本研究旨在克隆新吉细毛羊和小尾寒羊的角蛋白关联蛋白2(keratin-associated protein 2,KAP2)基因并对其进行生物信息学分析,并初步探讨KAP2基因与羊毛毛用性状分子的关系。分别提取新吉细毛羊和小尾寒羊皮肤组织中总RNA,用RT-PCR方法扩...本研究旨在克隆新吉细毛羊和小尾寒羊的角蛋白关联蛋白2(keratin-associated protein 2,KAP2)基因并对其进行生物信息学分析,并初步探讨KAP2基因与羊毛毛用性状分子的关系。分别提取新吉细毛羊和小尾寒羊皮肤组织中总RNA,用RT-PCR方法扩增KAP2基因,将PCR产物克隆于pMD19-T载体,转入大肠杆菌DH5α感受态细胞,筛选阳性克隆。提取扩增后的重组质粒pMD19-T-KAP2并进行PCR扩增、双酶切鉴定、序列测定及蛋白质结构预测。结果表明,试验成功克隆了大小为463bp的KAP2基因,开放阅读框架(ORF)长414bp,编码137个氨基酸。测序结果比对发现,与小尾寒羊KAP2基因相比,新吉细毛羊的KAP2基因中存在1个由G→A的碱基突变,编码氨基酸由精氨酸(Arg)变为谷氨酰胺(Gln),属于错义突变。新吉细毛羊和小尾寒羊的KAP2蛋白的分子质量分别为14.81和14.84ku,等电点分别是9.67与9.82,两种绵羊KAP蛋白的基本理化性质无明显差异,同属于碱性疏水性、跨膜蛋白;预测到蛋白二级结构均由α螺旋、延伸链、无规则卷曲等构成,新吉细毛羊和小尾寒羊KAP2蛋白三级结构中存在一个由α螺旋引起的空间结构的差异位点。综合以上结果推测KAP2基因可能是影响羊毛性状的差异基因,本试验结果可为探讨两种绵羊毛用性状表型差异的分子遗传奠定理论基础。展开更多
目的：研究中国汉族人群基质金属蛋白酶2与高度近视关联的位点．揭示与高度近视相关的发病环节。方法：本研究采取病例一对照关联分析，随机选取200名高度近视（要求近视度数≤-6．00D），及200名无相关的对照正视眼样本（要求双眼屈光...目的：研究中国汉族人群基质金属蛋白酶2与高度近视关联的位点．揭示与高度近视相关的发病环节。方法：本研究采取病例一对照关联分析，随机选取200名高度近视（要求近视度数≤-6．00D），及200名无相关的对照正视眼样本（要求双眼屈光不正在＋/-0．50D之间），提取全血DNA样本。选取基质金属蛋白酶2（MMP2）SNP rs9928731进行基因型的检测。根据样本所得SNP基因型，计算其基因型与等位基因的频率；采用卡方检验比较病例-对照组之间基因型与等位基因频率分布的差异。结果：高度近视组rs9928731基因型（TT，TC，CC）的频率分别为46％，21．5％，32．5％，而对照组正视眼等位基因（TT，TC，CC）的频率则为48％，21．5％，30．5％。等位基因分布在两组间差异无显著性。疾病比值比（OR）和95％可信区间提示，低频等位基因（C）可能会减少高度近视的发病风险（OR=0．921，C／=0．696～1．220）。结论：MMP2 SNP rs9928731与高度近视无明显关联。展开更多
文摘本研究旨在克隆新吉细毛羊和小尾寒羊的角蛋白关联蛋白2(keratin-associated protein 2,KAP2)基因并对其进行生物信息学分析,并初步探讨KAP2基因与羊毛毛用性状分子的关系。分别提取新吉细毛羊和小尾寒羊皮肤组织中总RNA,用RT-PCR方法扩增KAP2基因,将PCR产物克隆于pMD19-T载体,转入大肠杆菌DH5α感受态细胞,筛选阳性克隆。提取扩增后的重组质粒pMD19-T-KAP2并进行PCR扩增、双酶切鉴定、序列测定及蛋白质结构预测。结果表明,试验成功克隆了大小为463bp的KAP2基因,开放阅读框架(ORF)长414bp,编码137个氨基酸。测序结果比对发现,与小尾寒羊KAP2基因相比,新吉细毛羊的KAP2基因中存在1个由G→A的碱基突变,编码氨基酸由精氨酸(Arg)变为谷氨酰胺(Gln),属于错义突变。新吉细毛羊和小尾寒羊的KAP2蛋白的分子质量分别为14.81和14.84ku,等电点分别是9.67与9.82,两种绵羊KAP蛋白的基本理化性质无明显差异,同属于碱性疏水性、跨膜蛋白;预测到蛋白二级结构均由α螺旋、延伸链、无规则卷曲等构成,新吉细毛羊和小尾寒羊KAP2蛋白三级结构中存在一个由α螺旋引起的空间结构的差异位点。综合以上结果推测KAP2基因可能是影响羊毛性状的差异基因,本试验结果可为探讨两种绵羊毛用性状表型差异的分子遗传奠定理论基础。
文摘目的：研究中国汉族人群基质金属蛋白酶2与高度近视关联的位点．揭示与高度近视相关的发病环节。方法：本研究采取病例一对照关联分析，随机选取200名高度近视（要求近视度数≤-6．00D），及200名无相关的对照正视眼样本（要求双眼屈光不正在＋/-0．50D之间），提取全血DNA样本。选取基质金属蛋白酶2（MMP2）SNP rs9928731进行基因型的检测。根据样本所得SNP基因型，计算其基因型与等位基因的频率；采用卡方检验比较病例-对照组之间基因型与等位基因频率分布的差异。结果：高度近视组rs9928731基因型（TT，TC，CC）的频率分别为46％，21．5％，32．5％，而对照组正视眼等位基因（TT，TC，CC）的频率则为48％，21．5％，30．5％。等位基因分布在两组间差异无显著性。疾病比值比（OR）和95％可信区间提示，低频等位基因（C）可能会减少高度近视的发病风险（OR=0．921，C／=0．696～1．220）。结论：MMP2 SNP rs9928731与高度近视无明显关联。
