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大豆转录因子GmWIN1-1的鉴定与表达分析
1
作者
蔡桂萍
黄旭升
+2 位作者
史先飞
李润植
张莉
《山西农业科学》
2022年第3期296-302,共7页
为挖掘参与大豆胁迫应答的调控基因,研究聚焦大豆转录因子WAX INDUCER1(WIN1/SHN1)家族成员的鉴定和功能分析,以拟南芥AtWIN1编码序列为索引,在大豆转录组数据库中进行Blast比对,鉴定获得1条编码大豆GmWIN1-1转录因子的cDNA序列。通过...
为挖掘参与大豆胁迫应答的调控基因,研究聚焦大豆转录因子WAX INDUCER1(WIN1/SHN1)家族成员的鉴定和功能分析,以拟南芥AtWIN1编码序列为索引,在大豆转录组数据库中进行Blast比对,鉴定获得1条编码大豆GmWIN1-1转录因子的cDNA序列。通过生物信息学方法和qRT-PCR技术分析GmWIN1-1转录因子的序列特征及其在大豆各组织中和干旱胁迫下的表达水平。结果表明,该序列全长570 bp,编码189个氨基酸,蛋白分子质量为21.2 ku,理论等电点为8.45,为亲水性蛋白。GmWIN1-1蛋白二级结构主要元件为无规则卷曲,三级结构建模与模板5wx9.1蛋白氨基酸序列相似性为45%,为单体蛋白。多序列比对揭示GmWIN1-1与AtWIN1相似性最高。保守基序分析表明,WIN1蛋白具有3个基序,即AP2保守基序、中间基序、C端基序。系统发育分析显示,GmWIN1-1与MtWIN1亲缘关系较近。PlantCARE软件预测,GmWIN1-1启动子含有多个响应逆境胁迫的核心顺式元件。实时荧光定量PCR显示,GmWIN1-1在大豆各组织中的表达水平差异显著,在花器官中表达量最高。干旱胁迫条件下,GmWIN1-1的表达水平呈现先小幅度下降而后快速上调再下降的趋势。大豆GmWIN1-1转录因子在大豆各组织中的表达具有时空特异性,并且可能介导大豆干旱胁迫应答的调控。
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关键词
大豆
转录因子wax
INDUCER1(WIN1/SHN1)
基因鉴定
表达分析
干旱胁迫
下载PDF
职称材料
大豆转录因子GmWIN1-3介导逆境胁迫响应的功能分析
被引量:
1
2
作者
薛金爱
蔡桂萍
+4 位作者
周雅莉
陈莹
刘宝玲
张莉
李润植
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第9期1703-1714,共12页
为挖掘提高大豆逆境胁迫抗性的优异基因,本文聚焦大豆(Glycine max)WIN1转录因子基因克隆和生物学功能分析。基于转录组学分析,RT-PCR克隆到GmWIN1-3基因的编码序列(720 bp)。亚细胞定位分析显示该转录因子定位于细胞核。PlantCARE软件...
为挖掘提高大豆逆境胁迫抗性的优异基因,本文聚焦大豆(Glycine max)WIN1转录因子基因克隆和生物学功能分析。基于转录组学分析,RT-PCR克隆到GmWIN1-3基因的编码序列(720 bp)。亚细胞定位分析显示该转录因子定位于细胞核。PlantCARE软件预测GmWIN1-3启动子中含有LTR和TC-rich repeats等胁迫顺式作用元件。基因表达谱分析显示,在低温和高盐胁迫下,GmWIN1-3呈上调表达,而在干旱胁迫下呈下调表达。在低温胁迫下,过表达GmWIN1-3显著促进大豆毛状根油脂积累和减低MDA含量。油脂合成途径相关酶基因GmBCCP1-4和GmDGAT2-3在GmWIN1-3转基因大豆毛状根中表达显著上调,然而GmDGAT2-1和Gm LPAT5-2则呈下调表达。异源过表达GmWIN1-3显著提高烟叶油脂积累和烟草幼苗低温胁迫耐性。研究表明转录因子GmWIN1-3可通过上调GmDGAT2-3等酶基因表达和总脂质积累,进而提高大豆幼苗抵御逆境胁迫的能力。
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关键词
大豆
wax
INDUCER1(WIN1)
转录
因子
功能分析
逆境胁迫
大豆毛状根
原文传递
题名
大豆转录因子GmWIN1-1的鉴定与表达分析
1
作者
蔡桂萍
黄旭升
史先飞
李润植
张莉
机构
山西农业大学农学院
出处
《山西农业科学》
2022年第3期296-302,共7页
基金
山西省重点研发计划项目(201803D221019-1)
山西省应用基础研究计划项目(201901D111221)。
文摘
为挖掘参与大豆胁迫应答的调控基因,研究聚焦大豆转录因子WAX INDUCER1(WIN1/SHN1)家族成员的鉴定和功能分析,以拟南芥AtWIN1编码序列为索引,在大豆转录组数据库中进行Blast比对,鉴定获得1条编码大豆GmWIN1-1转录因子的cDNA序列。通过生物信息学方法和qRT-PCR技术分析GmWIN1-1转录因子的序列特征及其在大豆各组织中和干旱胁迫下的表达水平。结果表明,该序列全长570 bp,编码189个氨基酸,蛋白分子质量为21.2 ku,理论等电点为8.45,为亲水性蛋白。GmWIN1-1蛋白二级结构主要元件为无规则卷曲,三级结构建模与模板5wx9.1蛋白氨基酸序列相似性为45%,为单体蛋白。多序列比对揭示GmWIN1-1与AtWIN1相似性最高。保守基序分析表明,WIN1蛋白具有3个基序,即AP2保守基序、中间基序、C端基序。系统发育分析显示,GmWIN1-1与MtWIN1亲缘关系较近。PlantCARE软件预测,GmWIN1-1启动子含有多个响应逆境胁迫的核心顺式元件。实时荧光定量PCR显示,GmWIN1-1在大豆各组织中的表达水平差异显著,在花器官中表达量最高。干旱胁迫条件下,GmWIN1-1的表达水平呈现先小幅度下降而后快速上调再下降的趋势。大豆GmWIN1-1转录因子在大豆各组织中的表达具有时空特异性,并且可能介导大豆干旱胁迫应答的调控。
关键词
大豆
转录因子wax
INDUCER1(WIN1/SHN1)
基因鉴定
表达分析
干旱胁迫
Keywords
soybean
transcription factor
wax
INDUCER1/SHINE1(WIN1/SHN1)
gene identification
expression analysis
drought stress
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
大豆转录因子GmWIN1-3介导逆境胁迫响应的功能分析
被引量:
1
2
作者
薛金爱
蔡桂萍
周雅莉
陈莹
刘宝玲
张莉
李润植
机构
山西农业大学农学院/分子农业与生物能源研究所
出处
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第9期1703-1714,共12页
基金
国家自然科学基金(31201266和31401430)
山西省重点研发计划项目(201803D221005-9和201803D221019-1)
+2 种基金
山西省自然科学基金项目(201901D111221和20210302124170)
山西农业大学生物育种工程项目(YZGC101)
山西省晋中市科技重点研发计划项目(Y172007-5)。
文摘
为挖掘提高大豆逆境胁迫抗性的优异基因,本文聚焦大豆(Glycine max)WIN1转录因子基因克隆和生物学功能分析。基于转录组学分析,RT-PCR克隆到GmWIN1-3基因的编码序列(720 bp)。亚细胞定位分析显示该转录因子定位于细胞核。PlantCARE软件预测GmWIN1-3启动子中含有LTR和TC-rich repeats等胁迫顺式作用元件。基因表达谱分析显示,在低温和高盐胁迫下,GmWIN1-3呈上调表达,而在干旱胁迫下呈下调表达。在低温胁迫下,过表达GmWIN1-3显著促进大豆毛状根油脂积累和减低MDA含量。油脂合成途径相关酶基因GmBCCP1-4和GmDGAT2-3在GmWIN1-3转基因大豆毛状根中表达显著上调,然而GmDGAT2-1和Gm LPAT5-2则呈下调表达。异源过表达GmWIN1-3显著提高烟叶油脂积累和烟草幼苗低温胁迫耐性。研究表明转录因子GmWIN1-3可通过上调GmDGAT2-3等酶基因表达和总脂质积累,进而提高大豆幼苗抵御逆境胁迫的能力。
关键词
大豆
wax
INDUCER1(WIN1)
转录
因子
功能分析
逆境胁迫
大豆毛状根
Keywords
soybean(Glycine max)
wax
INDUCER1(WIN1)transcription factor
functional analysis
abiotic stress
soybean hairy roots
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大豆转录因子GmWIN1-1的鉴定与表达分析
蔡桂萍
黄旭升
史先飞
李润植
张莉
《山西农业科学》
2022
0
下载PDF
职称材料
2
大豆转录因子GmWIN1-3介导逆境胁迫响应的功能分析
薛金爱
蔡桂萍
周雅莉
陈莹
刘宝玲
张莉
李润植
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
1
原文传递
已选择
0
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