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OpenMPI环境下的VASP软件的并行与进程
1
作者
潘勇
史海洪
+1 位作者
赵琉涛
刘彤
《计算机科学与应用》
2021年第1期84-94,共11页
VASP是材料微观物性模拟的重要软件,并行性能优良,其中矩阵对角化在其运算过程中占据大量时间。在HPC作业调度下,VASP并行的进程分配表现单节点和跨节点的差异。通过对MPI并行的节点内和节点间进程、EDDIAG和RMM-DIIS运行时间分析,明确...
VASP是材料微观物性模拟的重要软件,并行性能优良,其中矩阵对角化在其运算过程中占据大量时间。在HPC作业调度下,VASP并行的进程分配表现单节点和跨节点的差异。通过对MPI并行的节点内和节点间进程、EDDIAG和RMM-DIIS运行时间分析,明确了VASP程序并行中,矩阵对角化的重要性和OpenMPI对矩阵对角化并行的作用。并编写了一个通讯优化的矩阵对角化程序,通过测试并行程序托比串行的马斯算法表现出强大的可扩展性,基于OpenMPI的并行程序能够极大提高对角化的并行效率,但其并行度、通讯代价与计算规模之间的关系需要进一步研究。
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关键词
VASP
矩阵对角化
MPI
跨节点并行
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职称材料
题名
OpenMPI环境下的VASP软件的并行与进程
1
作者
潘勇
史海洪
赵琉涛
刘彤
机构
北京市计算中心
北京北科融智云计算科技有限公司
出处
《计算机科学与应用》
2021年第1期84-94,共11页
文摘
VASP是材料微观物性模拟的重要软件,并行性能优良,其中矩阵对角化在其运算过程中占据大量时间。在HPC作业调度下,VASP并行的进程分配表现单节点和跨节点的差异。通过对MPI并行的节点内和节点间进程、EDDIAG和RMM-DIIS运行时间分析,明确了VASP程序并行中,矩阵对角化的重要性和OpenMPI对矩阵对角化并行的作用。并编写了一个通讯优化的矩阵对角化程序,通过测试并行程序托比串行的马斯算法表现出强大的可扩展性,基于OpenMPI的并行程序能够极大提高对角化的并行效率,但其并行度、通讯代价与计算规模之间的关系需要进一步研究。
关键词
VASP
矩阵对角化
MPI
跨节点并行
分类号
TP3 [自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
OpenMPI环境下的VASP软件的并行与进程
潘勇
史海洪
赵琉涛
刘彤
《计算机科学与应用》
2021
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