转录超保守区uc.290高表达促进溃疡性结肠炎肠壁纤维化

目的研究转录超保守区uc.290与溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)肠壁纤维化之间的关系及作用机制。方法收集2021年1月至2021年10月收治的50例慢性复发型UC住院患者(UC组),选取50例同期收治的结肠息肉内镜下治疗的住院患者(对照组)。两组患者行结肠镜检查并用活检钳获取UC患者结肠炎症部位黏膜及对照组结肠正常黏膜。RT-PCT检测结肠黏膜标本中uc.290、EMT标志性蛋白Vimentin、N-cadherin和E-cadherin的表达,免疫组化检测后三者的表达。采用改良Masson三色染色法检测结肠黏膜中胶原纤维含量并计算纤维化评分。Pearson相关分析uc.290表达与纤维化评分的关系。在模式细胞Caco2中过表达uc.290,RT-PCT、Western blotting分别检测Vimentin、N-cadherin和E-cadherin的表达。结果UC患者结肠黏膜中uc.290显著高表达,纤维化评分显著升高,且uc.290表达水平与纤维化评分呈正相关(r=0.735,P=0.012)。UC患者结肠黏膜及高表达uc.290的Caco2细胞中,Vimentin和N-cadherin显著高表达,而E-cadherin显著低表达。结论uc.290在UC患者结肠黏膜中高表达,通过激活EMT促进肠壁纤维化。

人肺腺癌细胞超保守区的生物信息学分析

目的:使用生物信息学的方法,分析肺癌细胞(A549)经慢病毒感染后,过表达超保守区基因与正常肺癌细胞之间的差异基因,并进行基因功能和信号通路分析,为肺癌研究提供差异基因。方法:在公共数据库(GEO)中下载6个肺癌细胞差异基因表达阵列数据进行生物信息学分析,筛选出相关的差异基因。使用DAVID和STRING数据库对差异基因表达进行基因功能、信号通路和蛋白互作用分析。结果:共得到230个差异基因,其中217个表达上调,13个表达下调;GO富集分析显示差异基因主要定位于细胞膜外,参与血管内皮生长因子的调节;KEGG信号通路分析显示差异基因主要表现在化学致癌上;蛋白互作网络显示主要的相关蛋白是CFH、MUC5B、PTGS2、LRRK2。结论:本研究从生物信息学方法对数据进行处理,在基因水平上表明肺癌细胞过表达超保守区后存在差异基因,为基础研究筛选出差异,进而服务于临床。

超保守长链非编码RNA uc.77在肺癌中的表达及其调控作用

目的探讨超保守长链非编码RNA uc.77(uc.77)在肺癌中的表达及其分子机制。方法肺癌组织及癌旁正常组织来自2014—2016年解放军南部战区总医院确诊肺癌并行手术的61例肺癌患者。采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测肺癌细胞株中uc.77的相对表达水平,同时在61对肺癌组织及其癌旁正常组织中验证其表达趋势,分析uc.77的表达与肺癌患者临床病理特征的关系。转染uc.77 siRNA敲低uc.77的表达,采用细胞计数试剂盒8法和克隆形成实验检测细胞增殖能力,流式细胞术检测细胞凋亡和细胞周期变化。将转染uc.77 siRNA的肺癌H1299细胞注射至BALB/c裸鼠构建荷瘤模型,观察uc.77对肿瘤生长的影响,对肿瘤组织进行HE染色和免疫组化检测,qRT-PCR和Western blot法检测p21 mRNA和蛋白表达水平。结果肺癌细胞系95-D、H1299、A549、H460、H446和16HBE-T中uc.77的表达水平高于正常支气管上皮样细胞16HBE(均P<0.05);61例肺癌组织中uc.77的表达水平高于旁正常组织(P<0.001)。肿瘤体积、有无淋巴结转移、TNM分期与uc.77的表达有关(均P<0.05)。转染uc.77 siRNA 48和72 h后,siRNA-1组H1299、95-D、16HBE-T细胞A值低于各自对照组和siRNA-NC组(均P<0.05)。转染uc.77 siRNA-1后,H1299 siRNA-1组细胞G0/G1期细胞比例[(71.86±3.46)%]高于H1299对照组[(47.62±5.48)%]和H1299 siRNA-NC组[(61.38±5.62)%,均P<0.05];H1299 siRNA-1组细胞S期细胞比例[(14.99±3.61)%]低于H1299对照组[(34.95±7.05)%]和H1299 siRNA-NC组[(23.75±5.87)%,均P<0.05]。H1299 siRNA-1组细胞凋亡率[(4.90±1.80)%]高于H1299对照组[(3.30±0.80)%]和H1299 siRNA-NC组[(2.80±1.20)%,均P<0.05]。H1299 siRNA-1组细胞克隆形成率[(19.20±2.00)%]低于对照组[(32.60±2.00)%]及siRNA-NC组[(34.40±1.00)%,均P<0.05]。H1299 siRNA-1组小鼠肿瘤体积低于H1299对照组和H1299 siRNA-NC组(均P<0.05),H1299 siRNA-1组小鼠肿瘤重量低于H1299-对照组和H1299 siRNA-NC组(均P<0.05)。Ki-67免疫组化结果显示,H1299对照组和H1299 siRNA-NC组肿瘤细胞增长标志物Ki-67呈阳性,而H1299 siRNA-1组呈弱阳性。qRT-PCR检测结果显示,H1299 siRNA-1组细胞中p21的mRNA表达水平(2.57±0.45)高于对照组(1.00±0.00,P=0.001)和H1299 siRNA-NC组(1.52±0.37,P=0.009)。Western blot结果表明,H1299 siRNA-1组细胞p21蛋白表达水平升高。结论超保守长链非编码RNA uc.77在肺癌细胞株和肺癌组织中均表达升高,敲低uc.77的表达可抑制肺癌细胞增殖和肿瘤生长,提示uc.77在肺癌中发挥促癌基因的作用,uc.77可能是肺癌的潜在治疗靶标。