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西藏亚东县西藏血蜱携带微生物群落情况及主要病原体进化分析
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作者 孙世伟 多吉欧珠 +4 位作者 李瑞山 张文凯 贺真 陆振华 邵中军 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期1490-1495,共6页
目的了解西藏自治区亚东县西藏血蜱携带微生物群落的情况及主要病原体无形体的分型。方法2022年5月在亚东县采集寄生于牦牛身上的蜱虫样本141只。根据硬蜱线粒体16S rDNA基因扩增序列进行分子鉴定以确定蜱种。采用Illumina Novaseq 600... 目的了解西藏自治区亚东县西藏血蜱携带微生物群落的情况及主要病原体无形体的分型。方法2022年5月在亚东县采集寄生于牦牛身上的蜱虫样本141只。根据硬蜱线粒体16S rDNA基因扩增序列进行分子鉴定以确定蜱种。采用Illumina Novaseq 6000平台对西藏血蜱进行高通量测序,将测序得到的原始数据处理后对其进行组装、基因预测、丰度分析和分类学预测。利用巢式PCR扩增无形体的16S rDNA基因片段并测序及进行序列的遗传进化分析。结果121只成蜱样本鉴定为西藏血蜱。非冗余数据集经NCBI-NR数据库比对进行物种注释后,最常见的微生物种类是真核生物(19.78%)和细菌(13.54%)。在细菌中,优势门分别是变形杆菌门、拟杆菌门和厚壁菌门;优势属分别是无形体属、锥虫属、冷杆菌属和立克次体属;优势种分别是嗜吞噬细胞无形体、泰勒虫和斑点热群立克次体。无形体的系统发育树与绵羊无形体遗传距离最近,具有较高的同源性。结论西藏自治区亚东县地区优势蜱种为西藏血蜱。无形体的主要分型为绵羊无形体。当地人畜暴露在多种蜱传病原体中,存在潜在蜱传疾病的威胁,应针对性加强对蜱的监测和预防控制工作。 展开更多
关键词 西藏血蜱 宏基因 高通量测序 无形体
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