陆地棉超矮杆突变体基因的初步定位

陆地棉超矮杆是一种新发现的突变体材料。前期对其遗传规律的研究表明,超矮杆突变性状是受一对完全隐性基因du控制的质量性状。文章以"超矮1号"和"新陆早16"配置的F2为作图群体,通过对双亲以及近等基因池的筛选,在1 350对SSR引物中共获得70对多态性引物。而后检测F2作图群体每个单株的基因型,显示有36个标记可以连锁,分布在8个连锁群上,其中超矮杆突变性状位于连锁群LG01。与目标基因du连锁的分子标记有7个:NAU2679、NAU2749、NAU905、NAU2838、NAU5373、NAU2238和NAU4946,它们皆为共显性标记。依据现有的棉花遗传图谱,标记NAU4946、NAU2238、NAU905、NAU5373和NAU2679位于第6染色体上,而目标基因du位于NAU2238和NAU4946之间,遗传距离分别为3.3 cM和1.4 cM,由此推定du在第6条染色体上。

陆地棉超矮秆突变体SSH文库的构建及分析

以陆地棉超矮秆突变体超矮1号及其近等基因系M104(正常株高)为材料提取棉花总RNA,以M104为促减物(Dirver),超矮1号为被测物(Tester),利用SSH法建立差异表达cDNA文库;分别以超矮1号和M104的cDNA为探针进行反向Northern杂交,筛选差异表达克隆,进行序列相似性分析。结果表明,通过建立差异表达cD-NA文库共获得2 530个克隆,通过反向Northern杂交共筛选到668个差异表达克隆,测序后得到539个质量合格的EST序列,共得到122个Unigene,有36个重叠群,86个单拷贝序列,平均长度1 319.26 bp。这些EST所涉及的基因,主要是与代谢和次生代谢调节、转录调控、生物合成、细胞凋亡、信号传导有关联。SSH文库的构建为陆地棉超矮秆突变形成的相关基因的克隆和结构功能研究奠定了基础。