血清hsa-miR3173-5p和hsa-miR-4297作为心源性脑卒中诊断标志物的研究

目的研究血清hsa-miR3173-5p和hsa-miR-4297与心源性脑卒中的关联性,及其作为诊断标志物的可行性。方法GEO数据库整合分析筛选出可能的心源性脑卒中特异性miRNA(hsa-miR3173-5p和hsa-miR-4297),通过孟德尔随机化与共定位分析验证两个miRNA对心源性脑卒中发病的危险作用,并对它们在miRNA-mRNA调控网络中的靶基因进行富集分析来寻找相关通路。纳入2022年3月—2023年1月于成都市第三人民医院急诊科诊断新发缺血性脑卒中的患者共103例,其中心源性脑卒中22例(病例组),非心源性脑卒中81例(对照组)。采用实时荧光定量聚合酶链反应检测血清hsa-miR3173-5p和hsa-miR-4297的表达水平,多因素逻辑回归分析其与心源性脑卒中的相关性,采用ROC曲线评估预测价值。结果孟德尔随机化分析提示遗传预测的循环血液中hsa-miR3173-5p和hsa-miR-4297表达增高分别使心源性脑卒中的发病风险增加46%和70%。共定位分析提示循环血液中hsa-miR3173-5p和hsa-miR-4297的表达与心源性脑卒中存在共享遗传变异的概率分别为95%和86%。病例组血清hsa-miR3173-5p和hsa-miR-4297表达水平显著高于对照组(P<0.05),hsa-miR3173-5p(OR=6.30,95%CI 1.79~22.14,P=0.004)和hsa-miR-4297(OR=12.38,95%CI 1.97~77.72,P=0.007)与心源性脑卒中有显著关联。hsa-miR3173-5p和hsa-miR-4297的ROC曲线下面积(AUC)分别为0.705和0.624,将hsa-miR3173-5p和hsa-miR-4297联合心房颤动共同进行分析,其AUC为0.842。结论hsa-miR3173-5p和hsa-miR-4297的表达水平与心源性脑卒中具有密切关联,有望作为心源性脑卒中的诊断标志物。

分化抑制因子3作为缺血性脑卒中诊断标志物的研究及其与免疫浸润的关系

目的明确分化抑制因子3(Id3)能否作为缺血性脑卒中(IS)潜在的诊断标志物,并研究免疫细胞浸润在IS病理中的作用。方法从基因表达综合数据库中下载IS数据集。首先使用R语言软件识别差异表达基因并进行功能相关分析。然后结合最小绝对收缩与选择算子、支持向量机的特征递减消除算法和加权基因共表达网络分析算法筛选IS的诊断标志物并进一步验证,通过受试者工作特征曲线评估标志物对IS的诊断价值。最后,利用反卷积算法评价IS组织中免疫细胞浸润情况,分析诊断标志物与浸润免疫细胞的相关性。结果本研究总共确定了165个差异表达基因,发现Id3可能是IS的诊断标志物(受试者工作特征曲线下面积0.839,95%置信区间:0.750~0.920)。免疫细胞浸润分析表明,中性粒细胞、初始CD_(4)^(+)T淋巴细胞、初始B细胞、CD_(8)^(+)T淋巴细胞、静息CD_(4)^(+)记忆T淋巴细胞、活化CD_(4)^(+)记忆T淋巴细胞、静息树突状细胞、静息肥大细胞、嗜酸性粒细胞与IS的发生进展可能存在关系。结论Id3可能是IS潜在的诊断基因,免疫细胞浸润对IS的发生发展有重要影响。

猫急性应激模型的建立及诊断标志物的筛选

本研究旨在建立猫急性应激模型,筛选诊断标志物,完善猫急性应激定义标准。选取18只猫随机分为对照组、应激组A和应激组B,每组6只。测量各组猫的生理指标,评估猫应激评分(CSS),采血进行血常规和血生化分析;ELISA法检测血清炎性因子、激素、五羟色胺(5-HT)和热休克蛋白-70(HSP-70)浓度;微量法检测血清氧化应激指标。结果表明,与对照组相比,应激组A的体温、呼吸频率、CSS、尿素氮(BUN)含量、肌酸激酶(CK)活性、IL-1β、TNF-α、促肾上腺皮质激素释放激素(CRH)、促肾上腺皮质激素(ACTH)、皮质醇(COR)、肾上腺素(EPI)、5-HT浓度显著升高(P<0.05),红细胞(RBC)数目、血红蛋白(HGB)、IL-10浓度、天门冬氨酸转氨酶(AST)、丙氨酸转氨酶(ALT)活性、总胆固醇(TC)含量显著降低(P<0.05),心率、白细胞(WBC)、淋巴细胞(LYM)、中性粒细胞(NEUT)数目、葡萄糖(GLU)、总蛋白(TP)、白蛋白(ALB)、肌酐(CRE)、三酰甘油(TG)、丙二醛(MDA)含量、淀粉酶(AMY)、超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化氢酶(CAT)活性和HSP-70浓度无显著变化(P>0.05);应激组B的体温、呼吸频率、CSS、WBC、NEUT、RBC数目、GLU、BUN、TG含量、CK、AST、SOD、CAT活性、HGB、IL-1β、TNF-α、CRH、ACTH、EPI、HSP-70、5-HT浓度显著升高(P<0.05),IL-10和COR浓度显著降低(P<0.05),心率、LYM数目、ALT、AMY活性、TP、ALB、CRE、TC、MDA含量无显著变化(P>0.05)。结果提示,本研究设计的复合应激和束缚应激均能成功建立猫急性应激模型,并筛选出CRH、ACTH和CSS可用于完善猫急性应激的定义标准。

骨质疏松诊断标志物的筛选及其与免疫浸润的关系

目的寻找潜在的骨质疏松(OP)诊断标志物,并分析免疫浸润在OP发展中的作用。方法使用源自基因表达综合数据库(GEO)的基因表达谱数据集来鉴定OP的差异表达基因(DEGs),并通过富集分析揭示DEGs的潜在机制;采用最小绝对值收敛和选择算法(LASSO)逻辑回归分析和支持向量机递归特征剔除算法(SVM-RFE)筛选和验证OP的诊断标志物;使用CIBERSORT评价OP组织中免疫细胞的浸润情况,分析诊断标志物与免疫细胞浸润的相关性。结果本研究共筛选出5个诊断相关基因为关键基因:SKAP2、SLC30A3、TDRD12、RPL10和CSPP1。SKAP2、SLC30A3、TDRD12、RPL10和CSPP1被确定为OP的诊断标志物。SKAP2、SLC30A3、TDRD12、RPL10联合CSPP1诊断OP的效能较高。22种免疫细胞的相关热图显示,活化的肥大细胞与浆细胞呈正相关,静息肥大细胞与嗜酸性粒细胞呈正相关。此外,活化的CD4记忆T细胞与调节性T细胞呈负相关,巨噬细胞与记忆B细胞呈负相关。结论免疫细胞浸润在OP的发生和发展中至关重要,静息CD4记忆T细胞和M2巨噬细胞可能参与了OP的发病机制,这些结果有助于为OP的诊断和治疗提供新的思路。

阿尔茨海默病诊断标志物的生物信息学分析筛选

目的:筛选阿尔茨海默病(AD)的分子诊断标志物,并探究其在AD发生发展中的作用机制。方法:从GEO数据库下载整合正常人和AD患者4个脑区的转录组测序数据,根据其数据特征,构建4个脑区的基因表达谱。利用R软件分析正常人与AD患者4个脑区的差异表达基因(DEG),对筛选出的DEG进行GO功能注释以及KEGG通路富集分析。利用STRING数据库构建DEG的蛋白质-蛋白质相互作用网络,从中筛选出核心基因。采用R软件对核心基因进行Logistic回归分析,利用C指数筛选出具有诊断价值的模型,再利用ROC曲线分析评估该组合的诊断价值。结果:共筛选得到263个DEG。GO功能注释显示DEG主要涉及蛋白质结合、神经元投射、谷氨酸突触、神经系统发育等功能。KEGG富集分析显示DEG主要富集在代谢途径、突触囊泡循环、AD、亨廷顿病、柠檬酸循环等信号通路。Logistic回归和ROC曲线分析发现由ACTB、CAMK2B、IDH3G、NRXN3、PPP3CA、VIP组成的标志物模型具有较高的诊断价值,ROC曲线下面积(95%CI)为0.745(0.714~0.776)。结论:由6个基因组成的AD诊断组合标志物具有重要的研究意义和潜在的临床应用前景。

散发型克雅氏病临床诊断标志物研究进展

散发型克雅氏病(sporadic Creutzfeldt-Jakob disease,sCJD)是一类以快速进展性痴呆为突出表现的致死性神经系统变性疾病,由脑内致病性朊蛋白沉积所致。其核心病理特征为海绵状变性、胶质增生及神经元丢失。sCJD的诊断主要以其特征性的临床表现、脑脊液、脑电图及影像学等标志物为依据,但因其各亚型临床异质性大和部分标志物在疾病早期敏感度低等原因,使其早期诊断仍较困难。该综述系统总结了sCJD诊断标准的更新,并对各种标志物在不同分子亚型诊断中的优劣性及研究进展进行系统阐述。

基于WGCNA分析鉴定糖尿病肾病新的诊断标志物

目的基于生物信息学技术鉴定糖尿病肾病(DKD)新的诊断标志物。方法在基因综合表达数据库(GEO)中筛选DKD与正常肾小球组织中的差异表达基因(DEGs),并通过加权基因共表达网络(WGCNA)筛选关键基因模块,获得关键DEGs。进行基因本体论功能(GO)以及基因组百科全书通路(KEGG)富集分析,以及蛋白互作(PPI)分析获取核心基因。绘制核心基因的受试者操作特征(ROC)曲线,筛选出诊断效能较好的基因作为诊断标志物,并进行基因集富集分析(GSEA)以及免疫浸润分析。结果共鉴定出87个DEGs,其中39个在DKD中上调,48个下调。WGCNA显示橙色模块为关键模块,共获得14个关键DEGs。对关键DEGs的GO富集结果主要富集于白细胞趋化、趋化因子结合等,KEGG富集结果主要富集于白细胞介素17、肿瘤坏死因子等信号通路。PPI分析鉴定出5个核心基因,ROC曲线提示DUSP1及FOSB具有较好的诊断效能(AUC=0.941,AUC=0.900),被筛选为潜在诊断标志物。GSEA富集分析结果提示随着标志物表达的增加,色氨酸代谢、脂肪酸代谢等通路被抑制。免疫浸润结果发现这两个标志物的表达均与免疫细胞的浸润密切相关。结论DUSP1和FOSB对DKD具有良好的诊断效能,并与DKD肾小球免疫细胞浸润相关,有望成为DKD的新型诊断标志物及治疗靶点。

VR技术在构建AD患者视空间障碍的数字化诊断标志物体系中的价值

阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease,AD)是构成全球重大社会和经济威胁的中枢神经系统退行性疾病之一,早期识别、诊断和干预是其预防的关键。传统的以临床经验和生物学标志物为依据的AD诊断体系存在储备的局限。随着虚拟现实技术(VR)等可穿戴设备的不断发展,AD“数字化生物标志物”诊断体系正在形成。本文将重点阐述VR技术在早期识别、预警、诊断AD时的研究进展,并展望其在未来AD防治中的应用前景。

基于机器学习算法筛选胰腺癌诊断标志物及药物敏感性分析

目的通过生物信息学方法和机器学习算法挖掘基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中胰腺癌的关键表达基因,探究胰腺癌的诊断标志物。方法以GEO数据库获得的芯片数据集GSE15471、GSE16515作为训练组,GSE28735作为验证组,用于筛选出差异表达基因(Differentially Expressed Genes,DEGs)。利用套索算法(Least absolute shrinkage and selection operator,Lasso)与支持向量机的递归特征消除算法(Support Vector Machines with Recursive Feature Elimination,SVM-RFE)从DEGs中筛选出胰腺癌的关键表达基因,并在验证组中进行验证。采用受试者工作特征(Receiver Operating Characteristic,ROC)曲线的曲线下面积(Area Under Curve,AUC)评价关键表达基因的诊断效能。使用Kaplan-Meier生存曲线对关键表达基因进行预后生存分析。通过CellMiner数据库探究关键表达基因与药物敏感性之间关系。结果训练组中筛选得到123个DEGs,其中上调基因85个,下调基因38个。LASSO筛选获得19个特征基因,SVM-RFE筛选获得16个特征基因,两种算法取交集得到2个关键表达基因(ITGA2、KRT19)。ITGA2、KRT19在训练组中的AUC值分别为0.933和0.903,在验证组中的AUC值分别为0.900和0.903,均表现出了较高的敏感性与特异性。生存分析结果显示不同表达量的ITGA2(P=0.0019)、KRT19(P=0.0045)患者生存率有显著差异。药物敏感性分析显示,ITGA2,KRT19和多种肿瘤的化疗药物的耐药性增加有关(P<0.05)。结论通过生物信息学与机器学算法筛选出的关键表达基因与胰腺癌发生发展密切相关,可作为胰腺癌的诊断标志物在指导肿瘤靶向治疗方面发挥潜在作用。

基于心力衰竭HMOX2诊断标志物的机器学习模型

目的基于生物信息学数据和机器学习技术探索心力衰竭(heart failure,HF)中免疫细胞浸润新型诊断生物标志物,并阐释其潜在作用机制,为HF诊治提供新思路。方法在基因表达综合(gene expression omnibus,GEO)数据库检索获取3个HF免疫细胞浸润组织基因表达数据集,其中GSE5406和GSE84796作为训练数据集,GSE21610作为验证数据集,使用R语言鉴定差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并进行基因本体论(gene ontology,GO)富集、京都基因和基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析、疾病本体论(disease ontology,DO)富集、基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)、免疫细胞浸润分析。进一步利用最小绝对收缩和选择算子(the least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)回归、支持向量机递归特征消除(support vector machine recursive feature elimination,SVM-RFE)和随机森林(random forest,RF)三种高效机器学习算法筛选核心基因,同时进行外部验证和受试者操作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC曲线)分析。结果使用三种机器学习算法最终确定HMOX2为诊断HF的关键生物标志物,且具有良好的诊断与预测效能,训练组和验证组诊断的ROC曲线下面积分别为94.3%和83.3%。HF组和正常组的样本免疫测定结果显示幼稚B细胞、CD8T淋巴细胞、中性粒细胞与HF相关。结论HMOX2可能是HF发生、发展的潜在分子靶点,并与HF组织的免疫浸润密切相关。

膀胱癌无创性早期诊断标志物的研究进展

膀胱癌是中国泌尿生殖系最常见的恶性肿瘤，近年来其发病率仍呈上升趋势。早期诊断患者的预后良好，术后5年生存率可达94％。目前，膀胱癌的诊断主要依赖膀胱镜检查和尿液脱落细胞学检查。膀胱镜检查是有创操作，患者痛苦大，医疗费用高，可发生尿道感染、出血等并发症，约有10％的病灶被漏诊，且其诊断原位癌的敏感度很低。

日本血吸虫感染者尿液诊断标志物的电泳筛选及其单克隆抗体的制备和初步应用

目的 筛选日本血吸虫感染者尿液检测探针。方法 采用电泳方法从日本血吸虫感染者尿液筛选诊断标志物，以此为抗原制备ＭｃＡｂ，并用ＥＬＩＳＡ对尿样进行了初步检测。结果 ＰＡＧＥ电泳法筛选到一条分子量约３０ｋＤａ 的糖蛋白带；以此糖蛋白为抗原免疫ＢＡＬＢ／ｃ 小鼠制备单克隆抗体，获得２ 株ＭｃＡｂ － ＮＰ５６ 和ＮＰ５４；用ＮＰ５６ 以间接ＥＬＩＳＡ法检测１０ 份日本血吸虫感染者尿液（ＥＰＧ中位数为６９），浓缩５０ 倍尿液和原尿分别有９ 份和５ 份呈阳性。结论 本研究制备的ＭｃＡｂ－ ＮＰ５６ 有望作为日本血吸虫慢性病人和轻度感染者尿液的检测探针应用于现场。

MicroRNAs—缺血性脑卒中潜在的诊断标志物及治疗靶点

缺血性脑卒中由局部脑组织血液供应障碍所致,具有发病率、致残率和致死率高的特征。由于其形成机制复杂及现有的预防与治疗手段有限,缺血性脑卒中已成为严重影响人类健康的重要疾病。MicroRNAs(miRNAs)是一类内源性、非编码小核糖核酸分子,进化上高度保守。在细胞增殖、凋亡、分化等过程中发挥重要作用。近年来研究发现,在脑缺血的条件下,miRNAs表达谱发生异常改变,多种miRNAs参与调节脑缺血后的病理过程,是缺血性脑卒中潜在的诊断、病情监测新型标志物及治疗靶点。

异位妊娠早期诊断标志物的研究进展

异位妊娠是妇产科常见的急腹症之一,早期诊断可以降低孕产妇死亡率,为临床提供更多的治疗选择余地,将几种标志物联合检测可以明显提高早期诊断异位妊娠的准确性。本文就目前早期诊断异位妊娠的几种标志物,如绒毛膜促性腺激素、孕酮、肌酸激酶、CA125、血管内皮生长因子和细胞因子等的研究进展作一综述。

造影剂急性肾损伤新型早期诊断标志物的研究现状

造影剂肾病（contrast-induced nephropathy,CIN）,即造影剂急性肾损伤（contrast-induced acute kidney injury,CIAKI）已成为医院获得性AKI最常见的原因之一[1],普通人群发病率约为5%~7%[2],当存在肾损害危险因素,如糖尿病[3],血肌酐（SCr）大于124、177μmol/L时,

重视肝癌筛查和早期诊断标志物的研究

原发性肝癌（PLC）是世界范围内第8位最常见的恶性肿瘤，在我国，肝细胞癌（HCC）占其91．5％。HCC是世界范围内第4位常见的恶性肿瘤，我国每年发病患者数占全球患者数的53％，是第二大疾病死亡原因，每年大约有250000名患者死于HCC。肝癌总的5年生存率不超过15％，尤其有症状者低于10％。目前肝癌发病率在我国呈上升趋势。

miR-4770作为结直肠癌的诊断标志物研究

目的:从微小RNA(micro RNA,mi RNA)表达谱中筛选出具有结直肠癌诊断潜能的mi RNA。方法:通过实时荧光定量PCR阵列法检测结直肠癌组织和癌旁组织mi RNA表达水平,筛选具有统计学意义的mi RNA。通过受试者特征曲线分析mi R-4770诊断结直肠癌的特异性与敏感性。结果 :从结直肠癌样本中筛选出差异具有统计学意义的mi RNA共102个,其中92个下调,10个上调。mi R-4770对结直肠癌的诊断特异性是71.43%,敏感性为95.24%,曲线下面积为0.952 4。结论:mi R-4770具有结直肠癌筛查和提示预后的潜能。

中性粒细胞明胶酶相关脂质运载蛋白—新型急性肾损伤的早期诊断标志物

中性粒细胞明胶酶相关脂质运载蛋白（Neutrophil gelatinase associated lipocalin,NGAL）属于脂质运载蛋白家族（lipocalin）的一员,作为新型急性肾损伤的早期诊断标志物与临床常用的肌酐、尿量等传统检测指标相比,更能迅速、灵敏地反映肾脏的损伤及恢复过程,

食管癌伴E-NED的临床病理特点及诊断标志物探讨

目的通过对食管癌伴神经内分泌分化(E-NED)的临床病理特点及诊断的标志物进行探讨,进一步加深对其的认识。方法回顾性分析2007年1月至2014年12月经病理确诊的食管癌389例患者的临床资料,其中ENED38例,食管癌不伴NED(E-NNED)351例。分析389例食管癌患者的性别、发病年龄、病变位置、浸润的深度及长度、TNM分期、淋巴结转移情况等资料,对比E-NED与E-NNED患者的临床病理学特征。通过免疫组织化学方法检测38例E-NED及随机选取的40例E-NNED患者的肿瘤组织中嗜铬蛋白A(Cg A)、神经细胞黏附分子(CD56)、突触素(Syn)、神经元特异度烯醇化酶(NSE)、促泌素(SCGN)、蛋白基因产物9.5(PCP9.5)、甲状腺转录因子1(TTF-1)的表达。结果 E-NNED与E-NED患者的性别、年龄、病变长度等病理因素之间差异无统计学意义(P>0.05)。ENED患者的Cg A、CD56、Syn、NSE、SCGN、PCP9.5表达均较E-NNED组患者的高,差异有统计学意义(P<0.05),但TTF-1两组间无显著差异(P>0.05)。Syn分别与CD56、SCGN或PGP9.5组成的3种组合诊断E-NED的阳性预测值、敏感度及准确率均高于Syn与Cg A的组合,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 E-NED与E-NNED可能为不同病理类型的食管癌,SCGN与PGP9.5可作为E-NED的诊断标志物,且Syn与PGP9.5、CD56或SCGN联合检测可提高E-NED的诊断敏感度及准确率。

急性肾衰竭的早期诊断标志物

急性肾衰竭（acute renal failure．ARF）是指由于多种病因引起肾功能在短期内（数小时或数天）急剧下降的脑床综合征，根据病因可以简单分为肾前性、肾实质性和肾后梗阻性。其发病率约占住院病人的5％．在ICU病人中高达30％～50％。死亡率达45％。ARF的发病率和死亡率都非常高。诊断不及时从而延误治疗是重要的原因。临床上常规肾功能诊断指标主要是血清肌酐、尿素氮、肌酐清除率等。但由于肾脏具备强大的代偿能力．这些指标往往要在肾功能快一半以上才会显示异常，因此无法用于早期诊断。随着研究深入．许多新的标志物被发现，为ARF的早期诊断带来了希望。现综述如下．