示该蛋白为血小板因子4(PF4).ELISA法测定结直肠癌患者血清PF4水平显著高于正常人(P<0.01),其灵敏度及特异度分别为61.1%,76.9%.结论:SELDI-TOF-MS联合蛋白质组学实验数据库的方法简便可行,可为蛋白芯片研究提供新思路;PF4(m/z=7778)在结直肠癌患者血清中明显升高,是结直肠癌患者新的血清学标志物. 展开更多
关键词 结直肠癌 血小板因子4 生物标志物 表面增强激光解析离子化飞行时间质谱 蛋白质组学实验数据库
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蛋白芯片联合SELDI-TOF-MS在卵巢癌诊断中的应用 被引量:2
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作者 顾蓓 李艳 李红霞 《山东医药》 CAS 北大核心 2009年第18期23-25,共3页
目的用蛋白芯片联合表面增强激光解析离子化/飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)分析卵巢癌与对照血清中的差异表达蛋白来筛选与卵巢癌早期诊断和预后相关的肿瘤标志物。方法采用联合SELDI-TOF-MS及WXC2蛋白质芯片,对21例卵巢癌患者(实验组... 目的用蛋白芯片联合表面增强激光解析离子化/飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)分析卵巢癌与对照血清中的差异表达蛋白来筛选与卵巢癌早期诊断和预后相关的肿瘤标志物。方法采用联合SELDI-TOF-MS及WXC2蛋白质芯片,对21例卵巢癌患者(实验组)及24例健康妇女(对照组)血清标本进行检测。结果在相对分子质量0~50 000 Da范围内,检测出69个差异蛋白峰。卵巢癌差异表达明显(P〈0.01)的蛋白峰8个,其中高表达的波峰3个,质荷比分别为5 927.6,8 719.3和11 729.8 Da,低表达的波峰5个,质荷比分别为4 073.8,4 158.4,4 186.7,4 290.2和8 162.5 Da。其中11 729.8 Da蛋白峰已经鉴定为血清淀粉样蛋白A1(SAA1)。结论SELDI-TOF-MS联合蛋白质芯片能够直接检测出卵巢癌患者血清中相对特异的蛋白峰,对于卵巢癌的诊断具有一定的临床意义。 展开更多
关键词 卵巢癌 肿瘤 标志物 表面增强激光解析离子化/飞行时间质谱 蛋白芯片 淀粉样蛋白
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SELDI-TOF-MS技术在预测肿瘤化疗敏感性中的应用 被引量:1
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作者 傅文凡 赵健 《医学综述》 2010年第3期369-371,共3页
表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术是新一代蛋白质组研究技术,它使用特殊的增强表面直接捕获待测样本中的蛋白质分子,能够快速、敏感地发现并鉴定蛋白,提供一个高通量和高灵敏度的检测平台。最初主要应用于疾病早期诊断相关的蛋... 表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术是新一代蛋白质组研究技术,它使用特殊的增强表面直接捕获待测样本中的蛋白质分子,能够快速、敏感地发现并鉴定蛋白,提供一个高通量和高灵敏度的检测平台。最初主要应用于疾病早期诊断相关的蛋白质标志物。目前在预测肿瘤化疗敏感性方面的应用也逐渐增多。本文除对表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术做详尽的介绍外,重点阐述其在预测肿瘤化疗敏感性方面的应用,并对其优缺点和发展前景进行评估。 展开更多
关键词 表面增强激光解析离子化飞行时间质谱 化疗敏感性 肿瘤
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应用SELDI-TOF-MS技术筛选不同分型卵巢上皮性癌血清标志物
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作者 王琪 尹茳平 +2 位作者 黎丹戎 张玮 李力 《广西医科大学学报》 CAS 2010年第3期378-382,共5页
目的:应用表面增强激光解析离子化—飞行时间—质谱(SELDI-TOF-MS)技术筛选不同分型的卵巢上皮性癌患者血清标志物。方法:选择卵巢上皮性癌68例,健康妇女87例,卵巢良性肿瘤组20例血清,以及体外培养的卵巢恶性肿瘤细胞系SKOV3、A2780、HO... 目的:应用表面增强激光解析离子化—飞行时间—质谱(SELDI-TOF-MS)技术筛选不同分型的卵巢上皮性癌患者血清标志物。方法:选择卵巢上皮性癌68例,健康妇女87例,卵巢良性肿瘤组20例血清,以及体外培养的卵巢恶性肿瘤细胞系SKOV3、A2780、HO8910、HO8910PM为材料,采用WCX2蛋白质芯片分析血清和体外培养的恶性肿瘤细胞系蛋白质表达差异蛋白,选择卵巢上皮性癌血清与细胞均存在表达的差异蛋白建立卵巢上皮性癌诊断模型进行验证。结果:WCX2芯片捕获的M/Z为5343和5640蛋白质,在卵巢浆液性上皮癌和浆液性上皮癌细胞系HO8910、HO8910PM中均上调表达。以上述2个蛋白质建立诊断模型判别浆液性卵巢癌的敏感性为97.8%,特异性为82.7%,优于CA125的检测结果。结论:M/Z为5343和5640蛋白质在卵巢浆液性上皮癌发生和发展的过程中的变化可以反映到血清中,而且可以验证血清标志蛋白的组织特异性,为其作为卵巢癌的肿瘤标志物提供强有力的支持。 展开更多
关键词 卵巢上皮性癌 表面增强激光解析离子化-飞行时间-质谱 血清标志物 卵巢癌细胞系
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应用SELDI-TOF-MS技术初步建立子宫内膜异位症诊断模型 被引量:2
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作者 胡芬 张炜 +1 位作者 康晓楠 刘银坤 《生殖与避孕》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期168-173,共6页
目的:分析子宫内膜异位症(EMs)患者血清差异蛋白谱,初步建立EMs的诊断模型。方法:采用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术,用弱阳离子交换芯片(WCX2)和分析软件对79例EMs(EMs组)及72例非EMs妇女(对照组)血清样品进... 目的:分析子宫内膜异位症(EMs)患者血清差异蛋白谱,初步建立EMs的诊断模型。方法:采用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术,用弱阳离子交换芯片(WCX2)和分析软件对79例EMs(EMs组)及72例非EMs妇女(对照组)血清样品进行检测,在不同的月经周期中分别筛选差异蛋白,建立诊断模型并进行盲法验证。结果:在质荷比(m/z)2000-30000的范围内,得到16个有统计学差异(P<0.01)的差异蛋白,进一步按月经周期分期分析,增生期和分泌期分别得到3个和6个有统计学差异的蛋白峰。增生期所建的诊断模型敏感性和特异性分别为94.3%和97.1%。盲筛结果敏感性为90.7%,特异性为93.0%,阳性预测值为92.9%,阴性预测值为90.9%。结论:利用增生期血清样品建立的诊断模型敏感性和特异性高,对EMs临床诊断和发病机理的理解具有重要意义。 展开更多
关键词 子宫内膜异位症(EMs) 表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(seldi—tof-ms) 质谱 蛋白芯片 蛋白质组
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蛋白飞行质谱在恶性胸腔积液诊断的初步研究 被引量:2
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作者 石琴 陈群 +5 位作者 谢强 黄明翔 李育宏 林江平 王成辉 陈巧林 《中国癌症防治杂志》 CAS 2010年第2期92-94,共3页
目的用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术探寻恶性胸水蛋白标志物,建立快速、简便的恶性胸腔积液诊断方法系。方法收集恶性和非恶性胸水各50例,按照年龄、性别进行一一配对,采用WCX2磁珠技术对血清蛋白进行捕获,用... 目的用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术探寻恶性胸水蛋白标志物,建立快速、简便的恶性胸腔积液诊断方法系。方法收集恶性和非恶性胸水各50例,按照年龄、性别进行一一配对,采用WCX2磁珠技术对血清蛋白进行捕获,用蛋白质谱阅读器PBSⅡ对芯片进行扫描、分析。结果恶性和非恶性的胸水蛋白图谱相比,存在5个差异表达蛋白(P<0.05),其中包括3个高表达蛋白,分子量分别是5335、7577、11670Da。结论 SELDI-TOF-MS技术能筛选出灵敏度和特异性较好的差异蛋白,为恶性胸腔积液的早期诊断提供了一种新的实验方法 。 展开更多
关键词 表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术 胸腔积液 蛋白质组学
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飞行质谱技术筛选烧伤瘢痕血清特异性标志物
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作者 左新成 赵光 +1 位作者 李冬晖 张云国 《实用医药杂志》 2007年第12期1484-1486,1489,共4页
目的通过对血清中蛋白质组的质谱分析来阐述烧伤瘢痕血清蛋白质组的改变。方法随机选取浅度烧伤患者10例(Ⅰ度烧伤5例,浅Ⅱ度烧伤5例)、深度烧伤患者10例(深Ⅱ度烧伤5例和Ⅲ度烧伤5例),并选35名正常人。将上述三组血清各分为预备组和检... 目的通过对血清中蛋白质组的质谱分析来阐述烧伤瘢痕血清蛋白质组的改变。方法随机选取浅度烧伤患者10例(Ⅰ度烧伤5例,浅Ⅱ度烧伤5例)、深度烧伤患者10例(深Ⅱ度烧伤5例和Ⅲ度烧伤5例),并选35名正常人。将上述三组血清各分为预备组和检测组。预备组血清与金属亲和表面芯片结合后,用蛋白芯片仪读取数据,用CipherGen公司提供的BioMarker Wizard及BioMarker Pattern软件分析可得到用于区分浅度烧伤患者、深度烧伤患者及正常人血清的树状分类规则,并用双盲法测试检测组以证实其准确性。结果软件分析结果显示预备组中三类血清蛋白质质荷比为5375、5717、4529、1225、1067、3883、66346Da7处含量有显著性差异(P<0.05),得到树状分类规则,其分类准确率为100%(55/55),灵敏度为100%(20/20),特异性为100%(35/35);对检测组进行双盲检测,结果显示准确度为100%(55/55),灵敏度和特异性均为100%(10/10,35/35)。结论表面增强激光解析离子化时间飞行质谱技术对正常人、浅度烧伤患者及深度烧伤患者进行的比较蛋白质组学研究,发现在烧伤病理发展中有一组蛋白质有显著性差异。 展开更多
关键词 表面增强激光解析离子化时间飞行质谱技术 烧伤 血清 生物标记物 蛋白质组学
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SELDI技术对开放性脊柱裂胎鼠羊水蛋白质组学的初步分析 被引量:1
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作者 刘振江 袁正伟 赵群 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期26-30,33,共6页
目的利用表面增强激光解析/离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术对脊柱裂胎鼠模型的羊水进行初步的蛋白质组学分析。方法将25只雌性Wistar大鼠随机分为脊柱裂组(n=15)和对照组(n=10)。于妊娠第10日(E10)8时,脊柱裂组孕鼠经胃管注入全... 目的利用表面增强激光解析/离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术对脊柱裂胎鼠模型的羊水进行初步的蛋白质组学分析。方法将25只雌性Wistar大鼠随机分为脊柱裂组(n=15)和对照组(n=10)。于妊娠第10日(E10)8时,脊柱裂组孕鼠经胃管注入全反式维甲酸与矿物油的混合物(140 mg/kg);对照组孕鼠给予等量的橄榄油。于妊娠第17日(E17)取胎鼠,立体显微镜下抽取羊水(0.2 mL/只)并确定开放性脊柱裂胎鼠。选取60只脊柱裂胎鼠和55只对照组胎鼠的羊水离心取上清。采用PBSⅡC型蛋白质芯片阅读机读取数据。采用Ciphergen protein chip 3.1.1软件对数据进行统计分析。SELDI数据结果采用分类与回归树分析建立诊断模型,用于区分脊柱裂组胎鼠与对照组胎鼠。结果脊柱裂胎鼠羊水中共检测到55个差异蛋白峰,有统计学意义的差异蛋白峰有9个。包括5种蛋白峰高表达,优化相对分子质量(m/z)分别为11 658,27 387,7 898,11 603,13 831 Da;4种蛋白峰低表达,m/z分别为5 124,14 702,5 403,13 626 Da。选取m/z 13 831 Da和m/z 17 798 Da用于建立决策分类树诊断模型,诊断灵敏度93.33%,特异度96.36%,阳性预测值96.55%,阴性预测值96.36%。结论 SELDI技术可初步筛选出脊柱裂胎鼠羊水中的差异蛋白峰,这些蛋白可能是脊柱裂胎鼠羊水中的特异性羊水标志物。 展开更多
关键词 神经管缺陷 脊柱裂 表面增强激光解析 离子化飞行时间质谱 羊水 蛋白标志物
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SELDI蛋白质芯片技术在结直肠癌临床诊断中的应用研究 被引量:4
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作者 张巍 邓明明 王开正 《泸州医学院学报》 2010年第1期5-10,共6页
目的:利用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术及蛋白质芯片检测结直肠癌病人血清蛋白质指纹图谱,初步探讨其用于结直肠癌诊断的临床价值。方法:利用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术及弱阳离... 目的:利用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术及蛋白质芯片检测结直肠癌病人血清蛋白质指纹图谱,初步探讨其用于结直肠癌诊断的临床价值。方法:利用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术及弱阳离子交换表面CM10蛋白芯片监测70例结直肠癌患者和48例良性病变对照及25例正常对照的血清蛋白质谱。分为训练集(40例患者40例对照)和验证集(30例患者和33例对照),前者用于筛选结直肠癌的差异蛋白标志物并建立人工神经网络(ANN)诊断模型,后者用于诊断效度的盲法验证。结果:结直肠癌患者和对照组血清蛋白指纹图谱共有148个明显表达差异的蛋白峰,筛选质荷比(m/z)为2957、2974、2982、3016、3282、5928、5948、6647、6661的9个蛋白质峰作为标志蛋白(P<0.01)建立人工神经网络诊断模型,利用该模型对结直肠癌进行盲法预测,结果表明该诊断模型检测结直肠癌的灵敏度为94.2%,特异度为91.3%。结论:应用蛋白芯片技术检测到对结直肠癌有鉴别意义的血清蛋白标志物,可能为结直肠癌的早期诊断提供了新的手段。 展开更多
关键词 结直肠癌 蛋白组学 表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(seldi—TOF—MS)技术 人工神经网络
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食管癌血清蛋白质谱揩纹图分析及人工神经网络诊断模型研究
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作者 任兴军 谭小林 +5 位作者 杨成虎 王开正 冯峰 胡球英 丁银环 戴天阳 《现代检验医学杂志》 CAS 2010年第3期22-26,共5页
目的利用高通量和高灵敏的表面激光解析电离飞行时间质涪技术(SELDI—TOF—MS)寻找食管癌患者血清中微量的标志性差异蛋白质组,为探索食管癌发生与基因转录的蛋白调控机制,基因治疗以及早期诊断提供参考数据,方法用SELDI—TOF—MS... 目的利用高通量和高灵敏的表面激光解析电离飞行时间质涪技术(SELDI—TOF—MS)寻找食管癌患者血清中微量的标志性差异蛋白质组,为探索食管癌发生与基因转录的蛋白调控机制,基因治疗以及早期诊断提供参考数据,方法用SELDI—TOF—MS检测食管癌及其相关人群的血清蛋白质谱指纹图,用Biomarkex Wizaid Software软件筛选出差异蛋白,选择具有标志性的差异蛋白质组建立人工神经网络诊断模型,使用SPSS分析其诊断效能。结果在食管癌患者血清中发现89个差异蛋白(P〈0.05)。其中有显著差异(P〈0.001)的蛋白质如下:在食管癌患者血清中表达增高的蛋白(5017.6Da,7458、5Da,7908,1Da,8111.9Da,8577,8Da)和表达降低的蛋白(4215.8Da,5890.9Da,7749.3Da)。利用筛选出8个有明显表达差并的蛋白质组建立食管癌人工神经网络筛查模型和诊断模型,其灵敏度达到93.2%和96.3%,特异度分别为95.6%和97.2%,经大样本盲法验证的灵敏度为75.4%和75.8%,特异度分别为84.8%和86.7%,经蛋白组数据库检索发现两种蛋白分别为血清淀粉样蛋白A和子宫球蛋白。结论血清蛋白质谱指纹图结合人工神经网络技术进行蛋白组学数据挖掘对食管癌的筛查和诊断以及探索其基因和蛋白调控机制具有重要的临床意义。 展开更多
关键词 食管癌 表面激光解析电离飞行时间质谱技术(seldi—tof-ms) 血清蛋白质组 人工神经网络 诊断
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大鼠胰腺上皮内瘤变和胰腺癌模型血清蛋白质谱的差异表达
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作者 王磊 刘海林 +2 位作者 廖萍 王文静 袁平 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2008年第19期2166-2170,共5页
目的:利用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF MS)技术,分析由7,12-二甲基苯并蒽(DMBA)诱导建立的大鼠胰腺上皮内瘤变(PanIN)和胰腺癌(PC)模型血清蛋白质谱的差异表达.方法:40只♂清洁级SD大鼠为模型组,DMBA胰腺局部种植建立... 目的:利用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF MS)技术,分析由7,12-二甲基苯并蒽(DMBA)诱导建立的大鼠胰腺上皮内瘤变(PanIN)和胰腺癌(PC)模型血清蛋白质谱的差异表达.方法:40只♂清洁级SD大鼠为模型组,DMBA胰腺局部种植建立PanIN和PC模型,根据PanIN标准进行病理学分级.26只♂清洁级SD大鼠为正常对照组.采用SELDI-TOF MS和铜离子鳌合芯片(IMAC-Cu2+芯片)检测大鼠血清蛋白质谱,Biomarker Wizard3.0软件分析比较对照组、PanIN组和PC组之间的差异表达蛋白.结果:DMBA胰腺局部种植后共获得PC11例,PanIN18例.与对照组比较,PanIN组和PC组表达强度显著上调(P<0.001)的蛋白质峰有19个,显著下调(P<0.001)的蛋白质峰有11个;其中质荷比分别为5835.2、4087.3、4786.5、4800.5、3932.2、5765.9、5924.8、5001.9、3913.7的9个蛋白质峰表达强度在对照组、PanIN组和PC组呈逐级递增趋势,质荷比分别为1096.9、1478.9、8572.9、1007.1的4个蛋白质峰表达强度呈逐级递减趋势.结论:与正常大鼠比较,PanIN和PC模型大鼠血清蛋白质谱表达发生显著变化,这些差异表达蛋白质在胰腺癌中的作用值得进一步深入研究. 展开更多
关键词 胰腺上皮内瘤变 胰腺癌 7 12-二甲基苯 并蒽 表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术
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SELDI-TOF MS技术及其在传染性疾病研究中的应用 被引量:1
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作者 刘小丽 李兰娟 《国外医学(流行病学.传染病学分册)》 2005年第3期149-152,共4页
SELDI-TOFMS(surface-enhancedlaserdesorptionionizationtime-of-flightmassspectrometry,表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱)技术,是随着蛋白质组学的兴起而出现的新技术,是一种基于蛋白质芯片和质谱技术的蛋白质指纹图谱分析平台... SELDI-TOFMS(surface-enhancedlaserdesorptionionizationtime-of-flightmassspectrometry,表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱)技术,是随着蛋白质组学的兴起而出现的新技术,是一种基于蛋白质芯片和质谱技术的蛋白质指纹图谱分析平台。本文就SELDI-TOFMS技术的原理、特点及其在传染性疾病研究中的应用进行综述。 展开更多
关键词 疾病研究 传染性 seldi MS TOF 激光解吸离子化 飞行时间质谱 指纹图谱分析 laser 蛋白质组学 蛋白质芯片 mass 表面增强 质谱技术
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SELDI蛋白质芯片技术在肿瘤诊断中的临床应用
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作者 吕赛平 邹学森 《江西医学检验》 2007年第1期41-44,共4页
SELDI蛋白质芯片技术。又称为表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(surface-enhanced laser desorption/ionization-time of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)。自2002年日本科学家田中耕一因发明该技术而荣获诺贝尔化学奖... SELDI蛋白质芯片技术。又称为表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(surface-enhanced laser desorption/ionization-time of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)。自2002年日本科学家田中耕一因发明该技术而荣获诺贝尔化学奖后.该技术发展十分迅速,目前已经广泛应用于生物技术、药学、基因学、临床诊断、生物信息等诸多领域。 展开更多
关键词 蛋白质芯片技术 seldi 临床应用 肿瘤诊断 激光解吸离子化 飞行时间质谱 诺贝尔化学奖 表面增强
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