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基于线粒体DNA序列分析金虎尾目在蔷薇亚纲中的地位
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作者 卿华 覃佳佳 +2 位作者 靳燕 马政 姚慧鹏 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2020年第6期708-714,共7页
【目的】探讨金虎尾目在蔷薇亚纲中的植物学地位。【方法】以金虎尾目,豆类以及锦葵类植物12条线粒体基因作为研究对象,利用最大似然法、最大简约法、近邻法分别构建系统发生树,对金虎尾目的植物学地位进行分析。【结果】最大似然法结... 【目的】探讨金虎尾目在蔷薇亚纲中的植物学地位。【方法】以金虎尾目,豆类以及锦葵类植物12条线粒体基因作为研究对象,利用最大似然法、最大简约法、近邻法分别构建系统发生树,对金虎尾目的植物学地位进行分析。【结果】最大似然法结果表明12条线粒体基因中,有9条线粒体基因支持金虎尾目属于锦葵类,支持率为29%~79%;有3条线粒体基因支持金虎尾目属于豆类,支持率为17%~52%。最大简约法结果表明12条线粒体基因中,有8条线粒体基因支持金虎尾目属于锦葵类,支持率为36%~85%;而支持金虎尾目属于豆类的仅有2条基因,支持率为25%和66%;其余的2条基因支持金虎尾目既不属于锦葵类也不属于豆类,支持率为77%和99%。近邻法结果表明12条线粒体基因中,有8条线粒体基因支持金虎尾目属于锦葵类,支持率为14%~82%;而只有3条基因表明金虎尾目属于豆类,支持率为36%~66%;其余的1条基因表明金虎尾目属于豆类和锦葵类分支之外,支持率为44%。【结论】上述3种模型分析结果表明,大多数基因的分类支持金虎尾目归属于锦葵类分支,同时具有高支持率。这个结果可为金虎尾目不完全谱系分选提供一定的证据。 展开更多
关键词 金虎尾目 线粒体同源基因 系统发生树 不完全谱系分选
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种间基因渐渗检测方法及其应用研究进展 被引量:4
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作者 程祥 李玲玲 +2 位作者 肖钰 陈晓阳 胡新生 《中国科学:生命科学》 CSCD 北大核心 2020年第12期1388-1404,共17页
伴随着谱系分选进程,从共同祖先群体分裂后形成的子代群体间的基因流逐渐衰减,并可能延续至新物种形成.种间基因组序列差异或种间群体基因频率的变异部分地记录了这些种群历史和当代动态过程,可以根据种间基因组序列变异或基因频率变异... 伴随着谱系分选进程,从共同祖先群体分裂后形成的子代群体间的基因流逐渐衰减,并可能延续至新物种形成.种间基因组序列差异或种间群体基因频率的变异部分地记录了这些种群历史和当代动态过程,可以根据种间基因组序列变异或基因频率变异推测这些发生过的事件.本文系统探讨了检测种间基因渐渗的方法,包括基于种间群体基因频率变异分析(Fst,LD, STRUCTURE, AFS, TreeMix)和基于种间DNA序列差异分析(ABBA-BABA,IM, IIM, ABC)方法,分析了这些方法的原理和应用局限性,拓展这些方法中的一些重要假设将是今后研究任务之一,包括基因重组效应、区分配子与合子迁移的贡献、交配系统与基因流互作以及适应性基因迁移的阻碍作用.澄清这些影响有助于深入理解物种形成过程. 展开更多
关键词 基因渐渗 物种形成 隔离-迁移模型 谱系分选 基因树
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Facilitated column selection in the separation of acetylspiramycin components using a simple column classification system 被引量:1
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作者 王明娟 郑超 +4 位作者 胡昌勤 金少鸿 Hoogmartens Jos VanSchepdael Ann Adams Erwin 《Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences》 CAS 2011年第6期572-577,共6页
Acetylspiramycin(ASPM),a 16-membered basic macrolide antibiotic,is the acetylated derivative of spiramycin.In addition to the four main components,more than seventy minor components could be present in ASPM.Thus,it ... Acetylspiramycin(ASPM),a 16-membered basic macrolide antibiotic,is the acetylated derivative of spiramycin.In addition to the four main components,more than seventy minor components could be present in ASPM.Thus,it is a challenge to obtain a baseline separation of ASPM components.Meanwhile,in some cases it was found that the results obtained by different brands of C_(18) columns were significantly different,indicating the necessity of a rational column selection for the separation of ASPM components.In this paper,we attempted to facilitate column selection for the analysis of ASPM using the database of the column characterization system established by Leuven University.With the CAPCELL PAK MG C_(18)(250 mm×4.6 mm,5μm) as the reference column,three groups of columns(F2 group:similar selectivity;2F6:intermediate ranked group;F6 group: different selectivity,compared to the reference column) were selected,and their performances in the separation of ASPM components were evaluated under the chromatographic conditions described in Chinese Pharmacopoeia monograph.A good relationship was demonstrated between the ranking of columns and their selectivity in the separation of ASPM components,indicating the column classification system established by Leuven University was a helpful tool in the selection of suitable columns for the analysis of ASPM,a complex mixture of basic compounds. 展开更多
关键词 ACETYLSPIRAMYCIN Semi-synthetic antibiotic Column selection Column characterization system
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