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题名谷熟菌子实体2个发育时期的转录组比较分析
被引量:2
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作者
赵春艳
李清
熊勇
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机构
中华全国供销合作总社昆明食用菌研究所
云南民族大学民族医药学院
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出处
《云南民族大学学报(自然科学版)》
CAS
2023年第1期19-31,共13页
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基金
国家自然科学基金(81760655),云南民族大学民族药资源化学国家民委-教育部重点实验室开放课题基金项目(MZY2104).
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文摘
以未开伞期和开伞期的谷熟菌子实体作为研究的材料,利用Illumina平台测序和生物信息学方法分析,探究谷熟菌子实体生长发育过程中不同基因表达的差异,预测对谷熟菌子实体生长和发育有影响的主要基因和代谢通路.结果显示谷熟菌未开伞期6.66 G和开伞期6.27 G的分析数据.KOG功能注释结果预测,谷熟菌子实体的基因成功注释在26基因功能类别中.GO富集预测结果谷熟菌在不同的生长阶段的生物过程、细胞成分和分子功能存在差异.基因表达水平与聚类分析结果显示,ATP酶和多功能伴侣家族基因是未开伞期和开伞期的主要高表达基因,在能量代谢和调控细胞周期过程中起着重要的作用.差异表达基因KEGG富集通路结果显示,影响谷熟菌2个生长发育过程中能量代谢的关键途径是氧化磷酸化途径.进一步研究结果显示,MAPK信号通路对谷熟菌子实体2个生长发育期起到关键作用,对于促进谷熟菌子实体未开伞期和开伞期有性生殖和调控菌丝体的极性生长过程中有着重要的影响.
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关键词
谷熟菌
转录组
Illumina测序
氧化磷酸化
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Keywords
Lactarius deliciosus
Expression gene
Illumina sequencing
Oxidative phosphorylation
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分类号
S646
[农业科学—蔬菜学]
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