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小麦液泡质子焦磷酸酶基因EST的克隆与分析
被引量:
1
1
作者
黄先忠
马正强
《石河子大学学报(自然科学版)》
CAS
2004年第3期185-187,共3页
通过RT-PCR的方法在矮苏3小麦的总cDNA中克隆到一个与大麦液泡质子焦磷酸酶基因(VP)高度同源的EST。以该序列为基础,利用生物信息学的方法构建了一个编码小麦VP蛋白的全长EST重叠群,长2764bp,其包含一个长2355bp的完整开放读码框(ORF),...
通过RT-PCR的方法在矮苏3小麦的总cDNA中克隆到一个与大麦液泡质子焦磷酸酶基因(VP)高度同源的EST。以该序列为基础,利用生物信息学的方法构建了一个编码小麦VP蛋白的全长EST重叠群,长2764bp,其包含一个长2355bp的完整开放读码框(ORF),编码785个氨基酸多肽。通过Southern杂交,将该VP基因定位在小麦染色体的第7同源群上。
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关键词
小麦
液泡
质子焦磷酸酶
EST
克隆
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职称材料
植物液泡膜质子转运焦磷酸酶研究进展
被引量:
4
2
作者
朱昀
李朝炜
魏景芳
《河北师范大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2013年第6期639-643,共5页
液泡膜质子转运焦磷酸酶是一种区别于H+-ATPase的质子泵,广泛存在于植物和少数藻类、原生动物以及细菌中.综述了植物液泡膜质子转运焦磷酸酶在结构特性以及功能方面的研究进展,并展望了该基因在植物抗旱耐盐基因工程中的应用前景.
关键词
液泡膜
质子
转运
焦磷酸
酶
抗盐性
耐旱性
下载PDF
职称材料
蕨类植物质子焦磷酸酶编码基因的鉴定及进化分析
3
作者
梁靖雯
王鹏
+5 位作者
叶秀旭
盖江涛
白蓓蓓
李倩
刘咲頔
徐诗涛
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第7期3168-3172,共5页
为了全面鉴定蕨类植物中质子焦磷酸酶(AVP1)编码基因,并构建家族进化关系,本研究首先通过检索PfamA数据库从AVP1蛋白序列中鉴定到了一个保守结构域,在此基础上,结合HMMER和BLAST,从6个物种基因组中鉴定到了18条质子焦磷酸酶家族基因。...
为了全面鉴定蕨类植物中质子焦磷酸酶(AVP1)编码基因,并构建家族进化关系,本研究首先通过检索PfamA数据库从AVP1蛋白序列中鉴定到了一个保守结构域,在此基础上,结合HMMER和BLAST,从6个物种基因组中鉴定到了18条质子焦磷酸酶家族基因。进化树构建结果表明,在勺叶槐叶萍中没有鉴定到AVP亚家族成员;而在细叶满江红中没有鉴定到AVPL亚家族成员。本研究为今后针对蕨类植物中AVP1基因功能的深入研究提供了基因靶标。
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关键词
蕨类植物
质子焦磷酸酶
结构域
进化关系
原文传递
两个棉纤维发育相关基因的克隆与特征分析(英文)
4
作者
王磊
朱一超
+2 位作者
蔡彩萍
张天真
郭旺珍
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期85-91,共7页
棉纤维发育突变体是克隆棉纤维发育关键基因和阐明其发育分子机理的优异资源。陆地棉李氏超短纤维突变体(Li1li1)是显性单基因突变体,表现为显性纯合体(Li1Li1)致死,显性杂合时(Li1li1)表型为茎秆扭曲、叶片卷曲和纤维短至6mm,而隐性纯...
棉纤维发育突变体是克隆棉纤维发育关键基因和阐明其发育分子机理的优异资源。陆地棉李氏超短纤维突变体(Li1li1)是显性单基因突变体,表现为显性纯合体(Li1Li1)致死,显性杂合时(Li1li1)表型为茎秆扭曲、叶片卷曲和纤维短至6mm,而隐性纯合体(li1li1)则表现为株型和纤维发育都正常。本文对开花后10d的李氏纤维发育正常材料(li1li1)和超短纤维突变体(Li1li1)胚珠纤维混合体进行mRNA差异显示反转录PCR(DDRT-PCR)分析,获得2条在李氏纤维发育正常材料中上调表达的差异片段。测序及DNA序列的生物信息学分析表明该差异片段分别与编码谷氨酸脱羧酶和质子焦磷酸酶的基因有较高同源性。通过电子拼接,5′RACE和全长cDNA序列验证,克隆了棉花的谷氨酸脱羧酶(GhGAD)和质子焦磷酸酶(GhVP1)基因全长cDNA,进一步对其功能和染色体定位进行了初步分析。转录水平分析表明,这两个基因在棉花根、茎、叶和纤维中组成性表达,在棉纤维中优势表达。利用本实验室陆地棉遗传标准系TM-1和海岛棉海7124培育的含140个单株的BC1作图群体,将GhGAD和GhVP1分别定位在第12条染色体和第8条染色体。
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关键词
棉花
纤维突变体
DDRT-PCR
谷氨酸脱羧
酶
质子焦磷酸酶
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职称材料
题名
小麦液泡质子焦磷酸酶基因EST的克隆与分析
被引量:
1
1
作者
黄先忠
马正强
机构
南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室
出处
《石河子大学学报(自然科学版)》
CAS
2004年第3期185-187,共3页
基金
国家杰出青年基金(30025030)
转基因产业化专项(JOO-A-006-1)
文摘
通过RT-PCR的方法在矮苏3小麦的总cDNA中克隆到一个与大麦液泡质子焦磷酸酶基因(VP)高度同源的EST。以该序列为基础,利用生物信息学的方法构建了一个编码小麦VP蛋白的全长EST重叠群,长2764bp,其包含一个长2355bp的完整开放读码框(ORF),编码785个氨基酸多肽。通过Southern杂交,将该VP基因定位在小麦染色体的第7同源群上。
关键词
小麦
液泡
质子焦磷酸酶
EST
克隆
Keywords
wheat
vacuolar H^+-pyrophosphatase
EST
clone
分类号
S512 [农业科学—作物学]
Q785 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
植物液泡膜质子转运焦磷酸酶研究进展
被引量:
4
2
作者
朱昀
李朝炜
魏景芳
机构
河北科技大学生物科学与工程学院
出处
《河北师范大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2013年第6期639-643,共5页
基金
河北省自然科学基金(C2011208057)
转基因生物新品种培育科技重大专项(2011ZX08001-003)
+1 种基金
河北省科技支撑计划项目(11220111D)
河北科技大学博士科研启动金项目(QD200963)
文摘
液泡膜质子转运焦磷酸酶是一种区别于H+-ATPase的质子泵,广泛存在于植物和少数藻类、原生动物以及细菌中.综述了植物液泡膜质子转运焦磷酸酶在结构特性以及功能方面的研究进展,并展望了该基因在植物抗旱耐盐基因工程中的应用前景.
关键词
液泡膜
质子
转运
焦磷酸
酶
抗盐性
耐旱性
Keywords
vacuolar H^+-pyrophosphatase
salt resistance
drought tolerance
分类号
Q943 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
蕨类植物质子焦磷酸酶编码基因的鉴定及进化分析
3
作者
梁靖雯
王鹏
叶秀旭
盖江涛
白蓓蓓
李倩
刘咲頔
徐诗涛
机构
海南大学热带农林学院
中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所
黑龙江八一农垦大学
海南大学环南海生物多样性研究中心
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第7期3168-3172,共5页
基金
国家自然科学基金(31660229)资助。
文摘
为了全面鉴定蕨类植物中质子焦磷酸酶(AVP1)编码基因,并构建家族进化关系,本研究首先通过检索PfamA数据库从AVP1蛋白序列中鉴定到了一个保守结构域,在此基础上,结合HMMER和BLAST,从6个物种基因组中鉴定到了18条质子焦磷酸酶家族基因。进化树构建结果表明,在勺叶槐叶萍中没有鉴定到AVP亚家族成员;而在细叶满江红中没有鉴定到AVPL亚家族成员。本研究为今后针对蕨类植物中AVP1基因功能的深入研究提供了基因靶标。
关键词
蕨类植物
质子焦磷酸酶
结构域
进化关系
Keywords
Fern
Proton pyrophosphatase
Domain
Evolutionary relationship
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
原文传递
题名
两个棉纤维发育相关基因的克隆与特征分析(英文)
4
作者
王磊
朱一超
蔡彩萍
张天真
郭旺珍
机构
南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期85-91,共7页
基金
国家自然科学基金重点项目(30871558)
国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2006AA10Z111)
+1 种基金
江苏省自然科学基金项目(BK2008036)
教育部高等学校学科创新引智计划项目(B08025)资助
文摘
棉纤维发育突变体是克隆棉纤维发育关键基因和阐明其发育分子机理的优异资源。陆地棉李氏超短纤维突变体(Li1li1)是显性单基因突变体,表现为显性纯合体(Li1Li1)致死,显性杂合时(Li1li1)表型为茎秆扭曲、叶片卷曲和纤维短至6mm,而隐性纯合体(li1li1)则表现为株型和纤维发育都正常。本文对开花后10d的李氏纤维发育正常材料(li1li1)和超短纤维突变体(Li1li1)胚珠纤维混合体进行mRNA差异显示反转录PCR(DDRT-PCR)分析,获得2条在李氏纤维发育正常材料中上调表达的差异片段。测序及DNA序列的生物信息学分析表明该差异片段分别与编码谷氨酸脱羧酶和质子焦磷酸酶的基因有较高同源性。通过电子拼接,5′RACE和全长cDNA序列验证,克隆了棉花的谷氨酸脱羧酶(GhGAD)和质子焦磷酸酶(GhVP1)基因全长cDNA,进一步对其功能和染色体定位进行了初步分析。转录水平分析表明,这两个基因在棉花根、茎、叶和纤维中组成性表达,在棉纤维中优势表达。利用本实验室陆地棉遗传标准系TM-1和海岛棉海7124培育的含140个单株的BC1作图群体,将GhGAD和GhVP1分别定位在第12条染色体和第8条染色体。
关键词
棉花
纤维突变体
DDRT-PCR
谷氨酸脱羧
酶
质子焦磷酸酶
Keywords
Cotton
Fiber developmental mutant
DDRT-PCR
Glutamate decarboxylase (GhGAD)
Vacuole-pyrophosphatase (GhVP1)
分类号
S562 [农业科学—作物学]
Q933 [生物学—微生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
小麦液泡质子焦磷酸酶基因EST的克隆与分析
黄先忠
马正强
《石河子大学学报(自然科学版)》
CAS
2004
1
下载PDF
职称材料
2
植物液泡膜质子转运焦磷酸酶研究进展
朱昀
李朝炜
魏景芳
《河北师范大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2013
4
下载PDF
职称材料
3
蕨类植物质子焦磷酸酶编码基因的鉴定及进化分析
梁靖雯
王鹏
叶秀旭
盖江涛
白蓓蓓
李倩
刘咲頔
徐诗涛
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020
0
原文传递
4
两个棉纤维发育相关基因的克隆与特征分析(英文)
王磊
朱一超
蔡彩萍
张天真
郭旺珍
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
0
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