西尼罗病毒Chin-01株基因组编码区序列测定及论著分析

目的 :对保存的西尼罗病毒Chin_0 1株基因组编码区序列进行测定 ,了解其与已报道毒株的序列差异及系统进化关系。方法 :对Chin_0 1株病毒基因组编码区分区段进行RT_PCR扩增 ,分别将扩增产物直接进行测序 ,采用DNAstar软件将测序片段拼接获得全长编码区序列。结果与结论 :Chin_0 1株基因组编码区全长 10 30 2nt ,为单一读码框架 ,编码 3434个氨基酸。其中结构蛋白基因为 2 373nt,依次编码 4种结构蛋白 (C ,PrM ,M和E) ;非结构蛋白基因全长 792 6nt,依次编码 7种非结构蛋白 (NS1,NS2a ,NS2b ,NS3,NS4a ,NS4b和NS5 )。序列同源性分析表明 ,Chin_0 1株与埃及Eg10 1株高度同源 ,两者氨基酸序列仅有 0 .3%的差异。该株西尼罗病毒基因组编码区序列已输入GenBank数据库。