苏荠黄酮抗新型冠状病毒肺炎并发症-脓毒症潜在靶点的筛选与鉴定

目的研究苏荠黄酮的分子特性,筛选并鉴定苏荠黄酮抗新型冠状病毒肺炎并发症-脓毒症的潜在靶点。方法通过TCMSP数据库分析苏荠黄酮的药理参数和分子特性;通过Swiss Targetprediction和DRAR-CPI软件筛选苏荠黄酮抗脓毒症的潜在靶点;通过OMIM、CTD和TTD数据库中已报道的与抗脓毒症相关疾病靶标进行筛选苏荠黄酮抗脓毒症的靶点,进一步通过分子对接软件鉴定苏荠黄酮抗脓毒症的潜在靶点。结果苏荠黄酮口服生物利用率为44.09%,药物相似度为0.25,具有很好的成药性;通过Swiss Targetprediction和DRAR-CPI软件共筛选到108个潜在靶点,与脓毒症直接相关的靶点有9个,经分子对接软件鉴定F9、ADORA1、ADORA2A、NOS2、NOS3、CTSG、PROC、SERPINE1和PTGS2为苏荠黄酮抗脓毒症的潜在靶点。结论苏荠黄酮能通过与筛选的9个靶标进行结合,通过调控ADORA1、ADORA2A、PTGS2、CTSG、NOS2和NOS3减少炎症,调控PROC、SERPINE1和F9抑制凝血并较少脓毒症的炎症反应及降低脓毒症凝血疾病,最终预防和治疗脓毒症。该研究为新型冠状病毒肺炎患者脓毒症并发症的预治研究奠定基础,具有良好的研究前景。

木犀草素抗骨性关节炎潜在靶点的筛选与鉴定

[目的]研究木犀草素的分子特性,筛选并鉴定木犀草素抗骨性关节炎(osteoarthritis,OA)的潜在靶点。[方法]通过中药系统药理学数据库及分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)分析木犀草素的药理参数和分子特性;通过Swiss TargetPrediction和药物再定位及药物不良反应预测(predict drug repositioning and adverse drug reaction,DRAR-CPI)软件筛选木犀草素抗OA的潜在靶点;通过人类孟德尔遗传(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)数据库、比较毒物遗传学数据库(The Comparative Toxicogenomics Database,CTD)和药物靶标数据库(Therapeutic Target Database,TTD)筛选已报道与OA相关的疾病靶点,并与木犀草素潜在靶点进行匹配,确定木犀草素抗OA的靶点,进一步采用分子对接软件对木犀草素抗OA的潜在靶点进行鉴定。[结果]木犀草素口服生物利用率为36.16%,药物相似度为0.25,具有很好的成药性;Swiss TargetPrediction和DRAR-CPI软件共筛选出6个潜在靶点,与OA直接相关的靶点有3个,经分子对接软件鉴定,间质胶原酶1/基质金属蛋白酶1(interstitial collagenase 1/matrix metalloproteinase 1,MMP1)和基质分解素-1/基质金属蛋白酶3(stromelysin-1/matrix metalloproteinase 3,MMP3)为木犀草素抗OA的潜在靶点。[结论]木犀草素可能通过结合MMP1和MMP3,下调其表达量,最终缓解OA的炎症反应。

红花素抗脓毒症潜在靶点筛选及鉴定

目的分析红花素的分子特性,筛选并鉴定红花素抗脓毒症的潜在靶点。方法通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)分析红花素的药理参数和分子特性。采用SwissTargetprediction服务器(提供化合物靶点预测的网站)和通过化学蛋白质相互作用分析来预测化学成分靶向蛋白的服务器(DRAR-CPI)筛选红花素抗脓毒症的潜在靶点,并与人类孟德尔遗传病数据库(OMIM)、毒性与基因比较数据库(CTD)和药物靶点数据库(TTD)中已发布的抗脓毒症相关疾病靶点进行匹配,筛选出红花素的抗脓毒症靶点,进一步通过分子对接服务器鉴定红花素抗脓毒症的潜在靶点。结果红花素的口服生物利用度为41.15%,药物相似度为0.24,可旋转键数为1,表明红花素口服吸收较好,具有良好的成药性。通过SwissTargetprediction和DRAR-CPI服务器共筛选到115个潜在靶点;从OMIM、CTD和TTD 3个数据库中共获得149个疾病靶点;将两个服务器筛选出的115个红花素靶向蛋白与疾病靶向蛋白进行匹配,发现既是分子靶点又是疾病靶点的蛋白有10个,分别为凝血因子Ⅸ(F9)、腺苷A1受体(ADORA1)、一氧化氮合酶2(NOS2)、丝裂素活化蛋白激酶1(MAPK1)、组织蛋白酶G(CTSG)、中性粒细胞弹性蛋白酶(ELANE)、蛋白C(PROC)、脂钙蛋白2(LCN2)、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)和前列腺素内过氧化物酶2(PTGS2)。经分子对接服务器鉴定显示,红花素具有与上述10个靶向蛋白结合的能力,为红花素抗脓毒症的潜在靶点;红花素可通过与靶向蛋白的关键氨基酸残基发生交互作用,从而发挥相应的药效。结论红花素能够通过调节CTSG、ELANE和LCN2抑制脓毒症组织和器官损伤,通过调控ADORA1、PTGS2、NOS2和MAPK1减轻炎症,通过调控PROC和F9抑制凝血并减轻脓毒症炎症反应,通过调节G6PD改善氧化应激而减少脓毒症的发生,最终预防和治疗脓毒症。

巴马汀抗脓毒症潜在靶点的筛选与鉴定

目的研究巴马汀的分子特性,筛选并鉴定巴马汀抗脓毒症的潜在靶点。方法通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)分析巴马汀的药理参数和分子特性;通过TCMSP和DRAR-CPI软件筛选巴马汀抗脓毒症的潜在靶点;进一步通过分子对接软件鉴定巴马汀抗脓毒症的潜在靶点,免疫组化法验证潜在靶点。结果巴马汀口服生物利用率为64.60%,血脑屏障渗透率为0.37,药物相似度为0.65,具有很好的成药性;通过TCMSP和DRAR-CPI软件共筛选到3个潜在靶点,经分子对接软件鉴定NOS3为巴马汀抗脓毒症的潜在靶点,免疫组化结果表明巴马汀能显著下调脓毒症大鼠NOS3的表达。结论巴马汀具有很好的成药性,其可能通过结合并激活NOS3保护心肌抑制起到抗脓毒症的作用。