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基于数据库挖掘分析TEAD2在胶质瘤诊断和治疗中的作用
1
作者
雷蓉
李珣
+1 位作者
贺诗施
聂燕
《岭南现代临床外科》
2023年第2期170-179,共10页
目的通过对数据库进行挖掘,分析转录增强缔合域(TEAD)蛋白⁃2(TEAD2)在胶质瘤中的表达水平及其与临床预后的关系。方法运用Timer2.0数据库、UCSC数据库和CCLE数据库分析TEAD2在泛癌中的表达水平。运用CGGA数据库和GBM线上数据库进行单细...
目的通过对数据库进行挖掘,分析转录增强缔合域(TEAD)蛋白⁃2(TEAD2)在胶质瘤中的表达水平及其与临床预后的关系。方法运用Timer2.0数据库、UCSC数据库和CCLE数据库分析TEAD2在泛癌中的表达水平。运用CGGA数据库和GBM线上数据库进行单细胞转录组测序数据分析。运用R语言对CGGA数据库和TCGA数据分析TEAD2与胶质瘤临床特征的关系。使用Kaplan⁃Meier进行生存分析,使用COX回归进行预后因素筛选。使用基因本体论(GO)分析和京都基因与基因组百科路径(KEGG)进行TEAD2相关基因功能富集。使用CCK8实验和细胞流式实验检测TEAD2小分子药物对胶质瘤细胞增殖和细胞周期的影响。结果TEAD2在多种肿瘤组织中表达水平升高。在胶质瘤中,TEAD2在肿瘤组织中高度富集,且主要在肿瘤细胞中表达。TEAD2与胶质瘤WHO临床病理分期、IDH突变状态和染色体1p/19q共缺失相关。高表达TEAD2的患者具有更差的预后,且TEAD2可以作为胶质瘤的独立预后因素。功能富集结果提示在胶质瘤中TEAD2可能参与肿瘤细胞的细胞周期、DNA复制等生物学过程。TEAD2小分子药物抑制胶质瘤细胞增殖,使细胞周期阻滞在G0/G1期。结论胶质瘤中TEAD2高表达,可以作为胶质瘤潜在的治疗和诊断靶点。
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关键词
胶质瘤
转录
增强
缔合
域
(
tead
)
蛋白⁃
2
生信分析
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职称材料
题名
基于数据库挖掘分析TEAD2在胶质瘤诊断和治疗中的作用
1
作者
雷蓉
李珣
贺诗施
聂燕
机构
中山大学孙逸仙纪念医院乳腺肿瘤中心
出处
《岭南现代临床外科》
2023年第2期170-179,共10页
基金
国家自然科学基金面上项目(81872158)
广东省基础与应用基础研究基金自然科学基金杰出青年项目(2022B1515020048)
国家自然科学基金青年项目(82002782)。
文摘
目的通过对数据库进行挖掘,分析转录增强缔合域(TEAD)蛋白⁃2(TEAD2)在胶质瘤中的表达水平及其与临床预后的关系。方法运用Timer2.0数据库、UCSC数据库和CCLE数据库分析TEAD2在泛癌中的表达水平。运用CGGA数据库和GBM线上数据库进行单细胞转录组测序数据分析。运用R语言对CGGA数据库和TCGA数据分析TEAD2与胶质瘤临床特征的关系。使用Kaplan⁃Meier进行生存分析,使用COX回归进行预后因素筛选。使用基因本体论(GO)分析和京都基因与基因组百科路径(KEGG)进行TEAD2相关基因功能富集。使用CCK8实验和细胞流式实验检测TEAD2小分子药物对胶质瘤细胞增殖和细胞周期的影响。结果TEAD2在多种肿瘤组织中表达水平升高。在胶质瘤中,TEAD2在肿瘤组织中高度富集,且主要在肿瘤细胞中表达。TEAD2与胶质瘤WHO临床病理分期、IDH突变状态和染色体1p/19q共缺失相关。高表达TEAD2的患者具有更差的预后,且TEAD2可以作为胶质瘤的独立预后因素。功能富集结果提示在胶质瘤中TEAD2可能参与肿瘤细胞的细胞周期、DNA复制等生物学过程。TEAD2小分子药物抑制胶质瘤细胞增殖,使细胞周期阻滞在G0/G1期。结论胶质瘤中TEAD2高表达,可以作为胶质瘤潜在的治疗和诊断靶点。
关键词
胶质瘤
转录
增强
缔合
域
(
tead
)
蛋白⁃
2
生信分析
Keywords
Glioma
Transcription enhancing association domain(
tead
)protein
⁃2
Bioinformatics analysis
分类号
R739.41 [医药卫生—肿瘤]
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作者
出处
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被引量
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1
基于数据库挖掘分析TEAD2在胶质瘤诊断和治疗中的作用
雷蓉
李珣
贺诗施
聂燕
《岭南现代临床外科》
2023
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