为探讨转录延伸因子B1(transcription elongation factor B subunit 1,TCEB1)基因在肝癌中的表达和临床意义,利用GEPIA、UALCAN分析TCEB1在肝癌中的表达以及与患者临床病理特征和预后的关系;采用cBioPortal分析肝癌中TCEB1基因的改变情...为探讨转录延伸因子B1(transcription elongation factor B subunit 1,TCEB1)基因在肝癌中的表达和临床意义,利用GEPIA、UALCAN分析TCEB1在肝癌中的表达以及与患者临床病理特征和预后的关系;采用cBioPortal分析肝癌中TCEB1基因的改变情况;利用LinkedOmics分析肝癌中TCEB1的相关基因,并通过Metascape对TCEB1相关基因进行GO和KEGG通路分析;最后通过GeneMANIA构建TCEB1相互作用蛋白质网络。GEPIA和UALCAN的分析结果显示,TCEB1在肝癌组织中显著高表达(P<0.05),且表达水平越高,患者肿瘤分级和预后越差(P<0.05)。cBioPortal数据库检测结果显示,5%(52/1136)的肝癌患者的肝癌样本发生TCEB1基因改变,且基因拷贝数扩增与TCEB1 m RNA表达呈正相关,发生基因改变的患者预后显著较差(P=0.0129)。GO分析结果提示,TCEB1及其相关基因的分子功能主要与转录因子结合、泛素样蛋白转移酶活性、钙黏着蛋白的结合等有关。GeneMANIA分析提示,TCEB1与TCEB2、VHL、CUL2等蛋白质相互作用。本研究表明,TCEB1可作为肝癌患者预后的生物标志物和肝癌治疗新的潜在靶点。展开更多
目的探讨转录延伸因子A样蛋白7(TCEAL7)对卵巢癌细胞增殖及迁移的影响。方法利用GEPIA网站分析正常卵巢组织及卵巢癌组织中TCEAL7的表达差异。通过定量聚合酶链式反应(PCR)及免疫印迹(Western blot)实验检测人卵巢表层上皮细胞(HOSEpiC...目的探讨转录延伸因子A样蛋白7(TCEAL7)对卵巢癌细胞增殖及迁移的影响。方法利用GEPIA网站分析正常卵巢组织及卵巢癌组织中TCEAL7的表达差异。通过定量聚合酶链式反应(PCR)及免疫印迹(Western blot)实验检测人卵巢表层上皮细胞(HOSEpiC)及人卵巢癌细胞株CAOV-3、HO-8910、OVCAR-3及SKOV-3中TCEAL7的mRNA及蛋白表达。通过慢病毒转染过表达SKOV-3细胞中的TCEAL7,再利用噻唑蓝(MTT)实验检测在24、48、72及96 h SKOV-3细胞增殖的变化。利用划痕实验检测过表达TCEAL7后SKOV-3细胞迁移能力的变化。结果GEPIA网站分析结果显示,正常卵巢组织中TCEAL7的表达量显著高于卵巢癌组织。TCEAL7在4种卵巢癌细胞株中的mRNA及蛋白表达同样均显著低于HOSEpiC。本研究进一步发现过表达TCEAL7可显著抑制SKOV-3细胞的增殖及迁移,并可显著降低SKOV-3细胞中细胞外调节蛋白激酶(ERK1/2)及即刻早期基因(c-FOS)的磷酸化水平。结论本研究表明TCEAL7在卵巢癌中的表达下调,并可通过负向调控ERK/c-FOS通路抑制卵巢癌细胞的增殖及迁移,提示TCEAL7可能是卵巢癌的一个潜在治疗靶点。展开更多
文摘为探讨转录延伸因子B1(transcription elongation factor B subunit 1,TCEB1)基因在肝癌中的表达和临床意义,利用GEPIA、UALCAN分析TCEB1在肝癌中的表达以及与患者临床病理特征和预后的关系;采用cBioPortal分析肝癌中TCEB1基因的改变情况;利用LinkedOmics分析肝癌中TCEB1的相关基因,并通过Metascape对TCEB1相关基因进行GO和KEGG通路分析;最后通过GeneMANIA构建TCEB1相互作用蛋白质网络。GEPIA和UALCAN的分析结果显示,TCEB1在肝癌组织中显著高表达(P<0.05),且表达水平越高,患者肿瘤分级和预后越差(P<0.05)。cBioPortal数据库检测结果显示,5%(52/1136)的肝癌患者的肝癌样本发生TCEB1基因改变,且基因拷贝数扩增与TCEB1 m RNA表达呈正相关,发生基因改变的患者预后显著较差(P=0.0129)。GO分析结果提示,TCEB1及其相关基因的分子功能主要与转录因子结合、泛素样蛋白转移酶活性、钙黏着蛋白的结合等有关。GeneMANIA分析提示,TCEB1与TCEB2、VHL、CUL2等蛋白质相互作用。本研究表明,TCEB1可作为肝癌患者预后的生物标志物和肝癌治疗新的潜在靶点。
文摘目的探讨转录延伸因子A样蛋白7(TCEAL7)对卵巢癌细胞增殖及迁移的影响。方法利用GEPIA网站分析正常卵巢组织及卵巢癌组织中TCEAL7的表达差异。通过定量聚合酶链式反应(PCR)及免疫印迹(Western blot)实验检测人卵巢表层上皮细胞(HOSEpiC)及人卵巢癌细胞株CAOV-3、HO-8910、OVCAR-3及SKOV-3中TCEAL7的mRNA及蛋白表达。通过慢病毒转染过表达SKOV-3细胞中的TCEAL7,再利用噻唑蓝(MTT)实验检测在24、48、72及96 h SKOV-3细胞增殖的变化。利用划痕实验检测过表达TCEAL7后SKOV-3细胞迁移能力的变化。结果GEPIA网站分析结果显示,正常卵巢组织中TCEAL7的表达量显著高于卵巢癌组织。TCEAL7在4种卵巢癌细胞株中的mRNA及蛋白表达同样均显著低于HOSEpiC。本研究进一步发现过表达TCEAL7可显著抑制SKOV-3细胞的增殖及迁移,并可显著降低SKOV-3细胞中细胞外调节蛋白激酶(ERK1/2)及即刻早期基因(c-FOS)的磷酸化水平。结论本研究表明TCEAL7在卵巢癌中的表达下调,并可通过负向调控ERK/c-FOS通路抑制卵巢癌细胞的增殖及迁移,提示TCEAL7可能是卵巢癌的一个潜在治疗靶点。