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小沙丁鱼属鱼类Cytb序列的比较分析
被引量:
1
1
作者
杨天燕
高天翔
+1 位作者
郭焱
孟玮
《水产科学》
CAS
北大核心
2009年第11期639-643,共5页
对小沙丁鱼属中的青鳞小沙丁鱼、裘氏小沙丁鱼、金色小沙丁鱼、天立体小沙丁鱼线粒体细胞色素b基因部分序列(402bp)进行测定,并比较分析了种间的序列差异。10尾样品中共检测到9种单倍型。同源基因序列分析显示T、C、A、G碱基的平均...
对小沙丁鱼属中的青鳞小沙丁鱼、裘氏小沙丁鱼、金色小沙丁鱼、天立体小沙丁鱼线粒体细胞色素b基因部分序列(402bp)进行测定,并比较分析了种间的序列差异。10尾样品中共检测到9种单倍型。同源基因序列分析显示T、C、A、G碱基的平均含量分别为:28.9%、28.2%、23.9%、19.0%,其中A+T含量高于G+C含量,与其他鱼类同源序列碱基特点相似。利用Kimura-2模型分析得到种间遗传距离为0.1616-0.2653,基于Cytb基因片段序列,构建的NJ树显示青鳞小沙丁鱼与裘氏小沙丁鱼亲缘关系较近,短体小沙丁鱼与金色小沙丁鱼亲缘关系较近。依据分子进化速率推测4种小沙丁鱼发生分歧的时间约为800万年到1300万年前的中新世中、晚期,略早于其他鱼类。
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关键词
青鳞
小沙丁鱼
裘氏小沙丁鱼
金色
小沙丁鱼
短体
小沙丁鱼
细胞色素B基因
序列差异
下载PDF
职称材料
题名
小沙丁鱼属鱼类Cytb序列的比较分析
被引量:
1
1
作者
杨天燕
高天翔
郭焱
孟玮
机构
中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室
新疆水产科学研究所
出处
《水产科学》
CAS
北大核心
2009年第11期639-643,共5页
基金
国家高技术研究发展计划项目(2006AA09Z418)
国家重点基础研究发展计划项目(2005CB422306)
文摘
对小沙丁鱼属中的青鳞小沙丁鱼、裘氏小沙丁鱼、金色小沙丁鱼、天立体小沙丁鱼线粒体细胞色素b基因部分序列(402bp)进行测定,并比较分析了种间的序列差异。10尾样品中共检测到9种单倍型。同源基因序列分析显示T、C、A、G碱基的平均含量分别为:28.9%、28.2%、23.9%、19.0%,其中A+T含量高于G+C含量,与其他鱼类同源序列碱基特点相似。利用Kimura-2模型分析得到种间遗传距离为0.1616-0.2653,基于Cytb基因片段序列,构建的NJ树显示青鳞小沙丁鱼与裘氏小沙丁鱼亲缘关系较近,短体小沙丁鱼与金色小沙丁鱼亲缘关系较近。依据分子进化速率推测4种小沙丁鱼发生分歧的时间约为800万年到1300万年前的中新世中、晚期,略早于其他鱼类。
关键词
青鳞
小沙丁鱼
裘氏小沙丁鱼
金色
小沙丁鱼
短体
小沙丁鱼
细胞色素B基因
序列差异
Keywords
Sardinella zunasi
S. jussieu
S. aurita
S. maderensis
eytochrome b gene
sequence difference
分类号
Q349.2 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
小沙丁鱼属鱼类Cytb序列的比较分析
杨天燕
高天翔
郭焱
孟玮
《水产科学》
CAS
北大核心
2009
1
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