基于智能检测的DNA序列载体片段清除工具

针对传统DNA载体检测和清除工具的不足,实现一种基于智能检测的DNA载体检测新工具.该工具的核心思想是无需预先给定克隆载体序列模版、剪接位点和克隆适配片段等信息,通过建立从载体出现概率到序列权重的映射,把载体片段的检测转化为求给定序列中具有最大权重的k个不重叠相交的子序列问题,并且引入了罚函数控制避免对载体序列的过度清除.实验结果表明该工具能显著提高载体清除的效率和准确性,在超长序列处理的时候更稳定、错误率更低.