目的:探索亚裔人群中转化生长因子β(transforming growth factor-β,TGF-β)信号通路基因多态性与非综合征型唇裂合并或不合并腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL/P)的关联及可能存在的基因-基因、基因-...目的:探索亚裔人群中转化生长因子β(transforming growth factor-β,TGF-β)信号通路基因多态性与非综合征型唇裂合并或不合并腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL/P)的关联及可能存在的基因-基因、基因-环境交互作用。方法:选取1038个NSCL/P核心家系作为研究对象。对TGF-β信号通路上的10个基因的343个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点进行了传递不平衡检验(transmission disequilibrium test,TDT),采用条件Logistic回归模型进行基因-基因交互作用分析和基因-环境交互作用分析。研究收集的环境因素包括患儿母亲孕期吸烟、被动吸烟、乙醇摄入量以及维生素使用情况。由于患儿母亲孕期吸烟和饮酒暴露率较低(<3%),因此,仅对母亲孕期被动吸烟及补充多种维生素这两个环境因素与基因之间的交互作用进行了分析。采用Bonferroni法对结果进行多重检验校正,显著性的阈值设置为P=1.46×10-4。结果:共有4个基因的23个SNP位点与NSCL/P之间存在关联(P<0.05),但经过Bonferroni多重检验校正后,这些关联均未达到统计学显著性水平。经过Bonferroni多重检验校正之后,6对SNP[rs4939874(SMAD2)与rs1864615(TGFBR2),rs2796813(TGFB2)与rs2132298(TGFBR2),rs4147358(SMAD3)与rs1346907(TGFBR2),rs4939874(SMAD2)与rs1019855(TGFBR2),rs4939874(SMAD2)与rs12490466(TGFBR2),以及rs2009112(TGFB2)与rs4075748(TGFBR2)]存在显著的统计学交互作用(P<1.46×10-4),基因-环境交互作用的分析没有达到多重检验校正阈值的显著结果。结论:未发现TGF-β通路基因多态性与NSCL/P的关联,该通路上部分基因可能通过基因-基因交互作用影响NSCL/P的发病风险。未来仍需其他独立研究的证据支持,以进一步的探索其中潜在的生物学机制。展开更多
目的:探讨长链非编码RNA(lncRNA) SIL对肺炎链球菌感染的肺上皮细胞细胞增殖、凋亡及转化生长因子β1(TGF-β1)/Smads通路的影响。方法:运用反转录PCR(RT-PCR)检测lncRNA SIL在人肺泡上皮细胞株A549、HEPApiC、肺泡Ⅱ型细胞(AECⅡ)以及...目的:探讨长链非编码RNA(lncRNA) SIL对肺炎链球菌感染的肺上皮细胞细胞增殖、凋亡及转化生长因子β1(TGF-β1)/Smads通路的影响。方法:运用反转录PCR(RT-PCR)检测lncRNA SIL在人肺泡上皮细胞株A549、HEPApiC、肺泡Ⅱ型细胞(AECⅡ)以及被肺炎链球菌R6感染的A549、HEPApiC、AECⅡ细胞的表达,显示其表达在R6感染的A549细胞中最高,故应用A549细胞进行后续实验。将A549细胞随机分为A549组(常规培养)、A549+R6组(用R6感染A549细胞)、lncRNA SIL mimic组(在A549细胞中转染lncRNA SIL mimic,并用R6感染细胞)和lncRNA SIL siRNA组(在A549细胞中转染lncRNA SIL siRNA,并用R6感染细胞)。采用CCK-8法检测各组细胞增殖情况。采用流式细胞仪检测各组细胞凋亡情况。采用免疫印迹法检测TGF-β1/Smads通路相关蛋白表达,并设立TGF-β1/Smads通路抑制剂组进行对照。采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测各组炎症因子表达。结果:与A549组比较,A549+R6组lncRNA SIL表达升高(P<0.05)。与A549+R6组比较,lncRNA SIL mimic组lncRNA SIL表达升高,lncRNA SIL siRNA组表达降低(均P<0.05)。与lncRNA SIL mimic组比较,lncRNA SIL siRNA组lncRNA SIL表达降低(P<0.05)。与A549组比较,A549+R6组不同时间细胞增殖率降低(均P<0.05)。与A549+R6组比较,lncRNA SIL mimic组不同时间细胞增殖率降低,lncRNA SIL siRNA组不同时间细胞增殖率升高(均P<0.05)。与A549组比较,A549+R6组细胞凋亡率增加(P<0.05)。与A549+R6组比较,lncRNA SIL mimic组细胞凋亡率增加,lncRNA SIL siRNA组细胞凋亡率降低(均P<0.05)。与A549组比较,A549+R6组TGF-β1、Smad 2、Smad 3蛋白表达升高,Smad 6、Smad 7蛋白表达降低(均P<0.05)。与A549+R6组比较,lncRNA SIL mimic组TGF-β1、Smad 2、Smad 3蛋白表达升高,Smad 6、Smad 7蛋白表达降低(均P<0.05)。与A549+R6组比较,lncRNA SIL siRNA组TGF-β1、Smad 2、Smad 3蛋白表达降低,Smad 6、Smad 7蛋白表达升高(均P<0.05)。lncRNA SIL siRNA组与抑制剂组各指标比较差异无统计学意义(均P>0.05)。与A549组比较,A549+R6组肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白介素细胞-1β(IL-1β)、IL-6水平升高(均P<0.05)。与A549+R6组比较,lncRNA SIL mimic组TNF-α、IL-1β、IL-6水平升高,lncRNA SIL siRNA组TNF-α、IL-1β、IL-6水平降低(均P<0.05)。结论:肺炎链球菌感染后,沉默lncRNA SIL可逆转肺上皮细胞凋亡增加及增殖减少的情况,并抑制TGF-β1/Smads通路激活,减少炎症因子释放,从而抑制炎性反应。展开更多
文摘目的:探索亚裔人群中转化生长因子β(transforming growth factor-β,TGF-β)信号通路基因多态性与非综合征型唇裂合并或不合并腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL/P)的关联及可能存在的基因-基因、基因-环境交互作用。方法:选取1038个NSCL/P核心家系作为研究对象。对TGF-β信号通路上的10个基因的343个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点进行了传递不平衡检验(transmission disequilibrium test,TDT),采用条件Logistic回归模型进行基因-基因交互作用分析和基因-环境交互作用分析。研究收集的环境因素包括患儿母亲孕期吸烟、被动吸烟、乙醇摄入量以及维生素使用情况。由于患儿母亲孕期吸烟和饮酒暴露率较低(<3%),因此,仅对母亲孕期被动吸烟及补充多种维生素这两个环境因素与基因之间的交互作用进行了分析。采用Bonferroni法对结果进行多重检验校正,显著性的阈值设置为P=1.46×10-4。结果:共有4个基因的23个SNP位点与NSCL/P之间存在关联(P<0.05),但经过Bonferroni多重检验校正后,这些关联均未达到统计学显著性水平。经过Bonferroni多重检验校正之后,6对SNP[rs4939874(SMAD2)与rs1864615(TGFBR2),rs2796813(TGFB2)与rs2132298(TGFBR2),rs4147358(SMAD3)与rs1346907(TGFBR2),rs4939874(SMAD2)与rs1019855(TGFBR2),rs4939874(SMAD2)与rs12490466(TGFBR2),以及rs2009112(TGFB2)与rs4075748(TGFBR2)]存在显著的统计学交互作用(P<1.46×10-4),基因-环境交互作用的分析没有达到多重检验校正阈值的显著结果。结论:未发现TGF-β通路基因多态性与NSCL/P的关联,该通路上部分基因可能通过基因-基因交互作用影响NSCL/P的发病风险。未来仍需其他独立研究的证据支持,以进一步的探索其中潜在的生物学机制。
文摘目的:探讨长链非编码RNA(lncRNA) SIL对肺炎链球菌感染的肺上皮细胞细胞增殖、凋亡及转化生长因子β1(TGF-β1)/Smads通路的影响。方法:运用反转录PCR(RT-PCR)检测lncRNA SIL在人肺泡上皮细胞株A549、HEPApiC、肺泡Ⅱ型细胞(AECⅡ)以及被肺炎链球菌R6感染的A549、HEPApiC、AECⅡ细胞的表达,显示其表达在R6感染的A549细胞中最高,故应用A549细胞进行后续实验。将A549细胞随机分为A549组(常规培养)、A549+R6组(用R6感染A549细胞)、lncRNA SIL mimic组(在A549细胞中转染lncRNA SIL mimic,并用R6感染细胞)和lncRNA SIL siRNA组(在A549细胞中转染lncRNA SIL siRNA,并用R6感染细胞)。采用CCK-8法检测各组细胞增殖情况。采用流式细胞仪检测各组细胞凋亡情况。采用免疫印迹法检测TGF-β1/Smads通路相关蛋白表达,并设立TGF-β1/Smads通路抑制剂组进行对照。采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测各组炎症因子表达。结果:与A549组比较,A549+R6组lncRNA SIL表达升高(P<0.05)。与A549+R6组比较,lncRNA SIL mimic组lncRNA SIL表达升高,lncRNA SIL siRNA组表达降低(均P<0.05)。与lncRNA SIL mimic组比较,lncRNA SIL siRNA组lncRNA SIL表达降低(P<0.05)。与A549组比较,A549+R6组不同时间细胞增殖率降低(均P<0.05)。与A549+R6组比较,lncRNA SIL mimic组不同时间细胞增殖率降低,lncRNA SIL siRNA组不同时间细胞增殖率升高(均P<0.05)。与A549组比较,A549+R6组细胞凋亡率增加(P<0.05)。与A549+R6组比较,lncRNA SIL mimic组细胞凋亡率增加,lncRNA SIL siRNA组细胞凋亡率降低(均P<0.05)。与A549组比较,A549+R6组TGF-β1、Smad 2、Smad 3蛋白表达升高,Smad 6、Smad 7蛋白表达降低(均P<0.05)。与A549+R6组比较,lncRNA SIL mimic组TGF-β1、Smad 2、Smad 3蛋白表达升高,Smad 6、Smad 7蛋白表达降低(均P<0.05)。与A549+R6组比较,lncRNA SIL siRNA组TGF-β1、Smad 2、Smad 3蛋白表达降低,Smad 6、Smad 7蛋白表达升高(均P<0.05)。lncRNA SIL siRNA组与抑制剂组各指标比较差异无统计学意义(均P>0.05)。与A549组比较,A549+R6组肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白介素细胞-1β(IL-1β)、IL-6水平升高(均P<0.05)。与A549+R6组比较,lncRNA SIL mimic组TNF-α、IL-1β、IL-6水平升高,lncRNA SIL siRNA组TNF-α、IL-1β、IL-6水平降低(均P<0.05)。结论:肺炎链球菌感染后,沉默lncRNA SIL可逆转肺上皮细胞凋亡增加及增殖减少的情况,并抑制TGF-β1/Smads通路激活,减少炎症因子释放,从而抑制炎性反应。