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丁型肝炎病毒(HDV)天然序列和G11C突变序列的转录折叠动力学研究 被引量:1
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作者 邹彦娟 龚沙 +1 位作者 王宇杰 张文炳 《武汉大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期69-77,共9页
在转录折叠条件下,丁型肝炎病毒(HDV)的自剪切活性的发挥受到转录过程中形成的中间态结构、转录速率、突变位点等的影响.本文采用转录折叠动力学方法研究了HDV的天然(wild-type,wt)序列在不同转录速率下的转录折叠动力学行为,并分析了G... 在转录折叠条件下,丁型肝炎病毒(HDV)的自剪切活性的发挥受到转录过程中形成的中间态结构、转录速率、突变位点等的影响.本文采用转录折叠动力学方法研究了HDV的天然(wild-type,wt)序列在不同转录速率下的转录折叠动力学行为,并分析了G11C突变对转录过程的影响.研究结果表明,虽然HDV的天然序列和G11C突变序列的转录折叠过程都存在快慢两条路径,但是对于HDV的天然序列,增大转录速率可以降低其慢速折叠路径上的RNA占据几率,而对于G11C突变序列,增大转录速率反而使得更多的RNA经过慢速路径形成天然态结构,并且在转录完全结束以后,HDV的天然序列要比G11C突变序列更快速地形成天然态结构. 展开更多
关键词 转录折叠 主方程方法 HDV 突变
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氟离子核糖开关调控行为的动力学研究
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作者 龚沙 杜承意 李丹 《武汉大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期74-80,共7页
核糖开关位于RNA(ribonucleic acid)的非编码区,参与调控很多重要的生物过程。本文利用已发展的RNA转录折叠预测方法,研究了位于Thermotoga petrophila中的氟离子核糖开关。计算结果表明,该核糖开关在转录过程中先折叠成一个包含假结并... 核糖开关位于RNA(ribonucleic acid)的非编码区,参与调控很多重要的生物过程。本文利用已发展的RNA转录折叠预测方法,研究了位于Thermotoga petrophila中的氟离子核糖开关。计算结果表明,该核糖开关在转录过程中先折叠成一个包含假结并可以特异性结合配体的适体域结构。当氟离子浓度较低时,随着RNA序列的延长,转录终止子开始成核、延长,最终完全形成,引起转录提前终止;当氟离子浓度较高时,配体和适体域结构结合形成一个稳定的复合体结构,阻止了转录终止子的形成,从而使得下游基因可以正常表达。该核糖开关受转录速度和配体浓度的联合控制,体现出动力学调控特性。 展开更多
关键词 氟离子核糖开关 转录折叠 基因调控 RNA结构 折叠动力学
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