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谷子MRP蛋白家族序列特征、分子进化及表达模式分析
被引量:
1
1
作者
高豪
满夏夏
+4 位作者
孙朝霞
韩渊怀
李红英
侯思宇
郭数进
《农学学报》
2021年第5期74-82,共9页
本研究旨在深入了解谷子叶酸转运家族成员的基因结构和表达模式,为谷子体内叶酸转运分子机制的研究奠定基础。使用Phytozome、Clustal X、MEGA7.0等在线工具和软件,对谷子MRP家族成员进行生物信息学分析;基于谷子谷穗有参转录组测序数据...
本研究旨在深入了解谷子叶酸转运家族成员的基因结构和表达模式,为谷子体内叶酸转运分子机制的研究奠定基础。使用Phytozome、Clustal X、MEGA7.0等在线工具和软件,对谷子MRP家族成员进行生物信息学分析;基于谷子谷穗有参转录组测序数据,分析谷子MRP家族成员表达模式。结果显示,谷子MRP蛋白家族成员共21个,在7号染色体分布最多,有8个基因;17个谷子MRP蛋白偏碱性和4个偏酸性,根据疏水值判断其均为亲水性蛋白;成员SiMRP7、SiMRP12基因的表达量与谷子组织中的总叶酸含量表现出协同降低的趋势,推测这两个蛋白可能对谷子叶酸的积累起到调控作用。本研究有助于进一步鉴定叶酸转运相关蛋白,为后续研究叶酸代谢途径及谷子基因挖掘提供了理论基础。
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关键词
谷子
MRP蛋白家族
谷子叶酸
生物信息学分析
表达模式
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职称材料
题名
谷子MRP蛋白家族序列特征、分子进化及表达模式分析
被引量:
1
1
作者
高豪
满夏夏
孙朝霞
韩渊怀
李红英
侯思宇
郭数进
机构
山西农业大学农学院
出处
《农学学报》
2021年第5期74-82,共9页
基金
国家重点研发计划“杂粮作物品质性状形成分子机理及调控途径”(2018YFD1000705-2)
山西省高等学校科学研究优秀成果培育项目“小米特色功能营养成分形成机制”(2019KJ020)
+5 种基金
山西省重点研发项目“谷子杂种优势利用及基于全基因组SNP的技术开发”(201703D211008)
山西农谷项目“山西省主要功能作物产业技术研究与示范-功能作物种质创新研究”(SXNGJSKYZX201702)
山西省粮食局攻关项目“特色品质谷子品种筛选”(201803)
山西省重点研发计划项目“高产富硒大豆新品系选育”(201803D221008-2)
山西农业大学博士科研启动项目“山西不同生态型大豆抗旱应答机制的研究”(2015ZZ07)
山西省研究生优秀创新项目“谷子叶酸富集性状全基因组关联分析”(2020SY207)。
文摘
本研究旨在深入了解谷子叶酸转运家族成员的基因结构和表达模式,为谷子体内叶酸转运分子机制的研究奠定基础。使用Phytozome、Clustal X、MEGA7.0等在线工具和软件,对谷子MRP家族成员进行生物信息学分析;基于谷子谷穗有参转录组测序数据,分析谷子MRP家族成员表达模式。结果显示,谷子MRP蛋白家族成员共21个,在7号染色体分布最多,有8个基因;17个谷子MRP蛋白偏碱性和4个偏酸性,根据疏水值判断其均为亲水性蛋白;成员SiMRP7、SiMRP12基因的表达量与谷子组织中的总叶酸含量表现出协同降低的趋势,推测这两个蛋白可能对谷子叶酸的积累起到调控作用。本研究有助于进一步鉴定叶酸转运相关蛋白,为后续研究叶酸代谢途径及谷子基因挖掘提供了理论基础。
关键词
谷子
MRP蛋白家族
谷子叶酸
生物信息学分析
表达模式
Keywords
Foxtail Millet
MRP Protein Family
Folate of Foxtail Millet
Bioinformatics Analysis
Expression Pattern
分类号
S515 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
谷子MRP蛋白家族序列特征、分子进化及表达模式分析
高豪
满夏夏
孙朝霞
韩渊怀
李红英
侯思宇
郭数进
《农学学报》
2021
1
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