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江孜沙棘和云南沙棘之间谱系分化和亲缘地理
被引量:
8
1
作者
程凯
孙坤
+3 位作者
温红艳
张敏
贾东瑞
刘建全
《植物生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第1期1-11,共11页
研究具有邻近分布的近缘类群的遗传分化和谱系筛选对于进一步揭示物种形成机制具有重要意义。该文以沙棘属(Hippophae)临域分布的两个类群,江孜沙棘(H.gyantsensis)和云南沙棘(H.rhamnoides subsp.yunnanensis)为研究对象,进行群体水平...
研究具有邻近分布的近缘类群的遗传分化和谱系筛选对于进一步揭示物种形成机制具有重要意义。该文以沙棘属(Hippophae)临域分布的两个类群,江孜沙棘(H.gyantsensis)和云南沙棘(H.rhamnoides subsp.yunnanensis)为研究对象,进行群体水平上的母系分化研究。前一个种分布于西藏的中西部,而后者主要分布于青藏高原东南部的云南西北部、四川西部和西藏东南部。两个类群在叶和果实性状存在明显区别。叶绿体在沙棘属植物中为母系遗传。共研究了两个类群14种群109个沙棘个体的叶绿体trnL-F、trnS-G序列;序列排序后共发现11种单倍型,江孜沙棘和云南沙棘分别有7种和6种,两种单倍型为两个类群共享。分支分析和嵌套进化分析进一步表明,两个类群之间的单倍型相互交错,单倍型分化与形态上划分的两个类群不一致,表明它们之间具有十分复杂的谱系筛选过程。这些发现明显不支持以前提出的有关江孜沙棘系统位置的假设。但是,目前所获得的证据不能区分该物种究竟是通过异域分化还是同倍性杂交起源的。不同种群固定特有单倍型表明,两个类群都在最后一次冰期可能存在多个避难所。
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关键词
云南沙棘
江孜沙棘
叶绿体DNA
TRNL-F
DNA
trnS-G序列
谱系筛选
物种形成
避难所
下载PDF
职称材料
基因流介导的种间渐渗与物种界定(英文)
被引量:
5
2
作者
杜芳
徐放
《植物分类与资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期257-262,共6页
物种界定是生物学中最基本的问题之一。近年来随着分子生物学技术的进步如分子条形码的发展,物种界定也越来越引起人们的兴趣。界定一个物种或相似的一组物种时最重要的一个原则就是选择适合的分子标记。然而,植物中广泛存在的不完全谱...
物种界定是生物学中最基本的问题之一。近年来随着分子生物学技术的进步如分子条形码的发展,物种界定也越来越引起人们的兴趣。界定一个物种或相似的一组物种时最重要的一个原则就是选择适合的分子标记。然而,植物中广泛存在的不完全谱系筛选与种间渐渗却常常会阻碍准确鉴定物种。最近,有关基因流介导的种间渗入和物种界定在理论和实验研究中都取得了重大进展。本文综述了基因流介导的物种形成;评价了种间渐渗与不完全谱系筛选的区别;最后总结出应该利用基因流速度较快的分子标记去鉴定物种。
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关键词
物种界定
分子标记
DNA条形码
种间渐渗
不完全
谱系筛选
基因流
原文传递
题名
江孜沙棘和云南沙棘之间谱系分化和亲缘地理
被引量:
8
1
作者
程凯
孙坤
温红艳
张敏
贾东瑞
刘建全
机构
四川农业大学农学院
兰州大学生命科学院干旱与草地教育部重点实验室
西北师范大学生命科学学院
云南省丽江市生物资源开发创新办公室
出处
《植物生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第1期1-11,共11页
基金
国家自然科学基金(30430560)
教育部专项基金(NCET-05-0886)
文摘
研究具有邻近分布的近缘类群的遗传分化和谱系筛选对于进一步揭示物种形成机制具有重要意义。该文以沙棘属(Hippophae)临域分布的两个类群,江孜沙棘(H.gyantsensis)和云南沙棘(H.rhamnoides subsp.yunnanensis)为研究对象,进行群体水平上的母系分化研究。前一个种分布于西藏的中西部,而后者主要分布于青藏高原东南部的云南西北部、四川西部和西藏东南部。两个类群在叶和果实性状存在明显区别。叶绿体在沙棘属植物中为母系遗传。共研究了两个类群14种群109个沙棘个体的叶绿体trnL-F、trnS-G序列;序列排序后共发现11种单倍型,江孜沙棘和云南沙棘分别有7种和6种,两种单倍型为两个类群共享。分支分析和嵌套进化分析进一步表明,两个类群之间的单倍型相互交错,单倍型分化与形态上划分的两个类群不一致,表明它们之间具有十分复杂的谱系筛选过程。这些发现明显不支持以前提出的有关江孜沙棘系统位置的假设。但是,目前所获得的证据不能区分该物种究竟是通过异域分化还是同倍性杂交起源的。不同种群固定特有单倍型表明,两个类群都在最后一次冰期可能存在多个避难所。
关键词
云南沙棘
江孜沙棘
叶绿体DNA
TRNL-F
DNA
trnS-G序列
谱系筛选
物种形成
避难所
Keywords
Hippophae rhamnoides subsp, yunnanensis, H. gyantsensis, cpDNA, trnL-F, trnS-G, lineage sorting, speciation, glacial refugia
分类号
S793.6 [农业科学—林木遗传育种]
下载PDF
职称材料
题名
基因流介导的种间渐渗与物种界定(英文)
被引量:
5
2
作者
杜芳
徐放
机构
北京林业大学计算生物学中心
出处
《植物分类与资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期257-262,共6页
基金
Young Scientist Fund(2010BLX01)
the Fundamental Research Funds(YX2011-23)in BJFU Research Fund for the Doctoral Program of Higher Education of China(2011DD14120014)
an open funding(K1004)from Beijing Normal University to FKD
文摘
物种界定是生物学中最基本的问题之一。近年来随着分子生物学技术的进步如分子条形码的发展,物种界定也越来越引起人们的兴趣。界定一个物种或相似的一组物种时最重要的一个原则就是选择适合的分子标记。然而,植物中广泛存在的不完全谱系筛选与种间渐渗却常常会阻碍准确鉴定物种。最近,有关基因流介导的种间渗入和物种界定在理论和实验研究中都取得了重大进展。本文综述了基因流介导的物种形成;评价了种间渐渗与不完全谱系筛选的区别;最后总结出应该利用基因流速度较快的分子标记去鉴定物种。
关键词
物种界定
分子标记
DNA条形码
种间渐渗
不完全
谱系筛选
基因流
Keywords
Species delimitation
Molecular Marker
DNA barcoding
Species introgression
Incomplete linkage sorting
Gene flow
分类号
Q949 [生物学—植物学]
Q943 [生物学—植物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
江孜沙棘和云南沙棘之间谱系分化和亲缘地理
程凯
孙坤
温红艳
张敏
贾东瑞
刘建全
《植物生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
8
下载PDF
职称材料
2
基因流介导的种间渐渗与物种界定(英文)
杜芳
徐放
《植物分类与资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
5
原文传递
已选择
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条
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参考文献
引证文献
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