西氏熊蜂线粒体基因组结构特征及系统发育分析

本研究利用二代测序技术对西氏熊蜂(Bombus sichelii)的线粒体基因组进行了测序、组装和注释,并对其线粒体基因组的组成、结构特征、基因重排及系统发育等方面进行了生物信息学分析。结果表明:西氏熊蜂线粒体基因组长度为15711 bp,包含13个蛋白编码基因、22个tRNA基因和2个rRNA基因;线粒体基因组全序列、蛋白编码基因的串联序列、tRNA串联序列、rRNA串联序列的A+T含量均大于80%,表现出明显的碱基偏倚;13个蛋白编码基因的起始密码子均为ATN,终止密码子为TAA,TAG或T--。tRNA二级结构预测发现,trnS 1与其他昆虫具有相同的特征,即缺少DHU臂和DHU环,其余21个tRNA均能形成典型的三叶草结构;系统发育进化分析结果高度支持西氏熊蜂与火红熊蜂(B.pyrosoma)隶属于黑熊蜂亚属(Melanobombus)。本研究首次获得西氏熊蜂线粒体基因组序列,初步鉴定了其线粒体基因组的特征,为进一步对熊蜂线粒体基因组学和系统发育关系的研究奠定了基础。