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题名磁珠诱导的慢性高眼压性青光眼小鼠模型转录组分析
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作者
王玥丹
李莹
冯佳卿
肖璇
杨安怀
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机构
武汉大学人民医院眼科中心
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出处
《武汉大学学报(医学版)》
CAS
2024年第9期1031-1037,共7页
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基金
国家自然科学基金资助项目(编号:82371079)
湖北省重点研发计划项目(编号:2022BCA009)。
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文摘
目的:利用转录组测序(RNA-seq)和生物信息学技术对磁珠诱导的慢性高眼压性青光眼小鼠模型的视网膜差异表达基因(DEGs)及信号通路的变化进行分析,探讨慢性高眼压青光眼视网膜损伤的生物学机制。方法:4~6周龄雄性C57BL/6J小鼠共6只,随机分为实验组、对照组。实验组通过2次对小鼠单眼前房注射磁珠悬液,阻断房水流出通道,模拟慢性高眼压性青光眼,对照组未行处理。取第48天实验组造模眼和对照组小鼠单眼的视网膜,进行RNA-seq和生物信息学分析,并进一步分析DEGs和线粒体共表达基因。结果:在注射2次磁珠后小鼠眼压升高并维持在较高水平。共筛选出606个DEGs,经GO和KEGG通路分析主要富集在能量代谢相关通路。GSEA分析表明氧化磷酸化、糖酵解通路下调。进一步分析发现DEGs和线粒体基因重叠共59个,富集在质子跨膜转运蛋白活性、线粒体蛋白复合物、氨基酸降解等方面。PPI网络分析揭示Uqcrfs1、Cyc1和Atp5f1a等核心基因。结论:RNA-seq和生物信息学分析提示能量代谢失调参与慢性高眼压性青光眼的视网膜损伤和退行性变,线粒体功能障碍导致轴突转运失调可能在青光眼的发病中发挥重要作用。
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关键词
转录组
磁珠模型
青光眼
线粒体功能障碍
轴突转运失调
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Keywords
Transcriptome
Magnetic Bead Model
Glaucoma
Mitochondrial Dysfunction
Axonal Transport Dysregulation
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分类号
R775
[医药卫生—眼科]
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