转座子挽救法对苜蓿中华根瘤菌与耐盐有关基因的定位

用含Tn5转座子的质粒pRL10 6 3a诱变苜蓿中华根瘤菌 (Sinorhizobiummeliloti) 0 4 2BM ,得到盐敏感突变株0 4 2BML 2。采用转座子挽救法对Tn5插入位点两边的序列进行克隆与测序 ,获得了 1179bp的转座子插入位点侧翼DNA序列。在GenBank中进行序列同源性和基因定位分析 ,结果表明 :转座子插入在一个功能未知的基因内部 ,此基因长 6 2 70bp。研究证明 :该基因与 0 4 2BM的耐盐性有关 ,并定名为rtsC。氨基酸疏水性分析表明 ,在RtsC蛋白的N端有两个跨膜区 ,该蛋白与细菌趋化性相关蛋白的功能域有同源性。并对RtsC蛋白在苜蓿中华根瘤菌0 4

转座子挽救法对转座子突变菌株中插入位点的定位分析

为寻找谷氨酸棒杆菌转座子插入突变菌株中的转座子插入位点 ,采用了转座子挽救法对转座子及其插入位点附近的序列进行分离 ,并测定插入位点相邻DNA序列 ,获得了三个转座子插入位点DNA序列 ,其中一个是柠檬酸合成酶基因 ,另两个为目前未知基因 ,暂命名为orfA和orfB。该方法简便易行 。

转座子挽救法克隆鞘氨醇单胞菌CDS-1中呋喃丹水解酶相关基因

用含Tn5转座子的自杀性质粒pSC123诱变呋喃丹降解菌Sphingomonas agrestis CDS-1,获得失去呋喃丹降解功能的突变株CDS-M1.以pMD18-T为载体在E. coli DH5α中构建了CDS-M1的基因组文库,采用转座子挽救法对Tn5插入位点两侧翼的序列进行克隆与测序,根据测序结果(共4551个碱基)设计引物,从CDS-1的基因组中扩增到同样大小的片段,把该片断克隆到广宿主载体pPZP201上,得到重组质粒pCDZ1,通过三亲接合的方法把pCDZ1导入CDS-M1中进行功能互补实验,结果显示CDS-M1的呋喃丹水解功能得到了恢复,表明该片断中包含呋喃丹水解酶相关基因.