河西绒山羊DQB1基因核苷酸序列变异和跨种进化

DQB1基因在抗原呈递和免疫系统中发挥重要的作用。为了研究河西绒山羊DQB1基因的核苷酸序列变异和跨种进化,采用PCR-SSCP和测序技术,检测899只河西绒山羊DQB1基因的多态性,并用来自山羊、绵羊和黄牛DQB1基因的33条核苷酸序列构建NJ树。结果表明,河西绒山羊DQB1基因存在6个等位基因和34个核苷酸变异位点,变异位点数目占分析位点数目的15.53%。经与GenBank中山羊DQB1基因的核苷酸序列比对后发现,5个等位基因为首次发现。系统进化研究表明,山羊DQB1基因的所有核苷酸序列均聚在第1支中,部分核苷酸序列与绵羊、牛的序列相似性高于山羊之间的序列相似性。因此,河西绒山羊DQB1基因多态性丰富,在山羊、绵羊和牛中存在跨种多态性。

尼罗鳄MHCⅡ类B基因第二外元的序列变异分析

利用一对简并引物扩增了尼罗鳄MHCⅡ类分子B基因第二外元的部分片段,并对PCR产物进行了克隆和测序,结果得到8种不同的序列,序列长度为166 bp;经分析,序列中有56个变异位点,核苷酸的非同义替换多于同义替换,造成30个位点氨基酸的改变,氨基酸的替换趋于集中在假定的抗原结合位点附近。核苷酸和氨基酸序列与已报道的扬子鳄和密河鳄的MHCⅡ类B基因第二外元序列有较高的同源性,利用PAUP4.0软件构建的NJ树显示,鳄类的MHCⅡ类B基因存在跨种多态性现象。

3种麻蜥MHC I类基因外显子3和外显子4序列特征

主要组织相容性复合体(Major histocompatibility complex,MHC)是有颌脊椎动物基因组中的一个高度多态性的基因家族,与免疫系统密切相关,MHC基因特征在哺乳类、鸟类、两栖类和鱼类中已被较好地描述.为了解爬行动物MHC基因的序列特征,通过PCR技术从胎生种密点麻蜥(Eremias multiocellata)、荒漠麻蜥(Eremias przewalskii)及卵生种山地麻蜥(Eremias brenchleyi)的肝脏中克隆了MHC I类基因外显子3和4的DNA片段,采用RT-PCR(逆转录-PCR)从这3种麻蜥的妊娠期子宫组织克隆了这两个外显子的cDNA片段.结果表明,3种麻蜥MHC I类基因均发生基因重复,密点麻蜥和山地麻蜥至少有4个基因座位,荒漠麻蜥至少有5个基因座位.在山地麻蜥获得的其中一条DNA片段中编码氨基酸的密码子突变为终止密码子,推测其为MHC I类基因的假基因.在外显子3编码的α2结构域中检测到多个多肽结合位点和β-2微球蛋白结合位点以及一个保守的半胱氨酸位点.在外显子4编码的α3结构域中检测到多个β-2微球蛋白结合位点和CD8分子结合位点以及一个保守的半胱氨酸位点.基于氨基酸的系统发育分析提示3种麻蜥的子宫均表达经典的MHC I类基因,可能有一些MHC基因座位未在子宫中表达.DNA系统发育重建揭示3种麻蜥MHC I类基因谱系没有表现出物种特异性进化,而表现出跨种多态性.上述结果为进一步研究胎生繁殖方式与母体免疫系统的协同进化及有鳞目MHC的演化奠定了基础.