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利用全基因组重测序技术鉴定五指山猪GHR突变体转基因插入位点
被引量:
4
1
作者
魏强
奥岩
+7 位作者
杨漫漫
陈涛
韩虎
张兴举
王然
夏秋菊
姜芳芳
李勇
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第12期1149-1158,共10页
转基因插入位点及其侧翼序列的分子特征对转基因动物新品系培育和生物安全评价至关重要。GHR(growth hormone receptor)显性抑制突变体转基因猪(T274)是本实验室前期制备的一种表型显著的矮小症模型,目前已形成了多世代群体,但该模型中...
转基因插入位点及其侧翼序列的分子特征对转基因动物新品系培育和生物安全评价至关重要。GHR(growth hormone receptor)显性抑制突变体转基因猪(T274)是本实验室前期制备的一种表型显著的矮小症模型,目前已形成了多世代群体,但该模型中外源突变体的插入位点尚未鉴定。本研究利用BGI-seq500测序平台,对T274转基因猪进行全基因组重测序,获得超过289 Gb的数据(106×)。以转基因载体和猪基因组序列作为参考序列进行比对分析,获得该外源GHR突变体的插入位点,并利用PCR扩增和Sanger测序进行验证。所有的分析数据都支持外源显性抑制突变体插入在五指山猪1号染色体269,513,538~269,514,371之间。序列保守性及功能元件分析表明,该插入位点可能位于转录激活相关的基因间区域。不同世代个体的7种组织中该外源突变体的表达水平和表达一致性都较高,说明该插入位点可以作为一个潜在的转基因“友好位点”。本研究表明全基因组重测序技术可以高效的鉴定转基因插入位点,该插入位点的获得为后期转基因猪新品系的培育奠定了基础,同时也为行业提供了一个可靠的基因组定点整合位点。
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关键词
转基因插入位点
全
基因
组重测序
转基因
猪
遗传稳定性
下载PDF
职称材料
题名
利用全基因组重测序技术鉴定五指山猪GHR突变体转基因插入位点
被引量:
4
1
作者
魏强
奥岩
杨漫漫
陈涛
韩虎
张兴举
王然
夏秋菊
姜芳芳
李勇
机构
深圳市华大农业应用研究院
深圳华大生命科学研究院
华中农业大学
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第12期1149-1158,共10页
基金
广东省重点领域研发计划项目(编号:2018B020203002)
广东省基础与应用基础研究基金项目(编号:2019B1515210028)资助。
文摘
转基因插入位点及其侧翼序列的分子特征对转基因动物新品系培育和生物安全评价至关重要。GHR(growth hormone receptor)显性抑制突变体转基因猪(T274)是本实验室前期制备的一种表型显著的矮小症模型,目前已形成了多世代群体,但该模型中外源突变体的插入位点尚未鉴定。本研究利用BGI-seq500测序平台,对T274转基因猪进行全基因组重测序,获得超过289 Gb的数据(106×)。以转基因载体和猪基因组序列作为参考序列进行比对分析,获得该外源GHR突变体的插入位点,并利用PCR扩增和Sanger测序进行验证。所有的分析数据都支持外源显性抑制突变体插入在五指山猪1号染色体269,513,538~269,514,371之间。序列保守性及功能元件分析表明,该插入位点可能位于转录激活相关的基因间区域。不同世代个体的7种组织中该外源突变体的表达水平和表达一致性都较高,说明该插入位点可以作为一个潜在的转基因“友好位点”。本研究表明全基因组重测序技术可以高效的鉴定转基因插入位点,该插入位点的获得为后期转基因猪新品系的培育奠定了基础,同时也为行业提供了一个可靠的基因组定点整合位点。
关键词
转基因插入位点
全
基因
组重测序
转基因
猪
遗传稳定性
Keywords
transgenic insertion site
whole genome sequencing
transgenic pig
genetic stability
分类号
S828 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用全基因组重测序技术鉴定五指山猪GHR突变体转基因插入位点
魏强
奥岩
杨漫漫
陈涛
韩虎
张兴举
王然
夏秋菊
姜芳芳
李勇
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2021
4
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