植物基因组DNase Ⅰ超敏感位点的研究进展

真核生物的基因表达与调控是一系列顺式作用元件(cis-acting element)与反式作用因子(trans-acting fac-tor)相互作用的结果。顺式作用元件本身不编码蛋白,只是基因组中一些特定的区域,它们需与反式作用因子结合才能发挥其生理作用。目前已知,顺式作用元件往往与染色质的结构密切相关,能与反式作用因子结合发挥生物学功能的顺式作用元件,通常存在于脱氧核糖核酸酶I超敏感位点(DNase Ⅰ hypersensitive site)的内部或周围。随着越来越多的植物基因组测序的进展,大规模高通量鉴定植物基因组的顺式作用元件正在受到关注,通过鉴定脱氧核糖核酸酶I超敏感位点可以有效确定顺式作用元件的富集区域,将对功能基因组学研究提供的数据支持。文章综述了近期高通量鉴定和分析植物基因组脱氧核糖核酸酶I超敏感位点研究进展。

染色质DNaseⅠ超敏感位点的定位及其转录调控功能的研究进展

DNaseⅠ超敏感位点(DNaseⅠhypersensitive sites,DHSs)是对DNaseⅠ高度敏感的活性染色质区域。全基因组DHSs的定位分析已成为准确识别染色质上基因转录调控元件的有效方法,有助于系统解析基因和基因组信息及转录调控的动态分子机制。文中就DHSs的分布、DHSs的高通量测序技术及DHSs的转录调控功能的相关性研究进展作一综述。

脱氧核糖核酸酶Ⅰ超敏感位点的定位

在开展真核基因表达调控的研究中,确定DNA顺式调控元件是非常重要的。我们知道,处于转录活性状态的基因,相对于非活性基因,对核酸酶更为敏感。在这些活性基因的周围及内部,有一系列的核酸酶超敏感位点(Nuclease Hypelrsensitive Site,NHS)存在。

基于开放染色质的全基因组水平转录调控元件的研究方法与进展

真核生物转录调控过程是大量的顺式调控元件与反式作用因子相互作用的结果.研究发现,这一调控过程与染色质核小体的动态定位相关,调控因子的结合需要裸露的无核小体的DNA区域,即开放的染色质位点.因此,高效精确地定位基因组上的开放染色质位点为成功地发掘基因组调控元件,乃至揭示基因表达调控机制提供了重要线索和有效手段.本文对开放染色质位点的定义、主要研究方法以及功能注释进行概述,希望对在基因组水平上调控元件的发掘,尤其是在植物中的应用提供借鉴.

转录因子Gata3在Th2细胞分化过程中的作用

CD4^+辅助性T细胞根据其所分泌的细胞因子主要分为Th1、Th2、Th17和调节性T细胞(Treg)四个细胞亚群,它们对机体的免疫功能有着重要的调节作用。作为Th2细胞特异性的转录因子,Gata3能选择性地诱导幼稚性(na(?)ve)CD4^+T细胞朝着Th2方向分化,这一作用不仅体现在Gata3对IL-5和IL-13在转录水平上的调节,更表现在对CD4+T细胞染色质的重塑(chromatinremodeling)。Gata3除了在早期调控Th2细胞的分化,其对终末分化的Th2细胞的主要表型的维持也必不可少。本文主要就Gata3调节Th2细胞分化的作用和具体机制以及它自身在这一过程中所受到的调控做一综述。